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        基于AFLP的茶花種質(zhì)資源遺傳多樣性研究

        2018-03-14 06:37:00吳德智胡孝枝
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年3期
        關(guān)鍵詞:山茶茶花類群

        楊 旭, 吳德智, 袁 偉, 胡孝枝

        (1.湖北生態(tài)工程職業(yè)技術(shù)學(xué)院,湖北武漢 430200; 2.湖北省麻城市國營五腦山林場,湖北麻城 435000)

        通信作者:胡孝枝,高級工程師,主要從事花卉資源培育方面的研究。E-mail:964216884@qq.com。

        茶花是山茶科山茶屬中具有觀賞價(jià)值的常綠灌木或小喬木的統(tǒng)稱,其形姿優(yōu)美、葉片濃綠有光澤、花色各異、花型繁多,是世界名貴花卉之一。目前全世界的茶花品種已達(dá)3萬余種[1],中、日、英、美、意、法、德、澳大利亞、新西蘭等國都有栽培和繁育。我國是茶花的起源中心,資源極其豐富,已培育出的近千個茶花品種在園林工程和園藝盆景上應(yīng)用廣泛,因此茶花也被稱為“中國十大名花”之一[2]。

        茶花經(jīng)過長期的異花授粉和自然選擇,產(chǎn)生了許多新品種,種質(zhì)交流頻繁,但由于我國茶花品種分類缺乏系統(tǒng)性研究,同名異物和同物異名現(xiàn)象嚴(yán)重,導(dǎo)致出現(xiàn)品種間遺傳差異小、品種創(chuàng)新不足等問題[3-4]。而以往對茶花品種的研究多以形態(tài)觀察、細(xì)胞學(xué)等為主,這種方法無法擺脫環(huán)境飾變的影響,存在很大的局限性和不確定性,對性狀相似的品種很難鑒別。在此背景下,新的遺傳多態(tài)性檢測手段——DNA分子標(biāo)記技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生,目前已有許多學(xué)者利用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(random amplification polymorphic DNA,RAPD)、簡單序列重復(fù)(simple sequence repeat,SSR)、簡單序列重復(fù)間(inter-simple sequence repeat,ISSR)、限制性片段長度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)等對茶花開展了相關(guān)研究,而利用限制性擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)分子標(biāo)記技術(shù)對茶花種質(zhì)資源遺傳多樣性進(jìn)行研究的報(bào)道甚少。與其他分子標(biāo)記方法相比,AFLP具有用量少、可重復(fù)性好、多態(tài)性強(qiáng)、分辨率高、試驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定可靠等特點(diǎn)[5-8]。本研究應(yīng)用此方法分析了35份茶花種質(zhì)資源的遺傳多態(tài)性和親緣關(guān)系,以期為茶花鑒別、雜交育種及其起源演化提供參考依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        供試茶花品種共35份(表1),均采自湖北省麻城市國營五腦山林場內(nèi)的茶花種質(zhì)資源圃。

        表1 供試的茶花品種

        1.2 方法

        1.2.1 DNA提取 采集茶花新梢葉片,裝入含有硅膠的自封袋中,干燥后放入-20 ℃冰箱中,采用CTAB法[9]提取樣品基因組DNA。

        1.2.2 AFLP分析 酶切體系(20 μL):4 μL 10×Buffer tango,0.4 μLEcoRⅠ(10 U/μL),0.4 μLMseⅠ(10 U/μL),37 ℃ 3 h接著65 ℃ 3 h條件下完成。加入2 μL 10×T4Buffer,1 μLEcoRⅠ酶切頭(adaptor)(50 μmol/L),1 μLMseⅠ adaptor(50 μmol/L ),10 μL T4DNA連接酶,0.4 μL(5 U/μL)酶切產(chǎn)物,16 ℃連接,過夜。利用Primer-EcoRⅠ-A和Primer-MseI-C進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增。選擇性擴(kuò)增反應(yīng)體系(20 μL)為2 μL 10×Buffer,0.4 μL 10 mmol/L脫氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleoside triphosphate,dNTPs),0.2 μL 5 U/μLTaq酶,5 μL預(yù)擴(kuò)稀釋液。PCR擴(kuò)增程序?yàn)?5 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性35 s,65 ℃復(fù)性35 s,72 ℃延伸1 min,12個循環(huán);94 ℃變性30 s,56 ℃復(fù)性30 s,72 ℃延伸1 min,23個循環(huán)。6%變性聚丙烯酰胺膠電泳分離,銀染顯色。試驗(yàn)所用AFLP接頭及選擇性擴(kuò)增引物序列見表2。

        1.2.3 數(shù)據(jù)分析 利用GeneMarker 2.2軟件將35份樣品、7對引物組合擴(kuò)增得到的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,將各泳道內(nèi)分子量內(nèi)標(biāo)的位置與各樣品峰值的位置作比較分析,得到片段的大小,再根據(jù)無帶和有帶情況轉(zhuǎn)化為0,1數(shù)據(jù)矩陣。依據(jù)Nei等的方法[10-11],利用POPGENE和NTsys-pc 2.1軟件[12-13]對樣品進(jìn)行遺傳多樣性分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 7對引物組合的擴(kuò)增效率

