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        傅里葉分析在江鱈矢耳石形態(tài)中的應(yīng)用

        2017-12-18 11:33:24方華華董曉煜
        水產(chǎn)科學(xué) 2017年3期
        關(guān)鍵詞:松葉耳石傅里葉

        方華華,李 翔,董曉煜

        ( 青島農(nóng)業(yè)大學(xué) 海洋科學(xué)與工程學(xué)院,山東 青島 266109 )

        傅里葉分析在江鱈矢耳石形態(tài)中的應(yīng)用

        方華華,李 翔,董曉煜

        ( 青島農(nóng)業(yè)大學(xué) 海洋科學(xué)與工程學(xué)院,山東 青島 266109 )

        為了驗(yàn)證傅里葉矢耳石分析在江鱈群體鑒別中的有效性,對(duì)3個(gè)江鱈群體矢耳石傅里葉描述子分別進(jìn)行判別分析、主成分分析和聚類分析。判別分析數(shù)據(jù)顯示,3個(gè)群體的判別成功率為96%,判別函數(shù)散點(diǎn)圖顯示,3個(gè)群體分離較清晰,僅有少量重疊;主成分分析中,特征值大于1的15個(gè)主成分的累計(jì)貢獻(xiàn)率為94.354%,其中第一個(gè)主成分的貢獻(xiàn)率為20.718%;聚類分析中,多布庫(kù)爾河群體和松葉湖群體關(guān)系較近,聚為一支。本研究的試驗(yàn)結(jié)果證實(shí)了傅里葉矢耳石分析進(jìn)行江鱈群體鑒別的有效性。

        江鱈;矢耳石;判別分析;聚類分析

        矢耳石因其存在于內(nèi)耳的位置以及以碳酸鈣為主的結(jié)構(gòu)成分,形成后,很難被吸收和改變[1]。隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)和圖像處理軟件的發(fā)展,矢耳石形態(tài)分析已成為一種操作方便、經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的手段。近年來,有關(guān)矢耳石形態(tài)的研究逐漸增多,充分證實(shí)矢耳石形態(tài)分析進(jìn)行魚類種群、種類及生活史鑒別的有效性,是漁業(yè)生態(tài)學(xué)研究的重要補(bǔ)充[2-4]。

        江鱈(Lotalota)——唯一的鱈科淡水魚類,在我國(guó)分布于鴨綠江、額爾齊斯河和黑龍江水系的一種底棲冷水魚類[5]。目前,魚類學(xué)家研究了中國(guó)境內(nèi)江鱈的矢耳石年輪、矢耳石長(zhǎng)與體長(zhǎng)的關(guān)系以及通過形狀指標(biāo)法研究江鱈矢耳石的形態(tài)特征[6-8]。筆者通過傅里葉方法分析了中國(guó)境內(nèi)3個(gè)江鱈群體(額爾齊斯河水系的布爾津河、黑龍江水系的松葉湖和多布庫(kù)爾河)的矢耳石形態(tài)學(xué),擬確定傅里葉矢耳石形態(tài)分析進(jìn)行江鱈群體鑒別的有效性。

        1.1 試驗(yàn)材料

        本試驗(yàn)所用的75尾江鱈分別采自布爾津河、多布庫(kù)爾河和松葉湖(圖1,表1),對(duì)所有樣品進(jìn)行形態(tài)學(xué)測(cè)量后,取其矢耳石,分別編號(hào)后置于離心管中待清洗。

        表1 江鱈樣品信息

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 矢耳石的清洗

        將盛有水和矢耳石的離心管置于超聲波清洗器中清洗50 min,再?zèng)_洗干凈,棄蒸餾水,干燥備用。

        1.2.2 數(shù)據(jù)的獲取

        因大量矢耳石形態(tài)分析顯示左右矢耳石沒有顯著性差異,并且矢耳石形狀指標(biāo)法也證實(shí)了江鱈左右矢耳石沒有顯著性差異[8-9],本研究主要對(duì)左耳石進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。數(shù)碼相機(jī)對(duì)矢耳石外側(cè)面進(jìn)行拍照(圖2),拍照時(shí)盡量將矢耳石的方向一致,減少因矢耳石擺放不一致產(chǎn)生的誤差。應(yīng)用 Shape 軟件包對(duì)矢耳石圖像進(jìn)行分析[10],獲取77 個(gè)傅里葉描述子。

        1.2.3 數(shù)據(jù)處理

        采用Excel 2007和SPSS 17.0對(duì)獲取的77個(gè)傅里葉描述子進(jìn)行判別分析、主成分分析和聚類分析。

        圖1 江鱈的采樣地點(diǎn)[7]

        圖2 江鱈左矢耳石外側(cè)面

        2 結(jié) 果

        2.1 不同群體江鱈矢耳石的判別分析結(jié)果

        對(duì)不同群體江鱈矢耳石的77個(gè)傅里葉描述子進(jìn)行逐步判別分析,得出以12個(gè)傅里葉描述子(V4,V18,V35,V37,V41,V42,V43,V50,V62,V65,V66,V70) 為自變量的判別方程,判別系數(shù)見表2。

