呂小林 聶益軍 林慧 肖婕
基于PCR-反向點(diǎn)雜交法對(duì)江西地區(qū)分枝桿菌感染狀況分析
呂小林 聶益軍 林慧 肖婕
目的了解江西地區(qū)分枝桿菌感染流行現(xiàn)狀,為臨床防治提供科學(xué)依據(jù)。方法運(yùn)用PCR-反向點(diǎn)雜交法對(duì)345例可疑分枝桿菌感染患者不同標(biāo)本進(jìn)行分枝桿菌核酸檢測(cè)。結(jié)果345份標(biāo)本中共檢出68例陽(yáng)性(陽(yáng)性率為19.7%),其中結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群(MTC)59例(占86.76%),非結(jié)核分枝桿菌(NTM)8例(占11.77%),混合感染(MTC/MIN)1例(1.47%);NTM感染中檢測(cè)出5種,分別為偶發(fā)/豬分枝桿菌(MFO)、戈登分枝桿菌(MGO)、胞內(nèi)分枝桿菌(MIN)、龜分枝桿菌膿腫亞腫(MAB)、蟾蜍分枝桿菌(MXE),其中以MIN為主,占5.88%;不同標(biāo)本中分枝桿菌檢出率不同,痰液、灌洗液、分泌物、胸水中分枝桿菌檢出率分別為:31.5%、20.3%、16.0%、4.7%。結(jié)論江西地區(qū)分枝桿菌感染主要以MTC為主,且多為單一感染。
分枝桿菌;感染;PCR-反向點(diǎn)雜交
分枝桿菌感染引起的結(jié)核病和非結(jié)核病是嚴(yán)重危害人類健康的慢性傳染病,在全球范圍內(nèi)流行,是全球重點(diǎn)控制的傳染病之一。全球每年新發(fā)病例超過(guò)900萬(wàn),約200萬(wàn)人死于結(jié)核病[1]。我國(guó)2009年的結(jié)核病年發(fā)病患者約為130萬(wàn),僅次于印度,為世界第二大結(jié)核病高發(fā)國(guó)家[2]。近年來(lái),非結(jié)核分枝桿菌(NTM)感染呈快速增長(zhǎng)趨勢(shì),并已成為威脅人類健康的重要公共衛(wèi)生問(wèn)題[3]。由于結(jié)核分枝桿菌感染及非結(jié)核分枝桿菌病在臨床特點(diǎn)上極其相似,但其治療方案存在明顯差異。2012年我國(guó)制訂的有關(guān)分枝桿菌感染的專家共識(shí)示,在診斷及治療分枝桿菌病前需進(jìn)行分枝桿菌菌種鑒定,以便對(duì)不同分枝桿菌感染進(jìn)行對(duì)癥治療[4]。因此菌種鑒定對(duì)分枝桿菌感染診治極其重要。本研究應(yīng)用PCR-反向點(diǎn)雜交法對(duì)我院345例疑似非分枝桿菌感染患者不同標(biāo)本進(jìn)行菌種鑒定,旨在報(bào)道江西地區(qū)非分桿菌流行狀況,為臨床診治及制訂相關(guān)防控措施提供實(shí)驗(yàn)室依據(jù)。
一、一般資料
收集2015年7月至2016年5月期間于江西省南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院就診的疑似分枝桿菌感染的門(mén)診及住院患者共345例,其中男性220例,女性125例,年齡1-88歲,平均年齡55.4歲。標(biāo)本類型有灌洗液、痰液、胸水、腹水等。
二、儀器與試劑
ABI2700定性PCR擴(kuò)增儀、水浴箱、分子雜交箱及分枝桿菌菌種鑒定基因檢測(cè)試劑(亞能生物技術(shù)有限公司原裝試劑)等。
三、方法
應(yīng)用PCR-反向點(diǎn)雜交法檢測(cè)22個(gè)分枝桿菌,包括恥垢分枝桿菌(MSM)、胞內(nèi)分枝桿菌(MIN)、堪薩斯分枝桿菌(MKA)、龜分枝桿菌龜亞種(MCH)、海/潰瘍分枝桿菌(MMA)、偶發(fā)/豬分枝桿菌(MFO)、土分枝桿菌(MTE)、不產(chǎn)色分枝桿菌(MNO)、結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群(MTC)、鳥(niǎo)分枝桿菌(MAV)、瘰疬分枝桿菌(MSC)、龜分枝桿菌膿腫亞腫(MAB)、蟾蜍分枝桿菌(MXE)、淺黃分枝桿菌(MGI)、草分枝桿菌(MPH)、戈登分枝桿菌(MGO)、次要分枝桿菌(MTR)、胃分枝桿菌(MGA)、母牛分枝桿菌(MUA)、蘇爾加分枝桿菌(MDI)、迪氏分枝桿菌(MDI)、猿猴分枝桿菌(MSI)。
1 標(biāo)本處理:在各種標(biāo)本中加入適量4%NaOH 37 ℃液化30min或更長(zhǎng)時(shí)間,13000rmp離心5min,棄上清液,向沉淀中加入1mL MTB洗液,洗滌離心棄上清液,再向沉淀中50 μl MTB裂解液,沸水浴10min離心留上清液。
2 取出PCR反應(yīng)管,加入已提取好的待測(cè)樣品DNA 4μl按以下條件進(jìn)行擴(kuò)增,50℃ 2min,95℃ 10min,95℃ 45s、68℃ 60s 30cycles,95℃ 30s、54℃ 30s、68℃ 60s 30cycles,68℃ 10min,另設(shè)陽(yáng)性、陰性質(zhì)控。
