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        單純室間隔缺損與房間隔缺損患者血清蛋白質(zhì)組學(xué)分析

        2017-08-24 02:06:02張妙賢李珂趙光李寶輝巴武龍盧圣勛鄒陽(yáng)
        實(shí)用醫(yī)藥雜志 2017年8期
        關(guān)鍵詞:磁珠正常人房間隔

        張妙賢,李珂,趙光,李寶輝,巴武龍,盧圣勛,鄒陽(yáng)

        單純室間隔缺損與房間隔缺損患者血清蛋白質(zhì)組學(xué)分析

        張妙賢,李珂*,趙光,李寶輝,巴武龍,盧圣勛,鄒陽(yáng)

        目的應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解析/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)技術(shù)對(duì)單純性室間隔缺損(ventrieular septal defect,VSD)、房間隔缺損(atrial septal defect,ASD)患者術(shù)前、術(shù)后及正常人血清蛋白質(zhì)譜進(jìn)行分析,得到高敏感性和特異性的血清蛋白,建立診斷模型指紋圖譜。方法采用MALDI-TOF-MS技術(shù)分別檢測(cè)27例單純VSD、ASD患者與20名正常人血清蛋白相對(duì)含量,運(yùn)用Flex Analysis和Bio Tools軟件對(duì)兩組血清蛋白質(zhì)譜進(jìn)行分析;篩選出差異蛋白,再通過(guò)分析軟件對(duì)其進(jìn)行交叉驗(yàn)證,得到具有診斷意義的特異性蛋白標(biāo)志物。結(jié)果檢測(cè)到蛋白質(zhì)質(zhì)荷比(M/Z)在600~10500Da范圍內(nèi),單純VSD、ASD組與正常人組有差異的蛋白質(zhì)峰為15個(gè)(P<0.05)。生物標(biāo)記物可以將單純VSD、ASD組與正常人準(zhǔn)確地分組,其敏感性為91.5%,特異性為97.2%。結(jié)論MALDI-TOF-MS技術(shù)對(duì)單純VSD、ASD組術(shù)前、術(shù)后及正常人組血清蛋白質(zhì)譜進(jìn)行分析,可以篩選出單純VSD、ASD患者的特異性血清標(biāo)志物。

        單純性室間隔缺損;房間隔缺損;基質(zhì)輔助激光解析/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜;血清蛋白

        室間隔缺損(ventrieular septal defect,VSD)、房間隔缺損(atrial septal defect,ASD)是臨床常見(jiàn)的先天性心臟病,Harris等[1]研究發(fā)現(xiàn),富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白(secreted protein acidic and rich in cysteine,SPARC)能夠調(diào)控心臟膠原蛋白的形成以及膠原蛋白與成纖維細(xì)胞分子間的相互作用,說(shuō)明先天性心臟病在蛋白質(zhì)水平方面應(yīng)該就已經(jīng)發(fā)生了變化,蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)可以從細(xì)胞整體水平上檢測(cè)到這種變化,這些發(fā)生的蛋白質(zhì)變化都有可能成為臨床監(jiān)測(cè)的指標(biāo)。

        基質(zhì)輔助激光解析/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrix assisted laser desorption/ionization-time of flightmass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技術(shù),主要是通過(guò)快速分析細(xì)胞以及組織中蛋白荷比的變化來(lái)了解細(xì)胞所產(chǎn)生的生物學(xué)變化[2],直接獲取某種疾病的特征生物學(xué)標(biāo)記。質(zhì)譜分析技術(shù)近年已逐漸應(yīng)用于胃癌、小細(xì)胞肝癌、乳腺癌、大腸癌及卵巢癌等惡性腫瘤早期診斷的探索性研究[3-8],該研究旨在應(yīng)用質(zhì)譜分析技術(shù)對(duì)單純VSD、ASD患者與正常人血清蛋白質(zhì)譜進(jìn)行分析,從中篩選差異性多肽和蛋白,建立診斷模型指紋圖譜,對(duì)單純VSD、ASD的發(fā)病機(jī)制進(jìn)行探索。

        1 資料與方法

        1.1 研究對(duì)象及分組先心病組VSD和ASD血清樣本27例取自筆者所在醫(yī)院2015年4月—2015年10月住院的單純性VSD和ASD患者,經(jīng)超聲心動(dòng)圖診斷并經(jīng)心臟手術(shù)確診,年齡0.5~40歲,治療前、治療后排除其他先天畸形,無(wú)發(fā)熱、炎癥等可能影響檢測(cè)結(jié)果的情況。健康對(duì)照組20名血清樣本取自同期該醫(yī)院體檢正常的健康者。兩組間性別、種族及月齡按1∶1匹配。出生地均為河南省。先心病組27例,分術(shù)前組19例與術(shù)后組8例(預(yù)報(bào)集數(shù)與校正集數(shù),分別為13∶6與5∶3);正常組20名(預(yù)報(bào)集數(shù)與校正集數(shù)為13和7)。

