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        老年糖尿病患者白色念珠菌感染臨床分離株的基因分型

        2017-07-18 11:50:15趙雪松
        中國(guó)老年學(xué)雜志 2017年13期
        關(guān)鍵詞:糖尿病

        趙雪松 呂 巖 張 斌

        (齊齊哈爾醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院,黑龍江 齊齊哈爾 161006)

        老年糖尿病患者白色念珠菌感染臨床分離株的基因分型

        趙雪松 呂 巖 張 斌

        (齊齊哈爾醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院,黑龍江 齊齊哈爾 161006)

        目的 探討老年糖尿病患者白色念珠菌感染臨床分離株的基因分型方法。方法 老年糖尿病患者發(fā)生念珠菌感染的臨床標(biāo)本185例,采用API20CAUX 酵母菌鑒定系統(tǒng)鑒定,提取DNA后采用PCR方法擴(kuò)增白色念珠菌25S rDNA基因內(nèi)含子區(qū)和特征性重復(fù)序列(RPS)對(duì)白色念珠菌進(jìn)行基因分型。結(jié)果 采用25S rDNA引物擴(kuò)增后的產(chǎn)物分別為450 bp、840 bp及450和840 bp,分別代表基因型A、B、C;185例樣本菌株中,51.9%為A型,29.2%為B型,18.9%為C型;采用根據(jù)ALT重復(fù)序列RPS設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增后的產(chǎn)物可將基因型A、B、C分為10個(gè)亞組,A型中24例為A2,50例為A3,12例為A2/3,8例為A3/4。54例B型中,15例為B2,7例為B3,25例為B2/3,7例為B3/4。35例C型中25例為C2,10例為C2/3。結(jié)論 利用25S rDNA和ALT重復(fù)序列RPS設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增產(chǎn)物對(duì)老年糖尿病患者樣本中白色念珠菌進(jìn)行基因分型方法具有快速、簡(jiǎn)捷、可靠、重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn),可提高治療效果,減少抗生素濫用和耐藥性的產(chǎn)生。

        糖尿??;白色念珠菌;分離株;基因分型

        目前我國(guó)老年糖尿病患者合并真菌感染發(fā)病率不斷升高,且以白色念珠菌感染為主〔1〕。通常老年患者病情相當(dāng)復(fù)雜、嚴(yán)重,死亡率較高〔2〕。由于老年患者特殊性,可選擇抗真菌藥物較少〔3〕。本研究通過(guò)對(duì)我院近2年來(lái)內(nèi)分泌科老年糖尿病患者感染白色念珠菌臨床分離株進(jìn)行基因分型研究,確定其分型,分析菌株遺傳相關(guān)性。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 收集2013年1月至2015年1月齊齊哈爾醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院內(nèi)分泌科收治的老年糖尿病患者發(fā)生念珠菌感染的臨床標(biāo)本185例(包含取自經(jīng)臨床確診為糖尿病真菌感染老年患者的痰、大小便、咽拭子、嘔吐物等標(biāo)本分離出的白色念珠菌),男90例,女95例,年齡65~98〔平均(76.2±3.4)〕歲。

        1.2 方法

        1.2.1 菌株鑒定 對(duì)標(biāo)本進(jìn)行病原學(xué)檢查,經(jīng)實(shí)驗(yàn)室鑒定和藥敏分析后的臨床分離株進(jìn)行PCR技術(shù)檢測(cè)分型。采用法國(guó)科瑪嘉(ChromG A)顯色培養(yǎng)基初篩,珠海黑馬Bact-IST藥敏分析儀進(jìn)行鑒定和藥敏分析,使用梅里埃生物公司API20CAUX 酵母菌鑒定系統(tǒng)鑒定白色念珠菌。

