劉升,江雅麗,付強,史慧君,李爽,孟露萍,郭飛,張輝,陳創(chuàng)夫
(1.新疆石河子大學(xué)動物科技學(xué)院,新疆石河子 832000;2.新疆石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,新疆石河子 832003;3.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)學(xué)院,烏魯木齊 830052;4.新疆石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院,新疆石河子 832003)
新疆羊種布魯氏菌分離株的鑒定與L7/L12蛋白的原核表達和生物信息學(xué)分析
劉升1,江雅麗2,付強3,史慧君3,李爽1,孟露萍1,郭飛4,張輝1,陳創(chuàng)夫1
(1.新疆石河子大學(xué)動物科技學(xué)院,新疆石河子 832000;2.新疆石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,新疆石河子 832003;3.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)學(xué)院,烏魯木齊 830052;4.新疆石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院,新疆石河子 832003)
【目的】分離并鑒定新疆羊種布魯氏菌。原核表達該菌的L7/L12蛋白,檢測該蛋白的反應(yīng)原性及進行部分生物學(xué)分析?!痉椒ā坎捎眉?xì)菌劃線培養(yǎng)、形態(tài)學(xué)觀察、PCR檢測以及生化試驗進行布魯氏菌分離鑒定。利用常規(guī)分子生物學(xué)方法表達并純化羊種布魯氏菌分離株的L7/L12蛋白,應(yīng)用Western Blot分析融合蛋白的反應(yīng)原性。使用生物信息學(xué)軟件對該蛋白進行了生物信息學(xué)分析。【結(jié)果】分離鑒定確定該菌株為羊種布魯氏菌。經(jīng)過測序與酶切鑒定,正確構(gòu)建了表達載體pET-28a-L7/L12. SDS-PAGE試驗顯示純化的L7/L12蛋白為單一條帶;經(jīng)過Western Blot檢測,該融合蛋白具有良好的反應(yīng)原性。生物信息學(xué)分析顯示,該蛋白無跨膜區(qū)結(jié)構(gòu),不存在信號肽,二級結(jié)構(gòu)α-螺旋為主并利用 Phyre2 服務(wù)器成功構(gòu)建了該蛋白的三維模型?!窘Y(jié)論】鑒定出該分離菌株,表達并純化了該菌的L7/L12融合蛋白,Western Blot證明該蛋白具有良好的反應(yīng)原性,為后續(xù)該蛋白的亞單位疫苗研究奠定了基礎(chǔ)。
羊種布魯氏菌;L7/L12;蛋白純化;反應(yīng)原性;生物學(xué)
【研究意義】布魯氏菌病(Brucellosis)簡稱布病,是由革蘭氏染色陰性、兼胞內(nèi)寄生的布魯氏菌(Brucella)引起的一種人獸共患傳染病[1]。動物感染后,主要引起母畜的不孕、流產(chǎn)和公畜的睪丸炎等[2]。人感染后,主要表現(xiàn)為發(fā)熱、脊柱炎、關(guān)節(jié)炎、骨髓炎等,嚴(yán)重時可導(dǎo)致患者喪失勞動力[3]。全世界每年超過50×104人被感染,造成的直接經(jīng)濟損失近30×108美元[4]。新疆是我國重要的牧區(qū),也是我國布魯氏菌病的高發(fā)區(qū),據(jù)不完全統(tǒng)計,布魯氏菌病在新疆80余縣、市和13個兵團師局均有不同程度的流行,造成的經(jīng)濟損失達幾個億[5-6]。研究對新疆羊種布魯氏菌分離株L7/L12蛋白進行表達、鑒定,生物信息學(xué)初步分析其結(jié)構(gòu)性質(zhì),期待能對后續(xù)研制適合新疆本地化新型亞單位疫苗制備提供幫助。【前人研究進展】L7/L12是布魯氏菌的一種核糖體蛋白,該蛋白參與布魯氏菌胞內(nèi)蛋白合成[7]。目前,對L7/L12蛋白的研究主要集中于保護性抗原和布魯氏菌致病過程中的作用機制研究?,F(xiàn)有報道,利用L7/L12蛋白免疫動物后,可誘導(dǎo)機體產(chǎn)生細(xì)胞免疫和體液免疫應(yīng)答,并且具有一定的保護力[8]。