        選用7對引物組合對35份茶花品種進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果(表3)顯示,共分離出508條清晰有效的條帶,其中456條具有多態(tài)性,占89.76%;平均每對引物組合擴(kuò)增出72.6條,其中65.1條具有多態(tài)性??梢钥闯?,利用AFLP進(jìn)行基因多態(tài)性檢測,效率高且擴(kuò)增片段多、多態(tài)性高,有利于品種間遺傳差異的分析。7對引物擴(kuò)增出的觀察等位基因數(shù)范圍為1.878 8~1.915 9個,有效等位基因數(shù)范圍為1.419 7~1.548 1 個,Nei’s基因多樣性指數(shù)(H)范圍為0.255 9~0.320 3,香農(nóng)指數(shù)(I)范圍為0.396 5~0.476 7,具有較豐富的遺傳多樣性。

        表2 引物和接頭序列

        表3 7對擴(kuò)增引物產(chǎn)生的條帶多態(tài)性及遺傳多樣性水平

        2.2 茶花品種的分子系統(tǒng)樹

        利用非加權(quán)組平均(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)聚類法對35份供試茶花品種進(jìn)行遺傳距離矩陣分析,形成分子系統(tǒng)樹(圖1)。當(dāng)以平均遺傳距離(0.69)來劃分時(shí),可分成三大類群:大類群Ⅰ為皮斯先生、難忘、毛緣黑瑪瑙、白寶塔、皇家天鵝絨、依莎安妮、黃達(dá)、抓破臉、牛西奧轉(zhuǎn)馬、撒威達(dá)的夢、道溫的曙光、狄斯、哈氏微笑、紅十八學(xué)士、女皇二號、大和錦、花芙蓉、可娜、琳布蕾、麻姑仙子、花鶴翎、亂世佳人、愛麗牡丹王和黛安娜皇后等24個品種,其又可分為2個亞類群,亞類群Ⅰ包括17個品種,亞類群Ⅱ包括7個品種;大類群Ⅱ?yàn)楠{子笑、六角大紅、金盤荔枝、閃爍、牛西奧美玉、絲紗羅、大卡特等7個品種;大類群Ⅲ包括娃麗娜深、帕克斯先生和情人節(jié)等3個品種;而黑魔法則未被劃入三大類群之中。

        2.3 品種間的親緣關(guān)系

        從表4可知,品種間的遺傳相似系數(shù)范圍為0.17~0.52,平均系數(shù)為0.37;遺傳距離范圍為0.50~0.84,平均距離為0.69。娃麗娜深和女皇二號之間的相似性系數(shù)最大(0.52),說明它們親緣關(guān)系較近,且具有較小的遺傳距離(0.66);花鶴翎和亂世佳人的相似性系數(shù)最小(0.17),說明它們的親緣關(guān)系最遠(yuǎn),遺傳距離也最大(0.84)。

        3 結(jié)論與討論

        據(jù)報(bào)道,倪穗等利用ISSR技術(shù)對國內(nèi)外20個茶花品種進(jìn)行了遺傳多樣性分析,21對引物擴(kuò)增出153條條帶,多態(tài)性為95.4%[14];張景榮等利用RAPD技術(shù)對國內(nèi)外23個茶花品種進(jìn)行種質(zhì)資源遺傳多態(tài)性的研究,10對引物擴(kuò)增出126條條帶,多態(tài)性為88.2%[15];申屠文月等結(jié)合RAPD分子標(biāo)記技術(shù)對山茶花3個栽培變異新品種的遺傳差異進(jìn)行分析,多態(tài)性為51.7%[16]。而本試驗(yàn)利用AFLP技術(shù)對35個茶花品種的遺傳多樣性進(jìn)行研究,7對引物擴(kuò)增出508條條帶,多態(tài)性為89.76%,平均遺傳距離為0.69,可見茶花品種間遺傳多樣性高,能準(zhǔn)確且高效地反映基因組組成上的差異,可以較好地區(qū)分表型特征非常相似的基因型,如花鶴翎和亂世佳人、牛西奧美玉和抓破臉等,這說明AFLP適用于茶花品種間的遺傳多樣性分析和種質(zhì)資源鑒別,是研究茶花種質(zhì)的有效方法之一。此外,研究結(jié)果還顯示,隨著資源和引物數(shù)量的增加,多態(tài)性程度也會提高[17]。

        表4 樣品間的Nei和Li相似系數(shù)(對角線下方)和遺傳距離矩陣(對角線上方)