        1.2.2 白色念珠菌DNA提取 挑取鑒定培養(yǎng)基上的綠色菌落,分離單菌落后加入酵母漫出粉胨葡萄糖(YPD)液體培養(yǎng)基,于37℃培養(yǎng)過(guò)夜,隔天將1 ml培養(yǎng)物離心后用磷酸鹽緩沖液(PBS)洗滌3次,采用玻璃珠-苯酚-氯仿法提取白色念珠菌基因組DNA。

        1.2.3 PCR引物 臨床常對(duì)老年糖尿病患者分離樣本采用CALB1、CALB2引物擴(kuò)增菌體DNA,產(chǎn)物273 bp代表含有白色念珠菌。采用PCR方法擴(kuò)增白色念珠菌25S rDNA基因內(nèi)含子區(qū),以?xún)?nèi)含子大小及其中可轉(zhuǎn)座Ⅰ型內(nèi)含子片段的缺失或插入作為分型依據(jù),可將白色念珠菌分為5種亞型(A/B/C/D/E),CA-INT-R引物序列:5′-ATAAGGGAAGTCGGCAAAATAGATCCGTAACCTTGGCTGTGGTTTCGCTAGATAGTAGAT-3′,擴(kuò)增長(zhǎng)度450 bp、840 bp、450 bp & 840 bp、1 040 bp、1 050 bp;依次對(duì)應(yīng)A、B、C、D、E型。同時(shí)有文獻(xiàn)〔4〕報(bào)道采用染色體的172 bp長(zhǎng)的特征性重復(fù)序列(RPS)對(duì)白色念珠菌進(jìn)行種內(nèi)基因分型,可根據(jù)電泳結(jié)果分離6種亞型。ASDcF:5′-TGATGAACCACATGTGCTACAAAG-3′,Pcscr:5′-CGCCTCTATTGGTCGAGCAGTAGTC-3′;擴(kuò)增長(zhǎng)度526、698、870、1 042、1 214、1 396 bp,依次對(duì)應(yīng)1~6型。

        1.2.4 PCR程序 PCR反應(yīng)總體積30 μl,含TaqDNA聚合酶0.2 μl(1 U,Selleck,B21101a),dNTP 1.5 μl(thermos,10 mmol/L each),引物P1、P2(生工,2 OD)各1 μl。擴(kuò)增程序:預(yù)變性94℃ 3 min;94℃ 1 min,60℃ 40 s,72℃ 1 min,共30個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。PCR采用Thermal cycler(Techne,TC512,England)擴(kuò)增。將擴(kuò)增產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳100 V/cm在20℃ 20 min后檢測(cè)。

        2 結(jié) 果

        本研究中收集的臨床老年糖尿病患者樣本中均檢測(cè)出白色念珠菌的存在。見(jiàn)圖1。所有收集的臨床樣本分別采用兩對(duì)引物(Gen Bankaccession nos.L47111,L28817)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)分析。其中采用25S rDNA引物擴(kuò)增后的產(chǎn)物分別為450 bp、840 bp及450 bp和840 bp,分別代表基因型A、B、C。老年糖尿病患者白色念珠菌采用25S rDNA引物擴(kuò)增基因型,在185例樣本菌株中,96例(51.8%)為A型,54例(29.2%)為B型,35例(19.0%)為C型,而基因型D和E并未在此次收集的臨床樣本中檢測(cè)到。見(jiàn)圖2。采用根據(jù)ALT重復(fù)序列RPS設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增后的產(chǎn)物可將基因型A、B、C分為10個(gè)亞組。老年糖尿病患者白色念珠菌采用RPS引物擴(kuò)增基因型,96例A型中24例為A2,50例為A3,12例為A2/3,8例為A3/4。54例B型中,15例為B2,7例為B3,25例為B2/3,7例為B3/4。35例C型中25例為C2,10例為C2/3。見(jiàn)圖3。