利用減毒沙門氏菌異源表達牛種布魯氏菌的L7/L12融合蛋白免疫動物后,可保護機體免受牛種布魯氏菌野毒株的感染[9]。此外,一些研究也發(fā)現(xiàn),L7/L12蛋白能夠刺激牛外周血淋巴細(xì)胞的增殖,使其分泌IFN-γ,并且L7/L12蛋白對布魯氏菌脂多糖誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞的凋亡有促進作用[10]。Sergio等證明L7/L12蛋白可以誘導(dǎo)T細(xì)胞的活化,刺激CD4+細(xì)胞釋放IFN-γ因子,對牛布魯氏菌病具有較好的防御能力[11,12]?!颈狙芯壳腥朦c】從新疆某羊場流產(chǎn)羔羊體內(nèi)分離出鑒定出布魯氏菌,并原核表達其L7/L12蛋白,進行部分生物信息學(xué)分析?!緮M解決的關(guān)鍵問題】研究新疆該羊場布魯氏菌的感染情況,為該羊場免疫措施的制定提供了依據(jù)。對L7/L12蛋白原核表達、生物信息學(xué)分析,為制備本地化該分離株新型亞單位疫苗提供依據(jù)。
1.1 材 料
1.1.1 羊胎兒與菌株
新疆地區(qū)某羊場流產(chǎn)胎兒1只,12 h內(nèi)收集新鮮病料;E.coliDH5α、E.coliBL21(DE3)為研究室保存;pMD19-T Simple載體購自Takara公司;表達載體pET-28a購自Promega公司。
1.1.2 主要試劑
卡那霉素、氨芐霉素、IPTG和NC膜購自Solarbio公司;2×EsTaqMasterMix、普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、高純度質(zhì)粒小提試劑盒、DNA分子量Marker、辣根過氧化物酶標(biāo)記兔抗羊IgG均購自北京康為世紀(jì)生物公司;限制性核酸內(nèi)切酶(BamHⅠ、XhoⅠ)、T4DNA連接酶、solutionⅠ連接酶均購自Takara公司;膜封閉液、DAB增強型顯色試劑盒從天根生化科技有限公司購置;蛋白分子量Marker購自Thermo公司;蛋白純化HisTrapTM FF柱購自美國GE Healthcare公司,弗氏完全佐劑購自Sigma公司。
1.1.3 主要儀器
PCR儀(BIO-RAD);UVP凝膠成像系統(tǒng);高速冷凍離心機(Sigma,2-16K);CO2恒溫培養(yǎng)箱(DNP-9162);Nanodrop 2000分光光度計;AKTAxpress智能多維純化系統(tǒng)(蛋白純化儀);生物安全柜(Esco,Class Ⅱ-biohazard safe cabinet);微量移液器(eppendorf)。
1.1.4 培養(yǎng)基
布魯氏菌固體培養(yǎng)基(TSA)、布魯氏菌液體培養(yǎng)基(TSB)、布魯氏菌鑒別培養(yǎng)基(BMB)、酵母提取物、胰蛋白胨購自英國OXOID公司;氯化鈉購置于上海生工生物工程股份有限公司。
1.2 方 法
1.2.1 引物
研究所用的引物均由北京六合華大基因科技股份有限公司合成。列出引物序列。表1
表1 PCR引物序列
Table 1 Nucleotide sequences of PCR primers
引物Primer序列(5’→3’)Sequences(5’→3’)omp25-NGAATTCATGCGCACTCTTAAGTCTCTCGTA(EcoRⅠ)omp25-CGTCGACGAACTTGTAGCCGATGCCGAC(SalⅠ)L7/L12-NGGATCCATGGCTGATCTCGCAAAGATC(BamHⅠ)L7/L12-CCTCGAGTTACTTGAGTTCAACCTTGGCG(XhoⅠ)
1.2.2 細(xì)菌分離與培養(yǎng)
P2級別實驗室內(nèi)于生物安全柜中,取流產(chǎn)胎兒的脾臟劃線培養(yǎng)于布魯氏菌鑒別培養(yǎng)基,在37℃,5% CO2的環(huán)境中培養(yǎng)細(xì)菌。48~72 h后對細(xì)菌進行形態(tài)學(xué)觀察,利用改良萋-尼染色法對細(xì)菌染色后進行形態(tài)學(xué)觀察,初步鑒定陽性的布魯氏菌。
1.2.3 PCR鑒定