        編號123456789101112131415161718290.400.310.350.360.310.350.430.380.400.390.360.340.380.340.420.360.360.37300.450.410.410.400.350.350.440.370.400.400.400.360.330.320.430.330.400.35310.380.310.360.390.370.390.460.390.380.410.440.370.340.330.390.300.390.32320.470.430.440.380.390.400.470.370.390.410.380.380.380.350.400.310.400.31330.360.330.330.360.310.350.380.330.340.360.410.300.360.300.520.360.340.31340.490.430.440.460.440.430.500.390.430.450.450.420.440.440.280.410.340.35350.380.330.340.380.360.360.350.380.370.350.410.320.380.390.470.320.330.33編號192021222324252627282930313233343510.690.660.700.690.660.630.700.690.680.710.670.640.690.620.700.610.6920.710.670.720.710.730.610.680.710.690.710.730.660.730.650.720.650.7230.700.690.740.690.720.690.730.740.690.710.710.660.690.650.720.650.7140.720.690.690.700.660.680.710.670.660.690.690.670.680.680.700.630.6850.710.680.720.710.690.650.710.730.710.690.730.700.690.680.740.640.7060.690.670.730.670.650.660.710.710.690.700.710.700.680.670.710.650.7070.650.640.680.670.680.620.680.680.640.660.650.650.630.630.690.610.7080.700.710.730.740.680.690.670.700.700.710.680.690.680.690.720.680.6990.700.670.740.680.700.660.720.720.700.710.670.670.680.680.710.650.69100.720.670.700.700.660.650.680.680.670.720.680.670.660.660.700.640.70110.720.700.660.720.690.650.670.690.660.680.700.670.650.680.670.640.66120.700.700.700.690.720.670.680.720.690.740.710.690.690.690.740.660.73130.740.720.720.710.690.690.720.710.670.710.690.720.710.680.690.640.68140.760.740.720.840.680.690.710.730.730.690.710.720.720.700.740.640.68150.640.630.650.650.650.740.650.660.640.650.660.650.680.670.600.760.62160.700.690.780.710.710.680.680.740.690.720.700.720.740.740.700.670.73170.690.690.730.700.690.680.700.730.740.700.690.670.680.670.710.710.72180.690.680.720.690.700.660.680.740.720.680.690.710.730.740.730.700.7219—0.730.690.760.690.680.740.710.690.730.720.710.710.680.700.660.70200.32—0.690.700.690.670.670.680.700.710.710.730.680.700.720.660.68210.370.37—0.700.710.690.710.750.700.700.700.690.730.700.720.670.72220.280.360.35—0.680.680.670.700.700.720.710.700.750.680.730.650.68230.370.370.340.38—0.620.670.720.680.700.700.680.700.690.700.650.69240.390.400.370.390.47—0.690.650.660.700.640.680.660.690.650.770.63250.300.400.340.400.400.37—0.720.710.690.690.670.690.680.700.680.69260.340.390.290.350.330.430.33—0.770.690.740.710.770.710.730.690.71270.370.360.350.360.390.420.350.26—0.690.720.710.760.710.710.720.67280.310.340.350.330.360.360.370.360.37—0.720.700.700.690.700.660.71290.330.340.350.340.350.450.380.300.330.33—0.730.730.700.700.660.69300.350.310.370.360.380.390.400.340.340.350.31—0.740.770.700.640.68310.340.390.310.280.350.410.380.270.270.350.310.30—0.740.750.670.71320.380.350.360.390.370.370.390.340.340.380.350.260.30—0.690.680.66330.350.330.330.320.360.440.350.310.340.350.360.360.290.37—0.650.74340.410.410.400.430.440.270.390.370.320.420.420.450.400.380.43—0.67350.350.390.330.390.370.470.380.350.400.340.380.390.340.410.310.40—

        注:編號同表1。

        通過UPGMA聚類分析可以發(fā)現(xiàn),供試的35份材料被分成3個大類群,結(jié)果與理論上期望的有所偏差:一是來自同一種群的品種聚類情況存在差異。帕克斯先生、情人節(jié)、娃麗娜深和大卡特都是云南山茶與紅山茶雜交選育出來的品種,前三者同聚于大類群Ⅲ,而大卡特卻與閃爍、牛西奧美玉、絲紗羅等紅山茶同聚于大類群Ⅱ,這可能是由于茶花在長期的引種培育與傳播過程中交換了遺傳物質(zhì)[18],也有可能是在流通過程中混淆了表型相似的品種,導(dǎo)致供試材料的真實(shí)性有誤。二是相同地理起源的品種聚類情況存在差異,如皇家天鵝絨、黃達(dá)、道溫的曙光、閃爍、牛西奧美玉等都是美國加州牛西奧苗圃選育出來的紅山茶,前三者在大類群Ⅰ,后兩者在大類群Ⅱ,這可能與引物偏少而使分子標(biāo)記的數(shù)量受限有關(guān)[19],也可能是不同品種為了適應(yīng)新的環(huán)境發(fā)生了相似性的變異。

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