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        基于高通量檢測發(fā)現(xiàn)并驗證膽道閉鎖血清標(biāo)志物

        2018-04-25 09:41:18余發(fā)星
        中國循證兒科雜志 2018年5期
        關(guān)鍵詞:膽道芯片抗體

        鄭 超 董 瑞 余發(fā)星 鄭 珊

        膽道閉鎖是一種以嬰兒肝內(nèi)膽汁淤積、肝內(nèi)外膽管阻塞、肝臟進(jìn)行性纖維化并惡性進(jìn)展至肝硬化為特征的罕見的破壞性炎癥性疾病[1],若不及時采取有效治療手段,多在2歲時因進(jìn)行性肝硬化而死亡[2]。早期篩查膽道閉鎖并盡快施行Kasai手術(shù)能夠很大程度地改善患兒的長期預(yù)后[3]。隨著許多與膽道閉鎖發(fā)病機制密切相關(guān)的差異表達(dá)蛋白被不斷發(fā)現(xiàn),采用分子標(biāo)志物獨立或聯(lián)合早期篩查膽道閉鎖成為可能。傳統(tǒng)的ELISA法、蛋白印跡法或免疫組織化學(xué)染色法,1次實驗只能檢測1種或幾種蛋白含量,無法進(jìn)行大規(guī)模、高通量的結(jié)果分析??贵w芯片技術(shù)具有微型化、集成化、高通量化的特點,在研究信號轉(zhuǎn)導(dǎo)異常、蛋白質(zhì)組學(xué)、腫瘤標(biāo)志物和細(xì)胞周期調(diào)控等領(lǐng)域有廣泛的應(yīng)用。本研究利用抗體芯片技術(shù)檢測膽道閉鎖患兒血清中細(xì)胞因子的表達(dá)水平,為進(jìn)一步探索膽道閉鎖的發(fā)病機制及診斷策略奠定新的研究基礎(chǔ)。

        1 方法

        1.1 倫理和知情同意 本研究方案經(jīng)復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院(我院)倫理委員會批準(zhǔn)。所有研究對象的父母均簽署知情同意書。

        1.2 研究對象納入標(biāo)準(zhǔn) 2017年1~5月于我院外科初診且未治療,經(jīng)我院外科術(shù)中探查、膽道造影及術(shù)后病理切片診斷為膽道閉鎖(膽道閉鎖組)或膽總管囊腫(對照組),且均無肝外合并畸形。

        1.3 血清樣本采集 采用惰性分離膠促凝采血管,在消毒無菌情況下,采集患兒入院后未輸血情況下的術(shù)前靜脈血5 mL,室溫下靜置30 min后,3 000 r·min-1離心15 min,取上清分裝,置于-80 ℃保存待用。

        1.4 抗體芯片檢測方法 抗體芯片購自廣州瑞博奧生物科技有限公司 (Quantibody?Human Cytokine Antibody Array X00,catalog#:QAH-CAA-X00)。該抗體芯片可檢測血清樣本中的1 002種蛋白指標(biāo),通過抗體芯片檢測陣列圖并釋放熒光信號,收集熒光信號數(shù)據(jù)后,經(jīng)過歸一化處理及t檢驗分析。

        1.5 酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA) 根據(jù)抗體芯片檢測結(jié)果,通過復(fù)習(xí)文獻(xiàn)選取部分分子標(biāo)志物,采用ELISA(試劑盒購自廣州瑞博奧生物科技有限公司,ELH-IL6-1,ELH-IL8-1,ELH-IL10-1)進(jìn)行擴(kuò)大樣本(2015年1月至2017年1月收集我院膽道閉鎖和膽總管囊腫患兒的血清樣本)的驗證。

        2 結(jié)果

        2.1 一般資料 膽道閉鎖組5例(表1,例1~5),平均年齡(88.2±22.3) d,男4例,女1例;對照組3例(表1,例6~8),平均年齡(104±9.5) d,男2例,女1例。兩組患兒年齡分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.299,t=2.447)。

        表1 膽道閉鎖組和對照組患兒的基本情況

        注 ALT:IU·L-1;AST:IU·L-1;γ-GT:γ-谷氨酰轉(zhuǎn)移酶,IU·L-1;TBil:總膽紅素,μmol·L-1;DBil:直接膽紅素,μmol·L-1;WBC:×109·L-1