將初步鑒定為陽性的布魯氏菌擴大培養(yǎng)后,取0.5 mL菌液熱滅活后,作為PCR模版,利用omp25-N和omp25-C引物進行PCR擴增。PCR反應(yīng)條件為:95℃ 5 min,94℃ 30 s,55℃ 45 s,72℃ 55 s,30個循環(huán),72℃ 7 min。PCR產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳進行分析。
1.2.4 生化鑒定
將PCR鑒定為陽性的布魯氏菌按照《可感染人類的高致病性病原微生物菌(毒)種或樣本運輸管理規(guī)定》送至中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所,對布魯氏菌進行生化鑒定,并命名。
1.2.5 L7/L12基因的擴增
以熱滅活的該分離株為模板,用L7/L12-N和L7/L12-C的引物,進行PCR擴增。PCR反應(yīng)條件為:95℃ 5 min,94℃ 30 s,60℃ 30 s,72℃ 30 s,35個循環(huán),72℃ 7 min。PCR產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳進行分析。
1.2.6 pMD19-T-L7/L12克隆載體的構(gòu)建
PCR產(chǎn)物經(jīng)過回收后,與pMD19-T simple載體連接。連接產(chǎn)物通過熱擊轉(zhuǎn)化的方法轉(zhuǎn)化至E.coli DH5α的感受態(tài)細(xì)胞中。經(jīng)過氨芐抗性篩選和PCR鑒定后,將陽性克隆菌進行擴繁培養(yǎng),提取質(zhì)粒后,用限制性內(nèi)切酶BamH I和XhoI進行酶切鑒定。將酶切鑒定正確的陽性菌送至北京六合華大基因科技股份有限公司進行DNA測序分析。
1.2.7 pET-28a-L7/L12表達載體的構(gòu)建
將pMD19-T-L7/L12質(zhì)粒和pET-28a質(zhì)粒同時進行雙酶切,酶切后的pET-28a載體片段和L7/L12目的基因片段進行凝膠回收,將兩個片段使用solution I連接。連接產(chǎn)物通過熱擊轉(zhuǎn)化的方法轉(zhuǎn)化至E.coliBL21感受態(tài)細(xì)胞中。經(jīng)過抗性篩選和PCR鑒定后,將陽性克隆菌進行擴繁培養(yǎng),提取質(zhì)粒后,用限制性內(nèi)切酶BamHI和XhoI進行酶切鑒定。將酶切鑒定正確的陽性菌送至北京六合華大基因科技股份有限公司進行DNA測序分析。
1.2.8 重組蛋白L7/L12的誘導(dǎo)表達
將測序正確的克隆菌接種于LB液體培養(yǎng)基中,37℃過夜培養(yǎng)后,按1∶100的比例轉(zhuǎn)接至新鮮的LB液體培養(yǎng)基中,振蕩培養(yǎng)OD600nm≈0.4~0.6,取1 mL作為對照,剩余菌液中加入IPTG(終濃度為1 mmol/L)誘導(dǎo)表達。在至誘導(dǎo)后0、2、4、6和8 h分別取樣1 mL,離心后,棄去上清,對細(xì)菌沉淀進行處理后,SDS-PAGE電泳分析。
1.2.9 重組蛋白L7/L12的純化
將重組蛋白L7/L12誘導(dǎo)表達的菌體重懸于Lysis Buffer(50 mmol/L NaH2PO4,300 mmol/L NaCl,20 mmol/L imidazole,pH 8.0)中,液氮和42℃水浴反復(fù)凍融三次后超聲破菌,每次超聲10s,間歇10s,99次/周期,直至菌體清亮為止。12 000 r/min離心15 min,取上清和沉淀,分別進行SDS-PAGE電泳,檢測重組蛋白的表達位置。根據(jù)重組蛋白的表達位置,用AKTA express智能多維純化系統(tǒng)(蛋白純化儀)純化目的蛋白。將純化后的目的蛋白進行SDS-PAGE電泳,檢測蛋白的純化效果。
1.2.10 重組蛋白L7/L12的反應(yīng)原性檢測
利用Western Blot分析重組蛋白L7/L12的反應(yīng)原性。純化后的重組蛋白L7/L12經(jīng)SDS-PAGE電泳后,轉(zhuǎn)膜至NC膜上,用封閉液37℃封閉1 h,隨后用TBST Buffer(20 mM Tris-HCl,150 mM NaCl,0.05%(v/v) Tween 20)漂洗三次;用布魯氏菌陽性血清作為一抗,37℃孵育1 h,TBST Buffer漂洗三次;用辣根過氧化物酶標(biāo)記兔抗羊IgG(1∶5 000)作為二抗,37℃孵育1 h,TBST Buffer漂洗三次;利用DAB底物顯色試劑盒進行顯色,觀察重組蛋白L7/L12的反應(yīng)原性。
