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        吉林省稻瘟病菌無毒基因鑒定及分析

        2017-07-21 23:27:45姜兆遠(yuǎn)劉曉梅李莉鄒曉威任金平
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年10期
        關(guān)鍵詞:稻瘟病

        姜兆遠(yuǎn) 劉曉梅 李莉 鄒曉威 任金平 袁媛 張鐵新 王繼春 吳憲+朱峰 孫輝

        摘要:為了明確無毒基因在吉林省不同稻區(qū)的分布及變異情況,將PCR檢測技術(shù)與接種鑒定技術(shù)相結(jié)合,分析2014年吉林、長春、通化、四平、延邊、松原、白城、遼源等稻區(qū)的24株優(yōu)勢單孢菌株中無毒基因的情況。結(jié)果表明,24個優(yōu)勢稻瘟病菌株含無毒基因的比率較高,5個稻區(qū)的優(yōu)勢菌株100%含有無毒基因,松原稻區(qū)1株優(yōu)勢菌株P(guān)CR檢測到無毒基因,但對[WTBX][STBX]Pi9[WTBZ][STBZ]單基因品系IRBL9-W仍有致病性,說明該菌株無毒基因結(jié)構(gòu)發(fā)生了變化,其他PCR結(jié)果均與接種結(jié)果相一致。

        關(guān)鍵詞:稻瘟?。豢共』?;無毒基因;;接種鑒定;PCR檢測

        中圖分類號: S435.111.4+1文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A

        文章編號:1002-1302(2017)10-0027-03

        稻瘟病是世界范圍內(nèi)的主要水稻病害之一。在我國各水稻栽培地區(qū)均經(jīng)常發(fā)生稻瘟病,吉林省也是稻瘟病經(jīng)常流行的主要地區(qū),如果不防治可導(dǎo)致稻谷損失30%以上,局部田塊甚至出現(xiàn)絕收的情況[1]。稻瘟病的病原為稻巨座殼(Magnaporthe oryzae B.C.Couch),隸屬于子囊門巨殼屬。其無性階段為稻梨孢(Pyricularia oryzae Cavara),屬于子囊菌無性型梨孢屬。稻瘟病是完全符合基因?qū)蚣僬f的病害[2-3],稻瘟病的發(fā)生程度取決于田間菌群的無毒基因類型,當(dāng)種植的水稻所含抗瘟基因與田間菌群所含的無毒基因相對應(yīng)時,水稻則表現(xiàn)抗?。蝗羲镜目共』蚺c菌群的無毒基因不對應(yīng),則表現(xiàn)感病,在適宜的氣候條件下極易造成災(zāi)變。種植抗瘟品種是防治稻瘟病最經(jīng)濟(jì)有效的方法,但一個抗病品種在推廣3~5年后就失去對當(dāng)?shù)氐疚敛【目剐訹4],主要是由稻瘟病菌變異及其上升為優(yōu)勢菌群所致。引起稻瘟病菌變異的因素很多[5-10],但田間稻瘟病致病性的變異實(shí)質(zhì)是田間無毒基因功能的缺失或獲得[11]。吉林省是優(yōu)質(zhì)粳稻主產(chǎn)區(qū),粳稻種植面積超過70萬hm2[12],稻瘟病的控制對我國優(yōu)質(zhì)米的保障尤為重要。

        截至2015年3月,已至少報(bào)道了69個抗稻瘟病位點(diǎn)共84個主效基因,其中24個基因已被成功克隆[13],抗瘟基因中[WTBX][STBX]Pi9[WTBZ][STBZ]抗譜較廣,對來自13個國家的43個稻瘟病菌株均表現(xiàn)出很高的抗性[14],抗瘟基因[WTBX][STBX]Pi9[WTBZ][STBZ]對應(yīng)的無毒基因已被克隆[15],因此明確吉林省稻瘟病菌無毒基因分布情況對吉林省稻區(qū)水稻品種布局具有較好的指導(dǎo)意義。

