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        微衛(wèi)星標(biāo)記及其在牛遺傳育種中的應(yīng)用

        2018-01-22 08:52:05
        中國畜牧獸醫(yī)文摘 2018年2期
        關(guān)鍵詞:禽畜微衛(wèi)星基因組

        (黑龍江省家畜遺傳資源保護(hù)中心,黑龍江哈爾濱 150069)

        1 前言

        微衛(wèi)星標(biāo)記是一種新型的遺傳標(biāo)記方式,在實(shí)際應(yīng)用當(dāng)中具有分布廣泛、檢測便利、數(shù)量大以及信息含量高的特點(diǎn),目前較多應(yīng)用在遺傳多樣性評估、系統(tǒng)發(fā)生樹構(gòu)建以及動植物基因定位等方面。在我國牛養(yǎng)殖業(yè)當(dāng)中,該技術(shù)也具有積極的應(yīng)用價(jià)值。

        2 技術(shù)概述

        微衛(wèi)星標(biāo)記是一種分子特征的遺傳標(biāo)記方式,同其余分析遺傳標(biāo)記方式相比,具有更多的極性標(biāo)記數(shù)量,且有著均勻的分布范圍,大部分處于真核生物的基因組內(nèi),也有少部分在原核生物的基因組當(dāng)中,在實(shí)際檢測當(dāng)中具有較易檢測的特點(diǎn),在生物多樣性方面具有較好的表現(xiàn),且同時(shí)有一定的保守特征。該技術(shù)誕生于20世紀(jì)70年代,在研究當(dāng)中,發(fā)現(xiàn)具有串聯(lián)特征的重復(fù)序列,在進(jìn)一步研究當(dāng)中,研究人員在技術(shù)基礎(chǔ)上將其發(fā)展成具有全新特征的DNA標(biāo)記系統(tǒng)。對于該種標(biāo)記系統(tǒng)來說,根據(jù)重復(fù)結(jié)構(gòu)差異性的存在分為不同的類型。目前,該技術(shù)已經(jīng)較為廣泛地應(yīng)用在禽畜養(yǎng)殖當(dāng)中。

        3 具體應(yīng)用

        3.1 構(gòu)建遺傳連鎖圖

        在牛遺傳育種工作進(jìn)行前,需要先構(gòu)建牛的遺傳連鎖圖,通過對具有較高精度遺傳圖譜的繪制使其能夠以準(zhǔn)確的方式對QTL在?;蚪M當(dāng)中的位置進(jìn)行確定。在該項(xiàng)工作開展中,即需要能夠以微衛(wèi)星技術(shù)為基礎(chǔ),在禽畜基因組當(dāng)中,每隔一定的距離對特定多塔進(jìn)行微衛(wèi)星標(biāo)記處理再以該方式逐漸標(biāo)記,直至標(biāo)記數(shù)量到達(dá)某值之后,即可以通過微衛(wèi)星標(biāo)記方式的應(yīng)用對基因組內(nèi)部存在的功能基因以及表型控制的QTL進(jìn)行找出,同時(shí)對其做好相關(guān)的操作以及利用處理。

        3.2 血緣控制

        在牛遺傳育種工作開展當(dāng)中,需要對牛種群的群系譜圖進(jìn)行應(yīng)用,通過該方式的落實(shí),即能夠根據(jù)牛親屬的信息情況確定其是否得到選留,這同時(shí)也對系譜的準(zhǔn)確性提出了較高的要求。在具體育種過程當(dāng)中,經(jīng)常會因母畜寄養(yǎng)以及返情重配等方面因素?zé)o法對某個(gè)特定個(gè)體的親代關(guān)系進(jìn)行準(zhǔn)確的判斷。此時(shí),則可以通過微衛(wèi)星標(biāo)記方式的應(yīng)用進(jìn)行處理,根據(jù)其多態(tài)性特征的存在,根據(jù)其在不同種群當(dāng)中基因頻率為基礎(chǔ)開展計(jì)算,在排除實(shí)現(xiàn)概率的基礎(chǔ)上對親子鑒定以及血緣控制的相關(guān)目標(biāo)進(jìn)行實(shí)現(xiàn)。目前,已經(jīng)有很多人員開展了該方面的研究,根據(jù)其中部分研究結(jié)果可以了解。在對5種微衛(wèi)星座位進(jìn)行組合的情況下,即能夠排除98%左右的概率,其中,在不同座位之上,都具有7個(gè)以上的等位基因。通過這部分微衛(wèi)星組之間的科學(xué)組合,即能夠獲得較高比例的概率排除。通過該方面的應(yīng)用即可以了解到,通過微衛(wèi)星標(biāo)記方式的應(yīng)用對傳統(tǒng)的圖譜分析、血型檢測以及DNA指紋檢測方式進(jìn)行替代,在具體禽畜飼養(yǎng)當(dāng)中的親子鑒定以及血緣控制工作開展當(dāng)中即能夠具有充分的發(fā)展空間。

