亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        我國豬博卡病毒的流行現(xiàn)狀及檢測技術(shù)

        2017-01-31 23:33:46謝金文沈志強
        養(yǎng)豬 2017年2期
        關(guān)鍵詞:博卡特異性引物

        李 嬌,謝金文,李 峰,沈志強,

        (1.山東綠都生物科技有限公司,山東 濱州 256600;2.山東省濱州畜牧獸醫(yī)研究院,山東 濱州 256600)

        我國豬博卡病毒的流行現(xiàn)狀及檢測技術(shù)

        李 嬌1,謝金文2,李 峰2,沈志強1,2

        (1.山東綠都生物科技有限公司,山東 濱州 256600;2.山東省濱州畜牧獸醫(yī)研究院,山東 濱州 256600)

        豬博卡病毒(PBoV)屬于細小病毒科(Parvovirus)細小病毒亞科(Parvovirus)博卡病毒屬(bocavirus),為無囊膜的單股DNA病毒,病毒粒子大小為25~30nm,呈正二十面體結(jié)構(gòu)。病毒基因組全長5.2 kb,編碼3個主要的開放閱讀框(ORF1~3),其中ORF1編碼非結(jié)構(gòu)蛋白NS1,ORF2編碼衣殼蛋白VP1和VP2,ORF3編碼非結(jié)構(gòu)蛋白NP1。根據(jù)非結(jié)構(gòu)蛋白NS1的核苷酸同源性分為5個基因型(PBoV-1型、PBoV-2型、PBoV-3型、PBoV-4型、PBoV-5型)。該病毒于2009年被首次報道[1],我國翟少倫等[2]于2010年首次在191份疑似患高熱病的病料中檢出PBoV,隨后國內(nèi)養(yǎng)豬密集地區(qū)相繼檢測出PBoV。目前國內(nèi)對于該病毒的研究仍處于起步階段,病毒的理化性質(zhì)、致病機理、致病性尚不清楚,病毒的體外細胞培養(yǎng)系和動物模型尚未建立。筆者就目前國內(nèi)PBoV的流行現(xiàn)狀及檢測技術(shù)進行綜述,以期為我國PBoV的防控提供參考。

        1 流行現(xiàn)狀

        1.1 病原學調(diào)查情況

        PBoV自2010年首次在國內(nèi)被檢測到以來,在短短幾年的時間內(nèi),在豬群中就有較高的流行率。Liu等[3]對遼寧、天津、河北、河南、山東5個省區(qū)采集的403份組織樣品進行檢測,PBoV平均感染陽性率為11.41%,其中以山東的感染率最高(41.86%),河北次之(20.8%),河南和遼寧的感染率分別為11.0%和10.0%,天津市的感染率最低(1.3%)。Zhai等[4]對采自浙江、江西、安徽、河北、河南、江蘇、北京、上海、新疆9省市的組織病料樣品進行檢測,PBoV感染率在12.5%~88.9%之間。Shan等[5]對上海、江蘇、安徽、山東、貴州的共計340份健康豬樣品進行檢測,PBoV感染率在45%~75%之間。胡軍勇等[6]對湖北、湖南、河南省的79個規(guī)?;i場進行流行病學調(diào)查,248份病料樣品中有172份樣品為PBoV陽性,PBoV陽性感染率高達69.35%。Zhang等[7]對國內(nèi)10個省份的166份樣品進行PBoV的分型檢測,結(jié)果PBoV-1、PBoV-2、PBoV-3、PBoV-4的感染率分別為28.9%、6.6%、19.3%和39.4%,說明中國豬群中存在多種基因型的PBoV感染。蔡雨函等[8]對四川省189份仔豬腹瀉病料進行檢測,PBoV陽性樣品121份,陽性率達64.02%,121份陽性樣品中有79份為PBoV 3/4/5型,29份為PBoV 1/2型,13份為PBoV 1/2型及3/4/5型混合感染,表明四川地區(qū)主要的流行毒株可能是PBoV 3/4/5型。鄧波等[9]對上海市1 800份豬血清、45份豬糞便、27份豬鼻棉拭、9份高熱病死豬內(nèi)臟進行檢測,陽性率依次為24%、30%、0%、67%,并且對6份PBoV陽性病料進行豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)、豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)、豬偽狂犬病病毒(PRV)、豬細小病毒(PPV)的檢測,陽性率依次為83%、100%、0%、0%,表明上海市PBoV感染情況普遍存在,豬內(nèi)臟中檢出率較高,且春秋兩季高發(fā),仔豬比較易感,并與PRRSV、PCV2存在混合感染。以上流行病學調(diào)查資料共同表明,PBoV在國內(nèi)豬群中流行廣泛,感染率較高,且存在PBoV多種基因型的感染,以及PBoV與PRRSV、PCV2等疫病的混合感染,感染情況比較復雜。