        1材料與方法

        1.1供試品種

        以單基因等基因系品種IRBL9-W、蒙古稻(感病對照)為供試材料。

        1.2稻瘟病樣采集及菌株篩選

        2014年從吉林、長春、通化、四平、延邊、松原、白城、遼源各稻區(qū)采集穗頸瘟標(biāo)樣,通過振蕩法分別獲得10個單孢菌株,從中選出3株菌絲生長較好、產(chǎn)孢子能力強(qiáng)的優(yōu)勢菌株,共獲得24個稻瘟病優(yōu)勢菌株,所有菌株均由吉林省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所水稻病害課題組保存。

        1.3菌絲的培養(yǎng)及孢子收集

        取4塊直經(jīng)約為5 mm的斜面培養(yǎng)稻瘟病菌菌塊于PDA平板上,27 ℃條件下在PDA培養(yǎng)基上培養(yǎng)7 d后,移至產(chǎn)孢培養(yǎng)基上,再培養(yǎng)5~7 d,無菌條件下洗去表面菌絲,將菌絲[HJ1.4mm]收集到2 mL的離心管中同時放入2粒玻璃珠,置于-80 ℃冰箱中保存,將洗掉菌絲的平板進(jìn)行12 h—12 h光—暗培養(yǎng) 3 d,用無菌水洗滌并稀釋孢子懸浮液終濃度為2×105個/mL,用于接種。

        1.4接種檢測

        將IRBL9-W播于16穴苗盤內(nèi),同時播2穴蒙古稻,在稻[CM(25]苗3葉期時進(jìn)行噴霧接種。接種在溫室內(nèi)進(jìn)行,接種后于[CM)][LM]24~28 ℃暗箱保濕16 h,6~7 d后進(jìn)行調(diào)查,采用0~9級標(biāo)準(zhǔn)調(diào)查發(fā)病率[16]。設(shè)3次重復(fù),蒙古稻發(fā)病率達(dá)5級及以上。

        1.5稻瘟病菌28 S rDNA檢測及分析

        將-80 ℃超低溫冰箱保存的菌株置于液氮中,2 min后將樣品置于高通量組織細(xì)胞研磨破碎儀中進(jìn)行破碎。DNA提取方法按試劑盒說明書進(jìn)行。

        根據(jù)NCBI上公布的稻瘟病菌28S核糖體RNA基因(GenBank:KM484999.1)設(shè)計(jì)引物28SF-TAGGACGCCGAACCTCTGTA,28SR-GGTATTACGCAACGGGCTA;根據(jù)NCBI上公布的無毒基因(GenBank:KM004023.1)起始密碼子前1 170 bp到起始密碼子后254 bp設(shè)計(jì)引物 F-GAGATTGTCAGAGAAGTCCGA,R-GCTTATTTACCCATCATCGC。

        反應(yīng)程序?yàn)?4 ℃預(yù)變性5 min;隨后30個擴(kuò)增循環(huán):94 ℃ 變性1 min,55 ℃(引物52 ℃)退火30 s,72 ℃延伸30 s(引物90 s);最后72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物采用0.8%瓊脂糖凝膠電泳成像分析。

        2結(jié)果與分析

        2.1接種檢測分析

        將24株菌株孢子懸液均勻的噴霧接種在IRBL9-W和蒙古稻葉片上,結(jié)果如表1所示,24株菌株均能侵染蒙古稻,且病級都達(dá)5級及以上。吉林稻區(qū)的2號菌株、通化稻區(qū)9號菌株和松原稻區(qū)的16號菌株均能侵染IRBL9-W,病級達(dá)到4級水平;松原稻區(qū)的18號菌株在IRBL9-W水稻上產(chǎn)生病斑達(dá)到5級水平,其他菌株均不能侵染IRBL9-W。根據(jù)基因?qū)蚣僬f,未侵染水稻的稻瘟菌含有對應(yīng)的無毒基因,侵染水稻的菌株不含有對應(yīng)的無毒基因,因此,24個菌株中有20個菌株含有無毒基因。其中長春、四平、延邊、白城及遼源等稻區(qū)的供試菌株都含有無毒基因,而吉林、通化及松原分別檢測到1、1、2株不含有無毒基因[WTBX][STBX]AvirPi9[WTBZ][STBZ]的菌株。

