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        耐多藥及廣泛耐藥MTB菌株對(duì)SQ109的耐藥性及其與北京基因型的關(guān)系

        2018-05-08 10:21:41董文竹王政文舒安張婷婷霍鳳敏董玲玲李云絮趙立平黃海榮高飛逄宇
        中國(guó)防癆雜志 2018年5期
        關(guān)鍵詞:結(jié)核病基因型耐藥

        董文竹 王政 文舒安 張婷婷 霍鳳敏 董玲玲 李云絮 趙立平 黃海榮 高飛 逄宇

        結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌(MTB)引起的慢性傳染病,主要的治療方法是依靠抗結(jié)核藥物進(jìn)行規(guī)范的化療。但是常用的抗結(jié)核藥物異煙肼(INH)、利福平(RFP)、吡嗪酰胺(PZA)等已經(jīng)越來(lái)越多地被結(jié)核分枝桿菌所耐受。世界衛(wèi)生組織(WHO)2017年全球結(jié)核病報(bào)告估算全球新發(fā)耐多藥結(jié)核病(MDR-TB)患者約為49萬(wàn)例,其中,MDR-TB疫情最嚴(yán)重地區(qū)是印度、中國(guó)及俄羅斯;而其中約有5.6%的患者為廣泛耐藥結(jié)核病(XDR-TB)。治療MDR-TB及XDR-TB的一個(gè)重要途徑就是研發(fā)新的治療藥物。SQ109作為乙胺丁醇(EMB)類似物中篩選出的抗結(jié)核新藥,在體外實(shí)驗(yàn)中表現(xiàn)出與INH和RFP具有協(xié)同作用,并且未見(jiàn)對(duì)其他抗結(jié)核藥物的拮抗作用[1],但是其對(duì)MDR-MTB及XDR-MTB臨床分離菌株的抑菌效果在我國(guó)缺乏進(jìn)一步研究。因此,筆者選取MDR-MTB及XDR-MTB臨床分離株,以微孔板阿爾瑪藍(lán)顯色法(micro-plate alamar blue assay,MABA)檢測(cè)菌株對(duì)于SQ109的最小抑菌濃度(minimal inhibit concentration,MIC),探究SQ109的體外抑菌效果。

        材料和方法

        1.菌株:收集首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京胸科醫(yī)院2014年7月至2016年12月臨床分離培養(yǎng)陽(yáng)性的MTB菌株。根據(jù)WHO建議,將對(duì)INH及RFP同時(shí)耐藥的109株菌株作為MDR菌株;將對(duì)INH及RFP同時(shí)耐藥,對(duì)氧氟沙星耐藥且對(duì)于阿米卡星、卷曲霉素、卡那霉素中的至少1種耐藥的114株菌株作為XDR菌株,兩種菌株共計(jì)223株。本研究中所有耐藥菌株均在國(guó)家結(jié)核病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室以絕對(duì)濃度法進(jìn)行藥物敏感性試驗(yàn)(簡(jiǎn)稱“藥敏試驗(yàn)”),且通過(guò)對(duì)硝基苯甲酸(PNB)和噻吩-2-羧酸肼(TCH)進(jìn)行抑制生長(zhǎng)試驗(yàn)鑒定為結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群。

        2.試劑儀器:藥敏試驗(yàn)所用SQ109、7H9培養(yǎng)基藥粉購(gòu)自美國(guó)Sigma公司;中性羅氏培養(yǎng)基購(gòu)自珠海銀科公司;營(yíng)養(yǎng)添加劑OADC購(gòu)自美國(guó)BD公司;96孔板購(gòu)自美國(guó)Coster公司;阿爾瑪藍(lán)購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司。