1.2.11 生物信息學(xué)分析目的蛋白
通過 TMHMM Server v.2.0 軟件(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/ ) 在線分析L7/L12蛋白的氨基酸序列,預(yù)測其蛋白跨膜區(qū);應(yīng)用SignalP 4.1 Server在線預(yù)測 L7/L12 蛋白的信號肽 (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/);SOPMA在線軟件預(yù)測 L7/L12蛋白的二級結(jié)構(gòu)(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/secpred_sopma.pl );Phyre2 構(gòu)建L7/L12蛋白三維結(jié)構(gòu)模型(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/webscripts/jobmonitor.cgi? Jobid = d97 9042d57b9240b);使用 PDBsum Generate( http: //www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/ pdb-sum / Generate.html ) 在線對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模型進行評估。
2.1 布魯氏菌形態(tài)學(xué)觀察及omp25 PCR鑒定結(jié)果
取流產(chǎn)羊胎兒脾臟病料,培養(yǎng)72 h后,肉眼觀察到5個邊緣整齊、呈露滴狀、折光較亮的單克隆菌落,符合布魯氏菌的菌落形態(tài)。對5個單克隆菌落進行改良萋-尼染色,發(fā)現(xiàn)其中有1個菌落鏡下為單一的紅色短球桿菌。將該菌落擴繁后,進行PCR鑒定,在大約650 bp處出現(xiàn)了預(yù)期大小的條帶。通過以上的結(jié)果,初次判定布魯氏菌,命名為015株。圖1
2.2 生化鑒定
經(jīng)中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所對布魯氏菌的鑒定結(jié)果表明,從流產(chǎn)胎兒脾臟中分離獲得的布魯氏菌為羊種布魯氏菌生物3型。表2
2.3 L7/L12基因的擴增
以金屬浴滅活的015株為模板,高保真擴增出目的片段,位于375 bp左右,鑒定結(jié)果與預(yù)期一致。圖2
1:布魯氏菌015株;2:布魯氏菌16M株;3:陰性對照;M:DNA marker DL2 000
Lane 1:Brucella015; Lane 2:Brucella16M; Lane 3: negative control; Lane M: DNA marker DL2,000
圖1 布魯氏菌omp25基因PCR鑒定
Fig.1 Identification ofBrucellaomp25 gene PCR
1-3:PCR產(chǎn)物,4:陰性對照,M: DNA markerⅡ
Lane 1-3: the product of L7/L12 gene; Lane 4: negative control; Lane M: DNA markerⅡ
圖 2 L7/L12基因的擴增
Fig.2 Amplification of L7/L12 gene by PCR表2 布魯氏菌015株的生化鑒定結(jié)果
Table 2 Biochemical identification of theBrucella015 strain
項目Item015標(biāo)準(zhǔn)株 Thestandardstain16M544A1330SCO2需求 CO2requirement————H2S產(chǎn)生 H2Sproduction—++++++三勝黃素 Acriflavin————染料抑菌aDyeinhibition硫堇++—+復(fù)紅+++—噬菌體裂解實驗(RTDb)LysitictestofphageTbRTD——+—Tb104RTD——++Iz+BK2++++單項特異性血清凝集cAgglutinationtestofMonospecificserumA+—++M++——R————鑒定結(jié)果Results種羊羊牛豬生物型3111