        2.2稻瘟病菌28S rDNA檢測及無毒基因基因分析

        根據(jù)稻瘟病菌28S rDNA序列設(shè)計(jì)引物檢測24個優(yōu)勢菌株的DNA,所有供試菌株均擴(kuò)增到342 bp大小的特異性片段(圖1),說明該方法提取的稻瘟病菌DNA完全可以用于稻瘟病菌無毒基因的PCR檢測分析。

        根據(jù)設(shè)計(jì)的引物擴(kuò)增24個菌株的無毒基因,經(jīng)檢測吉林地區(qū)2號菌株、通化地區(qū)株9號菌株、松原地區(qū)16號菌株未擴(kuò)增出目的條帶,與接種鑒定結(jié)果一致,而松原的18號菌株擴(kuò)增出目的條帶,與接種鑒定結(jié)果不一致,說明18號菌株無毒基因結(jié)構(gòu)可能發(fā)生了改變。其他菌株均擴(kuò)增到 1 425 bp 大小的目的條帶(圖2),PCR檢測結(jié)果與接種鑒定結(jié)果一致。

        3結(jié)論與討論

        3.1結(jié)論

        接種鑒定與PCR檢測結(jié)果表明,長春、四平、延邊、白城及遼源稻區(qū)供試稻瘟病菌優(yōu)勢菌株均含有無毒基因且[CM(25]不能侵染IRBL9-W葉片;吉林、通化和松原稻區(qū)分別有[CM)]

        1、1、2株稻瘟病菌優(yōu)勢菌株不存在無毒基因結(jié)構(gòu)且能夠侵染 IRBL9-W 葉片;松原稻區(qū)有1株菌株存在基因結(jié)構(gòu)但可以侵染IRBL9-W葉片,具體原因需要進(jìn)一步研究分析。

        3.2討論

        本研究從2014年吉林、長春、通化、四平、延邊、松原、白城、遼源各稻區(qū)栽培稻上分離病菌鑒定了24株稻瘟病菌優(yōu)勢菌株。吉林省位于中緯度歐亞大陸的東側(cè),地處長白山脈,東部為山區(qū)、半山區(qū),中部為松遼平原區(qū),西部為草原區(qū)。從東南向西北由濕潤氣候過渡到半濕潤氣候再到半干旱氣候,有明顯的季節(jié)變化和地域差異[17]。根據(jù)地域特點(diǎn)吉林省稻區(qū)可以劃分為平原稻作區(qū)、半山區(qū)稻作區(qū)、山區(qū)冷涼稻作區(qū)及高

        寒山區(qū)稻作區(qū),不同稻區(qū)活動積溫存在顯著差異,水稻品種覆蓋極早熟至晚熟所有熟期的品種。根據(jù)各地區(qū)生產(chǎn)水平,吉林省可分為8個稻作區(qū)域[18],所分離的8個地區(qū)稻瘟病菌優(yōu)勢菌株基本代表了吉林省稻瘟病菌優(yōu)勢菌群遺傳特點(diǎn),分析這些菌株的無毒基因,對了解吉林省整體稻瘟病菌菌群的變化和特點(diǎn)有重要的參考價(jià)值。

        2014年吉林省各稻區(qū)整體稻瘟病菌無毒基因存在頻率較高。松原地區(qū)3株優(yōu)勢菌株中存在1株優(yōu)勢菌株含無毒基因,該菌株分離自吉粳88,由于吉粳88種植面積逐年縮小,該優(yōu)勢菌株群可能存在下降的趨勢。吉林、通化及松原稻區(qū)PCR未檢測到無毒基因的菌株均分離自稻花香品種。稻花香2號品種目前對吉林省稻瘟病菌具有一定的抗性,但在稻田中已經(jīng)出現(xiàn)零星發(fā)病的稻穗,稻花香種植

        面積在吉林省各稻區(qū)呈逐年增加的趨勢,因此該稻瘟病菌優(yōu)勢菌群富集可能是吉林省未來稻瘟病暴發(fā)的原因。所得結(jié)果對含[WTBX][STBX]Pi9[WTBZ][STBZ]抗病基因水稻育種及推廣具有重要的參考價(jià)值。

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