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        不同產(chǎn)地及品種大蒜內(nèi)生菌群落多樣性分析及拮抗作用測定

        2017-12-28 02:50:54新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院微生物應(yīng)用研究所烏魯木齊830091新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與藥學(xué)學(xué)院烏魯木齊830052
        新疆農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年11期
        關(guān)鍵詞:新疆

        (1.新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院微生物應(yīng)用研究所,烏魯木齊 830091;2.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與藥學(xué)學(xué)院,烏魯木齊 830052)

        doi:10.6048/j.issn.1001-4330.2017.11.014

        不同產(chǎn)地及品種大蒜內(nèi)生菌群落多樣性分析及拮抗作用測定

        楚 敏1,張麗娟1,劉曉靜2,朱 靜1,王 瑋1,顧美英1,謝玉清1,張志東1

        (1.新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院微生物應(yīng)用研究所,烏魯木齊 830091;2.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與藥學(xué)學(xué)院,烏魯木齊 830052)

        目的調(diào)查分析不同產(chǎn)地及不同品種大蒜內(nèi)生菌的群落多樣性,測定內(nèi)生菌對(duì)5株病原菌的拮抗作用。方法以新疆、山東的白皮蒜、紅皮蒜為研究材料,采用BIOLOG生態(tài)板法和培養(yǎng)基培養(yǎng)法進(jìn)行大蒜內(nèi)生菌群落多樣性的分析,并利用平板對(duì)峙法,利用大蒜內(nèi)生菌對(duì)立枯絲核菌(Rhizoctoniasoleni)、棉花枯萎病菌棉花枯萎病菌 (Fusariumoxysporumf)、擴(kuò)展青霉 (Penicilliumexpansum)、大腸桿菌(Escherichiacoli)、金黃色葡萄球菌(Staphyloccocusaureus)的拮抗作用進(jìn)行研究。結(jié)果不同品種來源的大蒜內(nèi)生菌群落代謝活性均較低,但不同類型碳源利用活性存在明顯分布規(guī)律;初步篩選獲得的45株內(nèi)生菌,分屬于芽孢桿菌屬(Bacillus)、類芽孢桿屬(Paenibacillus)、鏈霉菌屬(Streptomyces)、擬諾卡氏菌屬(Nocardiopsis) 和迪茨菌屬(Dietzia) 等5個(gè)屬15個(gè)種,其中芽孢桿菌屬菌株占絕大部分,占85%以上,且在不同大蒜樣品中均為優(yōu)勢(shì)菌,但種間分布存在著差異。獲得了24株具有拮抗作用的內(nèi)生菌菌株。結(jié)論大蒜內(nèi)生菌群落多樣性較為簡單,存在著具有拮抗作用的微生物資源,有待進(jìn)一步開發(fā)利用。