        1.2 分子流行病學調(diào)查情況

        分子流行病學通過對病毒核酸序列或蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)構(gòu)建遺傳進化樹,可在同一病毒種屬內(nèi)進行種系分析,研究一定時期內(nèi)病毒的遺傳變異和流行情況,為尋找病毒的傳播途徑以及制定不同地區(qū)不同時間的防控措施提供指導。郝飛等[10]根據(jù)GenBank收錄的25條PBoV全基因或部分基因序列,利用DNAStar分析軟件,通過Jotun-Hein算法,分別從PBoV的NS、NP、VP以及全基因序列進行相似性臨近排組分析,并建立了系統(tǒng)發(fā)育進化樹,發(fā)現(xiàn)PBoV基因較為離散,種屬內(nèi)的差異較大,大體可分為2個大支和若干遺傳簇,不同的遺傳簇所包含的毒株在核苷酸序列上存在著一定的差異,同支序列的分離株相似性較高,PBoV在進化過程中存在一定的地域差異性,推測PBoV在傳播過程中可能發(fā)生了重組,從而產(chǎn)生了較大的變異。

        2 檢測方法研究進展

        PBoV在臨床中常常與PRRSV、PCV2、豬流行性腹瀉病毒(PEDV)、豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)等疫病混合感染,增加了PBoV臨床確診的難度,對于PBoV的確診需借助實驗室檢測技術(shù)。過去對于動物病毒病的實驗室檢測技術(shù)一般都采用病毒的分離鑒定方法,但PBoV作為一種新發(fā)病毒,對其研究尚處于初級階段,目前只有北愛爾蘭科研人員利用豬原代腎細胞成功分離出PBoV的報道[11],我國還未見PBoV成功分離的報道,至今尚未找到合適的PBoV體外細胞培養(yǎng)系和動物模型,故國內(nèi)對PBoV的實驗室檢測技術(shù)研究主要集中在分子生物學和血清學檢測方面,而且取得了較大進展。

        2.1 PCR方法

        PCR方法是目前最簡單的分子生物學檢測方法,該方法操作簡單、檢測快速、具有一定的敏感性,已被廣泛應用于動物疫病的檢測。葉星宇等[12]根據(jù)GenBank公布的PBoV的核苷酸序列,在其NP1保守區(qū)域設計1對特異性引物,經(jīng)過PCR反應條件的優(yōu)化,建立了檢測PBoV的PCR方法,該方法檢測豬瘟病毒(CSFV)、PPV、PRRSV、PCV2均為陰性,特異性好。該方法的敏感度可以達到58 pg/μL,敏感性高。該方法3次重復檢測的結(jié)果完全一致,重復性好。對陽性擴增產(chǎn)物測序,與Gen-Bank公布的PBoV NP1序列同源性在97.3%以上,可靠性強。胡軍勇等[6]也根據(jù)PBoV NS1基因序列設計1對引物,建立了檢測PBoV的PCR方法,該方法能夠從PBoV陽性樣品中特異性地擴增出482 bp的片段,而對PPV、PCV2、沙門氏菌、大腸桿菌、豬鏈球菌、副豬嗜血桿菌的核酸樣品均無非特異性擴增反應,該方法對PBoV的最低檢測量為213.6拷貝,為PBoV臨床診斷和病原學調(diào)查提供了一種檢測技術(shù)。