        表2 3個(gè)群體江鱈判別方程的判別系數(shù)

        逐步判別分析結(jié)果顯示,3個(gè)不同群體江鱈的75個(gè)樣品中,布爾津河28個(gè)樣品未出現(xiàn)錯(cuò)判現(xiàn)象,判別成功率達(dá)100%;多布庫(kù)爾河23個(gè)樣品出現(xiàn)1個(gè)錯(cuò)判現(xiàn)象,判別成功率達(dá)95.7%;松葉湖24個(gè)樣品產(chǎn)生2個(gè)錯(cuò)判現(xiàn)象,判別成功率達(dá)91.7%,3個(gè)群體總判別成功率達(dá)96%(表3)。

        表3 江鱈群體判別結(jié)果

        逐步判別分析法得出的典型判別分析散點(diǎn)圖顯示,3個(gè)群體間樣品的分離較清晰,僅有松葉湖和多布庫(kù)爾河少量個(gè)體發(fā)生重疊,并且松葉湖和多布庫(kù)爾河群體的組質(zhì)心距離最近(圖 3)。另外,第1個(gè)判別函數(shù)解釋了群體間差異的85.5%,第2個(gè)判別函數(shù)僅解釋群體間差異的14.5%。

        圖3 判別分析散點(diǎn)圖○:布爾津河,△:多布庫(kù)爾河,×:松葉湖,■:組質(zhì)心.

        2.2 不同群體江鱈矢耳石的主成分分析結(jié)果

        3個(gè)群體的77個(gè)傅里葉描述子數(shù)據(jù)進(jìn)行主成分分析,前15個(gè)主成分(特征值大于1)的累積貢獻(xiàn)率為94.354%,貢獻(xiàn)率最高的前3個(gè)主成分的貢獻(xiàn)率分別為20.718%、13.796%、10.425%(表4),主成分散點(diǎn)圖顯示,3個(gè)群體的個(gè)體分布較分散(圖4)。

        圖4 第1、2主成分構(gòu)成的散點(diǎn)圖○:布爾津河,△:多布庫(kù)爾河,×:松葉湖.

        表4 前15個(gè)主成分的貢獻(xiàn)率及特征值

        2.3 不同群體江鱈矢耳石的聚類分析結(jié)果

        為了更直觀的顯示3個(gè)江鱈群體間的差異,對(duì)3個(gè)群體的77個(gè)傅里葉描述子平均值進(jìn)行聚類分析,結(jié)果顯示,松葉湖群體和多布庫(kù)爾河群體的關(guān)系較近,聚為一支,布爾津河群體單獨(dú)聚為另一支(圖5)。

        圖5 3個(gè)江鱈群體聚類分析圖

        3 討 論

        魚類矢耳石形態(tài)分析已被證實(shí)是進(jìn)行種群鑒別和漁業(yè)管理的有效工具,但是不同的方法其準(zhǔn)確率往往有一定的區(qū)別,李輝華等[11]對(duì)刀鱭(Coiliaectenes)群體的研究證明傅里葉耳石分析法得出的判別率高于形態(tài)測(cè)量法,徐勝勇等[12]對(duì)許氏平鲉(Sebastesschlegelii)群體的研究證實(shí)傅里葉耳石分析法判別率高于形狀指標(biāo)法,對(duì)不同的種類、不同的群體要想取得最理想的結(jié)果需要采取不同的方法。對(duì)3個(gè)不同群體江鱈矢耳石的傅里葉分析數(shù)據(jù)進(jìn)行判別分析,總判別成功率高達(dá)96%,比形狀指標(biāo)法97.3%的判別成功率低1.3%,這可能與兩種方法研究的形態(tài)特征不同有關(guān)。傅里葉耳石分析法主要研究耳石的輪廓特征,形狀指標(biāo)法不僅研究矢耳石的輪廓與形狀,還引入反映三維結(jié)構(gòu)的面密度指標(biāo),不同的形態(tài)指標(biāo)受遺傳、性別、食物、水溫等外界環(huán)境的影響程度不同[13-14]。

        對(duì)3個(gè)不同江鱈群體矢耳石的傅里葉分析數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析表明,來自黑龍江水系的多布庫(kù)爾河群體和松葉湖群體聚為一支,額爾齊斯河水系的布爾津河單獨(dú)聚為一支,這一結(jié)果與判別分析中多布庫(kù)爾河群體和松葉湖群體組質(zhì)心距離較近的試驗(yàn)結(jié)果一致,也與形態(tài)學(xué)、遺傳學(xué)的試驗(yàn)結(jié)果一致[15-16]。形狀指標(biāo)法中布爾津河與多布庫(kù)爾河群體聚為一支,松葉湖群體單獨(dú)聚為一支,傅里葉分析方法的結(jié)果與形狀指標(biāo)法的結(jié)果不一致,這可能是因?yàn)閮烧呤褂玫男螒B(tài)指標(biāo)的差異引起的。不同群體江鱈的形態(tài)學(xué)研究也證實(shí)了因?yàn)椴捎玫男螒B(tài)學(xué)指標(biāo)不同而產(chǎn)生的額爾齊斯河水系和黑龍江水系的江鱈隸屬不同亞種的爭(zhēng)議[17-18]。