        大蒜品種;不同產(chǎn)地;內(nèi)生菌;拮抗菌

        0 引 言

        【研究意義】植物內(nèi)生菌(Endophyte)是指存活于健康植物組織內(nèi)部,而又不引發(fā)宿主植物表現(xiàn)出明顯感染癥狀的微生物類群,目前所有研究過的植物中均發(fā)現(xiàn)有內(nèi)生菌。植物內(nèi)生真菌的研究,不僅在系統(tǒng)分類學(xué)、生物多樣性和生態(tài)學(xué)研究上具有重要的理論意義,也在工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、生物醫(yī)藥以及基因操作應(yīng)用上具有廣泛的應(yīng)用價(jià)值[1-5]?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】大蒜AlliumsativumL.(Garlic),為半年生草本植物,百合科蔥屬,為食藥同源的植物[6,7],通常稱謂大蒜是指其鱗莖?!侗静菥V目》記載,大蒜“其氣熏烈,能通五臟,去寒濕,辟邪惡”。 近代科學(xué)研究表明, 大蒜營養(yǎng)成分豐富,其中以蒜氨酸為代表的大蒜含硫氨基酸具有獨(dú)特的藥理活性[89]。同時(shí),大蒜是天然的植物殺菌素,被世界醫(yī)學(xué)界稱為“二十一世紀(jì)在天然食藥物領(lǐng)域中的最偉大神奇發(fā)現(xiàn)之一”[11]。崔北米等[12]首次對(duì)大蒜的內(nèi)生菌進(jìn)行了分離,獲得19株芽孢桿菌;鄧振山等[13]利用大蒜內(nèi)生菌進(jìn)行了番茄灰霉病防治進(jìn)行了研究,取得了較好的結(jié)果。【本研究切入點(diǎn)】大蒜在我國種植歷史久遠(yuǎn),分布區(qū)域廣,種類多[14],為研究植物內(nèi)生菌的分布和組成提供了良好的材料。然而,有關(guān)大蒜內(nèi)生菌的研究,僅有零星報(bào)道[13-15]。研究不同產(chǎn)地及不同品種大蒜內(nèi)生菌的群落多樣性及拮抗作用測定?!緮M解決的關(guān)鍵問題】研究分別對(duì)產(chǎn)地為新疆和山東的紅皮大蒜、白皮大蒜的內(nèi)生菌群落代謝特征及菌群多樣性進(jìn)行分析,并對(duì)內(nèi)生菌菌株拮抗特性進(jìn)行測試,為進(jìn)一步闡述大蒜內(nèi)生菌菌群分布和開發(fā)利用其內(nèi)生菌資源提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 樣品

        保存完好新鮮的新疆紅皮蒜(產(chǎn)地吉木薩爾縣)、新疆白皮蒜(產(chǎn)地吉木薩爾縣)、山東紅皮蒜(產(chǎn)地金鄉(xiāng)縣)、山東白皮蒜(產(chǎn)地金鄉(xiāng)縣),購自烏魯木齊北園春蔬菜批發(fā)市場。

        1.1.2 測試菌株

        立枯絲核菌(Rhizoctoniasoleni)、棉花枯萎病菌棉花枯萎病菌 (Fusariumoxysporumf)、擴(kuò)展青霉 (Penicilliumexpansum)、大腸桿菌(Escherichiacoli)、金黃色葡萄球菌(Staphyloccocusaureus), 均由新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院微生物應(yīng)用研究所菌種保藏室提供。

        1.1.3 篩選培養(yǎng)基

        完全培養(yǎng)基:蛋白胨10.0 g,酵母膏5.0 g,磷酸氫二鉀 3.0 g,葡萄糖1.0 g,瓊脂15 g/L,水1 000 mL,pH 7.0~7.2。

        MM培養(yǎng)基:胰蛋白胨5.0 g,牛肉膏1.5 g,酵母膏5.0 g,葡萄糖2.0 g,磷酸氫二鉀3.0 g,氯化鈉5.0 g,硝酸鉀1.0 g,硫酸鎂0.5 g,硫酸亞鐵0.01 g,瓊脂15 g,水1 000 mL,pH 7.5。

        其它常見培養(yǎng)基:馬鈴薯-葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA),營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基(NA),高氏一號(hào)培養(yǎng)基(Gause' s No.1)。

        1.2 方 法

        1.2.1 表面消毒

        選取健康的大蒜,去皮,自來水沖洗干凈,用無菌濾紙吸干水分,70%無水乙醇的表面消毒時(shí)間為4 min,無菌水洗浄,無菌濾紙吸干水分;然后3%雙氧水浸泡5min,最后用無菌水沖洗10遍后,無菌濾紙吸干水分,備用。同時(shí)將沖洗的無菌水涂布于平板,以檢測表面消毒的完全[14,15]。

        1.2.2 內(nèi)生微生物群落碳源代謝利用測定[16,17]

