潘軍平+王俊+朱新華+吳亞夫+丁義濤
【摘要】目的:探討假性基因(MT1DP)在結(jié)直腸癌(CRC)組織及其癌旁組織中的表達(dá)水平,及假性基因(MT1DP)的表達(dá)與結(jié)直腸癌(CRC)預(yù)后的相關(guān)性。方法:我們研究了78例患者的CRC組織及其癌旁組織,通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)MT1DP的mRNA表達(dá)水平,并進(jìn)一步評(píng)估其在結(jié)直腸癌中的臨床價(jià)值。結(jié)果:在78例CRC組織中有55例的MT1DP表達(dá)水平顯著下降(70.5%,P<0.001)。此外,CRC中MT1DP的表達(dá)水平與TNM分期(P=0.020)和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(P=0.005)密切相關(guān)。而且,CRC患者中低MT1DP表達(dá)者的總體生存率(OS)及無(wú)病生存率(DFS)更低(P分別為0.002和0.006)。另外,單因素和多因素Cox回歸分析進(jìn)一步明確MT1DP低表達(dá)可能是CRC患者的OS和DFS的獨(dú)立預(yù)后因素。結(jié)論:研究結(jié)果表明MT1DP低表達(dá)與CRC的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),其有望成為結(jié)直腸癌患者一種新的診斷以及預(yù)后評(píng)價(jià)的生物標(biāo)志物。
【關(guān)鍵詞】結(jié)直腸癌;長(zhǎng)非編碼RNAs;MT1DP;預(yù)后
【中圖分類號(hào)】R735.3 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A 【文章編號(hào)】2095-6851(2017)06-00-01
1.引言:
大量證據(jù)表明lncRNAs表達(dá)異常與疾病的多樣性密切相關(guān),包括人類惡性腫瘤[5,6]。在結(jié)直腸癌中,lncRNAs表達(dá)異常與腫瘤生長(zhǎng)及轉(zhuǎn)移密切關(guān)聯(lián),而且其中一些在診斷與預(yù)測(cè)中頗具價(jià)值,例如:CCAT1[7],HOTAIR[8],UCA1[9]和MALAT1[10]在結(jié)直腸癌中高表達(dá),而長(zhǎng)鏈非編碼RNALET[11],MEG3[12],GAS5[13]以及LOC285194[14]在結(jié)直腸癌組織中低表達(dá)。
最近發(fā)現(xiàn)肝癌中一種新的lncRNA,即金屬硫蛋白1D假性基因(MT1DP),它可以作為一種腫瘤抑制基因抑制肝癌細(xì)胞生長(zhǎng)。然而,結(jié)直腸癌中MT1DP表達(dá)與其潛在的臨床病理學(xué)作用之間的關(guān)系尚不明。在本研究中,我們旨在探索MT1DP在CRC組織及癌旁組織中的表達(dá)水平。以及其表達(dá)水平與結(jié)直腸癌患者臨床病理學(xué)特征及預(yù)后價(jià)值的關(guān)系。
2.材料與方法:
2.1 患者的組織樣本
本研究共收集78例人體CRC組織及鄰近正常組織。所有患者均為近兩年在南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬鼓樓醫(yī)院接受結(jié)直腸癌手術(shù)的患者。入組均未接受術(shù)前放療或化療。組織樣本在外科手術(shù)離體后立即以液氮冷凍并儲(chǔ)存在-80℃用于進(jìn)一步分析?;颊咴敿?xì)的臨床特征列于表1。隨訪數(shù)據(jù)通過(guò)審查門診患者及通過(guò)電話或郵件隨訪患者。總生存期從最初的外科手術(shù)日期算起,直到死亡日期或隨訪的最后日期。該項(xiàng)目方案由南京大學(xué)和江蘇省醫(yī)學(xué)會(huì)倫理委員會(huì)通過(guò),所有患者簽署知情同意書。
2.2 RNA分離和定量實(shí)時(shí)逆轉(zhuǎn)錄PCR(QRT-PCR)
