徐田甜,侯是媛,齊斌,鄭麗雪,季亞美,李政洪,王立梅*
1(常熟理工學(xué)院,蘇州市食品生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,發(fā)酵工程技術(shù)研究中心,江蘇 常熟,215500) 2(蘇州大學(xué) 醫(yī)學(xué)部藥學(xué)院,江蘇 蘇州,215123)
甲殼素又叫幾丁質(zhì),是由β-1,4糖苷鍵連接的N-乙酰-D-氨基葡萄糖高分子多聚體[1],是自然界中唯一的天然帶正電荷的多糖,每年自然界中儲(chǔ)存量超過(guò)百億噸,僅次于纖維素[2]。但甲殼素分子量極大,不溶于水,只溶于濃酸,這極大地限制了甲殼素的應(yīng)用。目前降解甲殼素生成甲殼低聚糖的方法主要有化學(xué)法、物理法和酶法等?;瘜W(xué)法主要有酸解法和氧化法,這2種方法反應(yīng)條件比較嚴(yán)苛,反應(yīng)產(chǎn)物不均一,產(chǎn)品穩(wěn)定性差,對(duì)環(huán)境污染嚴(yán)重。物理法主要是利用微波、超聲波等產(chǎn)生巨大能量使得β-1,4糖苷鍵等化學(xué)鍵大量斷裂從而生成低分子量的甲殼低聚糖,其產(chǎn)品均一,穩(wěn)定性好,對(duì)環(huán)境污染少[3]。VASILIEVA等[4]利用低溫電子束等離子體(EBP)降解甲殼素,研究表明EBP對(duì)甲殼素的作用降低了其結(jié)晶度指數(shù)和聚合度。但物理方法生產(chǎn)成本比較高,應(yīng)用于工業(yè)化生產(chǎn)可能性較低。酶法則是通過(guò)專(zhuān)一性或非專(zhuān)一性酶水解甲殼酶,非專(zhuān)一性酶包括纖維素酶、溶菌酶、脂肪酶等。甲殼素酶是降解甲殼素的專(zhuān)一性酶,能斷裂甲殼素的β-1,4糖苷鍵使其水解生成N-乙酰葡糖胺[5-6]。與非專(zhuān)一性酶作用比較,專(zhuān)一性甲殼素酶酶解法反應(yīng)溫和,產(chǎn)品均一,對(duì)環(huán)境沒(méi)有污染,大量節(jié)省生產(chǎn)成本和時(shí)間。因此,專(zhuān)一性甲殼素酶越來(lái)越受到人們的重視,本文主要對(duì)甲殼素酶的研究現(xiàn)狀進(jìn)行綜述。
能產(chǎn)生甲殼素酶的生物很多,包括微生物、動(dòng)物、植物等。1905年,BENECKE首次發(fā)現(xiàn)幾丁芽孢桿菌(Bacilluschitinovirous)能分解利用甲殼素[2]。1921年,F(xiàn)OLPMERS發(fā)現(xiàn)某些細(xì)菌和真菌能利用甲殼素在瓊脂平板上形成水解圈,進(jìn)而證明了甲殼素酶的存在[2]。1929年時(shí),KARRER和HOFFMAN又在蝸牛體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了甲殼素酶[2]。之后,人們發(fā)現(xiàn)有一些病毒也能產(chǎn)甲殼素酶。
近年來(lái),對(duì)產(chǎn)甲殼素酶的微生物研究越來(lái)越多。產(chǎn)甲殼素酶的微生物包括細(xì)菌、放線菌和真菌等,其中主要包括粘質(zhì)沙雷氏菌、芽孢桿菌、假單胞菌以及鏈霉菌等[7-10]。LU等[11]從黃瓜根部分離到1株新型稀有放線菌SaccharothrixyanglingensisHhs.015,將甲殼素酶的基因片段在大腸桿菌中過(guò)表達(dá),產(chǎn)生的可溶性蛋白Chi6769(77.9 kDa)對(duì)真菌蘋(píng)果腐爛病菌(Valsamali03-8)有強(qiáng)烈的抑制作用。SONG等[12]在腐爛蘑菇的土壤里分離到1株新型的耐冷甲殼素酶生產(chǎn)菌Pedobactersp.,25 ℃下,其產(chǎn)生的甲殼素酶的酶活最高,該甲殼素酶對(duì)立枯絲核菌和灰葡萄孢菌的抑制率分別達(dá)到60.9%和57.5%,這種甲殼素酶PR-M6在低溫下防治植物病原體表現(xiàn)出了極大的潛力。BOUACEM等[13]研究發(fā)現(xiàn)嗜熱氫化嗜麥芽寡頭菌株KB-DZ44中能產(chǎn)耐高溫的甲殼素酶ChiA-Hh59,純化后的甲殼素酶在60 ℃溫育36 h后其最大酶活為3 000 U/mL。
