周海燕+廖世玉
摘 要: 我們來(lái)自哪里?我們又將去往何方?這既是一個(gè)哲學(xué)問(wèn)題又是一個(gè)科學(xué)問(wèn)題,哲學(xué)問(wèn)題沒(méi)有標(biāo)準(zhǔn)答案,但科學(xué)問(wèn)題可以通過(guò)實(shí)驗(yàn)和科學(xué)計(jì)算得到精確的結(jié)果?,F(xiàn)有的研究表明,地理距離較近的群體一般也表現(xiàn)出遺傳上的相似性,這就像不同地區(qū)的人說(shuō)不同的語(yǔ)言一樣,不同的發(fā)音傾向于在不同的地區(qū)使用和傳播,同一區(qū)域的群體則往往傾向于同一來(lái)源和群體內(nèi)部的基因交流,從而帶上相同或相似的遺傳標(biāo)記,我們將這些遺傳標(biāo)記叫做單倍型。研究這些單倍群的來(lái)源和分布情況可以很好的反映人類起源和史前遷徙的歷史,線粒體DNA和Y染色體DNA就是這些單倍型的載體,能在人類繁衍過(guò)程中代代相傳。
關(guān)鍵詞: 線粒體DNA;Y染色體;單倍型;起源;遷徙
自從誕生之初起,人類從未停止過(guò)對(duì)自身起源的探索,無(wú)論是東方的女?huà)z造人還是西方的亞當(dāng)夏娃,每一種傳說(shuō)都蘊(yùn)含著人類無(wú)盡的想象力和美好的愿景。然而傳說(shuō)畢竟是傳說(shuō),科學(xué)才是認(rèn)識(shí)世界的有力武器。現(xiàn)有的研究表明,地理距離較近的群體一般也表現(xiàn)出遺傳上的相似性,這是由于同一區(qū)域的群體往往傾向于同一來(lái)源和群體內(nèi)部的基因交流[1],在進(jìn)化的過(guò)程中,不同的群體之間由于不斷累積隨機(jī)突變,發(fā)生遺傳漂變、自然選擇過(guò)程,使群體之間存在遺傳多態(tài)性,這也是當(dāng)今世界三大人種形成的原因。對(duì)現(xiàn)代人群的起源和遷徙的研究可以回答人類來(lái)源和現(xiàn)有分布格局產(chǎn)生是如何產(chǎn)生的科學(xué)問(wèn)題。
非洲被稱為人類起源的搖籃,解剖學(xué)上的現(xiàn)代人(Homo sapiens)于10-20萬(wàn)年前出現(xiàn)在東非,在約12.5萬(wàn)年前的第四紀(jì)最后一個(gè)間冰期到達(dá)非洲紅海海岸,并學(xué)會(huì)了利用海岸線上的食物和資源的技能。大約9萬(wàn)年前,現(xiàn)代人沿紅海海岸進(jìn)入阿拉伯半島,再沿印度洋海岸到達(dá)南亞和東南亞,隨后一部分人群向南遷徙到達(dá)東南亞大陸、太平洋島嶼和澳大利亞,另一部分則向北遷徙進(jìn)入東亞和西伯利亞以及美洲大陸[2]?,F(xiàn)代人的出現(xiàn),取代了100萬(wàn)年前同樣起源與非洲的直立人(Homo erectus),如尼安德特人和丹尼索瓦人,成為現(xiàn)代人的祖先,這就是著名的現(xiàn)代人單地區(qū)起源假說(shuō),又叫走出非洲假說(shuō)(Out of Africa)。
然而,科學(xué)的進(jìn)步需要不同思想的碰撞,1984年Milford H. Wolpoff、 Alan Thorne 和吳新志提出多地區(qū)起源假說(shuō)(Multiregional hypothesis)。他們認(rèn)為走出非洲假說(shuō)并不能解釋為何在歐洲、中國(guó)以及印度尼西亞挖掘的人類化石在形態(tài)學(xué)上具有連續(xù)性,同時(shí)在時(shí)間和空間上也有連續(xù)性[4],多地區(qū)起源假說(shuō)將現(xiàn)代人的祖先追溯到分布在世界各地的直立人,在世界各地獨(dú)立進(jìn)化,并不像走出非洲假說(shuō)所提出的僅僅發(fā)生在非洲,同時(shí)由于不同地區(qū)群體之間一直不斷地進(jìn)行頻繁的基因交流,導(dǎo)致現(xiàn)代人在遺傳上的差異不像表型差異那么大。兩種學(xué)說(shuō)的主要分歧在于古人類到現(xiàn)代人進(jìn)化過(guò)程中是否發(fā)生物種分化,所有的變化是否發(fā)生在同一個(gè)物種內(nèi)。他們各自都有各自的證據(jù),這種矛盾一時(shí)間變得不可調(diào)和。
基因組學(xué)的研究為解決這一矛盾提供了新的切入點(diǎn)。隨著分子生物學(xué)和遺傳學(xué)的發(fā)展以及人們對(duì)基因組認(rèn)識(shí)的不斷加深,線粒體DNA(mtDNA)走上了研究人類群體歷史的舞臺(tái),80年代初美國(guó)斯坦福大學(xué)和加州大學(xué)伯克利分校的研究者們將mtDNA應(yīng)用到人類群體歷史的研究中[3]。1987年,Allan C.Willson首次通過(guò)分析來(lái)自五大洲人群的147份樣本的mtDNA,繪制了世界上第一個(gè)現(xiàn)代人mtDNA系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),表明全世界的現(xiàn)代人都是20萬(wàn)年前生活在非洲的一位女性,即“線粒體夏娃”的后代。第一次從分子水平上證明了現(xiàn)代人的非洲起源假說(shuō)。
