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        SAT技術(shù)檢測結(jié)核桿菌rRNA對肺結(jié)核的快速診斷價值

        2018-05-17 11:30:32許蘊怡蔡杏珊譚耀駒劉燕文曾少芳馬品云周輝林
        實用醫(yī)學(xué)雜志 2018年2期
        關(guān)鍵詞:敏感度肺結(jié)核陰性

        許蘊怡 蔡杏珊 譚耀駒 劉燕文 曾少芳 馬品云 周輝林

        廣州市胸科醫(yī)院檢驗科(廣州 510095)

        中國的結(jié)核病流行趨勢令人關(guān)注。目前能否提供敏感、快速的抗結(jié)核療效指標(biāo)指導(dǎo)臨床應(yīng)用,至關(guān)重要。目前,結(jié)核病的實驗室檢查中的涂片熒光染色鏡檢法及快速培養(yǎng)法(Bactec MGIT960)仍然是確診肺結(jié)核的傳統(tǒng)方法,臨床監(jiān)測療效可通過以下指標(biāo)來考察:(1)2個月直接涂片陰轉(zhuǎn)率:現(xiàn)常用于結(jié)核病的控制指標(biāo),但耗時長,其在國內(nèi)陽性率總體不高,僅為10%~30%[1],敏感度低;(2)快速培養(yǎng)法(Bactec MGIT960)比前者優(yōu)越,但檢測周期長,時間滯后于用藥,而限制其臨床應(yīng)用;而兩者陽性者均難以鑒別結(jié)核及非結(jié)核桿菌,前者不能區(qū)分死活菌。

        近年來,分子技術(shù)在國內(nèi)外發(fā)展以及臨床廣泛應(yīng)用,以RNA為靶標(biāo)的診斷技術(shù)可以反映病原體的存活狀態(tài),用于療效監(jiān)測。SAT?TB技術(shù)是以MTB特異的16srRNA為靶標(biāo)實時檢測,從而快速測出樣本中是否有活MTB存在。本研究通過SAT?TB技術(shù)對結(jié)核病患者的痰、支沖液標(biāo)本進行檢測來判斷MTB的活菌是否存在,評價其對肺結(jié)核病的快速診斷價值。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 選則廣州市胸科醫(yī)院收集2015年9月22日至11月22日廣州市胸科醫(yī)院疑似肺結(jié)核患者痰液169份、支沖液151份,共計320份標(biāo)本;同時進行SAT法、快速培養(yǎng)法(Bactec MGIT960)檢測。

        1.2 主要試劑與儀器 試劑:結(jié)核分枝桿菌(TB)核酸檢測試劑盒(上海仁度生物科技公司,批號20150925);熒光涂片法染色液及快速液體法培養(yǎng)液均由我院檢驗科自配;儀器:美國應(yīng)用公司ABI7300熒光定量擴增儀;BACTEC MGIT960儀器。

        1.3 方法

        1.3.1 標(biāo)本預(yù)處理 提取約2 mL左右的標(biāo)本至50 mL離心管中,加1~2倍的2%N?乙酰半胱氨酸-氫氧化鈉前處理液(去污染),漩渦震蕩20 s,靜置15 min后,以3 200 r/min離心15 min,棄去上清,加入1 mL/管PBS緩沖液(pH=6.8)以中和PH至6.8,混勻備用。

        1.3.2 SAT?TB檢測 取液化好的痰標(biāo)本1 mL于EP管中,以13 000 r/min離心5 min,后棄上清,再加入1 mL PBS緩沖液重懸離心,棄上清。將痰液標(biāo)本加入50 μL裂解液重懸,該樣品即為待測樣本,用超聲破碎儀破碎15 min,功率300 W。后將2 μL處理物加入含30 μL擴增檢測液的潔凈微量反應(yīng)管或者反應(yīng)板中。置恒溫?zé)晒鈾z測儀上進行檢測。

        1.3.3 快速液體培養(yǎng)法(Bactec MGIT960) 提取約2 mL左右的標(biāo)本至50 mL離心管中,加1~2倍的2%N?乙酰半胱氨酸-氫氧化鈉前處理液(去污染),漩渦震蕩20 s,靜置15 min后,以3 200 r/min離心15 min,棄去上清,加入1 mL/管PBS緩沖液(pH=6.8)以中和PH至6.8,取液化后的痰標(biāo)本放入BACTEC MGIT960儀器檢測。