        在無菌條件下,稱取20 g表面消毒完全的大蒜放入無菌的果汁均漿杯中,加入200 mL生理鹽水,進(jìn)行組織破碎勻質(zhì)5 min后,靜止20 min。吸取上述上清液加入Biolog Eco 生態(tài)板中,每微孔加150 μL。然后將微平板放置于30 ℃恒溫培養(yǎng)箱內(nèi)溫育。采用Biolog 分析鑒定系統(tǒng)進(jìn)行樣品測定,每24 h 讀板1次,連續(xù)讀7 d[15]。

        1.2.3 內(nèi)生菌的分離篩選

        吸取前述大蒜組織上清液進(jìn)行梯度稀釋,分別涂布在篩選培養(yǎng)基平板中,放置在30 ℃恒溫培養(yǎng),并逐日觀察。挑取具有不同形態(tài)的單菌落,劃線純化。經(jīng)合并整理,接種入相關(guān)培養(yǎng)基斜面保存,供后續(xù)使用。

        1.2.4 菌株的分子鑒定

        采用菌落克隆方法,利用細(xì)菌16S rRNA 基因通用引物27F和1492R進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR產(chǎn)物經(jīng)切膠純化回收后,送往北京鼎國生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測序,所測得序列去除載體序列后,將有效序列在EzTaxon(http://www.ezbiocloud.net/eztaxon/identify)數(shù)據(jù)庫上進(jìn)行比對(duì),調(diào)取同源性最高模式菌株序列, 使用MEGA5.0進(jìn)行CLUSTAL X多重比對(duì),使用NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[18],自舉值為(Bootstrap) 為1000。

        1.2.5 拮抗菌株的篩選

        使用無菌生理鹽水,分別配制不同測試菌株的孢子或菌懸液,真菌孢子懸液控制在104~105CFU/mL,細(xì)菌懸液控制在106~107CFU/mL,取0.2mL涂布于不同培養(yǎng)基上,30 ℃恒溫放置30 min,待平板水分吸干后,點(diǎn)接篩得的內(nèi)生菌,然后置于30 ℃恒溫培養(yǎng)3~5 d,觀察菌株生長情況和菌株間的拮抗現(xiàn)象[15]。

        1.3 數(shù)據(jù)處理[16,17]

        微平板孔中溶液吸光值平均顏色變化率(Average well color development, AWCD)用于描述樣品微生物代謝活性,計(jì)算公式如下:AWCD= (Ci﹣Ri)/n式中,Ci為每個(gè)有培養(yǎng)基孔的吸光值,Ri為對(duì)照孔的吸光值,n為培養(yǎng)基孔數(shù),Biolog Eco板n值為31。采用Simpson、Shannon-Wiener和McIntosh三個(gè)指數(shù)來表征土壤微生物群落功能和種群多樣性。其中Simpson指數(shù)(D)用于評(píng)估群落物種的優(yōu)勢(shì)度,Shannon-Wiener指數(shù)(H)用于評(píng)估群落物種的豐富度,McIntosh指數(shù)(U)用于評(píng)估群落物種均勻度。

        采用DPS v9.50版軟件進(jìn)行平均吸光值(AWCD)、多樣性指數(shù)、及相關(guān)性分析等。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 大蒜內(nèi)生菌代謝多樣性

        2.1.1 內(nèi)生菌代謝活性

        Biolog-Eco 每孔顏色平均變化率(AWCD)是表征樣品中微生物群落對(duì)底物碳源利用強(qiáng)度的指標(biāo),反映樣品中微生物活群落活性的一個(gè)重要指標(biāo)[16]。研究表明,不同來源和不同品種的大蒜內(nèi)生菌AWCD值隨培養(yǎng)時(shí)間的延長而提高。在開始的24 h內(nèi),各個(gè)樣品的AWCD值明顯提高,隨后(新疆紅皮蒜72 h后)表現(xiàn)出緩慢增長的趨勢(shì)。在整個(gè)培養(yǎng)期間,各樣品的AWCD值均不超過0.15,表明大蒜內(nèi)生菌的代謝活力均較低。但總體來說,各個(gè)樣品間微生物活性表現(xiàn)從高到低為新疆白皮蒜﹥山東紅皮蒜﹥新疆紅皮蒜﹥山東白皮蒜。圖1

