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        紫蘇醇溶性種子蛋白遺傳多樣性分析

        2017-06-20 23:45:29吳珊舒曉霞馬宗祥
        農(nóng)業(yè)與技術(shù) 2017年10期
        關(guān)鍵詞:遺傳多樣性紫蘇聚類分析

        吳珊+舒曉霞+馬宗祥

        摘 要:采用A-PAGE技術(shù)對來源于全國12個(gè)地區(qū)的13份紫蘇材料的醇溶性種子蛋白進(jìn)行了檢測。結(jié)果發(fā)現(xiàn):紫蘇材料的醇溶性蛋白具有豐富的等位變異,共分離出10條遷移率不同的譜帶;每份材料可分別電泳出2~9條譜帶,平均4.6條;2條電泳條帶為所有材料共有。因此,紫蘇醇溶性種子蛋白可作為評價(jià)紫蘇遺傳多樣性的生化標(biāo)記。不同紫蘇材料的遺傳相似系數(shù)(GS)變異范圍為0.56~1.000,平均值為0.751。聚類結(jié)果表明,在GS值為0.751的水平上供試材料聚為2大類,其親緣關(guān)系遠(yuǎn)近與地理來源關(guān)系不大。

        關(guān)鍵詞:紫蘇;醇溶蛋白;遺傳多樣性;聚類分析;A-PAGE

        中圖分類號:S567.219 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A DOI:10.11974/nyyjs.20170533024

        紫蘇(Perilla frutescens (L.)Britton),別名紅蘇、回回蘇、赤蘇,是唇形科紫蘇屬一年生草本植物[1]。紫蘇是日常生活當(dāng)中常用的一種中草藥,也是一種食材,也是一種油料植物。我國種植紫蘇已經(jīng)有2000多年的歷史,紫蘇的種植在我們國家的分布十分廣泛,我國對紫蘇的研究主要集中在藥用方面,通過分析紫蘇的化學(xué)成分來提煉相應(yīng)的藥物,紫蘇中含有多種對人體有益的化學(xué)物質(zhì),比如萜類、黃酮及其甙類、類脂類,花青素及多糖等。紫蘇嫩枝及葉或種子可以入藥。

        醇溶蛋白是一類種子貯藏蛋白,這種種子貯藏蛋白的存在幾乎不受自然環(huán)境的影響,其差異性是由遺傳基因決定的[4,5]。植物種子醇溶性蛋白的酸性聚丙烯酰胺凝膠電泳(A-PAGE)分析已廣泛應(yīng)用于植物的遺傳育種、種質(zhì)資源的鑒定、種子純度的檢驗(yàn)、植物的起源與演化等方面[6]。近年來,研究者利用形態(tài)學(xué)、同源克隆、SRAP和ISSR標(biāo)記等技術(shù)對紫蘇的主要營養(yǎng)成分、生理作用和遺傳多樣性方面進(jìn)行了研究,然而尚未見到利用A-PAGE技術(shù)對紫蘇種子醇溶性蛋白遺傳多樣性進(jìn)行研究的報(bào)道。因此,本研究利用A-PAGE方法對紫蘇種子的醇溶性蛋白進(jìn)行研究分析,以進(jìn)一步了解紫蘇貯藏蛋白的遺傳多樣性,為紫蘇品質(zhì)和遺傳穩(wěn)定性的深入研究奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 供試材料

        13份紫蘇種子,分別來源于全國12個(gè)地區(qū),其中7份為野生紫蘇, 6份為人工栽培種。其中1號金堂栽培種、10號重慶豐都栽培種、11號重慶彭水栽培種,由四川西金地有限責(zé)任公司提供(表1)。10號重慶豐都栽培種、11號重慶彭水栽培種均來源于日本品種經(jīng)馴化多年后栽培使用。

        1.2 A-PAGE檢測

        具體步驟和方法參考劉仁建等人的報(bào)道,每份供試材料重復(fù)2~3次試驗(yàn),并隨機(jī)選擇材料4份,每份取10粒種子進(jìn)行重復(fù)檢驗(yàn)[7-9]。電泳后,按照條帶的有無統(tǒng)計(jì)記錄每個(gè)材料,存在條帶時(shí)賦值為1,反之賦值為0。按Nei的方法計(jì)算材料間的遺傳相似系數(shù)GS, GS=2Nij/(Ni + Nj),其中Ni為i號材料出現(xiàn)的條帶數(shù),Nj為j號材料出現(xiàn)的條帶數(shù)。利用GS值按不加權(quán)成對群算數(shù)平均法(UPGMA)進(jìn)行遺傳相似性聚類分析。統(tǒng)計(jì)分析在NTSYSpc2.1系統(tǒng)下進(jìn)行。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 醇溶性蛋白標(biāo)記的多態(tài)性

        本次實(shí)驗(yàn)均在同等電泳條件下進(jìn)行,重復(fù)檢驗(yàn)結(jié)果顯示,除個(gè)別材料出現(xiàn)未用于統(tǒng)計(jì)分析的極弱譜帶外,所有材料電泳圖譜均表現(xiàn)一致。