a: 布魯氏菌固體培基中染料濃度20 μg/mL (1:50 000);b:RTD:常規(guī)試驗稀釋度(在增殖菌中完全裂解的最高稀釋度);c:A=A單因子血清,M=M單因子血清,R=R單因子血清;d:16M、544A、1 330S分別為羊種、牛種、豬種布魯氏菌標(biāo)準(zhǔn)株
a: Dye concetration ofBrucellaagar medium 20 μg/mL (1:50,000); b: RTD: The rac of rational test dilution (the highest dilution rate, at which the Tb phage completely lysesBrucellaspp; c: A-A mono-specific serum, M=M mono-specific serum, R=R mono-specific serum; d: 16M, 544A, 1,330S are the standard stains ofBrucellamelitensis,Brucellaabortus,Brucellasuis
2.4 pET-28a-L7/L12表達載體的構(gòu)建
重組質(zhì)粒pET28a-L7/L12經(jīng)BamHⅠ和XhoⅠ雙酶切后,電泳圖片顯示得到5 369 bp的pET-28a 載體片段和375 bp 的目的條帶。結(jié)果表明pET28a-L7/L12原核表達載體已成功構(gòu)建。圖3
1:陰性對照;2:質(zhì)粒pET-28a-L7/L12雙酶切;M:DNA marker DL10 000
Lane 1: the double digested plasmid of pET-28a-L7/L12 ; Lane 2: negative control;Lane M: DNA marker DL10,000
圖3 pET-28a-L7/L12雙酶切鑒定
Fig.3 The double digestion identification of pET-28a-L7/L12
2.5 重組蛋白L7/L12的誘導(dǎo)表達
將鑒定正確的pET-28a-L7/L12的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至 BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,篩選陽性重組菌后,IPTG誘導(dǎo)表達,SDS-PAGE結(jié)果表明目的蛋白位于大約19 ku處,與預(yù)計大小一致,且在8 h時表達量最高。圖4
0: BL21(DE3)空菌誘導(dǎo)表達;1:轉(zhuǎn)化pET-28a質(zhì)粒的BL21誘導(dǎo)表達;M:蛋白Marker;2-6:轉(zhuǎn)化pET-28a-L7/L12 質(zhì)粒的BL21誘導(dǎo)表達0、2、4、6和8 h 0:induce expression BL21(DE3);1:induce expression BL21 transformed with pET-28a plasmid;M: Protein Marker; 2-6:induce expression BL21 transformed with pET-28a-L7/L12 plasmid for 0 h,2 h,4 h,6 h,8 h
圖4 表達產(chǎn)物的SDS-PAGE分析Fig4 The SDS-PAGE of pET-28a-L7/L12
2.6 重組蛋白L7/L12的純化
誘導(dǎo)8 h后的菌使用裂解液裂解后,取上清和沉淀驗證,SDS-PAGE結(jié)果表明,融合蛋白L7/L12在上清中存在(圖5a)。通過AKTA蛋白純化系統(tǒng)純化后的蛋白條帶清晰,雜帶較少,說明純化效果較好(圖5b)。圖5
2.7 重組蛋白L7/L12的反應(yīng)原性檢測
將純化后的重組蛋白L7/L12轉(zhuǎn)至NC膜,采用羊布魯菌陽性血清作為一抗,HRP標(biāo)記的兔抗羊抗體為二抗進行免疫印跡分析。Western Blot結(jié)果顯示在19 ku的位置上有一條明顯的特異性反應(yīng)條帶,表明融合蛋白能被抗布魯氏菌的綿羊血清所識別,且目的蛋白具有良好的反應(yīng)原性,與理論分析相符合。圖6