甲殼素酶有多種分類(lèi)方法,可根據(jù)其分泌性、切口位置、等電點(diǎn)以及氨基酸序列的不同來(lái)分類(lèi)。
根據(jù)甲殼素酶的分泌性可分為胞內(nèi)甲殼素酶和胞外甲殼素酶,絕大多數(shù)的微生物所產(chǎn)的甲殼素酶都為胞外酶[14]。因此在做甲殼素酶菌株篩選時(shí),大多采用比較水解圈大小來(lái)選擇目標(biāo)菌株。這種甲殼素酶都是屬于誘導(dǎo)型的,即在底物甲殼素的誘導(dǎo)下向胞外分泌酶來(lái)降解底物生成殼寡糖或單糖再進(jìn)行利用[2,15]。
根據(jù)甲殼素酶的切口位置以及初級(jí)產(chǎn)物不同,可以分為甲殼素內(nèi)切酶和甲殼素外切酶。甲殼素內(nèi)切酶從甲殼素糖鏈內(nèi)部隨機(jī)切斷,水解產(chǎn)物為二糖或寡糖等[16]。而甲殼素外切酶是從甲殼素的非還原端依次切斷得到單糖[17]。
按照酶等電點(diǎn)的不同,可以將甲殼素酶劃分為酸性、中性和堿性甲殼素酶。微生物產(chǎn)的甲殼素酶多為酸性酶,而植物產(chǎn)的甲殼素酶多為堿性酶,也有少部分產(chǎn)酸性酶,且二者有可能出現(xiàn)在同一植株中[18]。
根據(jù)氨基酸序列的同源性,甲殼素酶被分為18和19兩個(gè)家族。18家族的甲殼素酶廣泛存在于動(dòng)物、植物和微生物中,而19家族的甲殼素酶主要存在植物內(nèi),在少部分放線菌中也有存在。18家族的甲殼素酶的催化區(qū)域都包括2個(gè)Asp和1個(gè)Glu,其應(yīng)該為18家族甲殼素酶的關(guān)鍵活性氨基酸[19-20]。18家族甲殼素酶的水解產(chǎn)物與19家族甲殼素酶的水解產(chǎn)物完全不同,18家族的甲殼素酶的水解產(chǎn)物都是β異構(gòu)體,而19家族的甲殼素酶的水解產(chǎn)物均為α異構(gòu)體[18]。18、19家族的甲殼素酶的催化機(jī)制差別也很大,且完整的催化機(jī)制有待進(jìn)一步研究[20-21]。
在甲殼素酶的分子生物學(xué)研究中,研究最多的為甲殼素酶基因的克隆表達(dá),通常將細(xì)菌甲殼素酶基因在大腸桿菌系統(tǒng)中表達(dá),將真菌甲殼素酶基因在酵母系統(tǒng)中表達(dá)。而常規(guī)來(lái)源的篩選方法并不能快速地篩選到高效產(chǎn)酶基因。因此有部分研究者采用隨機(jī)突變的方法進(jìn)行高通量篩選或?qū)蚨c(diǎn)突變,從而篩選到優(yōu)良性狀的產(chǎn)酶基因。為了研究甲殼素酶的功能和性質(zhì),部分研究者通過(guò)構(gòu)建基因缺失突變體來(lái)進(jìn)行研究。
CHEN等[22]為了提高來(lái)自秀麗隱桿線蟲(chóng)(Caenorhabditiselegans)的甲殼素酶的降解能力和殺死線蟲(chóng)的活性,通過(guò)易錯(cuò)PCR技術(shù)構(gòu)建了一個(gè)隨機(jī)突變體文庫(kù)進(jìn)行高通量篩選。突變型甲殼素酶的半數(shù)致死濃度與野生型相比降低20%,殺死線蟲(chóng)的活性大大提升。研究還發(fā)現(xiàn),突變型甲殼素酶減少了底物與底物結(jié)合位點(diǎn)Asp141之間的距離,最終導(dǎo)致底物親和力,催化效率和比活性的增加。
定點(diǎn)突變是一種高效快速改變目的基因表達(dá)蛋白的產(chǎn)量和性狀的方法,通常采用PCR的方法向目的基因中引入所需的變化,通常為堿基的替換、增減等。FAN等[23]研究發(fā)現(xiàn)Lymantriadispar幾丁質(zhì)酶中的2個(gè)天冬氨酸殘基(D143,D145)和1個(gè)色氨酸(W146)是在家族18幾丁質(zhì)酶催化區(qū)的第2個(gè)保守基序內(nèi)觀察到的高度保守的殘基,其從L.dispar克隆了幾丁質(zhì)酶cDNA LdCht5,并且使用定點(diǎn)突變的方法用其他3種氨基酸分別、組合、全部取代3種殘基制備7種突變型甲殼素酶,研究發(fā)現(xiàn)突變酶酶活穩(wěn)定的pH范圍變廣,在特定pH值下,突變型甲殼素酶的穩(wěn)定性?xún)?yōu)于野生型。