        3.3 遺傳結(jié)構(gòu)分析

        對于微衛(wèi)星標(biāo)記方式來說,其在多態(tài)性方面具有較好的表現(xiàn),也正是該特征的存在,使其在禽畜類品種資源利用、保存、遺傳多樣性分配以及評估方面都具有了較高的應(yīng)用價(jià)值發(fā)揮。同傳統(tǒng)血液多態(tài)座位以及蛋白多態(tài)座位方式相比,其在多態(tài)性方面具有十分明顯的特點(diǎn)與效果,根據(jù)相關(guān)計(jì)算,以該標(biāo)記方式所體現(xiàn)的遺傳雜合度即能夠達(dá)到較高的精度,這也是該種雜合度優(yōu)勢的表現(xiàn)。這部分特性的存在,使其在實(shí)際對部分具有接近親緣分析禽畜類動物遺傳距離進(jìn)行估計(jì),對不同動物間系統(tǒng)發(fā)育樹進(jìn)行繪制的過程當(dāng)中具有較高的精確性以及高效性。經(jīng)過相關(guān)試驗(yàn)驗(yàn)證,通過兩個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的掌握,即能夠?qū)?6種不同品系牛在遺傳方面的差異性進(jìn)行分析,在此基礎(chǔ)上還能夠?qū)哂袦?zhǔn)確特征的樹狀圖進(jìn)行繪制,以此實(shí)現(xiàn)遺傳距離的計(jì)算,最后獲得的結(jié)果同試驗(yàn)前已經(jīng)掌握的各類牛遺傳品系歷史具有較好的一致性。通常來說,在具體工作開展當(dāng)中,研究人員即可以根據(jù)牛的遺傳基因?qū)Σ煌N群間存在的差異性進(jìn)行標(biāo)識,即對不同群體間,在以遺傳變異為基礎(chǔ)的情況下從根本上對遺傳基因頻率的大小進(jìn)行分析。而根據(jù)雜交優(yōu)勢相關(guān)理論可以了解到,對于雜交來說,其優(yōu)勢的體現(xiàn)同遺傳距離具有一定的關(guān)聯(lián),即親本間遺傳差異性的體現(xiàn)。根據(jù)相關(guān)實(shí)驗(yàn)結(jié)果可以發(fā)現(xiàn),在對牛進(jìn)行雜交實(shí)驗(yàn),所獲得雜種間優(yōu)勢大小以及遺傳距離情況具有較為復(fù)雜的曲線關(guān)系。對于該問題,通過微衛(wèi)星標(biāo)記方式的應(yīng)用,即能夠在牛雜種優(yōu)勢研究方面體現(xiàn)出較好的效果。

        3.4 輔助標(biāo)記

        在牛遺傳育種輔助標(biāo)記工作當(dāng)中,微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)也具有較好的應(yīng)用價(jià)值以及較大的發(fā)展空間,通過該技術(shù)的應(yīng)用,即能夠?qū)ζ毡閼?yīng)用從表型值向基因型值過程的推斷選擇情況進(jìn)行體現(xiàn)。要想對該目標(biāo)進(jìn)行實(shí)現(xiàn),首先即需要分子生物學(xué)領(lǐng)域當(dāng)中,通過相關(guān)技術(shù)的應(yīng)用檢測個(gè)體基因型,之后再對表型值以及個(gè)體育種值進(jìn)行適當(dāng)?shù)墓烙?jì),通過軟件仿真結(jié)果方式的應(yīng)對相關(guān)結(jié)果進(jìn)行顯示。同普通的表型選擇方式相比,通過微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)的應(yīng)用,在具體工作當(dāng)中能夠?qū)Ω嗟倪z傳進(jìn)展情況進(jìn)行獲得,在牛后期表達(dá)性狀、顯性性狀以及低遺傳能力性狀方面都具有較大的選擇強(qiáng)度,且具有更高的選擇準(zhǔn)確性以及更短的世代間隔。通過該輔助性標(biāo)記方式的應(yīng)用,即能夠?qū)?dǎo)入有益基因的目標(biāo)進(jìn)行實(shí)現(xiàn),在有效去除不利基因的基礎(chǔ)上對牛種群的生產(chǎn)性能以及生活能力進(jìn)行了提升,最終實(shí)現(xiàn)育種年限的縮短。

        4 結(jié)語

        在上文中,我們對微衛(wèi)星標(biāo)記及其在牛遺傳育種中的應(yīng)用進(jìn)行了一定的介紹。在未來工作中,需要進(jìn)一步做好該技術(shù)的研究,使其在我國禽畜養(yǎng)殖當(dāng)中發(fā)揮出更大的作用。

        [1] 劉博.夏南牛和皮南牛微衛(wèi)星標(biāo)記研究及生長發(fā)育模型的建立[D].河南農(nóng)業(yè)大學(xué),2011.

        [2] 程文科.微衛(wèi)星標(biāo)記用于豬和羊親子鑒定快速、簡便方法的研究[D].華中農(nóng)業(yè)大學(xué),2011.

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