        2.2 多重PCR方法

        多重PCR方法是在常規(guī)PCR反應體系中加入多對引物,實現(xiàn)多種病原核酸的同時鑒別檢測,可應用于PBoV與其它致病原的鑒別診斷以及PBoV不同基因型的分型檢測。付朋飛等[13]根據(jù)GenBank中登錄的PBoV不同基因型序列和PCV2全基因組序列分別設計2對特異性引物,通過對擴增條件進行優(yōu)化,建立了能夠同時檢測PBoV和PCV2的雙重PCR方法,該方法可以同時擴增出PBoV(209 bp)和PCV2(476 bp)的特異性片段,而對PRV、PPV、沙門氏菌、大腸埃希氏菌DNA模板擴增結(jié)果均為陰性,對PBoV和PCV2的最低檢出量均為100拷貝/μL,該雙重PCR與單重PCR的檢測符合率為100%。該雙重PCR特異性強、重復性好、敏感性高,為PBoV和PCV2的快速鑒別診斷提供了有效的技術(shù)支持。焦洋等[14]根據(jù)GenBank登錄的TGEV S基因序列、PEDV M基因和PBoV NP1基因序列,設計合成3對引物,對TGEV、PEDV RNA反轉(zhuǎn)錄獲得的cDNA模板和PBoV的DNA模板進行多重PCR擴增,通過優(yōu)化反應條件,建立了同時檢測TGEV、PEDV和PBoV的多重PCR方法,該方法檢測豬A群輪狀病毒(GAR)、PRRSV、PRV、PCV2均為陰性,對TGEV、 PEDV、PBoV核酸的最低檢測限分別為35、20、10 pg。該方法可以在同一體系中同時檢測3種病毒,大幅降低了檢測成本,為TGEV、PEDV、PBoV感染的鑒別診斷提供了簡便、快速、準確的檢測方法。宏春慧等[15]分別根據(jù)PBoV-1型、PBoV-2型、PBoV-3型基因序列保守區(qū)域設計3對引物,通過引物濃度和退火溫度等條件優(yōu)化,建立了同時檢測PBoV 3種基因型的三重PCR方法。該方法可以同時擴增出645 bp(PBoV-1型)、352 bp(PBoV-2型)和259 bp(PBoV-3型)的特異性片段,而對PEDV、TGEV、GAR、豬庫布病毒(PKoV)、PCV2、CSFV、大腸埃希氏菌的檢測均為陰性,最低檢測限為8×10-7ng/μL,對臨床樣品進行三重PCR和單項PCR檢測,二者符合率為100%,該方法的建立為PBoV 3種不同基因型的鑒別檢測提供了有效手段。

        2.3 熒光定量PCR方法

        熒光定量PCR方法是指采用SYBR GreenⅠ熒光染料或熒光探針通過連續(xù)監(jiān)測熒光信號的強弱變化來定量分析擴增產(chǎn)物的數(shù)量,進而實現(xiàn)對起始模板的準確定量。與常規(guī)PCR方法相比具有敏感性更高、適時定量、自動化程度高等優(yōu)點。陳鵬強等[16]根據(jù)PBoV-5型NS1基因序列設計引物,建立了基于SYBR GreenⅠ檢測PBoV-5的實時熒光定量PCR,該方法在3.64×102~3.64×107拷貝/μL范圍內(nèi)有很好的線性關(guān)系,檢測豬圓環(huán)病毒(PCV1和PCV2)、PPV、豬輸血傳播病毒(TTV-1和TTV-2)的核酸均無陽性信號擴增,組內(nèi)變異系數(shù)為0.35%~1.24%,組間變異系數(shù)為0.43%~1.46%。鄧波等[17]根據(jù)PBoV序列,通過VP1和VP2基因設計引物和TaqMan探針,建立了檢測PBoV的實時熒光定量PCR方法,該方法檢測PPV、PRRSV、PCV2均為陰性,最低可檢測到101拷貝/mL的陽性質(zhì)粒,具有靈敏度高、特異性好和精確性高等優(yōu)點,在PBoV的臨床診斷、大規(guī)模臨床樣本檢測中將具有廣泛的臨床應用前景。