        1.4 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 16.0統(tǒng)計軟件進行統(tǒng)計學(xué)分析。分別以快速液體培養(yǎng)法和臨床診斷為“金標(biāo)準”,計算SAT檢測的靈敏度、特異性、陽性預(yù)測值、陰性預(yù)測值,突出比較BD960快速液體培養(yǎng)法和SAT法在痰液、支沖液的陽性檢出率,“率”用卡方檢驗比較,P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 一般資料 廣州市胸科醫(yī)院疑似肺結(jié)核患者的痰液169份、支沖液151份,共計320份標(biāo)本進入最后研究。169例痰液標(biāo)本患者中,男122例,女47例。痰液標(biāo)本菌鑒結(jié)果為非結(jié)核分枝桿菌患者有8例,其中龜-膿腫分枝桿菌復(fù)合群3例,胞內(nèi)分枝桿菌5例,3例非結(jié)核分枝桿菌感染患者的培養(yǎng)為陽性且SAT?TB為陰性。151例支沖液標(biāo)本患者中,男97例,女54例。支沖標(biāo)本菌鑒結(jié)果為非結(jié)核分枝桿菌患者有6例,其中龜-膿腫分支桿菌復(fù)合群3例,堪薩斯分枝桿菌2例,鳥-土分枝桿菌1例,2例非結(jié)核分枝桿菌感染患者的培養(yǎng)為陽性且SAT?TB為陰性。見表1、2。

        表1 169例疑似肺結(jié)核患者痰液的BD960法與SAT法實驗結(jié)果Tab.1 The result of 169 sputum suspected MTB patients of BD960 and SAT?TB 例

        表2 151例疑似肺結(jié)核患者支沖液的BD960法與SAT?TB法實驗結(jié)果Tab.2 The result of 151 BALF suspected MTB patients of BD960 and SAT?TB 例

        2.2 以培養(yǎng)法為標(biāo)準,SAT?TB檢測痰液、支沖液診斷肺結(jié)核的價值 BD960快培法在痰液、支沖液的陽性檢出率分別為:29.58%(50/169)和23.18%(35/151);SAT?TB法在痰液、支沖液的陽性檢出率36.09%(61/169)和39.07%(59/151)。痰、支沖液兩者的陽性率比較:痰SAT法陽性檢出率較BD960快速培養(yǎng)法高6.51%,(χ2=59.34,P< 0.05);支沖液SAT法陽性檢出率較BD960快速培養(yǎng)法高15.89%,(χ2=36.69,P<0.05),差異均有統(tǒng)計學(xué)意義。SAT?TB檢測痰液、支沖液對肺結(jié)核患者的診斷價值見表3、4。

        表3 SAT?TB檢測痰液對肺結(jié)核患者的診斷價值Tab.3 The diagnostic value of testing sputum MTB patients by SAT?TB

        表4 SAT?TB檢測支沖液對肺結(jié)核患者的診斷價值Tab.4 The diagnostic value of testing BALF MTB patients by SAT?TB

        2.3 以臨床診斷為標(biāo)準,SAT?TB檢測痰液、支沖液診斷肺結(jié)核的價值 若以臨床診斷作為判斷肺結(jié)核為陽性標(biāo)準,臨床診斷肺結(jié)核包括培陽及培陰肺結(jié)核,臨床診斷非肺結(jié)核或疑似肺結(jié)核為陰性標(biāo)準,SAT法在痰液、支沖液標(biāo)本對肺結(jié)核的敏感度、特異度、陽性預(yù)測值、陰性預(yù)測值分別為:57.73%(56/97)、93.06%(67/72)、91.80%(56/61)、62.04%(67/108);51.82%(57/110)、94.29%(39/41)、96.61%(57/59)、42.39%(39/92);BD960法在痰液、支沖液標(biāo)本的敏感度、特異度、陽性預(yù)測值、陰性預(yù)測值分別為:51.55%(50/97)、95.83%(69/72)、94.34%(50/53)、59.48%(69/116);33.64%(37/110)、90.24%(37/41)、90.24%(37/41)、33.64%(37/110)。

        3 討論

        多種結(jié)核桿菌的快速診斷方法均已建立,主要以DNA或者RNA作為檢測靶標(biāo)的分子生物學(xué)技術(shù),有噬菌體快速診斷法、基因芯片法[2-4]等。目前,一種以RNA為標(biāo)本類型的檢測手段受到人們的關(guān)注,其原理是以MTB特異的16srRNA為檢測目標(biāo),通過實時熒光定量PCR技術(shù),快速判斷MTB是否存在[5],又可反映是否存在活菌,優(yōu)于直接涂片熒光法和BD960法,與前者比較,操作時間從1 d縮短到1.5 ~ 2 h[6];與后者比較,SAT?TB法檢測痰液/支沖液操作完成總共時間平均為1.5~2 h,BD960快培法平均報陽時間約為14~21 d,檢測時間上優(yōu)于BD960法[6-10]。