        3.MABA藥敏試驗(yàn):SQ109的藥物終濃度為0.016~16.000 mg/L。將SQ109溶解后,用最高濃度進(jìn)行2倍梯度稀釋,制成含藥的96孔板。將選取的菌株接種在中性羅氏培養(yǎng)基上,37 ℃培養(yǎng)4周,刮取新鮮菌落,用磨菌瓶研磨均勻。將菌液稀釋至1麥?zhǔn)蠁挝缓笤俅蜗♂?/20,加入預(yù)先加入藥物的96孔板中,每孔100 μl。每株菌株設(shè)立1個(gè)不含藥物的陽(yáng)性對(duì)照孔。加入菌液后37 ℃培養(yǎng)7 d,每孔加入由20 μl 阿爾瑪藍(lán)和50 μl 5% Tween-80預(yù)混好的顯色液,37 ℃培養(yǎng)24 h后進(jìn)行結(jié)果判讀。判斷標(biāo)準(zhǔn)是孔內(nèi)液體呈紅色為有菌生長(zhǎng),呈藍(lán)色則無(wú)菌生長(zhǎng),以最后一個(gè)藍(lán)色孔的藥物濃度作為MIC值。按照以MIC值為橫坐標(biāo),菌株數(shù)或菌株所占百分比為縱坐標(biāo)做圖,如果呈單峰態(tài)分布,流行病學(xué)界值(ECOFF值)被定義為能抑制99.9%的細(xì)菌群的濃度;對(duì)于雙峰態(tài)分布,ECOFF值則在2個(gè)峰值中間[2]。

        4.菌株DNA提取:采用煮沸法粗提細(xì)菌DNA。刮取一環(huán)新鮮菌落到500 μl 三羥甲基氨基甲烷(Tris)-乙二胺四乙酸(EDTA)(TE)緩沖液中,金屬浴加熱煮沸30 min以裂解細(xì)菌。然后,離心半徑8 cm,13 000 r/min離心5 min,取含有細(xì)菌DNA的上清液放入新的1.5 ml離心管中,作為PCR的DNA模板使用。

        圖1 223株XDR和MDR臨床分離菌株對(duì)SQ109的MIC值頻數(shù)分布情況

        5.北京基因型與非北京基因型菌株的分離:采用RD207基因作為北京基因型和非北京基因型的分離標(biāo)準(zhǔn),即缺乏RD207基因者為北京基因型,含有RD207基因者為非北京基因型。RD207引物序列為:P1:CATGCGGCGATCTCATTGTT;P2:GCACTGTTACCCGCACTTTC。50 μl的PCR體系按照25 μl 2×PCR混合物,5 μl的DNA模板,各0.2 μl的上下游引物。PCR的擴(kuò)增條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性1 min,58 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,共35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物采用前述方法進(jìn)行判讀。

        6.EMB耐藥及敏感菌株的耐藥率比較:采用臨床羅氏培養(yǎng)及液體藥敏試驗(yàn)結(jié)果中的EMB耐藥情況作為菌株分離標(biāo)準(zhǔn),將菌株分為EMB耐藥菌株和EMB敏感菌株,比較兩者對(duì)SQ109耐藥率的差異。

        7.統(tǒng)計(jì)學(xué)處理:應(yīng)用SPSS 15.0軟件進(jìn)行分析,計(jì)算MDR及XDR菌株、北京基因型及非北京基因型菌株、EMB敏感及耐藥菌株對(duì)SQ109的耐藥率;不同特征菌株耐藥率的比較,以及北京基因型和非北京基因型菌株在不同MIC值分布差異的比較均采用Fisher精確概率法檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        結(jié) 果

        1. MIC值檢測(cè)結(jié)果:223株XDR和MDR菌株的MIC值分布在<0.016~16.000 mg/L之間,主要集中在0.120 mg/L(38.1%,85/223)及0.250 mg/L(43.0%,96/223)。根據(jù)菌株對(duì)SQ109的MIC值頻數(shù)分布情況,確定ECOFF值為1.000 mg/L(圖1)。對(duì)SQ109總耐藥菌株數(shù)為5株,總耐藥率為2.2%(5/223)。其MIC值分別為4.000 mg/L(1/5)、8.000 mg/L(3/5)、16.000 mg/L(1/5)。XDR菌株中有5株對(duì)SQ109耐藥,耐藥率為4.4%(5/114);MDR菌株中無(wú)耐藥菌株,耐藥率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Fisher精確概率法,P>0.05),見(jiàn)表1。