        圖1 不同品種產(chǎn)地大蒜內(nèi)生菌AWCD值
        Fig.1 AWCD of endophytes in Garlic varieties from different producing areas

        2.1.2 不同類型碳源利用的差異

        為了進(jìn)一步分析不同來源和不同品種大蒜內(nèi)生菌群落的代謝功能多樣性,根據(jù)各樣品AWCD具體變化情況,選取96h的各樣品進(jìn)行了內(nèi)生菌群落不同類型碳源利用的差異分析,此時(shí)AWCD值趨于穩(wěn)定,且各樣品間分形較好。

        通過AWCD值來看,新疆白皮蒜活性最高,而山東紅皮蒜活性最低。從不同來源和不同品種大蒜內(nèi)生菌對(duì)六類碳源代謝利用來看,存在明顯的差別和分布規(guī)律。大蒜內(nèi)生菌群落代謝糖類碳源百分比,從低到高按山東紅皮蒜<山東白皮蒜<新疆紅皮蒜<新疆白皮蒜的順序排列,而代謝多聚類化合物碳源百分比,則從高到低按山東紅皮蒜>山東白皮蒜>新疆紅皮蒜>新疆白皮蒜的順序排列。從不同來源大蒜來看,新疆大蒜內(nèi)生菌在代謝利用糖類碳源和羧酸類碳源百分比均高于山東大蒜,而山東大蒜內(nèi)生菌代謝多聚類化合物碳源百分比高于新疆大蒜。從大蒜種質(zhì)分析,白皮大蒜內(nèi)生菌代謝糖類碳源和氨基酸類碳源的百分比均高于紅皮大蒜,但紅皮大蒜內(nèi)生菌代謝多聚類化合物和胺類碳源的百分比均高于白皮大蒜。圖2

        圖2 不同品種產(chǎn)地大蒜內(nèi)生菌對(duì)6類碳源的利用情況
        Fig.2 Utilization of 6 types of carbon sources by endophytes in Garlic varieties from different producing areas

        2.1.3 土壤微生物群落功能多樣性指數(shù)

        進(jìn)一步分析土壤微生物群落多樣性結(jié)果表明,各樣品間AWCD值在0.132~0.068,差異顯著性分析表明,不同來源的樣品間碳源利用活性差異顯著(ρ﹤0.05),代謝活性呈現(xiàn)山東紅皮蒜>山東白皮蒜>新疆紅皮蒜>新疆白皮蒜。多樣性指數(shù)分析結(jié)果顯示,各樣品微生物Shannon-Wiener豐富度指數(shù)差異不大,表明各樣品間內(nèi)生菌多樣性差別不大,但Simpson優(yōu)勢(shì)度指數(shù)和McIntosh均勻度指數(shù)間差異顯著,且呈現(xiàn)一定規(guī)律,即Simpson優(yōu)勢(shì)度指數(shù)山東紅皮蒜>山東白皮蒜>新疆紅皮蒜>新疆白皮蒜,而McIntosh均勻度指數(shù)相反,表明山東大蒜內(nèi)生菌優(yōu)勢(shì)菌群較新疆群落內(nèi)物種數(shù)量分布不均勻,優(yōu)勢(shì)種的地位突出,且紅皮蒜大于白皮蒜。表1

        表1 不同品種產(chǎn)地大蒜內(nèi)生菌群落功能多樣性指數(shù)
        Table 1 Diversity indices of endophytes in Garlic varieties from different producing areas

        SamplesAWCDSimpson(D)Shannon(H)McIntosh(U)山紅0.132±0.011a1.721±0.111a2.723±0.052a0.886±0.073d山白0.097±0.005b1.673±0.211a2.528±0.032b1.208±0.036c新紅0.087±0.017c1.443±0.132b2.749±0.091a1.452±0.056b新白0.068±0.006d0.953±0.087c2.646±0.087ab1.783±0.067a