        1.2 儀器試劑與方法

        1.2.1 儀器試劑Eppendorf公司的磁珠分離器、微量加樣槍、高速臺(tái)式離心機(jī)、SCOUT-MTP樣品靶,Bruck公司的AUTOFLEX TOF/TOF質(zhì)譜儀及Reveo公司的超低溫冰箱、通風(fēng)櫥等。試劑采用銅整合磁珠懸浮液、銅整合磁珠清洗緩沖液(WS)、銅整合磁珠結(jié)合緩沖液(BS)、銅整合磁珠清洗脫緩沖液(ES)、基質(zhì)(3mg/mlCHCA,50%ACN,2%TFA)等。

        1.2.2 樣品收集患者入院次日或手術(shù)次日清晨采集空腹靜脈血3m l,普通干燥管靜置于4℃冰箱內(nèi)2 h,2000 r/min離心10~20min,取上清按100μl管分裝標(biāo)記,置于-70℃超低溫冰箱保存。血清樣品、樣品靶進(jìn)行結(jié)合前生化處理后,血清蛋白與標(biāo)準(zhǔn)靶進(jìn)行結(jié)合:樣品10μl置于1.5ml離心管中,混勻磁珠懸浮液,取5μl磁珠加入樣品管,再加入50μlBS,將樣品管放入磁珠分離器,在前后相鄰兩孔間反復(fù)移動(dòng)樣品管10次混勻,分離后用加樣槍吸去樣品管中的溶液,向樣品管中加入20μl BS使磁珠重新懸浮、分離,再向樣品管中加入100μl WS,在磁珠分離器內(nèi)混勻,向樣品管中加入10μl ES混勻,磁珠與洗脫液分離,用加樣槍將洗脫下來(lái)的多肽樣品溶液小心移入干凈的0.5ml樣品管,點(diǎn)1μl洗脫樣品及1μl基質(zhì)于樣品靶。提取出47份血清中蛋白成分。

        1.2.3 質(zhì)譜檢驗(yàn)及樣品統(tǒng)計(jì)學(xué)分析將制備好的SCOUT-MTP樣品靶通過(guò)AUTOFLEX TOF/TOF質(zhì)譜儀檢測(cè)口放入并固定,啟動(dòng)脈沖激光,擊打樣品靶點(diǎn),通過(guò)flex Control的setup設(shè)置儀器參數(shù),當(dāng)激光開(kāi)始脈沖時(shí),數(shù)字轉(zhuǎn)換器記錄由檢測(cè)器檢測(cè)到的模擬信號(hào),并將它們轉(zhuǎn)換為數(shù)字信號(hào)。

        采集系統(tǒng)運(yùn)用Flex Analysis軟件,設(shè)定激光能量、譜圖評(píng)估參數(shù)、譜圖疊加次數(shù),靶的移動(dòng)方式和范圍等參數(shù)。應(yīng)用Bio Tools軟件對(duì)47個(gè)待測(cè)樣品分析,分析模式:線(xiàn)性正離子模式,質(zhì)量數(shù)范圍:600~10500Da?;瘜W(xué)計(jì)量學(xué)分析(基于MATLAB 7.0)。

        2 結(jié)果

        2.1 兩組差異蛋白表達(dá)情況M/Z值為600~10500 Da范圍內(nèi)篩選出15個(gè)蛋白在單純VSD、ASD組與正常人表達(dá)有差異,均方根誤差為0.59,且M/Z值600、603、608、611、621、6405 Da的蛋白質(zhì)在單純VSD、ASD組中高表達(dá),在正常人組中低表達(dá);M/Z值4103、4416、4888、4917、5907、5922、5926、7475、7487 Da的蛋白質(zhì)在單純VSD、ASD組中低表達(dá),在正常人組中高表達(dá)(表1、圖1)。

        表1 單純VSD和ASD與正常人分組差異蛋白表達(dá)情況(x±s)

        圖1 連續(xù)投影法顯示單純VSD、ASD與正常人分組差異蛋白表達(dá)情況

        2.2 結(jié)果驗(yàn)證運(yùn)用最小二乘-支持向量機(jī)(least square-support vector machine,LS-SVM);徑向基-神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(radial-basis function neural network,RBF-NN)的非線(xiàn)性驗(yàn)證及線(xiàn)性判別分析(linear discriminate analysis,LDA),進(jìn)行雙盲驗(yàn)證,得到單純VSD、ASD與正常人分組差異蛋白表達(dá)的敏感性與特異性分析(表2)。

