黃誠(chéng)梅, 楊翠芳,, 魏源文, 鄧智年, 吳凱朝, 曹輝慶, 李楊瑞,
(1.廣西作物遺傳改良生物技術(shù)重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室,廣西南寧 530007; 2.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究中心/農(nóng)業(yè)部廣西甘蔗生物技術(shù)與遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣西南寧 530007)
甘蔗蔗糖積累過(guò)程是甘蔗最重要的代謝途徑,與甘蔗產(chǎn)量和品質(zhì)形成密切相關(guān)。甘蔗蔗糖積累過(guò)程主要涉及蔗糖合成酶(sucrose synthase,簡(jiǎn)稱SS)、蔗糖磷酸合成酶(sucrose phosphate synthase,簡(jiǎn)稱SPS)、可溶性酸性轉(zhuǎn)化酶(acid invertase,簡(jiǎn)稱AI)和中性轉(zhuǎn)化酶(neutral invertase,簡(jiǎn)稱NI)等,與蔗糖合成和分解反應(yīng)密切相關(guān)[1-2]。SPS在蔗糖代謝中被認(rèn)為是控制蔗糖合成的一個(gè)關(guān)鍵酶,其活性不僅能影響蔗糖的合成能力,還影響光合同化碳的分配和糖分積累[1-6]。Langenk?mper等用生物信息學(xué)方法對(duì)高等植物已知的SPS基因的全長(zhǎng)序列和其保守序列進(jìn)行分析,把SPS基因分為A、B、C這3個(gè)家族[7]。但Castleden等對(duì)小麥等單子葉植物的SPS基因進(jìn)行研究后發(fā)現(xiàn),單子葉植物中的SPS基因分為5個(gè)家族,除了存在A(Ⅱ)、B(Ⅴ)、C(Ⅰ)家族外,還包括D(Ⅲ)和D(Ⅳ)家族[8]。目前,從美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心網(wǎng)站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)上檢索可知,已經(jīng)從玉米[9]、菠菜[10]、甜菜[11]、柑橘[12]、蘋果[13]、水稻[14]、甘蔗[15]、馬鈴薯[16]等作物中克隆到SPS基因。
甘蔗(SaccharumofficinarumL.)是最主要的糖料作物,蔗糖占世界食糖總產(chǎn)量的76%,占我國(guó)食糖總產(chǎn)量的90%以上。作為C4高生物量和高纖維作物,甘蔗是一種理想的能源作物。蔗糖代謝是甘蔗生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中最重要的代謝途徑。甘蔗SPS基因SPSⅡ于1997年被成功克隆[15],近年來(lái),甘蔗SPS基因家族的其他成員也先后被成功克隆,如SPSⅡ(EU269038.1)、SPSⅢ(EU278618.1、EU278617.1)、SPSA(HM854011.1)、SPSB(JN584485.1、HQ117935.1)。但到目前為止,對(duì)甘蔗SPS基因家族的功能及表達(dá)特性等方面的研究報(bào)道仍然較少。利用已克隆的甘蔗SPSⅢ cDNA片段,通過(guò)半定量RT-PCR方法對(duì)SPSⅢ在工藝成熟期中甘蔗不同基因型及其不同部位中的表達(dá)差異進(jìn)行分析,為進(jìn)一步研究SPSⅢ的表達(dá)特性及其在甘蔗蔗糖代謝中的作用機(jī)制提供參考。