        2.4 LAMP方法

        環(huán)介導等溫擴增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一種新興的分子生物學檢測方法,具有不需要特殊儀器設備、操作簡單、檢測快速等優(yōu)點,但該方法的敏感性太高,已導致臨床假陽性的檢測結(jié)果。李彬等[18]從基因數(shù)據(jù)庫中檢索獲得PBoV基因序列,通過DNAStar軟件進行序列比對,獲得PBoV特異性保守序列,通過LAMP引物設計軟件(Primer Explorer software version 4.0)對該保守序列進行LAMP引物設計,獲得4條特異性引物,經(jīng)Mg2+濃度、反應溫度、反應時間3個參數(shù)反應條件的優(yōu)化,建立了檢測PBoV的LAMP方法,該方法的靈敏度可達到檢測10個拷貝的PBoV核酸,檢測CSFV、PRRSV、PCV2、PRV均為陰性。該LAMP檢測方法敏感性高、特異性強、操作簡單、檢測快速,已經(jīng)組裝了試劑盒并申請了國家專利,能夠較好的滿足PBoV現(xiàn)地檢測的需要。

        2.5 血清學方法

        血清學檢測技術(shù)或稱免疫學檢測技術(shù)是一種基于抗原抗體特異性反應原理,通過在抗原抗體上標記的放射線、熒光、酶等特殊物質(zhì)作為探針來檢測抗原抗體的體外免疫反應技術(shù)。張晶等[19]為研究PBoV VP1蛋白在血清學診斷中的作用,用DNAStar軟件預測了PBoV NP08株VP1蛋白的主要抗原表位,確定1~34個氨基酸為優(yōu)勢抗原表位區(qū),將其定向克隆至pET32a原核表達載體,轉(zhuǎn)化BL21感受態(tài)細胞,利用IPTG誘導表達,獲得了分子量為56.7 ku的重組蛋白VP1,Western blot鑒定表明,純化后的VP1蛋白與PBoV陽性血清具有良好的反應性,用該蛋白包被ELISA反應板,檢測10份臨床感染PBoV的豬血清樣品和3份未感染豬血清樣品,結(jié)果表明其具有很好的特異性,不與未感染豬的血清發(fā)生反應,為進一步建立檢測PBoV的血清學抗體診斷方法奠定了基礎。李彬等[20-21]利用原核表達系統(tǒng)先后分別成功表達了PBoV NP1和VP2蛋白,利用鎳離子蛋白純化柱分別成功純化了2個重組蛋白,Western blot結(jié)果顯示,表達的VP2蛋白和NP1蛋白均能與His抗體發(fā)生特異性免疫反應,重組VP2蛋白和重組NP1蛋白均可以作為PBoV診斷抗原的候選蛋白,分別為建立檢測PBoV NP1抗體和VP2抗體的血清學診斷方法奠定了基礎。