3 雜交:將所有PCR擴(kuò)增產(chǎn)物(約25μl)加入到裝有雜交膜的雜交液管中,沸水水浴10min之后置于雜交箱中,59℃雜交1.5h。
4 洗膜:取出雜交膜,移至裝有預(yù)熱到59℃的洗液中,輕搖洗滌15min。
5 顯色:將洗滌好的雜交膜放入1:2000的POD溶液中,室溫輕搖浸泡30min,再用洗液清洗2遍,之后置于顯色液中避光顯色10min即可觀察結(jié)果。
6 結(jié)果判讀:根據(jù)雜交膜塊上不同位點(diǎn)是否顯判讀分枝桿菌陰、陽(yáng)性。
四、統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析采用SPSS17.0軟件處理,分類計(jì)數(shù)資料用率來(lái)進(jìn)行描述。
一、分枝桿菌菌種鑒定結(jié)果
345例患者中檢出68例(19.7%)陽(yáng)性共6種分枝桿菌,其中男性40例(18.2%),女性28例(22.4%);結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群59例(17.1%),非結(jié)核分枝桿菌8例(2.3%),另外1例為混合分枝桿菌感染(0.3%);痰液、灌洗液、分泌物、胸水各種標(biāo)本中分枝桿菌檢出率分別為31.5%、20.3%、16%、4.7%。(見(jiàn)表1)。
二、分枝桿菌分布特點(diǎn)
68例分枝桿菌中共包括6種類型,分別為MTC 59例(86.76%)、MFO 1例(1.47%)、MGO 1例(1.47%)、MIN 4例(5.88%)、MAB 1例(1.47%)、MXE 1例(1.47%)、MTC/MIN 1例(1.47%),具體結(jié)果見(jiàn)表2。
表1 345例患者分枝桿菌檢測(cè)結(jié)果
表2 68株非分枝桿菌菌種分布情況
自1882年分枝桿菌被Koch發(fā)現(xiàn)以來(lái),現(xiàn)已知有150多種, 分為結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群、非結(jié)核分枝桿菌及麻風(fēng)桿菌三大類,目前以結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群及非結(jié)核分枝桿菌感染為主。分枝桿菌是引起人類慢性傳染性感染的最重要的病原微生物之一,無(wú)論在發(fā)展中國(guó)家還是在發(fā)達(dá)國(guó)家,分枝桿菌感染都是影響公共衛(wèi)生健康的棘手問(wèn)題。高發(fā)病率、高死亡率及易傳染性,迫使分枝桿菌感染倍受關(guān)注。2010年我國(guó)第五次全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)調(diào)查示[5],我國(guó)現(xiàn)有結(jié)核病患者700萬(wàn),其中非結(jié)核分枝桿菌的感染率為22.9%,明顯高于2000年全國(guó)第四次結(jié)核病流行病調(diào)查的11.1%[6]。本研究分析了345例可疑分枝桿菌感染患者,結(jié)果示共68例陽(yáng)性(占19.7%),其中MTC占86.76%,NTM占11.77%,混合感染占1.47%,NTM感染率低于第五次全國(guó)調(diào)查水平,與第四次全國(guó)感染率相仿。NTM與MTC同屬抗酸桿菌,有臨床特征相似,故極易誤診誤治[7],而NTM對(duì)常規(guī)抗結(jié)核藥具有較高的耐藥性[8-9],因此準(zhǔn)確快速檢測(cè)分枝桿菌菌種對(duì)于結(jié)核病防治意義重大。作者運(yùn)用PCR-斑點(diǎn)雜交方法分析了345例患者不同標(biāo)本中分枝桿菌感染狀況,結(jié)果示男性感染40例(占18.2%),女性感染28例(占22.4%);不同標(biāo)本中分枝桿菌檢出率不同,痰液、灌洗液、分泌物、胸水中分枝桿菌檢出率分別為:31.5%、20.3%、16.0%、4.7%;本次研究共發(fā)現(xiàn)6種分枝桿菌,其中以MTC感染為主,占86.76%,非結(jié)核分枝桿菌中以MIN為主,占5.88%,與北京[10]、上海[11]、廣州[12]等報(bào)道存在一定差異,由此可見(jiàn)NTM感染具有明顯地區(qū)差異;另外68例感染患者中只有1例混合感染,提示分枝桿菌感染以單一感染為主。
由于非結(jié)核分枝桿菌感染呈現(xiàn)上升趨勢(shì),且存在明顯地域差異等特性,因此有必要建立準(zhǔn)確、快速檢測(cè)方法,分析分枝桿菌流行狀況,為當(dāng)?shù)匦l(wèi)生醫(yī)療機(jī)構(gòu)因地制宜地制訂相應(yīng)的防治措施提供依據(jù)。
[1] World Health Organization.Tuberculosis[M].Geneva:World Health Organization,2008.