供試甘蔗材料包括桂糖28號(hào)(GT28)、果蔗Badila、新臺(tái)糖20號(hào)(ROC20)、新臺(tái)糖22號(hào)(ROC22),均由廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院廣西遺傳改良生物技術(shù)重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室提供。
甘蔗總RNA提取世紀(jì)Trizol購(gòu)自Invitrogen公司;Ex-Taq酶、dNTPs Mixture、DNA Maker、載體pMD-18-T-Vector、異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)、X-Gal等均購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司;PCR擴(kuò)增引物由寶生物工程(大連)有限公司合成;所用的菌株為筆者所在實(shí)驗(yàn)室保存的大腸桿菌JM109,小量膠回收試劑盒購(gòu)自上海華禹生物工程有限公司;其他試劑均為進(jìn)口分裝或國(guó)產(chǎn)分析純。
試驗(yàn)在廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院溫室大棚進(jìn)行,采用口徑為 35 cm、桶底直徑為28 cm的黑色塑料桶裝沙質(zhì)土壤進(jìn)行桶栽,每桶4~6芽,齊苗后定苗,每桶2~3株,其余管理措施與一般桶栽試驗(yàn)的管理措施相同。于甘蔗生長(zhǎng)后期、工藝成熟初期進(jìn)行取樣,每個(gè)甘蔗基因型選取生長(zhǎng)比較一致的5株植株,取+1、0葉、嫩葉鞘、幼莖(最高可見(jiàn)肥厚帶的第1張完全展開(kāi)葉為+1葉,自下而上位于+1葉之上的為0葉,自上往下數(shù)位于+1葉下面的為+2葉,依此類推[17])。葉片選用距葉環(huán)20~60 cm區(qū)段,去除中脈后立即放于液氮中,混勻分裝保存用于總RNA的提取。
根據(jù)NCBI的GenBank與DDBJ數(shù)據(jù)庫(kù)中的甘蔗SPS基因核酸序列,采用生物學(xué)軟件Primer Premier 5.0分析設(shè)計(jì)半定量RT-PCR的特異性引物,引物序列為SF2:5′-GGGAGGAGAAGGACTAAGGA-3′和SR2:5′-GCAAGACAA TAGGCTGAAGAG-3′。內(nèi)參基因引物參考甘蔗的看家基因25S rRNA的實(shí)時(shí)PCR引物[18],引物序列為RF2:5′-GCAGCCAAGCGTTCATAGC-3′和RR2:5′-CCTATTGGTGG GTGAACAATCC-3′。
參照Invitrogen的Trizol方法[19]提取甘蔗各部位的總RNA。取各個(gè)部位的總RNA 500 ng,用TaKaRa公司的AMV Reverse Transcriptase XL反轉(zhuǎn)錄酶進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第1鏈,反應(yīng)后將cDNA凍置-20 ℃?zhèn)溆谩?/p>
以甘蔗工藝成熟期各基因型各個(gè)部位的cDNA第1鏈為模板,以目的基因SPSⅢ引物及內(nèi)參基因25S rRNA的引物進(jìn)行半定量RT-PCR擴(kuò)增,分析SPSⅢ的表達(dá)情況。25 μL PCR反應(yīng)體系為10×Ex-TaqBuffer 2.5 μL、2.5 mmol/L dNTPs Mixture 2.0 μL、10 pmol/μL前引物1.0 μL、10 pmol/μL 后引物1.0 μL,模板cDNA第1鏈1.0 μL,5 U/μL Ex-Taq酶 0.2 μL,ddH2O補(bǔ)足至25.0 μL。PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性45 s,50~55 ℃退火35 s,72 ℃延伸90 s,35個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸10 min,4 ℃下保存。反應(yīng)完成后,取5 μL擴(kuò)增產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè)。