1-2:純化后的 L7/L12蛋白;M:蛋白MarkerSDS-PAGE analysis the effect of purified L7/L12 fusion protein 1-2:the purified L7/L12 protein ;M:Protein Marker
圖5 SDS-PAGE 電泳檢測L7/L12融合蛋白純化效果
Fig.5 SDS-PAGE analysis the effect of purified L7/L12 fusion protein
1-3:純化的His-L7/L12 融合蛋白;M:蛋白Marker
1-3: the purified His- L7/L12 fusion protein ;M: Protein Marker
圖6 融合蛋白His-L7/L12 Western Blot分析
Fig.6 The Western Blot analysis of fusion protein His-L7/L12
2.8 目的蛋白的生物信息學(xué)
通過TMHMM Server v.2.0在線軟件分析得出,目的蛋白無跨膜螺旋結(jié)構(gòu)(圖7)。SignalP 4.1 Server 對該蛋白氨基酸序列分析顯示,該蛋白有信號肽(圖8)。利用 SOPMA 在線軟件分析該蛋白的二級結(jié)構(gòu),結(jié)果顯示,85個氨基酸參與形成α-螺旋,占68.55%。延伸鏈占8.87%,有13個氨基酸參與形成β-折疊,占10.48%,無規(guī)卷曲結(jié)構(gòu)占12.10%(圖9)。通過 Phyre2 在線服務(wù)器構(gòu)建出并優(yōu)化目的蛋白的三維結(jié)構(gòu)(圖10)。利用 PDBsum Generate在線評估(圖11)。從Ramachandran 圖中可以看出,在 121個氨基酸殘基中,有98個處于核心允許區(qū),占 92.5% ,6 個處于額外允許區(qū),占5.7% ,1個處于最大允許區(qū),占 0.9% ,不可信區(qū)域為1,占 0.9%。這說明該模型具有一定的可信度。圖7~11
圖7 TMHMM Server v.2.0 預(yù)測L7/L12蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域
Fig.7 The prediction of transmembrane domain of L7/L12 protein by TMHMM Server v.2.0
圖8 Signal P 4.1 Server 預(yù)測L7/L12蛋白信號肽
Fig.8 The prediction of signal peptide of L7/L12 protein by Signal P 4.1 Server
圖9 SOPMA 軟件推測的L7/L12蛋白二級結(jié)構(gòu)
Fig.9 The prediction of secondary structure of L7/L12 protein by SOPMA Server
圖10 Phyre2 在線服務(wù)器預(yù)測 L7/L12 蛋白三級結(jié)構(gòu)的構(gòu)建
Fig.10 The construction of tertiary structure of L7/L12 protein by Phyre2
圖11 拉氏圖
Fig.11 The Ramachandran plot
布魯氏菌病是世界上具有嚴(yán)重危害性的人畜共患的傳染病之一,幾乎世界各地都有分布。從20世紀(jì)50年代中期,我國就開始了有組織有計劃地對人畜布病調(diào)查及防治[13]。20世紀(jì)80年代中后期,布魯氏菌病在世界部分地區(qū)有回升趨向,尤其在亞洲更為明顯[14]。90年代以來,布病疫情呈持續(xù)愈演愈烈的態(tài)勢,在我國西部、東北及華北省區(qū)疫情尤為嚴(yán)重。進入2000年以后,布病疫情強勢走高,每年報導(dǎo)的發(fā)病人數(shù)逐年上升,由總共報導(dǎo)的37種傳染病的第17位到2006年已上升至第10位,這種狀況在所有法定報告?zhèn)魅静≈惺菢O其罕見的,進一步說明了當(dāng)前布病疫情的嚴(yán)重性,研究及防治的迫切性[15]。