        2.2 抗體芯片檢測情況 表2顯示,47/1 002個蛋白在兩組樣本中的表達(dá)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P均<0.05),且兩者相差倍數(shù)均>1.2倍,在膽道閉鎖組中表達(dá)上調(diào)的蛋白34個,下調(diào)13個。圖1顯示表達(dá)差異蛋白的火山分布圖。

        圖1 膽道閉鎖和對照組血清抗體芯片1 002個蛋白火山分布圖

        注 綠色圓點代表差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,即-log 10Pvalue>1.30)且兩者倍數(shù)相差>1.2倍(即log 2 Foldchange的絕對值>0.263)的47個蛋白;紅色圓點代表差異無統(tǒng)計學(xué)意義的蛋白

        2.3 抗體芯片蛋白信號通路和生物功能富集分析結(jié)果 對膽道閉鎖組和對照組血清差異表達(dá)蛋白進(jìn)行KEGG信號通路富集分析和GO生物分子功能以及生物功能分析。

        圖2顯示,232個差異有統(tǒng)計學(xué)意義的富集GO生化過程中所包含差異蛋白個數(shù)最多的前10個生化過程,即與膽道閉鎖差異表達(dá)蛋白相關(guān)程度最高的生化過程,結(jié)果提示膽道閉鎖主要與白細(xì)胞介導(dǎo)免疫、白細(xì)胞遷移和適應(yīng)性免疫應(yīng)答等生化過程高度相關(guān)。

        圖3顯示差異有統(tǒng)計學(xué)意義的5個包含差異蛋白相關(guān)的細(xì)胞組成成分,即與膽道閉鎖差異表達(dá)蛋白相關(guān)程度最高的細(xì)胞組成成分,包括受體復(fù)合物、蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)、胞膜受體復(fù)合物、基底膜和HEF-轉(zhuǎn)鐵蛋白受體復(fù)合物。

        圖4顯示24個差異有統(tǒng)計學(xué)意義的富集GO分子功能中所包含差異蛋白個數(shù)最多的前10個生物分子功能,結(jié)果提示膽道閉鎖主要與代謝物結(jié)合、受體信號蛋白活性和趨化因子活性等分子功能高度相關(guān)。

        圖5顯示差異有統(tǒng)計學(xué)意義的4個包含差異蛋白相關(guān)的KEGG信號通路,即與膽道閉鎖差異表達(dá)蛋白相關(guān)程度最高的信號通路,包括細(xì)胞因子-受體相互作用、流體剪應(yīng)力和動脈粥樣硬化、TNF信號通路和瘧疾。

        表2 膽道閉鎖組和對照組血清中的差異表達(dá)蛋白

        注 1):膽道閉鎖組蛋白表達(dá)均值/對照組蛋白表達(dá)均值

        圖2 膽道閉鎖組和對照組血清差異表達(dá)蛋白相關(guān)的生化過程(部分顯示)

        注 橫坐標(biāo)表示對應(yīng)差異基因數(shù)/能夠?qū)?yīng)到GO數(shù)據(jù)庫中同類型的差異基因數(shù)

        圖3 膽道閉鎖組和對照組血清差異表達(dá)蛋白相關(guān)的細(xì)胞組成成分

        注 橫坐標(biāo)表示對應(yīng)差異基因數(shù)/能夠?qū)?yīng)到GO數(shù)據(jù)庫中同類型的差異基因數(shù)

        圖4 膽道閉鎖組和對照組血清差異表達(dá)蛋白相關(guān)的生物分子功能(部分顯示)

        注 橫坐標(biāo)表示對應(yīng)差異基因數(shù)/能夠?qū)?yīng)到GO數(shù)據(jù)庫中同類型的差異基因數(shù)

        圖5 膽道閉鎖組和對照組血清差異表達(dá)蛋白相關(guān)的信號通路

        注 橫坐標(biāo)表示所包含的差異蛋白個數(shù)

        2.4 擴(kuò)大樣本驗證結(jié)果 根據(jù)抗體芯片檢測結(jié)果,本研究選取IL-6、IL-8和IL-10指標(biāo)[20~23]進(jìn)行驗證,表3顯示,50例膽道閉鎖患兒和30例膽總管囊腫患兒血清IL-6、IL-8和IL-10濃度差異均有統(tǒng)計學(xué)意義。IL-6、IL-8和IL-10在膽道閉鎖患兒血清中濃度均高于膽總管囊腫患兒。

        膽道閉鎖(n=50)膽總管囊腫(n=30)tPIL-6387.753±215.113141.778±116.1144.916<0.000 1IL-8279.102±204.65795.963±109.7424.607<0.000 1IL-1095.416±104.81745.135±41.5572.3780.020 2