由圖1可見(jiàn),4個(gè)甘蔗基因型的+1、0葉、幼嫩葉鞘、幼莖4個(gè)不同部位采用Trizol法提取得到的總RNA經(jīng)電泳檢測(cè),2條主帶28S與18S清晰完整,沒(méi)有明顯的拖尾現(xiàn)象。RNA濃度及其純度檢測(cè)表明,D260 nm/D230 nm比值大于2.0,D260 nm/D280 nm比值在1.8~1.9之間。以500 ng總RNA進(jìn)行cDNA第1鏈合成,以進(jìn)行下一步的半定量PCR擴(kuò)增。
在甘蔗工藝成熟初期,SPSⅢ在4個(gè)甘蔗基因型的+1、0葉、幼嫩葉鞘、幼莖中均已有表達(dá),但SPSⅢ表達(dá)因甘蔗基因型不同而有所差異(圖2)。GT28的4個(gè)部位中,在+1葉中表達(dá)量較高,0葉、嫩葉鞘和幼莖的表達(dá)量都很低;在果蔗Badila的4個(gè)部位中表達(dá)量差異不大,以0葉的表達(dá)量最高;在ROC20中以嫩葉鞘中的表達(dá)量最高;而在ROC22中以幼莖中表達(dá)量最高。由此可見(jiàn), 不同基因型的SPSⅢ表達(dá)情況存在差異。
由圖3可見(jiàn),在甘蔗工藝成熟中期,SPSⅢ在4個(gè)甘蔗基因型的+1、0葉、幼嫩葉鞘、幼莖中的表達(dá)量較初期沒(méi)有明顯差異。在果蔗Badila 4個(gè)部位中的表達(dá)量稍高于其他3個(gè)品種,而在GT28的4個(gè)部位中表達(dá)量最低;ROC20與ROC22的4個(gè)部位中均以在嫩葉鞘中的表達(dá)量較高,其次為+1葉。
由圖4可見(jiàn),在甘蔗工藝成熟后期,SPSⅢ在4個(gè)甘蔗基因型的+1、0葉、幼嫩葉鞘、幼莖中的表達(dá)量較前2個(gè)時(shí)期迅速提高,均達(dá)到了較高的表達(dá)水平,尤其是在GT28、果蔗Badila和ROC20中,而在ROC22的0葉、幼嫩葉鞘2個(gè)部位中表達(dá)量較低。其中,SPSⅢ基因在GT28的4個(gè)部位中表達(dá)較前2個(gè)時(shí)期迅速提高,+1葉、0葉、嫩葉鞘、幼莖的表達(dá)水平相當(dāng);SPSⅢ基因在果蔗Badila的幼莖中表達(dá)量稍弱外,其他3個(gè)部位的表達(dá)水平均較高;SPSⅢ在高糖品種ROC20的幼莖中表達(dá)量較其他3個(gè)部位的高;而在ROC22的+1葉與幼莖中表達(dá)量較0葉與嫩葉鞘高。結(jié)果表明,在甘蔗工藝成熟后期,SPSⅢ基因達(dá)到較高的表達(dá)水平,以利于甘蔗糖分積累進(jìn)入成熟收獲期。
SPS已經(jīng)被確認(rèn)是甘蔗蔗糖積累過(guò)程中的主要關(guān)鍵酶之一,SPS活性可直接影響甘蔗的蔗糖合成能力和糖分積累[1-6,20]。SPS基因家族的不同成員在不同植物體內(nèi)的表達(dá)特性不同,所發(fā)揮的功能也不同[21]。由于生產(chǎn)上的甘蔗品種多為異源多倍體,遺傳背景復(fù)雜且差異很大,加上甘蔗SPS基因家族又十分復(fù)雜,由此推斷,甘蔗SPS基因的表達(dá)情況也是十分復(fù)雜的。Gpl等研究發(fā)現(xiàn),甘蔗SPS基因中的 B(Ⅴ) 和C(Ⅰ)家族主要在葉片中表達(dá),D家族中的2個(gè)亞家族[D(Ⅲ)和D(Ⅳ)]在各種部位中均表現(xiàn)出較相似的表達(dá)水平[22];而A(Ⅱ)家族在葉中表達(dá)量最低,從莖尖分生組織往下到第7節(jié)間的表達(dá)量表現(xiàn)為逐漸降低,而從甘蔗頂部葉到下部莖表達(dá)量逐節(jié)增強(qiáng),在蔗莖中的轉(zhuǎn)錄量占SPS轉(zhuǎn)錄總量的40%。