        現(xiàn)在常用熒光探針定量PCR技術(shù)與SAT?TB技術(shù)相比,均具有快速的優(yōu)點。前者擴增產(chǎn)物為DNA無法做活菌診斷,更不能反映活菌的量,無法監(jiān)測患者的用藥療效,不利于臨床調(diào)整用藥方案。并且DNA也較易在實驗室中產(chǎn)生污染;后者則可彌補其不足。

        本研究結(jié)果顯示:BD960快培法和SAT法在痰液、支沖液的陽性檢出率分別為:29.58%(50/169)和 23.18%(35/151)、36.09%(61/169)和37.75%(57/151)。痰標(biāo)本兩者的陽性率比較,SAT?TB法陽性檢出率較BD960快速培養(yǎng)法高6.51%,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=59.34,P< 0.05);支沖液兩者的陽性率比較,SAT陽性檢出率較BD960快速培養(yǎng)法高15.89%,“率”之間的比較,差異存在統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=36.69,P<0.05)。SAT法在痰液、支沖液標(biāo)本的敏感度分別為:84%(42/50);89%(33/37)。用 LE PALUD 等[11]用 Xpert Mtb/RIF檢測BALF對培陽標(biāo)本的敏感度為80%,特異度為98.6%;其他方法如KIM等[12]研究巢式PCR法診斷結(jié)核病的敏感度僅為69.4%。以IS6110為基礎(chǔ)的環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法(LAMP)[13]檢測呼吸道標(biāo)本診斷肺結(jié)核的敏感度可達89.6%。因此,與其他最新使用的分子生物學(xué)診斷技術(shù)比較,SAT?TB法檢測BALF診斷結(jié)核病的敏感度與最新使用的其他分子生物學(xué)技術(shù)Xpert Mtb/RIF相似,比經(jīng)典PCR法敏感度高。所以,SAT?TB法檢測支沖液能提供較高的敏感度和特異度。

        此外,在痰、支沖液中SAT?TB法檢測結(jié)果與BD960法的一致率達81.66%、76.16%,也就是說SAT?TB法能夠在最短的時間內(nèi)提供準確率為81.66%或76.16%的診斷結(jié)果;SAT法在痰液、支沖液的陽性檢出率36.09%、39.07%略高于BD960快培法29.58%、23.18%。

        從數(shù)據(jù)中卻不難發(fā)現(xiàn),50例痰培陽標(biāo)本中有8例SAT?TB法陰性,37例痰培陽標(biāo)本中有4例SAT?TB陰性,說明產(chǎn)生假陰性結(jié)果,與BD960快速培養(yǎng)法比較痰、支沖液的SAT?TB法的檢出率分別為84%、89%,而非100%,而痰中14例、支沖液中24例卻被SAT?TB法檢出陽性。因此,若以臨床診斷肺結(jié)核為計算肺結(jié)核陽性標(biāo)準,臨床上仍有約10%~20%的培陽患者無法通過SAT?TB法檢出,但結(jié)果證明SAT?TB法對肺結(jié)核的檢出率略高于BD960快速培養(yǎng)法。兩者存在各自的優(yōu)點,究其原因可能有:(1)SAT?TB法的靶標(biāo)為RNA,它降解的速度快,對于菌量未足的標(biāo)本會因處理時間過長,RNA降解后而不被檢出,這與操作者控制試驗的時間至關(guān)重要。而BD960快速培養(yǎng)法中不存在RNA降解的問題,只是在固定時間范圍內(nèi)達到一定的菌量即可在液體培養(yǎng)基生長。因此,因不同操作者而得出的不同的陽性檢出率。(2)當(dāng)患者可能是結(jié)核桿菌與非結(jié)核桿菌感染混合感染時,會干擾SAT?TB法對結(jié)核桿菌的檢出,而培養(yǎng)法可以為陽性。因此,BD960快速培養(yǎng)法與SAT?TB法可以同時用于臨床輔助診斷,但本研究證明:SAT?TB法檢測痰液和支沖液標(biāo)本中的結(jié)核分枝桿菌,具有快速、敏感度高、特異度和陽性率較好的優(yōu)點,可區(qū)分結(jié)核和非結(jié)核桿菌。因此,SAT?TB法為一項有價值的輔助臨床診斷的工具之一。

        綜上所述,該技術(shù)的今后臨床使用中,若能增加患者的標(biāo)本量或在用藥的不同時段增加該項目的檢測,對藥物治療的跟蹤監(jiān)測具有非常重要的意義,這是單純依靠BD960快速培養(yǎng)法在此方面是無法比擬的;若能把SAT?TB法聯(lián)合BD960法一起使用,可能會進一步提高檢測的敏感度。因此,SAT?TB法技術(shù)在臨床上是值得廣泛推廣應(yīng)用的。

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