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        維吾爾族及漢族帕金森病患者ATP13A2基因Ala1144Thr突變比較

        2018-04-17 02:49:46李桂花楊新玲
        中國(guó)老年學(xué)雜志 2018年7期
        關(guān)鍵詞:維族亞組漢族

        李桂花 夏 歡 楊新玲 

        (新疆醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院神經(jīng)中心,新疆 烏魯木齊 830000)

        1新疆醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院

        研究認(rèn)為,基因突變不僅是家族性帕金森病(FPD)的致病因素,在散發(fā)性帕金森病(SPD)患者中也可出現(xiàn)致病基因的突變〔1〕。研究也證實(shí)帕金森病(PD)相關(guān)基因的基因多態(tài)性與SPD患病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)〔2〕。ATP13A2基因目前研究認(rèn)為是PD發(fā)病的易感致病基因,在早發(fā)性PD(EOPD)和FPD 患者中均可發(fā)現(xiàn) ATP13A2 基因突變〔3〕。Ala1144Thr位點(diǎn)目前是ATP13A2基因研究最新的位點(diǎn)之一,但目前尚缺乏相關(guān)研究報(bào)道。新疆地處中亞,世代居住于該地區(qū)的維吾爾族(簡(jiǎn)稱維族)相比漢族具有遺傳背景的差異性,故該研究在本課題組前期工作的基礎(chǔ)上,探討ATP13A2基因位點(diǎn)Ala1144Thr位點(diǎn)突變及多態(tài)性與新疆地區(qū)維吾爾族和漢族人群SPD發(fā)病(尤其是早發(fā)性)的相關(guān)性。

        1 對(duì)象與方法

        1.1研究對(duì)象選擇2012年8月至2015年3月收集來自于新疆伊犁地區(qū)、和田地區(qū)、烏魯木齊市流行病學(xué)調(diào)查及就診于新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院的長(zhǎng)期生活在新疆地區(qū)(2代以上)、未與其他民族通婚的維族及漢族原發(fā)性PD患者,正常對(duì)照組為同期流調(diào)中及來自新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院的生活環(huán)境、飲食習(xí)慣和受教育程度與PD患者相似,性別、族別相同,年齡相差不超過5歲,且家族中無PD家族史的健康體檢者。PD組420例,男245例,女175例;維族200例,漢族220例;以50歲為界分為EOPD組和遲發(fā)性PD(LOPD)組,EOPD組101例,LOPD組319例;正常對(duì)照組400例,男208例,女192例;維族198例,漢族202例;≤50歲者110例;>50歲者290例。兩組年齡、性別比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

        1.2實(shí)驗(yàn)方法獲得患者知情同意后,抽取外周靜脈血2 ml置于含800 μl乙二醇四乙酸的抗凝管中,使用天根生化(北京)有限公司的血液基因組DNA提取試劑盒提取基因組DNA,嚴(yán)格按照試劑盒配套說明操作書操作。檢驗(yàn)DNA純度在1.7~1.9,濃度≥10 ng/Bul,判為DNA純度合格。樣本-20℃保存,備用。引物設(shè)計(jì)參照文獻(xiàn)由上海生工公司合成,Ala1144Thr位點(diǎn):上游引物:5′-GCAGGGAGTTCCAGTGTCTG-3′。下游引物:5′-GGTCTGGTCACCCTCAACTTC-3′;聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)體系共20 μl:2×Qat PCR Master Mix 10 μl,10 μmol/ml上下游引物各0.5 μl,100 ng/μl DNA 2 μl,去離子水補(bǔ)至20 μl。PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3 min,經(jīng)過25個(gè)循環(huán)(94℃變性30 s,60.3℃退火30 s,72℃延伸30 s),最后72℃延伸7 min,保存于4℃,PCR產(chǎn)物為323 bp。

        1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法使用SPSS17.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行χ2檢驗(yàn)和Fisher精確檢驗(yàn)。

