任彩霞,郭慧玲,李麗娜,張文羿,孫天松
(內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品生物技術(shù)與工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室奶制品加工農(nóng)業(yè)部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,呼和浩特 010018)
乳酸菌是人們認(rèn)可的安全菌株,作為菌株發(fā)酵劑使用已有較長的歷史[1]。其定殖于人類及動(dòng)物的胃腸道中,對人體具有重要的益生作用[2-5]。保加利亞乳桿菌是發(fā)酵酸乳的主要乳酸菌之一,最早由保加利亞人Stam en Grigorov發(fā)現(xiàn)[6],具有多種生理功能[7]。目前,人們使用抗生素來治療細(xì)菌感染,部分細(xì)菌對其產(chǎn)生了耐藥性。研究者們最初只發(fā)現(xiàn)某些食源性致病菌具有抗生素耐藥性[8],之后,在葡萄球菌和乳酸菌中也檢測到了抗生素耐藥基因[9]。近年來的研究表明,我們食品中使用的乳酸菌有的具有抗生素耐藥性,有的甚至攜帶抗生素耐藥基因[10-12],部分耐藥基因還可能進(jìn)行水平轉(zhuǎn)移[13-15]。保加利亞乳桿菌也不例外。AKPINAR[16]和SOZZ[17]報(bào)道,保加利亞乳桿菌對抗生素具有耐藥性,有的甚至具有多重耐藥性。
因此,為了判斷分離自新疆地區(qū)酸牛乳中保加利亞乳桿菌的安全性,本實(shí)驗(yàn)采用肉湯稀釋法測定5株受試菌株在15種抗生素條件下的耐藥表型,并通過PCR手段對已報(bào)道的耐藥基因進(jìn)行檢測。最終的實(shí)驗(yàn)結(jié)果可能會對同行的乳酸菌抗生素耐藥性研究提供一定的參考。
1.1.1 所用菌株與培養(yǎng)基
菌株:試驗(yàn)菌株保加利亞乳桿菌IMAU 32265,IMAU 32166,IMAU 32276,IMAU 32071,IMAU 32330均分離自新疆的酸牛乳,由內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品生物技術(shù)與工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室乳酸菌菌種保藏庫(LABCC)提供。
培養(yǎng)基:M RS broth(OXO ID,CM 0359),M RSagar(OXO ID,CM 0361),LSM 培 養(yǎng) 基[18]:90%IST(ISO-SENSITEST broth;OXO ID,CM 0473),10%MRSbroth。
1.1.2 所用抗生素及試劑
抗生素:四環(huán)素(tetracycline,TET),新霉素(neomycin,NEO),紅霉素(erythromycin,ERY),卡那霉素(kanamycin,KAN),環(huán)丙沙星(ciprofloxacin,CIP),鏈霉素(streptomycin,STR),利福平(rifampicin,R IF),克林霉素(clindamycin,CLI),氨芐西林(ampicillin,AM P),奎奴普丁/達(dá)福普?。╭uinupristin/dalfopristin,QU I/DAL),甲氧芐啶(trimethoprim,TRI),利奈唑胺(linezolid,LINE),慶大霉素(gentamicin,GEN),氯霉素(chloramphenicol,CHL),萬古霉素(vancomycin,VAN)。
試劑:生理鹽水,TE緩沖液,5×TBE電泳緩沖液貯液,0.5mol/L EDTA,10%SDS,3m ol/L NaAc,5 m ol/L N aC l,1%的瓊脂糖凝膠,酚-氯仿-異戊醇(25∶24∶1,體積比),氯仿-異戊醇(24∶1,體積比),異丙醇,蛋白酶 K,dN TPs,10×PCR Buffer,Taq Polymerase,RNaseA,核酸染料等試劑,引物由上海桑尼生物科技有限公司合成。
1.1.3 儀器
式中:Qk為單獨(dú)空氣源熱泵機(jī)組的額定制熱量,kW;K為富裕系數(shù),取1.05;Ks為根據(jù)空氣源熱泵性能曲線在冬季空氣調(diào)節(jié)室外計(jì)算溫度(青島市為-7.2 ℃[14]),熱泵機(jī)組出水溫度45 ℃下的制熱量修正值,取0.79;Qg為單獨(dú)燃?xì)忮仩t的額定制熱量,kW.