根據(jù)TRlozol試劑說(shuō)明書(Invitrogen公司)提取組織樣本的所有RNA。RNA的濃度及純度以分光光度法在260nm和280nm處測(cè)定,只有A260/A280的OD值接近1.8~2.0的樣本進(jìn)行隨后的分析。使用PrimeScriptTMFirstStrandcDNA試劑盒(Takara,大連,中國(guó))并根據(jù)其說(shuō)明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。qRT-PCR使用SYBRPremixExTaqTMII試劑盒(Takara公司),AppliedBiosystems7500PCRSystem(ABI,TX,USA)。MT1DP引物序列為5-ATTTCTGAGGCGAGAGGACT-3(正向)和5-GCAGGAGCAGCAGTTCTTCT-3(逆向)。GAPDH(內(nèi)參)序列為5-AGAAGGCTGGGGCTCATTTG-3(正向)and5-AGGGGCCATCCACAGTCTTC-3(逆向)。PCR擴(kuò)增方案如下:95℃下5分鐘,在95℃下30秒進(jìn)行40個(gè)循環(huán)變性,在58℃下30秒退火,在72℃下20秒延伸。所有反應(yīng)一式三份進(jìn)行,比較循環(huán)閾值(CT)的方法和方程2-ΔΔCT用于量化MT1DP的表達(dá)水平。
3.統(tǒng)計(jì)分析:
組間差異的顯著性應(yīng)用Studentst檢驗(yàn),檢驗(yàn)或Wilcoxon檢驗(yàn)進(jìn)行評(píng)價(jià)。建立受試者工作特征(ROC)曲線評(píng)價(jià)診斷價(jià)值。生存曲線構(gòu)建使用Kaplan-Meier方法和通過(guò)對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn)進(jìn)行比較。單因素和多因素分析在Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回顧模型基礎(chǔ)上進(jìn)行。所有統(tǒng)計(jì)分析使用SPSS18.0軟件(SPSS,Chicago,IL,USA)。雙側(cè)P值小于0.05時(shí)認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
4.結(jié)果:
4.1 MT1DP在CRC患者中表達(dá)下調(diào)
如圖1A,B所示,與癌旁組織相比,MT1DP在腫瘤組織中表達(dá)明顯下降,P<0.001。78例CRC患者中有55例腫瘤組織MT1DP的表達(dá)水平低于癌旁組織70.5%),腫瘤組織比癌旁組織中MT1DP的表達(dá)水平低1.52倍。
4.2 CRC中MT1DP下調(diào)的診斷價(jià)值
我們發(fā)現(xiàn)ROC曲線下面積(AUC)為0.714,95%可信區(qū)間(Cl)為0.636-0.783,靈敏度為88.46%(95%Cl:79.2-94.6),特異性為51.28%(95%Cl:39.7-62.8),Youden指數(shù)(J=0.3974)為最大值,P<0.001。(圖2)。
4.3 CRC患者M(jìn)T1DP表達(dá)與臨床特征的關(guān)系
我們根據(jù)78例CRC患者腫瘤組織中MT1DP表達(dá)水平的中位數(shù)為界,將78例患者分為低MT1DP組(n=39)和高M(jìn)T1DP組(n=39)。結(jié)果表明,CRC中MT1DP低水平組與TNM分期(P=0.020)及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(P=0.005)存在顯著相關(guān)性。相反的,MT1DP表達(dá)與其他臨床參數(shù)如年齡(P=0.365)、性別(P=0.610)、腫瘤大?。≒=0.103)、腫瘤位置(P=0.640)和腫瘤分化程度(P=0.147)之間無(wú)關(guān)聯(lián)(表1)。
4.4 MT1DP表達(dá)與CRC患者預(yù)后的關(guān)聯(lián)