        注:每組同列的不同字母表示差異顯著性水平。小寫字母為5%顯著水平

        Note:Letters in same column and same block represented significant differences. Small letters wereP﹤0.05

        2.2 內(nèi)生菌多樣性

        2.2.1 內(nèi)生菌的分離及鑒定

        通過反復(fù)分離純化共獲得可培養(yǎng)的微生物100余株,經(jīng)菌落、菌株形態(tài)觀察,上述菌株合并為45株其中細(xì)菌43株,均為革蘭氏陽性菌;放線菌2株,未發(fā)現(xiàn)真菌。

        通過測序獲得16S rRNA基因序列,與GENEBANK中序列比對(duì)并進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹分析,所得到的45株內(nèi)生菌分離株分屬于芽孢桿菌屬(Bacillus)、類芽孢桿屬(Paenibacillus)、鏈霉菌屬(Streptomyces)、擬諾卡氏菌屬(Nocardiopsis)和迪茨菌屬(Dietzia)的5個(gè)屬15個(gè)種內(nèi),其中芽孢桿菌屬菌株占絕大部分,占85%以上。圖3

        圖3 大蒜內(nèi)生細(xì)菌系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹拓?fù)鋱D
        Fig.3 Neighbor-joining phylogenetic tree based on partial16S rRNA of endophytes in Garlic varieties from different producing areas. Numbers on the nodes are the bootstrap values (percentages) based on 1,000 replicates and values of above 50% were presented

        2.2.2 內(nèi)生菌的分布

        對(duì)不同品種及來源分布不同的大蒜內(nèi)生菌進(jìn)行分析,結(jié)果表明:山東紅皮蒜分離到內(nèi)生菌種類最多,共涉及9種,其它樣品中分離的內(nèi)生菌均為7種。芽孢桿菌為大蒜內(nèi)生菌主要優(yōu)勢(shì)菌群,涉及11個(gè)種,但除B.tequilensis和B.pumilus在四種樣品中均發(fā)現(xiàn)外,其它種的芽孢桿菌在樣品間仍有細(xì)微差別。表2

        2.3 拮抗菌株的篩選

        選取有功能活性的45株菌株進(jìn)行平板對(duì)峙試驗(yàn),測定這45株大蒜內(nèi)生菌對(duì)5種病原菌的拮抗作用。發(fā)現(xiàn)有24株菌株具有不同程度的抑菌效果,其中單獨(dú)抑制細(xì)菌的有7株,單獨(dú)抑制真菌的有14株,另有3株對(duì)實(shí)驗(yàn)選用的真菌和細(xì)菌均有抑制效果。表3

        表2 不同品種產(chǎn)地大蒜內(nèi)生菌分布
        Table 2 Community composition of endophytes in Garlic varieties from different producing areas

        種屬Genus來源及品種Garlicvarietiesfromdifferentproducingareas山東紅皮蒜RedGarlicfromShangdong山東白皮蒜WhiteGarlicfromShangdong新疆紅皮蒜RedGarlicfromXinjiang新疆白皮蒜WhiteGarlicfromXinjiangB.subtilissubsp.inaquosorum++B.mojavensis++B.tequilensis++++B.methylotrophicus+B.sonorensis++B.altitudinis++B.pumilus++++B.aryabhattai++B.anthracis++B.cereus++B.toyonensis++P.taichungensis++S.pratensis+D.cercidiphylli+N.dassonvillei+

        注:+為存在

        Note: +exist

        表3 部分大蒜內(nèi)生菌抑菌特性
        Table 3 Partial results of screening on the antagonism