        紫蘇種子A-PAGE電泳檢測結(jié)果(圖1)表明,13份來源不同的供試材料中出現(xiàn)9種不同的電泳圖譜,每份材料均出現(xiàn)了2~9條比較清晰的帶紋,平均值為4.6條,所有材料均有2條共有帶,共分離出了10條遷移率不同的醇溶性蛋白帶紋,其中有6條帶紋分布在電泳圖譜的下端,即快速電泳區(qū)(A區(qū));而其余4條帶紋集中在圖譜上端,即慢速電泳區(qū)(B區(qū))。發(fā)現(xiàn),9條電泳圖譜中有6條屬于13份材料中的6份材料單獨(dú)擁有的一種特異圖譜,而其余出現(xiàn)的3種圖譜則由剩余的7份材料中的某2份或者3份共有。結(jié)果表明,供試材料在醇溶蛋白位點(diǎn)上遺傳多態(tài)性較高,遺傳差異較大。

        2.2 醇溶性蛋白遺傳相似系數(shù)

        利用研究中的A-PAGE數(shù)據(jù),計(jì)算遺傳相似系數(shù)GS。其變異范圍為0.56~1.000,平均值0.751,進(jìn)一步表明了供試材料具有非常豐富的醇溶性蛋白遺傳多態(tài)性。

        2.3 聚類分析

        采用UPGMA法[10]對13份紫蘇材料間的種子醇溶性蛋白遺傳相似系數(shù)進(jìn)行聚類分析(見圖2)。聚類分析結(jié)果表明,13份供試材料在GS值為0.751水平上聚為2大類,第Ⅰ類為1、4、5、6、12、13號材料,第Ⅱ類為2、3、7、8、9、10、11號材料。2大類中兼有野生種與栽培種,其中第Ⅱ類中包括10、11號來自日本的重慶地區(qū)的馴化種。

        3 討論

        大量的研究證實(shí),醇溶性蛋白多樣性在很多植物上都能夠很好地評價(jià)物種的遺傳多樣性。劉仁建、官玲亮等人先后采用A-PAGE技術(shù)分析了來自不同國家的紅花材料的醇溶蛋白遺傳多樣性,證實(shí)了可以將醇溶蛋白帶型作為評價(jià)紅花資源遺傳多樣性的工具。鄧傳良等人研究發(fā)現(xiàn),紅花種子醇溶蛋白多態(tài)性較高,可以作為紅花品種鑒定的一個(gè)指標(biāo)。王仕玉等人采用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對云南16份紫蘇資源的遺傳多樣性進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)云南紫蘇資源的遺傳多樣性程度較高。蔡順順等人研究發(fā)現(xiàn)SRAP技術(shù)可用于紫蘇不同材料之間遺傳關(guān)系的研究。

        本研究中,采用A-PAGE技術(shù)分析了全國12個(gè)地區(qū)的13份紫蘇材料的種子醇溶性蛋白遺傳多樣性,結(jié)果表明,紫蘇種子的醇溶性蛋白多態(tài)性較高,在醇溶蛋白位點(diǎn)上具有豐富的遺傳多樣性,醇溶性種子蛋白可作為評價(jià)紫蘇遺傳多樣性的生化標(biāo)記。研究將來自全國12個(gè)地區(qū)的13份紫蘇材料在遺傳相似系數(shù)0.751水平上聚為兩類,聚類結(jié)果與其地理來源并不完全一致。紫蘇醇溶蛋白遺傳多樣性是否與其地理來源具有相關(guān)性,需要進(jìn)一步擴(kuò)大供試材料的種類及地理來源范圍,進(jìn)一步開展更深入的研究。

        今后的研究中,應(yīng)進(jìn)一步加強(qiáng)紫蘇品種資源的收集紫蘇品種資源,并對其研究整理,了解其差異,才能充分挖掘其潛力,才能同時(shí)結(jié)合國外紫蘇品種資源,培育出更加優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)的紫蘇品種,促進(jìn)我國藥用植物種質(zhì)資源研究的發(fā)展。

        參考文獻(xiàn)

        [1]李錫文.中國植物志[M].北京:科學(xué)出版社,1977.

        [2]張洪,黃建韶,趙東海.紫蘇營養(yǎng)成份的研究[J].食品與機(jī)械,2006,22(02):41-43.

        [3]彭小平,熊勁松.我國紫蘇產(chǎn)業(yè)化研究現(xiàn)狀與展望[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2010,38(16): 8709-8711.

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        [5]Metakovsk E V, Novoselskaya A Y,Sozinov A A.Genetic analysis of gliadin components in winter wheat using two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis[J].Theory Applied Genet,1984(69):31-37.

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        [7]馬德偉,高鎖柱,張彥萍.甜瓜種子蛋白質(zhì)電泳檢測遺傳純度的應(yīng)用研究[J].中國西瓜甜瓜,1996(02):10-13.

        [8]張志娥.石思信.肖建平,等.人參、西洋參種子醇溶蛋白電泳分析[J].特產(chǎn)研究,1995(04):13-16.

        [9]張彥萍,劉海河,賈兵國,等.利用種子醇溶蛋白指紋圖譜鑒定蔥蒜類蔬菜品種純度的研究[J].種子,2004,23(05):12-13,31.

        [10]劉仁建,吳衛(wèi),鄭有良,等.紅花種子醇溶蛋白遺傳多樣性分析[J].中國油料作物學(xué)報(bào),2006,28(02):109-114.

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