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        淺談分子生物學(xué)在食品微生物檢驗中的應(yīng)用和前景

        2018-01-17 06:03:42劉永嘉阜新市檢驗檢測認(rèn)證中心
        食品安全導(dǎo)刊 2018年33期
        關(guān)鍵詞:方法

        □ 劉永嘉 單 非 阜新市檢驗檢測認(rèn)證中心

        隨著時代的發(fā)展,食品安全愈加被社會大眾所關(guān)注,而與食品安全密切相關(guān)的食品檢驗就顯得至關(guān)重要。分子生物學(xué)顧名思義,從分子水平研究生命本質(zhì),以微觀視野分析生命現(xiàn)象。其中PCR技術(shù)在食品微生物檢驗領(lǐng)域具有不可取代的積極作用。

        1 PCR技術(shù)的時代背景與意義

        食品微生物檢驗的技術(shù)手段日益更新,常規(guī)檢驗方法不斷優(yōu)化(如各種顯色培養(yǎng)基、生化鑒定試劑條等)[1],酶聯(lián)免疫法逐漸成熟[2],分子生物學(xué)手段也沒有缺席,理所當(dāng)然地在食品檢驗領(lǐng)域成為熱點。PCR是20世紀(jì)80年代中期開始發(fā)展的特定核酸體外擴增技術(shù),至今PCR已經(jīng)日趨成熟??梢哉f,在食品微生物檢驗領(lǐng)域PCR技術(shù)已經(jīng)取得了顯著的成績,同時也存在著一些問題,使得這項技術(shù)沒有被更普遍地使用,但這并不影響食品檢驗者對它的熱情。因為對微生物本質(zhì)核酸的探索,讓食品微生物檢驗進入了另外一個層次,這也必將大大地推動食品微生物檢驗事業(yè)的進步。

        2 傳統(tǒng)PCR

        2.1 傳統(tǒng)PCR的原理

        PCR的工作原理就是以目標(biāo)核酸分子為模板,設(shè)計與模板核酸相匹配的單鏈核酸片段作為引物,在核酸聚合酶的作用下,按照半保留復(fù)制原則合成新的核酸。

        2.2 傳統(tǒng)PCR技術(shù)在食品微生物檢驗中的特點

        用傳統(tǒng)PCR法檢測食品中金黃色葡萄球菌[3]、食品中沙門氏菌[4]等都取得了成功。樣品懸液制備完成后,首先要進行核酸的提取,然后進行選擇性擴增(PCR),最后進行凝膠電泳并觀察記錄。該方法對無菌環(huán)境和無菌操作沒有太高的要求,可以對多個樣品的目標(biāo)菌同時進行檢測,從而完成大批量的檢測任務(wù),具有很好的特異性、敏感性強,并且比常規(guī)方法更簡單。

        2.3 傳統(tǒng)PCR技術(shù)應(yīng)用于食品微生物檢驗時存在的問題

        在食品微生物檢驗過程中,傳統(tǒng)PCR法仍然存在假結(jié)果的可能。這是因為,一方面在樣品中可能存在干擾因素或者抑制因素,以及聚合酶鏈反應(yīng)效率差異很大,需要根據(jù)不同的因素設(shè)計優(yōu)化反應(yīng)條件,影響因素和反應(yīng)條件的不同都會使得目標(biāo)核酸的擴增不理想;另一個方面,在進行凝膠電泳準(zhǔn)備工作時,人員操作的準(zhǔn)確性、時效性對于結(jié)果有著顯著的影響,增加了結(jié)果的不確定度。

        3 熒光定量PCR

        3.1 熒光定量PCR的原理

        熒光定量PCR就是在反應(yīng)體系中加入熒光因子監(jiān)測熒光信號的變化過程,最后利用專業(yè)軟件對目標(biāo)核酸模板進行定量分析。

        3.2 食品微生物檢驗中熒光定量PCR與傳統(tǒng)PCR的比較

        熒光定量PCR技術(shù)是在傳統(tǒng)PCR方法的基礎(chǔ)上發(fā)展出來的檢驗技術(shù),在金黃色葡萄球菌[5]、芽孢桿菌[6]、大腸桿菌[7]等的食品微生物檢驗中都取得了成熟的經(jīng)驗。與傳統(tǒng)PCR比較,該方法在結(jié)果讀取分析上進行了改進,更簡單、更快速、靈敏度更強。彌補了傳統(tǒng)PCR 定性檢測的一些不足,全過程采用閉管操作,用光譜技術(shù)代替凝膠電泳來呈現(xiàn)結(jié)果,減少了人員操作帶來不利影響的機會,降低了擴增產(chǎn)物污染的可能性,有效地避免了假陽性結(jié)果的出現(xiàn),同時對熒光信號累積過程進行監(jiān)測分析,可以實現(xiàn)對樣本中目標(biāo)菌的定量檢測[8]。但依然沒有解決傳統(tǒng)PCR在擴增過程中,放大干擾因素或者存在抑制因素的問題。

        4 環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增技術(shù)

        4.1 環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增技術(shù)的原理

        環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增技術(shù)根據(jù)靶基因的6個區(qū)域設(shè)計4條引物,核酸鏈在某一恒溫條件下達成解鏈和退火的動態(tài)平衡狀態(tài),因此可以在一個溫度下完成核酸的擴增。

        4.2 食品微生物檢驗中環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法與熒光定量PCR法的比較

        環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增是2000年由Notomi 等[9]發(fā)明的一種新式的恒溫核酸擴增技術(shù),目前已經(jīng)在阪崎腸桿菌[10]、副溶血性弧菌[11]、金黃色葡萄球菌[12]等的食品微生物檢測中取得不錯的效果。熒光定量PCR法與環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法都可以比較準(zhǔn)確地檢出目標(biāo)菌,但相對于環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法,熒光定量PCR法需要質(zhì)量更高的核酸模板,需要更長的檢測時間,需要更精密的儀器設(shè)備,相反環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法用時短、成本低,環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法更適合現(xiàn)場的快速監(jiān)督抽檢[13]。

        5 討論

        PCR技術(shù)是分子生物學(xué)的重要手段,引入了光譜技術(shù)后,發(fā)展出熒光定量PCR方法,在結(jié)果收集分析階段,以熒光信號為標(biāo)的,有較好的特異性、敏感度。熒光定量PCR方法全程閉管操作,減少了與外界接觸的機會,降低了實驗室污染的可能性,這在操作程序上顯得更優(yōu)化、更科學(xué)。但相比常規(guī)檢驗方法,仍然存在儀器設(shè)備昂貴等問題。環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增另辟蹊徑不同于常規(guī)PCR需要多個溫度完成核酸的擴增,而是在恒溫下達到核酸擴增的目的,用時更短、成本更低,同時依然有很好的特異性和敏感度。那么,將環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法與熒光定量所用到的光譜技術(shù)結(jié)合起來,用環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法進行核酸復(fù)制,在反應(yīng)體系中加入熒光基團,然后監(jiān)測熒光信號,進行分析得出結(jié)果[14]。這樣就可以整合熒光定量PCR方法的優(yōu)點和環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法的長處,得到更加普遍使用的食品微生物檢驗分子生物學(xué)技術(shù)方法。

        6 結(jié)語

        熒光環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法仍然還有很多地方需要完善,未來有很大的發(fā)展空間,是未來食品微生物檢驗應(yīng)用分子生物學(xué)方法研究發(fā)展的方向,也勢必會成為食品微生物檢驗領(lǐng)域至關(guān)重要的技術(shù)手段,為食品安全保駕護航。

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