        3 討論

        膽道閉鎖是一種重大先天性膽道畸形疾病,其較差的預(yù)后及后期可能的肝移植所帶來的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)已成為威脅新生兒健康的重大問題。實驗室常規(guī)血液檢查發(fā)現(xiàn),膽道閉鎖患兒結(jié)合膽紅素升高,堿性磷酸酶和γ-谷氨酰轉(zhuǎn)肽酶亦可升高,但缺乏特異性,無法與其他嬰兒肝臟疾病進(jìn)行鑒別,必須進(jìn)一步行超聲檢查[4,5]和經(jīng)皮穿刺肝臟活檢[6]等。盡早診斷、行Kasai手術(shù)治療,方能較大改善膽道閉鎖患兒的長期預(yù)后[3,7~9]。

        膽道閉鎖的血清學(xué)檢查常作為輔助診斷手段,如ALT、AST、堿性磷酸酶、γ-谷氨酰轉(zhuǎn)移酶、膽紅素和膽汁酸等,并不能作為確診手段[10,11]。血清中含有種類繁多的蛋白質(zhì), 且這些蛋白質(zhì)的含量存在著巨大的差異。高通量技術(shù)的發(fā)展使得血清中差異表達(dá)蛋白的研究更全面和廣泛??贵w芯片技術(shù)的應(yīng)用主要是發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)新的功能、了解蛋白功能的分子機制、分析特定刺激因素激發(fā)的信號通路、篩選藥物候選的效應(yīng)分子和發(fā)現(xiàn)新的腫瘤生物標(biāo)志物等[12]。近年來,抗體芯片技術(shù)在腫瘤、免疫性疾病、神經(jīng)性疾病等罕見病中的應(yīng)用已有不少文獻(xiàn)報道[13,14]。本研究采用抗體芯片檢測血清指標(biāo),結(jié)合其潛在的相關(guān)生物學(xué)功能信號通路分析,進(jìn)一步探索膽道閉鎖的發(fā)病機制以及診斷策略。

        本研究通過比較兩組蛋白表達(dá)情況,篩選出47個差異表達(dá)蛋白,在膽道閉鎖患兒血清中表達(dá)上調(diào)34個,下調(diào)13個,部分結(jié)果與既往文獻(xiàn)報道一致。Kobayashi等[15]和Ghoneim等[16]均報道膽道閉鎖血清中ICAM-1含量高于對照組,與本研究檢測結(jié)果一致,表明ICAM-1對膽道閉鎖患兒具有診斷價值。而Leonhardt等[17]在膽道閉鎖RRV注射小鼠動物模型的RNA檢測中檢出Granzyme A的基因表達(dá)在造模組小鼠肝臟中升高,本研究檢測結(jié)果可能進(jìn)一步揭示GranzymeA表達(dá)在膽道閉鎖中不僅在基因?qū)用嫔仙撸诘鞍讓用嫔弦嗌?。Kobayashi等[18]還檢測到膽道閉鎖患兒血清中IP-10升高且其含量與膽道閉鎖患兒術(shù)后肝功能及門靜脈壓力密切相關(guān),肝功能損害越嚴(yán)重患兒血清中IP-10含量越高,本研究檢測結(jié)果同樣顯示膽道閉鎖血清中IP-10含量增加,但是由于樣本數(shù)量有限,因此無法判斷其是否與膽道閉鎖患兒術(shù)后肝功能損害相關(guān)。既往文獻(xiàn)報道MMP-7[19]、IL-6[20]、IL-8[20~22]和IL-10[23]在膽道閉鎖患兒血清中升高,與本研究抗體芯片檢測結(jié)果一致。本研究通過擴(kuò)大樣本量檢測血清IL-6、IL-8和IL-10水平,結(jié)果顯示膽道閉鎖患兒血清中IL-6、IL-8和IL-10水平均升高,與抗體芯片結(jié)果一致,但考慮到實驗方法及所選樣本數(shù)量和來源有所差別,因此其相差的倍數(shù)與抗體芯片結(jié)果有所差異。

        本研究的結(jié)果初步表明,利用血清抗體芯片分析技術(shù),不僅能夠?qū)ρ鍢颖局蟹彪s的多種蛋白進(jìn)行微型化、集成化、高通量化地檢測分析,也可能篩選出一些具有臨床診斷價值的膽道閉鎖血清標(biāo)志蛋白,為進(jìn)一步探索膽道閉鎖發(fā)病機制以及診斷策略奠定新的研究基礎(chǔ)。

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