L7/L12核糖體蛋白是布魯氏菌重要的免疫性抗原之一,結(jié)構(gòu)保守,是良好的疫苗候選抗原蛋白[16]。另外,L7/L12蛋白在布魯氏菌逃逸機體免疫應(yīng)答后所引起的Ⅳ型超敏反應(yīng)中也扮有重要角色[17]。除了引起細(xì)胞免疫反應(yīng)外,L7/L12也可以引起體液免疫應(yīng)答[18]。Tabynov 等[19,20]將L7/L12 蛋白與流感病毒載體結(jié)合包裹成類病毒顆粒作為疫苗抗原,免疫豚鼠和小鼠后發(fā)現(xiàn)該抗原可作為疫苗預(yù)防B.abortus544株所引起的動物感染。Luo等[21]研究表明L7/L12作為布魯氏菌疫苗抗原的機制之一是天然的L7/L12蛋白內(nèi)含有T淋巴細(xì)胞的表位,從而能夠刺激機體產(chǎn)生Th1類細(xì)胞免疫應(yīng)答,分泌IFN-γ刺激巨噬細(xì)胞活化,從而清除藏匿在巨噬細(xì)胞中的布魯氏菌。因此,研究由此構(gòu)建新疆地區(qū)分離株的L7/L12蛋白表達,對于進一步研制新疆地區(qū)的亞單位疫苗具有現(xiàn)實意義。
試驗成功分離到新疆羊種生物3型布魯氏菌并成功構(gòu)建L7/L12蛋白重組表達載體。表達的重組蛋白能與布魯氏菌陽性血清反應(yīng),說明表達的L7/L12在大腸桿菌中得到了正確折疊,其免疫學(xué)活性沒有受到影響。免疫印跡實驗證明了L7/L12蛋白具有良好的反應(yīng)原性。
試驗運用生物信息學(xué)相關(guān)知識分析,結(jié)果表明該基因所表達的蛋白并沒有跨膜結(jié)構(gòu),說明該蛋白可能不參與細(xì)胞內(nèi)外信號的轉(zhuǎn)導(dǎo)。該蛋白沒有信號肽,說明該蛋白屬于非分泌性蛋白,不能被布魯氏菌分泌到細(xì)胞外發(fā)揮作用。其二級結(jié)構(gòu)主要以α-螺旋為主,和絕大多數(shù)蛋白的二級結(jié)構(gòu)一樣,都是通過骨架上的羰基和酰胺基團之間形成的氫鍵維持該二級結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。利用生物信息學(xué)軟件Phyre2 等構(gòu)建了出了L7/L12蛋白的三維模型,這有利于蛋白結(jié)構(gòu)、功能的可視化分析。經(jīng)分析發(fā)現(xiàn),與其同源性的模型具有免疫調(diào)控功能,間接驗證了該蛋白可能具有免疫調(diào)控的功能。布魯氏菌的免疫逃避是一個復(fù)雜的過程,其分子機制尚不完全清楚。試驗通過構(gòu)建布魯氏菌L7/L12基因的原核表達載體并對其反應(yīng)原性進行鑒定以及生物信息學(xué)分析,為進一步探究布魯氏菌疫苗研究提供了一些參考。同時,該蛋白作為新疆該地區(qū)羊種布魯氏菌的疫苗候選分子具有一定的參考價值。
實驗以羊流產(chǎn)胎兒為病料,經(jīng)過劃線培養(yǎng)、改良萋-尼染色法染色觀察其形態(tài),對疑似菌進行omp25PCR鑒定,初步判斷出分離的菌中有布魯氏菌,命名為015。經(jīng)中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所對布魯氏菌通過一系列的生化鑒定,最終確定了該菌為羊種布魯氏菌生物3型,這表明新疆該羊場存在羊種布魯氏菌3型的感染。L7/L12蛋白參與布魯氏菌的蛋白質(zhì)合成以及發(fā)揮保護性抗原的作用,為此通過原核表達的方式大量表達出L7/L12蛋白,并使用Western Blot方法檢測出該表達蛋白有良好的反應(yīng)原性。生物學(xué)軟件對該蛋白進行了一些常規(guī)的預(yù)測,為了解該蛋白性質(zhì)提供參考。
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Supported by: General Programs of the National Natural Science Foundation of China"Study on the molecular regulation of TceSR and TcfSR in the pathogenesis of Brucella" (31572491).