        1∶100 bp分子量標(biāo)準(zhǔn)(天根,MD109);2:白色念珠菌陽(yáng)性對(duì)照(ATCC 10231);3~10:老年糖尿病患者分離樣本根據(jù)CALB1、CALB2擴(kuò)增產(chǎn)物273 bp;11~14:陰性對(duì)照光滑念珠菌、熱帶念珠菌、克魯斯假絲酵母、類(lèi)星形念珠菌;15:1 kb分子量標(biāo)準(zhǔn)(天根,MD111)圖1 臨床樣本中菌體檢測(cè)結(jié)果

        1~6:450 bp,A型;7~11:840 bp,B型;13~15:450+840 bp,C型圖2 老年糖尿病患者樣本中白色念珠菌25S rDNA引物PCR擴(kuò)增產(chǎn)物

        1~3:B2亞型,698 bp;4~6:B3亞型,870 bp;7~9:2/3亞型,698 bp+870 bp;10~11:3/4亞型,870 bp+1-42 bp圖3 老年糖尿病患者樣本白色念珠菌RPS引物PCR擴(kuò)增產(chǎn)物基因亞型分型結(jié)果

        3 討 論

        隨著白色念珠菌臨床病例不斷增加,分子分型技術(shù)已成為研究念珠菌病流行病學(xué)及合理選擇藥物的基礎(chǔ)。分子生物學(xué)方法已應(yīng)用于深部真菌病的診斷和分型研究,形成了以PCR 技術(shù)為基礎(chǔ)的一系列分子診斷方法,成為感染菌種(型)的早期鑒定和指導(dǎo)前期治療的有力工具〔5〕。近年來(lái),國(guó)內(nèi)外有關(guān)白假絲酵母菌分型的報(bào)道很多〔6〕,主要有傳統(tǒng)的表型分型方法和基因分型方法。表型分型存在鑒別力弱、重復(fù)性差、實(shí)驗(yàn)結(jié)果變異大、易受環(huán)境及人為因素影響、耗時(shí)費(fèi)力等缺點(diǎn);基因分型是以生物體DNA 序列的差異為基礎(chǔ)建立的顯示基因組多態(tài)性的方法〔7〕?;诤怂岬姆肿由飳W(xué)方法(主要是PCR方法)是念珠菌診斷、分型的發(fā)展趨勢(shì),PCR基因分型方法具有快速、簡(jiǎn)捷、可靠、重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn)。實(shí)驗(yàn)從模板DNA提取到PCR擴(kuò)增后電泳觀察結(jié)果,共耗時(shí)6 h左右,可在1個(gè)工作日內(nèi)完成,比較適合臨床念珠菌種內(nèi)和種間分型研究。本課題首次將白色念珠菌基因分型應(yīng)用于糖尿病老年患者中,為治療和預(yù)防糖尿病老年患者的真菌感染提供依據(jù)。

        糖尿病是一種常見(jiàn)的內(nèi)分泌―代謝疾病,發(fā)病率呈逐年上升趨勢(shì),尤其在老年患者中尤為突出〔8〕。同時(shí),隨著近年來(lái)抗生素及免疫抑制劑的普遍應(yīng)用和濫用,使真菌感染的發(fā)病率有明顯增加趨勢(shì)〔9〕,尤其是免疫功能低下的糖尿病患者更為真菌感染提供了充足的條件〔10〕,從淺部到深部的真菌感染率都明顯高于非糖尿病病人,且以白色念珠菌感染最為常見(jiàn)〔11〕。本課題采用PCR分型方法,對(duì)取自老年糖尿病患者感染白色念珠菌臨床分離株進(jìn)行基因分型,確定其分型。

        本研究結(jié)果表明,老年糖尿病患者的白色念珠菌基因型分布尚無(wú)明顯的規(guī)律和風(fēng)險(xiǎn)因素,最近有研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)〔12〕,同一老年患者身體不同部位分離出不同基因型白色念珠菌,但目前尚無(wú)研究明確表明同一部位感染是單一基因型或多個(gè)基因型菌株混合感染導(dǎo)致。對(duì)引起老年糖尿病患者感染白色念珠菌進(jìn)行基因分型研究,初步闡明造成老年糖尿病患者感染白色念珠菌是多基因型株系的,但仍需繼續(xù)對(duì)上述樣本的基因型與白色念珠菌菌株分布及耐藥性進(jìn)行系統(tǒng)的相關(guān)性統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。