        2.不同基因型分離結(jié)果:109株MDR菌株中共分離出8株非北京基因型菌株,114株XDR菌株中共分離出10株非北京基因型菌株。205株北京基因型菌株MIC值范圍為<0.016~16.000 mg/L,主要集中在0.120 mg/L(39.0%,80/205)和0.250 mg/L(43.9%,90/205);對(duì)SQ109耐藥菌株數(shù)為5株,耐藥率為2.4%。非北京基因型菌株的MIC值范圍為0.030~0.500 mg/L,主要集中在0.120 mg/L(27.8%,5/18)和0.250 mg/L(33.3%,6/18);未發(fā)現(xiàn)對(duì)SQ109耐藥菌株。經(jīng)比較,北京基因型和非北京基因型菌株耐藥率的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Fisher精確概率法,P>0.05),見(jiàn)表2。

        3.EMB敏感及耐藥菌株MIC值分布:223株菌株中共有138株EMB敏感菌株和85株EMB耐藥菌株。EMB敏感菌株的MIC值范圍為<0.016~8.000 mg/L,主要集中在0.120 mg/L(36.2%,50/138)和0.250 mg/L(46.4%,64/138);對(duì)SQ109耐藥菌株為1株,其MIC值為8.000 mg/L,耐藥率為0.7%(1/138)。EMB耐藥菌株的MIC值范圍為0.016~16.000 mg/L,主要分布于0.120 mg/L(41.2%,35/85)和0.250 mg/L(37.6%,32/85);對(duì)SQ109耐藥菌株為4株,耐藥率為4.7%(4/85)。經(jīng)比較,EMB敏感和耐藥菌株對(duì)SQ109耐藥率的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Fisher精確概率法,P>0.05),見(jiàn)表3。

        討 論

        MDR-MTB及XDR-MTB感染已成為全世界結(jié)核病治療的難題。為解決這個(gè)難題,新藥的研發(fā)成為關(guān)注的焦點(diǎn)。SQ109是從EMB類似物中篩選出來(lái)的具有潛力的新藥。該藥具有腸道吸收效果好,以及與INH、RFP具有協(xié)同作用,并與其他一線抗結(jié)核藥物無(wú)拮抗作用的優(yōu)點(diǎn)。研究顯示,SQ109與RFP聯(lián)合使用時(shí),在極低濃度下可對(duì)超過(guò)99%的MTB具有生長(zhǎng)抑制作用,且對(duì)耐RFP的菌株均有效[1]。這使得SQ109對(duì)MDR-MTB及XDR-MTB具有較強(qiáng)的抑菌作用。SQ109的Ⅰ期臨床研究顯示,其在人體內(nèi)無(wú)論是單一劑量還是多劑量使用時(shí)均具有良好的安全性及耐受性;而Ⅱ期臨床研究表明,SQ109單一療法每日劑量為75、150和300 mg或和標(biāo)準(zhǔn)劑量的RFP聯(lián)合使用時(shí)也表現(xiàn)出良好的安全性及耐受性[3-4]。

        在本次研究中,XDR菌株對(duì)于SQ109的耐藥率為4.4%,低于同類試驗(yàn)中的環(huán)絲氨酸(22.4%)、利奈唑胺(5.6%)、氯法齊明(5.6%),與德拉馬尼(4.4%)、貝達(dá)喹啉(3.3%)結(jié)果相當(dāng)[5-6]。顯示出SQ109對(duì)XDR菌株生長(zhǎng)抑制作用較好。這對(duì)于目前幾乎“無(wú)藥可治”的XDR-TB具有重要意義。而本次實(shí)驗(yàn)中,MDR菌株對(duì)SQ109的耐藥率和XDR菌株相比,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,考慮可能由于樣本量較少所致,需要進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量進(jìn)行驗(yàn)證。