        表2 單純VSD和ASD與正常人分組差異蛋白表達(dá)情況分析

        3 討論

        該研究收集了與心臟外科相關(guān)疾病的術(shù)前、術(shù)后患者以及正常人的外周血樣本;樣本經(jīng)WCX磁珠處理后,得到血清中蛋白組分。應(yīng)用MALDI TOF MS線(xiàn)性正離子模式對(duì)樣本檢測(cè),并獲取了600~10500m/z的質(zhì)譜數(shù)據(jù)(蛋白組)。為了使獲得的數(shù)據(jù)充分有效,應(yīng)用平滑和基線(xiàn)消除的方法對(duì)光譜進(jìn)行預(yù)處理;之后應(yīng)用連續(xù)投影算法尋求與疾病診斷、預(yù)后相關(guān)的蛋白/多肽,這些蛋白/多肽構(gòu)成了該疾病的指紋圖譜。為了驗(yàn)證該指紋圖譜的準(zhǔn)確度,本研究應(yīng)用主成分分析以及受試者工作曲線(xiàn)分析;為了驗(yàn)證該指紋圖譜的有效性,本研究應(yīng)用有監(jiān)督模式識(shí)別方法構(gòu)建校正預(yù)報(bào)模型(LSSVM,LDA和RBFNN)。篩選出的15個(gè)變量,交叉驗(yàn)證結(jié)果顯示,以M/Z值為600、603、608、611、621、6405Da的蛋白質(zhì),在單純VSD、ASD組中高表達(dá),在正常人組中低表達(dá);以M/Z值4103、4416、4888、4917、5907、5922、5926、7475、7487 Da的蛋白質(zhì),在單純VSD、ASD組中低表達(dá),在正常人組中高表達(dá);以上蛋白質(zhì)在單純VSD、ASD組術(shù)前、術(shù)后的檢測(cè)中差異不顯著。結(jié)果表明,單純VSD、ASD患者與正常人在血清蛋白質(zhì)譜中存在差異性多肽和蛋白;且利用MALDI-TO-MS技術(shù)和Flex Analysis和Bio Tools軟件可較準(zhǔn)確地將單純性VSD、ASD組與正常人分開(kāi),其特異性為97.2%,敏感性為91.5%。

        [1]Harris BS,Zhang Y,Card L,et al.SPA R C regulates collagen interaction with cardiac fibroblast cell surfaces[J].Am J Physiol Heart Circ Physiol,2011,301(3):H841-847.

        [2]Vestal ML.Modern MALDI time-of-flightmass spectrometry[J]. JMass Spectrom,2009,44(3):303-317.

        [3]Sauter ER,Davis W,Qin W,et al Identiication of a beta-caseinlike peptide in breast nipple aspirate luid that is associated with breast cancer[J].Biomark Med,2009,3(5):577-588.

        [4]Helgason HH,Engwegen JY,Zapatka M,et al.Identiication of serum proteins as prognostic and predictive markers of colorectal cancer using surface enhanced laser desorption ionization-time of light mass spectrometry[J].Oncol Rep,2010,24(1):57-64.

        [5]李珂,何偉華,趙光,等.MALDI-TOF-MS技術(shù)篩查原發(fā)性小細(xì)胞肝癌血清特異蛋白[J].實(shí)用醫(yī)藥雜志,2012,29(12):1060-1064.

        [6]Lu HB,Zhou JH,Ma YY,et al.Five serum proteins identified using MALDI-TO-MS as potential biomarkers of gastric cancer[J].Jpn J Clin Oncol,2010,40(4):336-342.

        [7]Wang Y,Yu JJ,Zhu T,et al.Analysis of diferentially expressd protein from primary and recurrent ovarian cancer serum[J]. Asian Pac J Trop Med,2012,5(7):573-576.

        [8]Wu S,Xu K,Chen G,et al.Identiication of serum biomarkers for ovarian cancer using MALDI-TOF-MS combined with magnetic beads[J].Int J Clin Oncol,2012,17(2):89-95.

        [2017-02-15收稿,2017-03-19修回]

        [本文編輯:王茜]

        Proteom ics analysis on serum proteins of simple VSD or ASD patients


        ZHANG Miao-xian①,LI Ke,ZHAO Guang,et al.
        ①Dept.of Special Examination,the No.150 Hospital of People Liberation Army,Luoyang,Henan 471031,China

        Obiective By using the technique of matrix assisted laser desorption/ionization-time of flightmass spectrometry(MALDI-TOF-MS)to analyse the serum protein spectrum and to get high sensitivity and specificity protein marker in simple ventricular septal defect(VSD),atrial septal defect(ASD)patients(preoperative/after-operation)and normal persons,then to establish serum markers pattern for the diagnosis of VSD/ASD.M ethods The technique of MALDI-TOF-MS was used to detect relative content of serum in 27 cases of VSD/ASD and 20 normal persons,and the Flex Analysis and BioTools software was used to analyse protein spectrum in two groups to find specific proteomic,then through the analysis software for cross-validation to get a diagnosis from specific proteins.Results There were 15 protein's peaks having significant discrepancy in the 600-10500Da(P<0.05).The sensitivity and specificity was 91.5%and 97.2%respectively.Conclusion By using MALDI-TOF-MS to analyze serum protein spectrum in VSD/ASD group(preoperative/after-operation)and normal group could get the specific serum protein markers for diagnosis of VSD/ASD.

        Ventricular septal defect;Atrial septal defect;MALDI-TOF-MS;Serum protein

        Q26:R541.1

        A

        10.14172/j.issn1671-4008.2017.08.009

        471031河南洛陽(yáng),解放軍150醫(yī)院特檢科(張妙賢,李珂),中心實(shí)驗(yàn)室(趙光,李寶輝,巴武龍),心血管科(盧圣勛,鄒陽(yáng))

        李珂,Email:likehesiyuan@163.com

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