冷凍離心機(jī)(5810R型),臺式高速離心機(jī)(TGL-16B型),微量紫外分光光度計(jì)(ND-1000型),全自動(dòng)高壓蒸汽滅菌器(HA-300M),恒溫水浴鍋(HW S28型),電熱恒溫培養(yǎng)箱(DHP-9272型),UPV凝膠成像儀(GDS-8000型),電泳儀(DYY-12)。
1.2.1 菌株的制備及質(zhì)控菌株的選取
取凍存管中的保加利亞乳桿菌,按1%接菌量活化于MRS液體培養(yǎng)基中,37℃恒溫,培養(yǎng)24 h。之后將其劃線培養(yǎng)至M RS固體培養(yǎng)基上,37℃恒溫,培養(yǎng)48 h。挑取劃線培養(yǎng)后的單菌落于5 mL生理鹽水中,混勻,制成種子液,測定625 nm處菌株的OD值,直至OD值在0.16~0.2之間[19](活菌數(shù)約為3×108mL-1)。
參照ISO 10932/IDF223,試驗(yàn)選取Lactobacillus paracaseiATCC 334做質(zhì)控菌,質(zhì)控菌株可用于檢測試驗(yàn)的精確度及準(zhǔn)確度[20]。在試驗(yàn)中,質(zhì)控菌株的培養(yǎng)條件需嚴(yán)格控制。
1.2.2 抗生素溶液的制備
因?yàn)榭股氐娜芙庑圆煌士股厝芤旱闹苽浞譃樗苄院退蝗苄詢煞N??股氐呐渲迫軇┘皾舛确秶鷧⒄瘴墨I(xiàn)[20-21]。根據(jù)不同抗生素的濃度測定范圍,水溶性抗生素(LSM為溶劑)高濃度貯藏液需稀釋為2倍于對應(yīng)濃度梯度的抗生素溶液。,而水不溶性抗生素根據(jù)對應(yīng)溶劑溶解后,抗生素高濃度貯藏液需稀釋為10倍于對應(yīng)濃度梯度的抗生素溶液,這與其溶劑的選擇有關(guān)。稀釋好的抗生素溶液置于-20℃保藏備用。
1.2.3 菌株耐藥性的表型分析
本試驗(yàn)采用肉湯稀釋法測定保加利亞乳桿菌的M IC值,具體方法參考文獻(xiàn)[20]。
1.2.4 菌株全基因組DNA的提取DNA采[23]。用液氮凍融-CTAB法提取乳酸菌基因組
1.2.5 菌株耐藥基因的檢測
將上述制備的基因組DNA作為PCR擴(kuò)增的模板,根據(jù)已報(bào)道的抗生素耐藥基因設(shè)計(jì)引物,采用50μL反應(yīng)體系進(jìn)行擴(kuò)增。組成為:10×easytaq Buffer 5μL、dN TPs 4μL、基因組DNA模板1.5μL、上下游引物各1.5μL,Taq Polymerase 0.5μL、滅菌去離子水加至50μL。PCR擴(kuò)增循環(huán)參數(shù)如下:94℃預(yù)變性5 min;接著進(jìn)行30個(gè)循環(huán):94℃變性1 min,退火1 min,72℃延伸2 min;最終72℃末端延伸10 min。所擴(kuò)增耐藥基因的特異性引物序列及PCR退火溫度見表1。PCR擴(kuò)增結(jié)束后通過1%的瓊脂糖凝膠對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測,并用凝膠成像儀分析結(jié)果。
本研究采用歐洲食品安全局[24]、歐盟委員會[25]共同制定的保加利亞乳桿菌臨界點(diǎn)的判定標(biāo)準(zhǔn),分別將受試菌株的M IC值與臨界點(diǎn)進(jìn)行比較,MIC值高于臨界點(diǎn)為耐藥(R),低于或等于臨界點(diǎn)則為敏感(S)。
試驗(yàn)結(jié)果如表2所示,5株受試菌對慶大霉素、四環(huán)素、新霉素、紅霉素、卡那霉素、鏈霉素、利福平、克林霉素、氨芐西林、奎奴普汀/達(dá)福普汀、甲氧芐啶、利奈唑胺、氯霉素、萬古霉素敏感,其MIC值表現(xiàn)為一定的差異,而且范圍較廣,從小于0.032~16μg/mL不等。5株受試菌對氨基糖苷類抗生素(慶大霉素、卡那霉素、鏈霉素、新霉素)的M IC值范圍為小于0.5μg/mL~16μg/mL;對萬古霉素的MIC值為小于其測定的最低濃度,即小于0.25μg/mL,表現(xiàn)出極強(qiáng)的敏感性;對紅霉素和利福平的MIC值分別為小于0.016μg/mL和小于0.125μg/mL。氯霉素對5株受試菌的抑制作用較低,MIC值為2μg/mL和1μg/mL,這一數(shù)據(jù)與KLARE[18]報(bào)道的結(jié)果相近。