        2 結(jié) 果

        2.1ATP13A2基因Ala1144Thr位點(diǎn)PCR擴(kuò)增及直接測(cè)序結(jié)果Ala1144Thr多態(tài)位點(diǎn)基因型分為野生型CC型,純合變異TT型和雜合變異CT型,應(yīng)用PCR擴(kuò)增產(chǎn)物直接測(cè)序的方法,在420例SPD患者和400例正常對(duì)照組中,僅發(fā)現(xiàn)1例男性維吾爾族PD患者(42歲,病程4年)發(fā)生雜合CT基因型變異,且這例PD患者是EOPD患者,未發(fā)現(xiàn)有純合變異TT基因型。所有漢族SPD患者和正常對(duì)照組未均未發(fā)現(xiàn)雜合變異CT基因型和純合變異TT基因型。ATP13A2基因Ala1144Thr位點(diǎn)經(jīng)PCR 擴(kuò)增后產(chǎn)物片段的理論值為323 bp,在2.0 %瓊脂糖凝膠上電泳可顯示該P(yáng)CR的擴(kuò)增產(chǎn)物,見圖1。ATP13A2基因Ala1144Thr位點(diǎn)直接測(cè)序圖:Ala1144Thr多態(tài)基因型以CC野生型為主,雜合子變異CT基因型極少,未發(fā)現(xiàn)有純合子變異TT基因型。直接測(cè)序結(jié)果見圖2所示(SNP位點(diǎn)反向測(cè)序圖,圖中箭頭所指為堿基替換處):上圖為CC型;下圖為CT型;從下圖可以看出從左向右第5個(gè)本來是C的,結(jié)果突變成了T,測(cè)序結(jié)果為雜合變異,雙峰圖。

        1~7:PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖圖1 Ala1144Thr PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖

        上圖:CC型;下圖:CT型圖2 Ala1144Thr位點(diǎn)直接測(cè)序圖

        2.2ATP13A2基因Ala1144Thr位點(diǎn)基因型及等位基因頻率比較

        2.2.1PD組與正常對(duì)照組Ala1144Thr位點(diǎn)基因型及等位基因頻率比較ATP13A2基因Ala1144Thr位點(diǎn)在PD組和正常對(duì)照組基因型頻率及等位基因型頻率分布比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見表1。

        表1 不同年齡、不同性別新疆維吾爾族及漢族PD與正常對(duì)照組Ala1144Thr基因型及等位基因頻率比較〔n(%)〕

        2.2.2不同年齡、不同性別新疆維吾爾族及漢族PD與正常對(duì)照組Ala1144Thr基因型及等位基因頻率比較Ala1144Thr基因型及等位基因型頻率在男性PD組與女性PD組,男性PD組與男性正常對(duì)照組,女性PD組與女性正常對(duì)照組,EOPD亞組與LOPD亞組,EOPD亞組與≤50歲正常對(duì)照組,LOPD亞組與>50歲正常對(duì)照組,EOPD亞組男性組與EOPD亞組女性組,LOPD亞組男性組與LOPD亞組女性組之間比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見表1。

        2.2.3不同民族PD與對(duì)照組Ala1144Thr基因型及等位基因頻率比較Ala1144Thr位點(diǎn)基因型頻率及等位基因頻率在維族PD與漢族PD,維族PD與維族正常對(duì)照組,漢族PD與漢族正常對(duì)照組,維族EOPD亞組與漢族EOPD亞組,漢族EOPD亞組與≤50歲漢族正常對(duì)照組,維族EOPD亞組與≤50歲維族正常對(duì)照組,維族LOPD亞組與漢族LOPD亞組,漢族LOPD亞組與>50歲漢族正常對(duì)照組,維族LOPD組與>50歲維族正常對(duì)照組各個(gè)組之間比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見表1。

        2.3Ala1144Thr位點(diǎn)不同基因表型(野生型CC與雜合變異CT型)PD患者臨床資料比較在420例SPD患者和400例正常對(duì)照組中,Ala1144Thr位點(diǎn)發(fā)生雜合突變CT基因型的僅有1例EOPD患者,這1例EOPD患者基本情況及量表測(cè)評(píng)結(jié)果如下,野生CC基因型SPD患者共419例,由于變異樣本量極少,故不同基因表型PD臨床資料方面對(duì)比無法得出有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的結(jié)論。