[2] World Health Organization.WHO report 2009: Global Tuberculosis Control: Epidemiology, Strategy, Financing [M].Geneva:World Health Organization,2009.
[3] Thomson RM.Changing epidemiology of pulmonary nontuberculous mycobacteria infections[J].Emerg Infect Dis,2010,16(10):1576-1583.
[4] 中華醫(yī)學(xué)會(huì)結(jié)核病學(xué)分會(huì),《中華結(jié)核和呼吸雜志》編輯委員會(huì).非結(jié)核分枝桿菌病診斷與治療專家共識(shí)[J].中華結(jié)核和呼吸雜志,2012,35(8):572-580.
[5] 全國(guó)第五次結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查技術(shù)指導(dǎo)組,全國(guó)第五次結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查辦公室.2010年全國(guó)第五次結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查報(bào)告[J].中國(guó)防癆雜志,2012,34(8):485-508.
[6] 全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查技術(shù)指導(dǎo)組.第四次全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查報(bào)告[J].中華結(jié)核和呼吸雜志,2002,25(1):3-7.
[7] 孫勤,沙巍.非結(jié)核分枝桿菌肺病與肺結(jié)核患者的臨床特征對(duì)比分析[J].中國(guó)防癆雜志,2011,33(2):120-122.
[8] 柴華,包訓(xùn)迪.29例非結(jié)核分枝桿菌的藥敏實(shí)驗(yàn)分析[J].臨床肺科雜志,2012,17(3):564-565.
[9] 齊志強(qiáng),向延根,唐愛(ài)國(guó),等.225株非結(jié)核分枝桿菌基因芯片分型及藥敏分析[J].臨床肺科雜志,2014,19(1):105-107.
[10] 宋文虎,端木宏謹(jǐn).我國(guó)人群中非典型分枝桿菌感染調(diào)查[J].中華結(jié)核和呼吸雜志,1992,15(6):333-335.
[11] 梁莉,張瀅蓉,樂(lè)軍,等.上海市非結(jié)核分枝桿菌感染趨勢(shì)及耐藥分析[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2007,17(7):895-897.
[12] 李昕潔,譚守勇,黃業(yè)倫,等.812株非結(jié)核分枝桿菌臨床分離株流行病學(xué)特征分析[J].中國(guó)防癆雜志,2010,32(12):811-814.
EpidemiologyofmycobacteriainfectionbyPCR-reversedothybridizationinJiangxiarea
LVXiao-lin,NIEYi-jun,LINHui,XIAOJie
theFirstAffiliatedHospitalofNanchangUniversity,Nanchang,Jiangxi330006,China
ObjectiveTo understand the prevalence of mycobacteria infection in Jiangxi region and to provide a scientific basis for clinical prevention and treatment.MethodsThe different samples of 345 patients who suspected with mycobacteria infection were tested by PCR- reverse dot hybridization.Results68 cases were positive in 345 specimens, including 59 cases of mycobacteria tuberculous complex (MTC) (86.76%) and 8 cases of nontuberculous mycobacteria (NTM) (11.77%) and 1 case of mixed infection (MTC/MIN) (1.47%). There were 5 kinds of NTM infection detected, namely MFO, MGO, MIN, MAB and MXE respectively, and MIN was priority to others in NTM, accounted for 5.88%. The positive rate was various in different specimens, which sputum, lavage, secretions, pleural effusion positive rate was31.5%, 20.3%, 16.0%, and 4.7% respectively.ConclusionMTC and single infection are mainly types of mycobacterial infection in Jiangxi region.
mycobacteria; infection; PCR- reverse dot hybridization
10.3969/j.issn.1009-6663.2017.12.032
330006 江西 南昌,南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科
2016-12-30]