        ECOFF值是通過(guò)藥物MIC值估計(jì)的藥物最佳抑菌濃度,也就是當(dāng)藥物濃度達(dá)到ECOFF值時(shí),能夠抑制大部分細(xì)菌生長(zhǎng)。本次研究通過(guò)MIC值確定的ECOFF值為1.000 mg/L,即當(dāng)藥物濃度為1.000 mg/L時(shí),可以有效抑制98.2%的菌株的生長(zhǎng),與國(guó)外同類研究結(jié)果相符[7]。而既往研究顯示,對(duì)MTB感染小鼠每天口服25 mg/kg的SQ109處理后,其血藥濃度峰值為0.135 mg/L。而通過(guò)檢測(cè)口服藥物的小鼠組織中的SQ109水平,發(fā)現(xiàn)肺部藥物濃度最高,其次為脾臟,肺部藥物濃度至少可以達(dá)到其MIC值的10倍水平,在用藥期間可以達(dá)到其血藥濃度的120倍,可以有效抑制MTB生長(zhǎng);而心臟、腦、血漿中藥物濃度較低[8-9]。所以,這個(gè)有效藥物濃度在小鼠實(shí)驗(yàn)中的肺和脾臟中是可以達(dá)到的,但是在血漿、心臟、腦等組織中難以達(dá)到,也就是說(shuō)SQ109可能對(duì)于肺結(jié)核的效果優(yōu)于心包結(jié)核、結(jié)核性腦膜炎等肺外結(jié)核。而目前在小鼠實(shí)驗(yàn)中也證實(shí)了SQ109在停止給藥后藥效仍能延續(xù)10~15 d[10]。這對(duì)于降低藥物口服頻率,簡(jiǎn)化治療方案較為有利。但是,目前缺乏SQ109在人體中藥物濃度的研究數(shù)據(jù),所以此ECOFF值還需要根據(jù)人體血藥濃度及組織中藥物濃度進(jìn)行驗(yàn)證。

        在223株XDR及MDR結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群臨床分離菌株中,實(shí)驗(yàn)分離出205株北京基因型菌株。研究發(fā)現(xiàn),在俄羅斯、越南、伊朗、愛(ài)沙尼亞、美國(guó)紐約等地區(qū),北京基因型菌株與對(duì)藥物的耐藥率間存在明顯相關(guān)性,但是在印度尼西亞、阿塞拜疆、哥倫比亞等地區(qū),北京基因型菌株和非北京基因型菌株在耐藥率方面的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[5];中國(guó)香港地區(qū)北京基因型分離株的耐藥率低于非北京基因分離株[5]。說(shuō)明北京基因型菌株和耐藥率相關(guān)情況可能具有地區(qū)差異性。在對(duì)環(huán)絲氨酸、對(duì)氨基水楊酸藥物的研究中顯示,北京基因型和非北京基因型菌株耐藥率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[5];但是在對(duì)RFP研究中顯示,兩者差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[11],說(shuō)明北京基因型菌株和耐藥率的相關(guān)情況也可能受到藥物類型及使用情況的影響。本次研究顯示SQ109的耐藥情況可能與北京基因型無(wú)關(guān)。但是,本次研究中非北京基因型菌株僅為18株,樣本量較少,因此,有待擴(kuò)大樣本量做進(jìn)一步研究。SQ109作為EMB的類似物,是否和EMB形成交叉耐藥也是臨床用藥的一個(gè)考慮要點(diǎn)。本次研究中,通過(guò)對(duì)MDR和XDR菌株中EMB敏感菌株和耐藥菌株的分離對(duì)比發(fā)現(xiàn),EMB敏感和耐藥的菌株對(duì)SQ109的耐藥率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        最后,本研究?jī)H對(duì)SQ109的體外抑菌情況進(jìn)行了分析討論,在研究中出現(xiàn)的5株SQ109耐藥菌株的耐藥機(jī)制尚不明確,需要進(jìn)一步做試驗(yàn)驗(yàn)證。

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