        3 結(jié)語

        現(xiàn)階段的流行病學調(diào)查證明,PBoV自2010年在我國被首次發(fā)現(xiàn)以來,其在國內(nèi)豬群中感染率一直較高,且存在PBoV多種基因型的感染以及PBoV與PRRSV、PCV2等疫病的混合感染,感染情況比較嚴峻,應加強重視。對于PBoV的各種檢測方法,PCR和多重PCR方法雖然操作簡單、快速,但不能定量,且敏感性有限,容易漏檢。LAMP方法雖然對儀器、試劑、操作人員的要求較低,更適合基層應用,但敏感性太高,易污染。熒光定量PCR方法彌補了常規(guī)PCR方法的缺點,但該方法對儀器、試劑、操作人員的要求均較高,有條件的實驗室可選擇使用。血清學方法操作簡單、檢測快速、高通量,適合大規(guī)模樣品檢測,雖然國內(nèi)還沒有商品化的血清學檢測試劑盒,但其將具有廣闊的開發(fā)與應用前景。綜合判斷,各種檢測方法均具有各自的優(yōu)缺點,不同單位可根據(jù)自身的情況選擇適合自己的方法。相信隨著分子生物學和免疫學技術(shù)的不斷發(fā)展,以及PBoV基礎性研究的不斷深入,PBoV的各種檢測方法將會得到進一步發(fā)展與完善,從而為PBoV的臨床診斷與流行病學調(diào)查提供技術(shù)保障。

        [1]Blomstrom A L,Belak S,Fossum C,et al.Detection of a novel porcine boca-like virus in the background of porcine circovirus type 2 induced postweaning multisystemic wasting syndrome[J]. Virus Res,2009,146(1-2):125-129.

        [2]翟少倫,岳城,韋祖樟,等.豬博卡病毒PCR檢測方法的建立及其應用[J].中國動物傳染病學報,2010,11(2):14-17.

        [3]Liu M,Li Y,Sun D,et al.Detection and genetic analysis of porcine bocavirus in different swine herds in North Central China[J].Scientific World Journal,2014(8):947084.

        [4]Zhai S,Yue C,Wei Z,et al.High prevalence of a novel porcine bocavirus in weanling piglets with respiratory tract symptoms in China[J].2010,155(8):1313-1317.

        [5]Shan T,Lan D,Li L,et al.Genomic characterization and high prevalence of bocaviruses in swine[J].PLoS One,2011,6(4):e17292.

        [6]胡軍勇,張倩,王丹丹,等.豬博卡病毒PCR檢測方法的建立及其初步流行病學調(diào)查[J].中國預防獸醫(yī)學報,2012,34(8):632-636.

        [7]Zhang H B,Huang L,Liu Y J,et al.Porcine bocaviruses:genetic analysis and prevalence in Chinese swine population[J]. Epidemiol Infect,2011,139(10):1581-1586.

        [8]蔡雨函,周遠成,朱玲,等.豬博卡病毒雙重PCR檢測方法的建立及其應用[C].2015中國豬業(yè)科技大會暨2015年學術(shù)年會,2015:375.

        [9] 鄧波,劉佩紅,周錦萍,等.上海市豬博卡病毒感染情況調(diào)查[J].中國動物傳染病學報,2012,20(3):62-66.

        [10]郝飛,湯德元,李春燕,等.豬博卡病毒流行病學研究[J].畜牧獸醫(yī)學報,2012,43(10):1609-1617.

        [11]McKillen J,McNeilly F,Duffy C,et al.Isolation in cell cultures and initial characterisation of two novel bocavirus species from swine in Northern Ireland[J].Vet Microbiol,2011,152(1-2): 39-45.

        [12]葉星宇,聶奎,聶福平.豬博卡病毒NP1基因特異性的PCR方法建立及應用[J].西南大學學報(自然科學版),2015,37(5):18-22.

        [13]付朋飛,喬涵,潘鑫龍,等.豬博卡病毒和豬圓環(huán)病毒2型雙重PCR檢測方法的建立[J].中國預防獸醫(yī)學報,2014,36(9):708-711.

        [14]焦洋,姜焱,王凱民,等.豬傳染性胃腸炎病毒、豬流行性腹瀉病毒和豬博卡病毒多重PCR檢測方法的建立[J].動物醫(yī)學進展,2013,34(8):71-75.

        [15]宏春慧,楊兵,覃湘婕,等.豬博卡病毒不同基因型三重PCR檢測方法的建立及初步應用[J].華北農(nóng)學報,2016,31(2):12-16.

        [16]陳鵬強,胡崇偉,陳秋勇,等.豬博卡病毒5型SYBR Green I實時熒光定量PCR檢測方法的建立[J].中國獸醫(yī)科學,2015,45(2):150-155.