        3 討 論

        ATP13A2基因位于1號(hào)染色體上,共編碼29個(gè)外顯子,Ala1144Thr位點(diǎn)位于1號(hào)染色體上第28號(hào)外顯子上,Ala1144Thr多態(tài)性位點(diǎn)為C→T轉(zhuǎn)換,丙氨酸被蘇氨酸代替(Ala→Thr)。到目前為止,ATP13A2基因的研究熱點(diǎn)主要集中在該基因位點(diǎn)突變與PD的相關(guān)性方面,但研究結(jié)果表明ATP13A2基因突變率極低,且僅發(fā)生在某些特殊種類的PD患者中〔4〕。本研究?jī)H發(fā)現(xiàn)1例維吾爾族PD患者發(fā)生Ala1144Thr位點(diǎn)雜合變異CT基因型,且這例PD患者為EOPD患者,該患者焦慮、抑郁、震顫、平衡障礙程度均較為嚴(yán)重,但由于變異樣本量少,與野生CC基因型的SPD患者無法做比較,故今后研究仍需繼續(xù)擴(kuò)大樣本量進(jìn)行相關(guān)研究。Ala1144Thr位點(diǎn)突變率在本研究中的SPD患者中占0.24%,與目前研究認(rèn)為的ATP13A2基因突變總體頻率較低結(jié)果基本一致。但因目前國(guó)內(nèi)外缺乏關(guān)于Ala1144Thr位點(diǎn)突變的相關(guān)報(bào)道,本研究結(jié)果尚需繼續(xù)擴(kuò)大樣本量,重復(fù)驗(yàn)證,減少假陽(yáng)性和假陰性可能,以找出真正與PD發(fā)病相關(guān)的易感基因多態(tài)及突變位點(diǎn)。

        維吾爾族與漢族存在不同的社會(huì)遺傳背景,研究結(jié)果表明ATP13A2基因Ala1144Thr位點(diǎn)基因型及等位基因型頻率在這兩個(gè)民族間可能存在較小的差異性;分析其原因考慮雖然不同民族間其遺傳結(jié)構(gòu)可能存在不同,但由于不同民族人群長(zhǎng)期所處環(huán)境相同,期間一些生活習(xí)慣的彼此融合,不可避免的都或多或少對(duì)基因有所影響,基因多態(tài)性分布可以趨向于差異減小。ATP13A2基因位點(diǎn)Ala1144Thr基因型及等位基因型頻率多態(tài)性可能與性別及年齡關(guān)系也不顯著。Ala1144Thr多態(tài)性與性別及年齡的關(guān)系目前國(guó)內(nèi)外尚缺乏相關(guān)報(bào)道,仍需繼續(xù)擴(kuò)大樣本量進(jìn)一步研究該位點(diǎn)多態(tài)與PD性別及年齡的關(guān)系。不同于FPD,占絕大數(shù)量的SPD病因上很大程度仍不清楚,只有基于流行病學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)的遺傳易感性的報(bào)道。但是應(yīng)該指出的是,PD的基因數(shù)據(jù)的報(bào)道提示沒有單一的常見基因多態(tài)能夠改變PD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)〔5,6〕。選擇基因同質(zhì)人群、進(jìn)行表型分析和謹(jǐn)慎的分析解釋數(shù)據(jù)以確保這些研究的正確發(fā)展。

        1Park JS,Mehta P,Cooper AA.Pathogenic effects of novel mutations in the P-type ATPase ATP13A2(PARK9)causing Kufor-Rakeb syndrome,a form of early-onset parkinsonism〔J〕.Hum Mutat,2011;32(12):956-64.

        2Ning YP,Kanai K,Tomiyama H,etal.PARK9-linked parkinsonism in eastern Asia:mutation detection in ATP13A2 and clinical phenotype〔J〕.Neurology,2008;70(12):1491-3.

        3Xiromerisiou G,Dardiotis E,Tsimourtou V,etal.Genetic basis of Parkinson disease〔J〕.Neurosurg Focus,2010;34(4):28-9.

        4Mao XY,Burgunder JM,Zhang ZJ,etal.ATP13A2 G2236A variant is rare in patients with early-onset Parkinson′s disease and familial Parkinson′s disease from Mainland China〔J〕.Parkinsonism Relat Disord,2010;16(2):235-6.

        5Crosiers D,Ceulemans B,Meeus B.Juvenile dystonia-parkinsonism and dementia caused by a novel ATP13A2 frameshift mutation〔J〕.Parkinsonism Relat Disord,2011;17(1):135-8.

        6Martin I,Dawson VL,Dawson TM.The impact of genetic research on our understanding of Parkinson′s disease〔J〕.Prog Brain Res,2010;183(1):21-4.

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