反向遺傳學(xué)經(jīng)常通過(guò)制備目的基因功能缺失突變體來(lái)研究該基因的功能,CRISPR/Cas9工具基因編輯工具以及RNA干擾技術(shù)是目前常用的制備方法[24]。SUN等[25]利用CRISPR/Cas9工具敲除脊尾白蝦的幾丁質(zhì)酶基因(EcChi4)來(lái)制備EcChi4基因的功能缺失體從而研究EcChi4基因的免疫防御功能。研究發(fā)現(xiàn),在受到副溶血性弧菌或嗜水氣單胞菌攻擊時(shí),EcChi4缺失組的蝦的死亡率顯著高于野生型組,由此證明EcChi4基因具有免疫防御功能。RNAi(RNA干擾)是通過(guò)序列特異性方式沉默靶基因的技術(shù)。GANBAATAR等[26]選擇幾丁質(zhì)酶基因作為靶基因,將靶基因的干擾序列克隆到L4440載體中以產(chǎn)生序列特異性dsRNA(雙鏈 RNA),將重組L4440載體轉(zhuǎn)化入大腸桿菌菌株 HT115(DE3)中,將基因工程菌直接喂養(yǎng)給受體昆蟲(chóng)Mythimnaseparata。研究發(fā)現(xiàn)口服大腸桿菌表達(dá)的dsRNA的受體昆蟲(chóng)也會(huì)發(fā)生RNAi效應(yīng),M.separata內(nèi)源性基因表達(dá)被沉默,M.separata的甲殼素酶基因缺失突變體的死亡率增加和幼體體重下降。上述研究結(jié)果表明甲殼素酶具有抑菌活力,提高免疫防御以及促進(jìn)昆蟲(chóng)發(fā)育等功能。
為了使甲殼素酶廣泛應(yīng)用于工業(yè)化,其固定化研究也越來(lái)越受人們關(guān)注。MOHAMMADZADEH等[27]將純化的Chit36酶固定在Ca2+交聯(lián)的海藻酸鹽/海泡石(AlgSep)納米復(fù)合物珠粒中,以改善生物催化過(guò)程期間Chit36酶的催化活性和穩(wěn)定性,研究發(fā)現(xiàn)藻酸鹽納米復(fù)合物珠中的Chit36的催化活性比不含海泡石的藻酸鹽珠粒中的固定化Chit36高,該項(xiàng)研究在制藥等工業(yè)上具有廣泛的應(yīng)用前景。
甲殼素酶具有抗蟲(chóng)和抗真菌作用,由于真菌細(xì)胞壁和昆蟲(chóng)骨骼中都含有大量的甲殼素,在甲殼素酶的作用下水解甲殼素造成真菌和害蟲(chóng)的死亡[28-30]。甲殼素酶可以用來(lái)解決由害蟲(chóng)和真菌作用導(dǎo)致的農(nóng)作物減產(chǎn)問(wèn)題,同時(shí)不會(huì)對(duì)環(huán)境造成污染和損害。用幾丁質(zhì)酶分解植物病原體進(jìn)行的生物防治在農(nóng)業(yè)中的應(yīng)用越來(lái)越受到重視。GURAV等[31]從貝類(lèi)加工工業(yè)土壤中分離出2種不同的菌株RST25和SUK25可以分解甲殼素,RST25酶活較高并被鑒定為短小芽孢桿菌,在體外測(cè)定中,短小芽孢桿菌RST25能顯著抑制植物病原菌Fusariumsolani和Aspergillusniger,短小芽孢桿菌RST25及其產(chǎn)生的幾丁質(zhì)酶可以作為抗真菌植物病原體的生物防治劑。除此以外,將甲殼素酶基因轉(zhuǎn)化到農(nóng)作物中構(gòu)建轉(zhuǎn)基因食品的研究越來(lái)越受到人們的關(guān)注。KHAN等[32]通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化方法將甲殼素酶基因重組到馬鈴薯內(nèi)開(kāi)發(fā)了過(guò)表達(dá)內(nèi)切幾丁質(zhì)酶基因的轉(zhuǎn)基因馬鈴薯(品種Desiree),研究表明轉(zhuǎn)基因馬鈴薯能顯著抑制植物病原真菌包括鏈格孢菌(Alternariasolani)的生長(zhǎng)。KHAN等[33]將甲殼素酶基因(NiC)轉(zhuǎn)化到甘藍(lán)型油菜中,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因甘藍(lán)型油菜能抑制常見(jiàn)真菌病原體交鏈孢菌(Alternariabrassicicola)的活性??