        株編號(hào)Isolates大腸桿菌E.coli金黃色葡萄球菌S.aureus擴(kuò)展青霉P.expansum立枯絲核菌R.soleni大麗輪枝菌F.oxysporumfSH1++++++、+SB-1++-+++XB-5--+++++XB-18--++++++SH-3++---XH20---++XB-6+----

        注:-為無抑圈菌;+為有抑圈菌;++為抑圈菌直徑比大于1.5 cm

        Note: - no inhibition zone; + inhibition zone; ++ inhibition zone R more than 1.5 cm

        3 討 論

        研究首次通過Biolog Eco生態(tài)板對(duì)來源于山東和新疆的紅皮大蒜和白皮大蒜內(nèi)生菌的代謝多樣性及分布進(jìn)行了研究。研究發(fā)現(xiàn),新疆白皮蒜內(nèi)生菌代謝活性最高,而山東紅皮蒜活性最低,但總體來說大蒜內(nèi)生菌的代謝活性均較低,這可能與大蒜自身具有廣譜抗菌能力有關(guān)。對(duì)六類碳源代謝利用情況分析,內(nèi)生菌群代謝存在產(chǎn)地和品種間差別和規(guī)律;多樣性指數(shù)分析結(jié)果顯示,各樣品間大蒜內(nèi)生菌群多樣性差別不大,但Simpson優(yōu)勢(shì)度指數(shù)和McIntosh均勻度指數(shù)間差異顯著,且呈現(xiàn)一定規(guī)律,即Simpson優(yōu)勢(shì)度指數(shù)山東紅皮蒜>山東白皮蒜>新疆紅皮蒜>新疆白皮蒜,而McIntosh均勻度指數(shù)相反,表明山東大蒜內(nèi)生菌優(yōu)勢(shì)菌群較新疆群落內(nèi)物種數(shù)量分布不均勻,優(yōu)勢(shì)種的地位更突出,且紅皮蒜大于白皮蒜。

        目前有關(guān)大蒜內(nèi)生菌的研究表明,大蒜的內(nèi)生菌種群組成存在地域間的差別,已發(fā)現(xiàn)內(nèi)生菌均為原核微生物,未發(fā)現(xiàn)真核微生物,芽孢桿菌屬菌株為其優(yōu)勢(shì)菌群[13-15]。研究通過多種培養(yǎng)基對(duì)大蒜內(nèi)生菌進(jìn)行了初步分離篩選,共獲得了微生物100余株,經(jīng)形態(tài)學(xué)觀察合并為45株,分子鑒定確定為細(xì)菌和放線菌,未發(fā)現(xiàn)真菌,與現(xiàn)有對(duì)大蒜內(nèi)生菌的研究結(jié)果一致;45株菌株分屬于芽孢桿菌屬、類芽孢桿屬、鏈霉菌屬、擬諾卡氏菌屬和迪茨菌屬的5個(gè)屬15個(gè)種內(nèi),種群組成明顯有別于現(xiàn)有有關(guān)大蒜內(nèi)生菌的報(bào)道。但芽孢桿菌屬為大蒜內(nèi)生菌的優(yōu)勢(shì)菌群,這一結(jié)果與相關(guān)報(bào)道一致。

        同時(shí),大蒜是天然的植物殺菌素,對(duì)致病的葡萄球菌、化膿性球菌、痢疾桿菌、大腸桿菌等,都有明顯的抑菌和殺菌作用[7,10];對(duì)不少細(xì)菌性、真菌性和原蟲性感染,均有治療和預(yù)防價(jià)值[7,11,12]。研究發(fā)現(xiàn)分離的內(nèi)生菌中普遍存在不同性能的抑菌性,且有3株內(nèi)生菌株對(duì)實(shí)驗(yàn)選用的多種植物致病真菌和致病細(xì)菌均有良好的抑菌效果,這一結(jié)果為進(jìn)一步利用大蒜內(nèi)生菌進(jìn)行農(nóng)作物生物防治,以及了解內(nèi)生菌與植物間相互適應(yīng)和進(jìn)化提供了材料。