5株受試菌對氨芐西林的M IC值最高僅為0.064μg/mL,對甲氧芐啶的M IC值最高可達(dá)16μg/mL,這可能與氨芐西林和甲氧芐啶的結(jié)構(gòu)不同有關(guān)。奎奴普汀/達(dá)福普汀和利奈唑胺對5株受試菌株的抑制程度接近,均在0.125~0.5μg/mL之間。對于四環(huán)素,除IMAU 32330的M IC值為小于0.125μg/mL外,其他菌株的M IC值均為0.5μg/mL。5株受試菌對環(huán)丙沙星的耐藥性存在明顯不同,IMAU 32071和IMAU 32276對環(huán)丙沙星敏感,而IMAU 32330、IMAU 32265和IMAU 32166對環(huán)丙沙星耐藥,且M IC值范圍較小,在2~16μg/mL之間。
通過特異性引物PCR擴(kuò)增技術(shù)對受試菌株的常見抗生素耐藥基因進(jìn)行分析,統(tǒng)計(jì)結(jié)果如表3所示。5株受試菌均檢出了紅霉素耐藥基因erm(B),IMAU 32265還檢出了紅霉素耐藥基因erm(C),但表現(xiàn)為紅霉素敏感性。IMAU 32265、IMAU 32166、
IMAU 32276和IMAU 32071檢出了萬古霉素耐藥基因vanX,對萬古霉素表現(xiàn)為敏感;IMAU 32166、IMAU 32276和IMAU 32071檢出了利福平耐藥基因rpoB,卻表現(xiàn)為利福平敏感性;IMAU 32276還檢出了氯霉素耐藥基因cat,表現(xiàn)為氯霉素敏感性。受試菌株中,IMAU 32330、IMAU 32265和IMAU 32166雖表現(xiàn)為環(huán)丙沙星耐藥性,但并未檢出環(huán)丙沙星耐藥基因gyrA、parC。其它耐藥基因,如氯霉素耐藥基因catA、紅霉素耐藥基因erm(B)-1、萬古霉素耐藥基因vanE在菌株中均未檢出。除表4中所列基因在對應(yīng)菌株中檢出外,與四環(huán)素、慶大霉素、卡那霉素等抗生素相關(guān)的耐藥基因均未檢出。
表1 特異性引物序列及PCR退火溫度[21]
表2 5株保加利亞乳桿菌對15種抗生素的M IC分布結(jié)果
表3 保加利亞乳桿菌及耐藥性基因
我國新疆地區(qū)地域遼闊,環(huán)境獨(dú)特,這里的少數(shù)民族牧民生產(chǎn)的發(fā)酵乳制品大多以牛乳、羊乳、馬乳和駱駝乳為原料,富含大量的有益乳酸菌[7],保加利亞乳桿菌就是其中的代表。
本文研究的5株保加利亞乳桿菌均分離于新疆的酸牛乳,實(shí)驗(yàn)測定受試菌株的M IC時(shí)采用了肉湯稀釋法,該方法是體外定量測定抗生素對細(xì)菌抑制活力的方法。測定過程中,不同濃度抗生素的液體培養(yǎng)基中加入定量的細(xì)菌,培養(yǎng)一定時(shí)間后,通過肉眼觀察判定MIC值。與濃度梯度法[26](Etest)、紙片擴(kuò)散稀釋法[27](disk diffusion)、藥物敏感實(shí)驗(yàn)[28](Kirby-Bauer method)、微稀釋法[29](microdilution)等相比,肉湯稀釋法操作方便,價(jià)格低廉,是實(shí)驗(yàn)室普遍使用的判斷M IC的方法。之前的研究中,測定M IC所用的培養(yǎng)基為M RS培養(yǎng)基,但其結(jié)果的準(zhǔn)確性備受質(zhì)疑。HUYS[30]在用MRS與ISA(Iso-sensitest agar)培養(yǎng)基測定菌株的抗生素耐藥性時(shí)發(fā)現(xiàn),兩種培養(yǎng)基條件下,同一菌株對慶大霉素的耐藥性有顯著差別,可能與M RS培養(yǎng)基中某些成分易與抗生素發(fā)生拮抗作用相關(guān)。隨著研究的深入,KLARE[18]發(fā)現(xiàn)LSM培養(yǎng)基能結(jié)合MRS和ISA兩種培養(yǎng)基的優(yōu)勢,并且能夠降低拮抗作用的發(fā)生概率,對于抗生素耐藥性檢測較準(zhǔn)確,故一直應(yīng)用于乳酸菌抗生素耐藥性研究中。