葉冰瑩等研究表明,在糖分積累初期蔗莖中的SPSⅡ相對(duì)表達(dá)量最大,在糖分積累中期蔗葉中的SPSⅡ相對(duì)表達(dá)量達(dá)到最高峰[23];同組織部位中,糖分積累初期SPSⅡ 相對(duì)表達(dá)量高于糖分積累中、后期。Verma等用半定量PCR對(duì)甘蔗SPSⅡ的表達(dá)進(jìn)行研究,結(jié)果表明,甘蔗SPSⅡ 基因在成熟節(jié)間比未成熟節(jié)間表達(dá)量高,高糖品種比低糖品種表達(dá)量高[24]。
關(guān)于SPSⅢ在甘蔗中的表達(dá)情況仍鮮有報(bào)道,本研究結(jié)果表明,SPSⅢ在GT28、果蔗Badila、ROC20、ROC22這4個(gè)甘蔗基因型的+1、0葉、幼嫩葉鞘、幼莖中均有表達(dá),其表達(dá)量因基因型不同及測(cè)定部位與時(shí)期不同而異。其中,在工藝成熟初期,4個(gè)甘蔗基因型中,以GT28的4個(gè)部位較其他3個(gè)品種的低,而在果蔗Badila的4個(gè)部位中表達(dá)較穩(wěn)定,在ROC20中以嫩葉鞘中表達(dá)量最高;而ROC22以在幼莖中表達(dá)量最高。在工藝成熟中期,SPSⅢ在4個(gè)甘蔗基因型的+1、0葉、幼嫩葉鞘、幼莖中的表達(dá)量較初期沒(méi)有明顯差異;以在果蔗Badila 4個(gè)部位中的表達(dá)量稍高于其他3個(gè)品種,而在GT28的4個(gè)部位中表達(dá)量最低;在ROC20與ROC22的4個(gè)部位中表達(dá)量變化一致,以+1葉、嫩葉鞘中表達(dá)量明顯高于0葉和幼莖,尤其是在嫩葉鞘中。在工藝成熟后期,SPSⅢ在4個(gè)甘蔗基因型的+1、0葉、幼嫩葉鞘、幼莖中的表達(dá)量較前2個(gè)時(shí)期迅速提高,均達(dá)到了較高的表達(dá)水平,尤其是在GT28、果蔗Badila和ROC20中,而在ROC22的0葉和嫩葉鞘2個(gè)部位中表達(dá)量較低。這表明,在甘蔗工藝成熟后期,SPSⅢ 達(dá)到較高的表達(dá)水平,利于甘蔗糖分積累,利于進(jìn)入成熟收獲期。在本研究的4個(gè)甘蔗材料中,GT28、ROC20、ROC22都是生產(chǎn)上的甘蔗品種,遺傳背景差異很大。而果蔗Badila是甘蔗屬中的熱帶種典型代表之一,遺傳背景較單一[25]。因此,SPSⅢ在這4種不同基因型中的表達(dá)差異可能與甘蔗材料的遺傳背景有關(guān)?;虮磉_(dá)是SPS活性調(diào)控的主要方式之一[3],因此,為了進(jìn)一步探討SPS基因表達(dá)與甘蔗糖分積累的關(guān)系,對(duì)SPS基因家族中各成員的表達(dá)情況進(jìn)行深入研究是十分必要的。至于SPSⅢ在高、低糖甘蔗基因型及不同成熟度節(jié)間的表達(dá)情況等還有待于繼續(xù)研究,以進(jìn)一步探討SPSⅢ基因表達(dá)對(duì)甘蔗糖分積累的影響。
SPSⅢ在GT28、果蔗Badila、ROC20、ROC22這4個(gè)甘蔗基因型的+1、0葉、幼嫩葉鞘、幼莖中均有表達(dá),其表達(dá)量因基因型不同及測(cè)定部位與時(shí)期不同而異。在甘蔗工藝成熟后期,SPSⅢ達(dá)到較高的表達(dá)水平,利于甘蔗糖分積累,以利于甘蔗進(jìn)入成熟收獲期,表明該基因很有可能在甘蔗的蔗糖代謝過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。
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