拐婢D(zhuǎn)基因食品對(duì)環(huán)境的影響廣受關(guān)注。KHAN等[33]研究發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因甘藍(lán)型油菜與非轉(zhuǎn)基因甘藍(lán)型油菜之間的土壤酶活性沒(méi)有明顯差別,對(duì)根際土壤進(jìn)行微生物多樣性分析發(fā)現(xiàn)NiC甘藍(lán)型油菜品系可能不會(huì)影響根際土壤的微生物活性和群落結(jié)構(gòu)。品種之間根際土壤進(jìn)行微生物多樣性的差異可能是測(cè)試參數(shù)的微小變化導(dǎo)致。甲殼素酶轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物能有效抵抗植物病原體的侵害,大大提高產(chǎn)量,同時(shí)并未對(duì)環(huán)境造成影響,具有很廣闊的農(nóng)業(yè)應(yīng)用前景。
自然界中甲殼素含量很高,但目前對(duì)甲殼素利用度很低。含有甲殼素的生物體被認(rèn)為是新型動(dòng)物飼料資源,但動(dòng)物無(wú)法消化甲殼素,這就極大地限制了甲殼素在畜牧業(yè)上的應(yīng)用。TABATA等[34-35]研究發(fā)現(xiàn)酸性甲殼素酶(Chia)可以在小鼠,雞和豬胃組織中高度表達(dá),并且它可以在動(dòng)物的胃腸道(GIT)中消化甲殼素,且酸性甲殼素酶(Chia)可以對(duì)胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶的蛋白水解活性產(chǎn)生抗性,這意味著在動(dòng)物胃中成功表達(dá)的甲殼素酶并不會(huì)輕易被蛋白酶水解。酸性甲殼素酶可以作為動(dòng)物飼料添加劑,可以將甲殼素制成動(dòng)物可食用飼料,提高甲殼素利用率。
甲殼素酶的工業(yè)化生產(chǎn)一直是人們的研究重點(diǎn)。KIDIBULE等[36]將來(lái)自Trichodermaharzianum的甲殼素酶Chit42基因在巴斯德畢赤酵母中表達(dá),采用分批補(bǔ)料的發(fā)酵方法,甲殼素酶的產(chǎn)量可以達(dá)到約3 g/L。KIM等[37]在從韓國(guó)本土小牛糞便中分離出幾丁質(zhì)酶Escherichiafergusonii菌株,在pH值為7.0和30 ℃的最適條件下,深層發(fā)酵幾丁質(zhì)酶活達(dá)到最大,為7.24±0.07 U/mL。在這項(xiàng)研究中,發(fā)現(xiàn)蔗糖,酵母提取物,(NH4)2SO4和NaCl可能會(huì)提高外切幾丁質(zhì)酶的活性。AOUNALLAH等[38]運(yùn)用響應(yīng)面法優(yōu)化地衣芽孢桿菌AT6菌株(BacilluslicheniformisAT6 Strain)的發(fā)酵培養(yǎng)基,將初始甲殼素酶的酶活提高近10倍達(dá)到505.26±22.22 mU/mL。目前對(duì)甲殼素酶的工業(yè)化研究都集中在提高甲殼素酶的酶活上,對(duì)利用甲殼素酶生產(chǎn)殼寡糖的研究較少。
甲殼素酶具有良好的抗菌抗蟲(chóng)特性,在生物防治上具有廣闊的應(yīng)用前景。甲殼素酶還能快速降解甲殼素幫助生物體消化利用甲殼素,提高自然界中甲殼素的利用率。而工業(yè)化生產(chǎn)穩(wěn)定性好、酶活高的甲殼素酶是一直困擾人們的難題。因此,人們從工業(yè)發(fā)酵條件、固定化方法、異源表達(dá)高產(chǎn)酶基因等方面進(jìn)行研究,以促進(jìn)發(fā)展甲殼素酶工業(yè)化步伐[39-40]。
目前,雖然甲殼素酶已經(jīng)商業(yè)化,但其發(fā)酵水平較低,發(fā)酵成本較高,這將限制甲殼素酶的廣泛應(yīng)用。一方面,要尋找甲殼素酶新的來(lái)源和低價(jià)培養(yǎng)基,在提高甲殼素酶發(fā)酵水平的同時(shí)降低發(fā)酵成本;另一方面,要深入研究利用甲殼素酶發(fā)酵生產(chǎn)殼寡糖的技術(shù),提高酶法產(chǎn)殼寡糖的產(chǎn)量和純度。