生存分析表明,被分到兩組的患者的總存活率(OS)和無(wú)病生存率(DFS)的顯著差異是基于他們MT1DP表達(dá)水平的差異。具體表現(xiàn)為CRC患者中MT1DP低表達(dá)者的OS和DFS低于那些MT1DP高表達(dá)者(對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn),P=0.002和0.006,分別如圖3A,3B)。
另外,Cox比例風(fēng)險(xiǎn)分析用于進(jìn)一步評(píng)估MT1DP表達(dá)在CRC中對(duì)預(yù)后判斷的價(jià)值。單因素生存分析顯示,腫瘤大小、腫瘤分化程度、TNM分期、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移和MT1DP表達(dá)與CRC患者的OS和DFS顯著相關(guān)(所有P<0.05)。相反的,其他臨床病理參數(shù),如年齡、性別和腫瘤位置不是具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的預(yù)后因子(所有P>0.05,表2)。隨后,多因素Cox比例風(fēng)險(xiǎn)分析顯示MT1DP表達(dá)、TNM分期和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移與CRC患者的OS和DFS顯著相關(guān)(所有P<0.05,表2),這提示MT1DP可能是CRC的一個(gè)獨(dú)立預(yù)后因素。
5.討論
CRC仍是導(dǎo)致全球癌癥相關(guān)死亡的主要原因之一,其致死的主要原因是腫瘤的侵襲性及轉(zhuǎn)移[16-18]。根據(jù)癌癥統(tǒng)計(jì),大約60%的CRC患者處于轉(zhuǎn)移的進(jìn)展?fàn)顟B(tài)。盡管最近已發(fā)展出多種治療方法,中晚期CRC患者預(yù)后仍然很差。
在本次研究中,我們提供了一種新的候選生物標(biāo)記物,即MT1DP,用于CRC的診斷、預(yù)后判斷和治療?;?8例CRC患者腫瘤與癌旁組織的qRT-PCR結(jié)果,我們發(fā)現(xiàn)與癌旁組織相比,MT1DP在CRC組織中顯著下調(diào)。ROC曲線表明MT1DP表達(dá)水平在CRC中具有潛在的診斷價(jià)值。我們也發(fā)現(xiàn)CRC中MT1DP低表達(dá)與TNM分期和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移密切先關(guān),這提示MT1DP表達(dá)情況可以幫助我們預(yù)測(cè)CRC腫瘤分期和判斷進(jìn)展程度。連同前面肝癌研究中的發(fā)現(xiàn),即MT1DP可以抑制肝癌細(xì)胞增殖和表型改變[15],我們的數(shù)據(jù)顯示MT1DP可能在CRC致癌過(guò)程中發(fā)揮腫瘤抑制物的作用。
另一方面,我們的Kaplan-Meier分析表明MT1DP表達(dá)與CRC患者的OS和DFS密切關(guān)聯(lián)。另外,單因素和多因素Cox風(fēng)險(xiǎn)比例分析進(jìn)一步揭示MT1DP可能是CRC患者OS和DFS的獨(dú)立預(yù)后因素。因此,MT1DP可能有助于確定具有較高死亡風(fēng)險(xiǎn)的高風(fēng)險(xiǎn)CRC患者,并可能成為一種更積極的、有效的治療的候選靶點(diǎn)。
總的來(lái)說(shuō),我們目前的研究首次報(bào)道了結(jié)直腸癌組織樣本中MT1DP水平的下調(diào)與結(jié)直腸癌患者的不良預(yù)后密切相關(guān)。此外,MT1DP有望成為結(jié)直腸癌患者預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。為結(jié)直腸癌患者的診斷及預(yù)后評(píng)估提供一條新途徑。
參考文獻(xiàn)
[1]Jemal A,Bray F,Center MM,et al.Global cancer statistics.CA Cancer J Clin 2011;61:69-90.
[2]Morris V,Kopetz S.Clinical biomarkers in colorectal cancer.Clin Adv Hematol Oncol 2013;11:768-76.