        本研究結(jié)果提示利用25S rDNA和ALT重復(fù)序列RPS設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增產(chǎn)物對(duì)老年糖尿病患者樣本中白色念珠菌進(jìn)行基因分型方法具有快速、簡(jiǎn)捷、可靠、重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn),可提高治療效果,減少抗生素濫用和耐藥性的產(chǎn)生。

        1 McCullough MJ,Clemons KV,Stevens DA.Molecular and phenotypic characterization of genotypic Candida albicans subgroups and comparison with Candida dubliniensis and Candida stellatoidea〔J〕.J Clin Microbiol,1999;37(2):417-21.

        2 厲榮玉,歐成舉,陳裕秀.老年病區(qū)220株白色念珠菌分離及耐藥性分析〔J〕.中國(guó)老年學(xué)雜志,2014;34(24):7092-3.

        3 Karahan ZC,Guriz H,Agrbasal H,etal.Genotype distribution of Candida albicans isolates by 25S intron analysis withregard to invasiveness〔J〕.Mycosis,2004;47(11-12):465-9.

        4 馬曉瑞,蘇加峰,梁明輝.住院老年患者念珠菌感染的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)及耐藥性分析〔J〕.中國(guó)老年學(xué)雜志,2014;34(15):4332-3.

        5 Luo G,Mitchell TG.Rapid identification of pathogenic fungi directly from cultures by using multiplex PCR〔J〕.J Clin Microbiol,2002;40(8):2860-5.

        6 王光鎖,吳勁松,楊 林,等.胸外科圍術(shù)期并發(fā)感染的病原菌分布特征及耐藥性分析〔J〕.中國(guó)老年學(xué)雜志,2014;34(16):4528-30.

        7 Iwata T,Hattori H,Chibana H,etal.Genotyping of Candida albicans on the basis of polymorphisms of ALT repeats in the repetitive sequence(RPS)〔J〕.J Dermatol Sci,2006;41:43-54.

        8 吳奎海,芮勇宇.老年患者痰液中病原菌種類(lèi)及耐藥性變遷分析〔J〕.中國(guó)老年學(xué)雜志,2011;31(22):4316-8.

        9 Hattori H,Iwata T,Nakagawa Y,etal.Genotype analysis of Candida albicans isolates obtained from different body location of patients with superficial candidiasis using PCRs targeting 25S rDNA and ALT repeat sequences of the RPS〔J〕.J Dermatol Sci,2006;42(1):31-46.

        10 李艷華,馮福民,郭 梅.惡性腫瘤老年患者念珠菌感染臨床分離株的基因型特征研究〔J〕.中國(guó)老年學(xué)雜志,2007;27(18):1772-4.

        11 Gurbuz M,Kaleli I.Molecular analysis of Candida albicans isolates from clinical specimens〔J〕.Mycopathologia,2010;169(4):261-7.

        12 朱洪權(quán),劉佰純,王志慧,等.老年患者158株念珠菌分離及耐藥性分析〔J〕.中國(guó)老年學(xué)雜志,2005;25(10):1179-80.

        〔2017-01-12修回〕

        (編輯 袁左鳴)

        齊齊哈爾科學(xué)技術(shù)局指令性計(jì)劃項(xiàng)目(No.SFGG-201320)

        趙雪松(1973-),男,副主任醫(yī)師,主要從事微生物檢驗(yàn)、細(xì)菌和真菌耐藥監(jiān)測(cè)研究。

        R587.1

        A

        1005-9202(2017)13-3167-03;

        10.3969/j.issn.1005-9202.2017.13.020

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