由于抗生素對細(xì)菌細(xì)胞的功能不同,目前已發(fā)現(xiàn)的抗生素可分為15類[11]。5株受試菌株對不同類的抗生素表現(xiàn)出不同的敏感性。對于能抑制核酸合成的利福平及環(huán)丙沙星,5株受試菌株的M IC值具有極大的差異。利福平對5株受試菌株具有敏感性,且抑制程度均相同,為小于0.125μg/mL。而5株受試菌株中,3株對環(huán)丙沙星耐藥,M IC值范圍在2~16μg/mL之間。Li等[31]所報(bào)道的環(huán)丙沙星耐藥率(68.3%)與本試驗(yàn)結(jié)果接近。氯霉素、克林霉素、氨基糖苷類及四環(huán)素類抗生素雖均可抑制蛋白質(zhì)的合成,但其敏感性存在區(qū)別。氯霉素與克林霉素相比,氯霉素對受試菌株的的耐藥性較高;氨基糖苷類抗生素對受試菌株的抑制作用相對較低,卡那霉素、鏈霉素及新霉素的耐藥性明顯高于慶大霉素,這可能與慶大霉素的結(jié)構(gòu)有關(guān),進(jìn)而能較好的通過細(xì)菌細(xì)胞膜。對于抑制細(xì)菌細(xì)胞壁合成的抗生素,如氨芐西林和萬古霉素,5株受試菌株均表現(xiàn)出較強(qiáng)的敏感性。其中,氨芐西林的M IC值最高僅為0.064μg/mL,與周寧[32]得出的結(jié)果相似。NAW A[33]和郭慧玲[34]的報(bào)道中,保加利亞乳桿菌對萬古霉素100.0%耐藥,而試驗(yàn)中5株受試菌株對萬古霉素均表現(xiàn)為敏感。顯然,這與之前報(bào)道的有關(guān)萬古霉素對乳酸菌作用機(jī)制的推斷[35]是不吻合的。
在耐藥基因檢測方面,通過比對耐藥基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,發(fā)現(xiàn)5株受試菌株檢出了耐藥基因erm(B),IMAU 32265還檢出了紅霉素耐藥基因erm(C),卻不具有紅霉素耐藥性。IMAU 32330、IMAU 32265和IMAU 32166具有環(huán)丙沙星耐藥性,卻未檢出耐藥基因gyrA等。在部分受試菌中也檢出了基因erm(C)、vanX等,但均無相關(guān)耐藥性。有文獻(xiàn)報(bào)道,分離自酸奶的乳酸桿菌表現(xiàn)為鏈霉素耐藥性,卻未檢出與鏈霉素相關(guān)的耐藥基因strA、strB、aadA等[1];L.delbrueckii subsp.bulgaricus BFE 7430對氯霉素敏感,卻成功檢出了耐藥基因cat[36]。這均與本試驗(yàn)結(jié)果較為相似。因此,菌株具有抗生素耐藥性,不一定能檢出與其耐藥性相關(guān)的耐藥基因;同樣的,菌株攜帶抗生素耐藥基因,不一定對該抗生素表現(xiàn)為耐藥。影響菌株耐藥性及耐藥基因檢出的因素有很多,歸納如下,(1)存在其他機(jī)制決定抗生素的耐藥性,例如編碼核糖體蛋白質(zhì)或rRNA的基因發(fā)生突變[18];(2)耐藥基因在RNA水平未發(fā)生表達(dá)[36];(3)調(diào)節(jié)基因表達(dá)的核苷酸序列發(fā)生了基因突變[37];(4)菌株對抗生素的耐藥性為固有耐藥性,其耐藥性由其它耐藥基因引起;(5)菌株的耐藥性來自于其它基因的水平轉(zhuǎn)移。到底是何種原因?qū)е卤驹囼?yàn)菌株出現(xiàn)以上情況,還需要我們進(jìn)一步探究。
耐藥基因的水平轉(zhuǎn)移是影響食品安全的一大問題,致病菌和乳酸菌可通過基因的水平轉(zhuǎn)移獲得耐藥性[38-39],任何攜帶耐藥基因的菌株都具有潛在的危害。因此,在對乳酸菌進(jìn)行安全性評價(jià)時(shí),除需檢測菌株在抗生素條件下的M IC值及耐藥基因外,還需進(jìn)行耐藥基因轉(zhuǎn)移的判斷,確保其安全后方應(yīng)用于發(fā)酵生產(chǎn)中。
分離自新疆的5株保加利亞乳桿菌對15種常見不同抗生素的耐藥表型及基因型存在很大差異,且試驗(yàn)菌株的耐藥表型與基因型間并非一一對應(yīng)。IMAU 32330、IMAU 32265和IMAU 32166對環(huán)丙沙星耐藥,對其他抗生素敏感;IMAU 32071、IMAU 32276對所有抗生素均敏感。5株受試菌株都檢出了耐藥基因erm(B),部分菌株還檢測到了vanX等,但5株菌均未檢出環(huán)丙沙星相關(guān)耐藥基因。因此,未來的研究中,菌株耐藥表型與基因型不匹配的作用機(jī)制有待進(jìn)一步研究。
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