        傅里葉分析數(shù)據(jù)進(jìn)行主成分分析顯示特征值>1的15個(gè)主成分累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)94.354%,貢獻(xiàn)率最高的第1主成分貢獻(xiàn)率為20.718%。在形狀指標(biāo)法中,貢獻(xiàn)率最高的前3個(gè)主成分的累積貢獻(xiàn)率為87.965%,其中,第1個(gè)主成分的貢獻(xiàn)率為49.552%。傅里葉分析方法的第1、2主成分的散點(diǎn)圖顯示3個(gè)群體樣品分布較分散。以上結(jié)果證實(shí)了傅里葉耳石分析法反映的形態(tài)特征是一個(gè)細(xì)微的變化過程。

        綜上所述,傅里葉矢耳石分析法在江鱈的群體鑒別中是有效的,并且這是一種既操作方便,又經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的手段,但矢耳石形態(tài)又受遺傳、年齡、性別、水溫等內(nèi)因和外因的影響,所以傅里葉耳石形態(tài)分析是進(jìn)行江鱈種群鑒別和漁業(yè)管理的重要補(bǔ)充手段。

        致謝

        感謝中國(guó)海洋大學(xué)高天翔老師給予的幫助和指導(dǎo)!

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        ApplicationofFourierShapeAnalysisinSagittaeofBurbot

        FANG Huahua, LI Xiang, Dong Xiaoyu

        ( College of Marine Science and Engineering, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China )

        Fourier shape analysis was used to study the morphology of sagittae of 75 individuals from 3 burbot (Lotalota) populations. The data from Fourier shape analysis were determined with three statistical analysis methods. The stepwise discriminant analysis revealed that the classification accuracy was 96%. The principal component analysis revealed that the accumulated contribution rate of 15 principal components were 87.965%, with the first principal component of 20.718% of the variation. Cluster analysis revealed that Duobuku′er River and Songye Lake populations clustered as a clade. In short, these findings demonstrated the usefulness of Fourier shape analysis for population identification of burbot.

        Lotalota; sagittae; stepwise discriminant analysis; cluster analysis

        2016年度《水產(chǎn)科學(xué)》優(yōu)秀論文評(píng)選結(jié)果揭曉

        遼寧省水產(chǎn)學(xué)會(huì)近日組織專家對(duì)2016年度《水產(chǎn)科學(xué)》發(fā)表的論文進(jìn)行了評(píng)選,共評(píng)出優(yōu)秀論文8篇,其中一等獎(jiǎng)2篇,分別是《植物乳酸桿菌對(duì)凡納濱對(duì)蝦生長(zhǎng)、消化酶活性和腸道組織形態(tài)的影響》(鄭曉婷,段亞飛,董宏標(biāo),等)、《海捕野生大黃魚選育子代生長(zhǎng)性能及現(xiàn)實(shí)遺傳力分析》(黃偉卿,韓坤煌,陳仕璽,等)。二等獎(jiǎng)6篇,分別是《星斑川鰈、黃蓋鰈和石鰈線粒體基因Cytb和COⅠ片段序列的比較研究》(李青,王波,鄭風(fēng)榮,等)、《混合植物蛋白替代魚粉對(duì)雜交鱘幼魚生長(zhǎng)、排氨率和轉(zhuǎn)氨酶活性的影響》(宋嬌,姜海波,姜志強(qiáng),等)、《長(zhǎng)江口及毗鄰海域三疣梭子蟹種群生物學(xué)特征及與環(huán)境的關(guān)系》(袁偉,金顯仕,單秀娟)、《大西洋鮭循環(huán)水養(yǎng)殖水體異養(yǎng)細(xì)菌組成的研究》(王先平,李杰,韓厚偉,等)、《大竹蟶幼貝濾水率的響應(yīng)面法分析》(姜北,董穎,高杉,等)、《貫眾、當(dāng)歸、黃芪對(duì)半滑舌鰨血液抗氧化指標(biāo)的影響》(葛婧,郭永軍,王慶奎,等)。遼寧省水產(chǎn)學(xué)會(huì)將對(duì)上述優(yōu)秀論文作者頒發(fā)證書。

        10.16378/j.cnki.1003-1111.2017.03.018

        Q917

        A

        1003-1111(2017)03-0364-05

        2016-09-01;

        2016-10-18.

        國(guó)家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新項(xiàng)目(201310435044) ;山東省青年科學(xué)基金資助項(xiàng)目(ZR2011CL014).

        方華華(1979—),女,講師,碩士;研究方向:漁業(yè)資源. E-mail:fanghh79@126.com. 通訊作者:董曉煜(1978—),男,副教授;研究方向:漁業(yè)資源. E-mail:David_xiaoyu@126.com.

        (遼寧省水產(chǎn)學(xué)會(huì)秘書處)

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