除了線粒體DNA,Y染色體的研究也為追溯人類起源和遷徙提供有力的手段和證據(jù)。人類Y染色體DNA(Y-DNA)總長(zhǎng)約60Mbp,大小是線粒體的三千多倍,蘊(yùn)含更多群體信息。此外,Y染色體由兩端的擬常染色體區(qū)(Pseudoautosomal regions,PAR)和中間的雄性特異區(qū)(Male Specific Region of Y Chromosome,MSY)組成(圖1),雄性特異區(qū)不與其同源染色體發(fā)生重組,在父系遺傳中能夠很好的累積傳代過(guò)程中所產(chǎn)生的突變。同時(shí),Y染色體理論上的有效群體大?。‥ffective Population Size)是常染色體的四分之一,對(duì)遺傳漂變(Genetic Drift)群體事件非常敏感,能提供豐富的群體歷史信息。
Y染色體單倍型分析是重建人類群體父系歷史的有效手段。Y染色體上的單倍型遺傳標(biāo)記主要有兩種:一種是雙等位基因標(biāo)記(Y-SNP),另一種是短串聯(lián)重復(fù)序列(Y-STR)。Y-SNP的突變速率很低(2X10-8個(gè)/代),同一位點(diǎn)發(fā)發(fā)生回復(fù)突變的可能性幾乎為零,所以Y染色體上的突變反應(yīng)了人類漫長(zhǎng)的父系遺傳歷史。Y-STR的突變速率比Y-SNP要快許多(約為6.9X10-4個(gè)/代),存在回復(fù)突變和重復(fù)突變,可以記錄較為近期的群體事件,被用來(lái)估計(jì)人群的起源和分歧時(shí)間。因此,我們將Y染色體上的Y-SNP和Y-STR遺傳標(biāo)記結(jié)合起來(lái),通過(guò)分析一定Y-SNP背景下的Y-STR分布結(jié)構(gòu)來(lái)推測(cè)攜帶某一Y-SNP的群體的群體歷史,這種方法比單獨(dú)用Y-SNP或者Y-STR取得的結(jié)果更為準(zhǔn)確。目前,這一分析方法已經(jīng)在研究世界各大人群進(jìn)化歷史中廣泛使用。
由于Y-SNP突變速率很低,并且不與其他染色體發(fā)生重組,一旦產(chǎn)生就會(huì)穩(wěn)定的傳遞給后代,這些突變?cè)赮染色體上按時(shí)間順序先后發(fā)生并在后代中完整的保留下來(lái)。以這一方式產(chǎn)生的多個(gè)Y-SNP在不同個(gè)體或群體間的差異構(gòu)成了Y-DNA的單倍型(Haplotype),祖先單倍型與后代單倍型共享相同的單倍群(Haplogroup),根據(jù)不同單倍群中的SNP的發(fā)生時(shí)間順序關(guān)系可以構(gòu)建單倍群譜系樹(shù),即Y染色體系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。
在群體遷徙過(guò)程中,先產(chǎn)生的突變完整的保留在所以的子代中,后產(chǎn)生的突變也反映在不同的遷徙歷史中,呈現(xiàn)出一定的地理分布規(guī)律。如圖2所示,根部支系A(chǔ)和B只分布在廣袤的非洲大地,非洲以外地區(qū)則分布著C到Q支系,這些支系人群都帶有M-168、M294和P9.1突變位點(diǎn),在CT支系中新產(chǎn)生的突變位點(diǎn)YAP定義的DE支系在非洲和亞洲都有分布[5],突變位點(diǎn)M-130定義支系C主要分布在東亞、太平洋島嶼和北美;F-M89則在非洲以外地區(qū)廣泛分布;I和J支系是中東和歐洲人群的主要支系[6];在東亞M-9定義的K支系具有最高的分布頻率。
根據(jù)不同支系在不同地區(qū)的分布頻率的差別,我們可以大致的推測(cè)出人類祖先在遙遠(yuǎn)的史前時(shí)期的遷徙路線,再次將人類的祖先追溯到遙遠(yuǎn)的非洲大草原,證明了走出非洲假說(shuō)的正確性。
線粒體DNA和Y染色體DNA為研究人類祖先起源和史前遷徙提供有力的工具,為考古學(xué)研究提供間接證據(jù),同時(shí)相較于考古學(xué)又有更高的精確度和分辨率,我相信,隨著古DNA技術(shù)的發(fā)展和新的分析工具的產(chǎn)生,人類對(duì)自身的認(rèn)識(shí)將會(huì)更加透徹,真正的解決科學(xué)研究的終極目的:我是誰(shuí)?我來(lái)自哪里?我將去往何方?■
參考文獻(xiàn)
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