        4 結(jié) 論

        4.1 大蒜內(nèi)生菌群代謝活性均較低,但存在著差別,其中新疆白皮大蒜活性最高,而山東紅皮蒜活性最低。各樣品間大蒜內(nèi)生菌群多樣性差別不大,但山東大蒜內(nèi)生菌菌群較新疆群落內(nèi)物種數(shù)量分布不均勻,且紅皮蒜大于白皮蒜。

        4.2 開展了45株代表菌株的鑒定,確定分屬于芽孢桿菌屬、類芽孢桿屬、鏈霉菌屬、擬諾卡氏菌屬和迪茨菌屬的5個(gè)屬15個(gè)種,芽孢桿菌屬菌株為大蒜內(nèi)生菌的優(yōu)勢(shì)菌群。

        4.3 獲得了24株具有抑菌作用的菌株,其中單獨(dú)抑制細(xì)菌的有7株,單獨(dú)抑制真菌的有14株,另有3株內(nèi)生菌對(duì)實(shí)驗(yàn)選用的真菌和細(xì)菌均有抑制效果。

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        DiversityoftheendophytesandscreeningofantagonisticmicrobesinGarlicvarietiesfromdifferentproducingareas

        CHU Min1, ZHANG Li-juan1, LIU Xiao-Jing2, ZHU Jing1, WANG Wei1, GU Mei-ying1,XIE Yu-qing1, ZHANG Zhi-dong1

        (1.InstituteofMicrobiology,XinjiangAcademyofAgriculturalSciences,Urumqi830091;2.DepartmentofFoodScience,CollegeofFoodScienceandPharmaceuticalScience,XinjiangAgriculturalUniversity,Urumqi830052)

        ObjectiveIn order to investigate diversity of the endophytes in Garlic varieties from different producing area, and obtain antagonistic microbes.MethodGarlic varieties, white garlic and red garlic from different producing areas were sampled. And then, Biolog Eco method was employed to investigate metabolic characteristics of endophytes. Meanwhile, Endophytes were isolated and antagonistic bacteria toRhizoctoniasoleni,F(xiàn)usariumoxysporumf,Penicilliumexpansum,EscherichiacoliandStaphyloccocusaureuswere screened.ResultLow metabolic activity of endophytes in Garlic were determined, and some differences in the utilization and diversity in Garlic varieties from different producing areas were analyzed. 45 endophytes were isolated which were involved in 15 species belonging to genus Bacillus, genusPaenibacillus, genusStreptomyces, genusNocardiopsis, and genusDietz. Isolates in GenusBacilluswere dominant in Garlic endophytes, accounted for more than 85%, but there were differences in the distribution of species. Additionally, lots of antagonistic bacteria were obtained.ConclusionDiversity of the endophytes in Garlic varieties from different producing area were all poor, but effective resource of antagonistic microbes needs further explore.

        Garlic varieties; different producing areas; endophytes; antagonistic microbes

        Supported by: Natural Science Funds of Xinjiang Uygur Autonomous Region (No.2014211B033)

        ZHANG Zhi-dong(1977-), male, native place:Urumqi,Xinjiang, researcher, Master,research field:Microbial ecology, (E-mail)zhangzheedong@sohu.com

        S188

        A

        1001-4330(2017)11-2067-08

        2017-08-18

        新疆維吾爾自治區(qū)自然基金項(xiàng)目“新疆大蒜根腐病病原菌分離鑒定及發(fā)病規(guī)律動(dòng)態(tài)分析”(2014211B033)

        楚敏(1977-),女,新疆烏魯木齊人,副研究員,碩士,研究方向?yàn)榉肿由飳W(xué)與微生物學(xué),(E-mail)chuliu2002@163.com

        張志東(1977-),男,新疆烏魯木齊人,研究員,碩士,研究方向?yàn)槲⑸锷鷳B(tài),(E-mail)zhangzheedong@sohu.com

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