        [17]鄧波,劉佩紅,周錦萍.豬博卡病毒實時熒光定量PCR檢測方法的建立[J].動物醫(yī)學進展,2012,33(9):70-74.

        [18]李彬,何孔旺,溫立斌,等.豬博卡病毒的LAMP檢測試劑盒及其檢測方法:中國,201110092345[P].2011-04-13.

        [19]張晶,黃寶慧,劉雪嶺,等.豬博卡病毒VP1蛋白抗原表位分析及其克隆表達[J].畜牧與獸醫(yī),2016,48(9):96-99.

        [20]李彬,毛立,何孔旺,等.豬博卡病毒NP1基因的克隆與原核表達[J].華北農(nóng)學報,2011,26(3):28-31.

        [21]李彬,杜露平,何孔旺,等.豬博卡病毒VP2基因的克隆與原核表達[J].江蘇農(nóng)業(yè)學報,2013,29(4):796-799.

        (編輯:郭玉翠)

        S858.28

        A

        1002-1957(2017)02-0118-03

        2016-10-14

        山東省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系生豬創(chuàng)新團隊項目(SDAIT-08-17)

        李 嬌(1981-),女,滿族,遼寧鐵嶺人,助理研究員,碩士,主要從事動物疫病診斷技術(shù)研究工作.E-mail:lijiao_zone@163.com

        猜你喜歡
        博卡特異性引物
        豬博卡病毒的流行病學、發(fā)病機理和檢測技術(shù)研究進展
        DNA引物合成起始的分子基礎
        高中生物學PCR技術(shù)中“引物”相關(guān)問題歸類分析
        生物學通報(2022年1期)2022-11-22 08:12:18
        SSR-based hybrid identification, genetic analyses and fingerprint development of hybridization progenies from sympodial bamboo (Bambusoideae, Poaceae)
        打造酣暢淋漓的觀影體驗 BOKAR(博卡) Theatre Sense S224/Bass Ultra B1501
        豬博卡病毒感染的綜合診斷要點及其防控
        精確制導 特異性溶栓
        BOPIM-dma作為BSA Site Ⅰ特異性探針的研究及其應用
        火炬松SSR-PCR反應體系的建立及引物篩選
        重復周圍磁刺激治療慢性非特異性下腰痛的臨床效果
        偷偷色噜狠狠狠狠的777米奇| 黄色中文字幕视频网站| 人妻丰满熟妇av一区二区| 亚洲色图第一页在线观看视频| 日韩视频午夜在线观看| 男女视频网站在线观看| 国内嫩模自拍诱惑免费视频| 精品国产粉嫩内射白浆内射双马尾 | 亚洲av本道一本二本三区| 亚洲视频在线免费不卡| 免费观看全黄做爰大片| 变态 另类 欧美 大码 日韩 | 日本高清一区二区三区视频| 丰满人妻一区二区三区52 | 中文字幕精品人妻丝袜| 国产一区二区精品久久岳| 一本久久a久久精品vr综合| 国产精品jizz视频| 亚洲中文字幕巨乳人妻| 日韩精品人妻少妇一区二区| 美女和男人一起插插插| 国产一精品一av一免费爽爽| 亚洲av成人中文无码专区| 免费av片在线观看网站| 亚洲AV无码专区国产H小说| 蜜桃在线观看免费高清完整版| 久久日韩精品一区二区| 狠狠躁夜夜躁人人躁婷婷视频| 欧美v亚洲v日韩v最新在线| 国产婷婷丁香五月麻豆| 美利坚亚洲天堂日韩精品| 精品视频在线观看日韩| 内射少妇36p亚洲区| 国产精品无码专区综合网| 日本一区二区三区看片| 亚洲精品中文字幕乱码无线| 国产精品二区一区二区aⅴ污介绍| 小sao货水好多真紧h视频| 日韩欧美国产亚洲中文| 日韩精品一区二区av在线| 最新国产不卡在线视频|