CHEN Chuang-fu(1962-), male, professor, doctoral supervisor, mainly engaged in the study of pathogenic microorganisms pathogenic mechanism
Identification of Isolate Strain of Brucella Melitensis in Xingjiang and Prokaryotic Expression and Bioinformatics Analysis of Its L7/L12 Protein
LIU Sheng1, JIANG Ya-li2, FU Qiang3, SHI Hui-jun3, LI Shuang1, MENG Lu-ping1, GUO Fei4, ZHANG Hui1, CHEN Chuang-fu1
(1.CollegeofAnimalScienceandTechnology,ShiheziUniversity,ShiheziXinjiang832000,China; 2.CollegeofLifeTechnology,ShiheziUniversity,ShiheziXinjiang832000,China; 3.CollegeofVeterinaryMedicine,XinjiangAgriculturalUniversity,Urumqi830052,China; 4.SchoolofMedicine,ShiheziUniversity,ShiheziXinjiang832000,China)
【Objective】 To isolate and identify Xinjiang Brucella melitensis, this project focuses on prokaryotic expression of the L7/L12 protein of the bacteria,detection of its reactionogenicity and and partial biological analysis. 【Method】Isolation and identification of Brucella melitensis by using bacterial streak culture, morphological observation, biochemical test and PCR detection. Using conventional and molecular biological methods to express and purify the L7/L12 protein of this Brucella melitensis. Expression and purification isolate strain L7/L12 protein by using the conventional molecular biological methods, and analysis of the fusion protein reactionogenicity by Western Blot . Using bioinformatics software to analyze some functions of this protein. 【Result】After identification, the strain was identified as Brucella melitensis. After enzyme digestion and sequencing, the expression vector pET-28a-L7/L12 was correctly constructed. SDS-PAGE tests showed that the purified L7/L12 protein was a single band. The fusion protein had good reactionogenicity by Western Blot detection. Bioinformatics analysis showed the protein had no trans-membrane domain and no signal peptide.Its secondary structure was mainlyα-helix.And the three-dimensional structure of the protein was constructed by Phyre2 Server. 【Conclusion】The isolated strain was identified successfully and L7/L12 fusion protein of this isolate strain was expressed and purified. Blot Western test proved that the protein had a good reactionogenicity, which laid the foundation for the protein follow-up research of the subunit vaccine.
Brucellamelitensis;L7/L12; protein purification; reactionogenicity;biological analysis
10.6048/j.issn.1001-4330.2017.03.022
2016-11-24
國家自然科學(xué)基金面上項目“TceSR和TcfSR在布魯氏菌致病過程中的分子調(diào)控機制研究”(31572491)
劉升(1992-),女,安徽宿州人,碩士研究生,研究方向為分子病毒學(xué),(E-mail)1341753096@qq.com
陳創(chuàng)夫(1962-),男,廣東潮州人,教授,博士生導(dǎo)師,研究方向為病原微生物致病機理,(E-mail)ccf-xb@163.com
S852.1;S188
A
1001-4330(2017)03-0564-10