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        EB病毒感染與XRCC1-Arg399Gln基因多態(tài)性在鼻咽癌發(fā)生中的交互作用

        2016-11-15 08:18:42郭俊英鄭瑜宏崔兆磊辛小琴李筱莉
        關(guān)鍵詞:鼻咽癌多態(tài)性基因型

        郭俊英,鄭瑜宏,崔兆磊,辛小琴,李筱莉,陳 燕

        (福建醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院,福建省腫瘤轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福建省腫瘤醫(yī)院檢驗(yàn)科,福建福州350014)

        ·論著·

        EB病毒感染與XRCC1-Arg399Gln基因多態(tài)性在鼻咽癌發(fā)生中的交互作用

        郭俊英,鄭瑜宏,崔兆磊,辛小琴,李筱莉,陳 燕

        (福建醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院,福建省腫瘤轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福建省腫瘤醫(yī)院檢驗(yàn)科,福建福州350014)

        目的評(píng)估XRCCl-Arg399 Gln單核苷酸多態(tài)性在鼻咽癌發(fā)病中的風(fēng)險(xiǎn),研究XRCCl-Arg399 Gln單核苷酸多態(tài)性與EB病毒感染的交互作用。方法采用病例對(duì)照研究,收集90名經(jīng)病理確診的鼻咽癌患者作為病例組和75名在我院進(jìn)行健康體檢的病人作為對(duì)照,并按照性別和年齡1∶1配對(duì),提取全血基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物再進(jìn)行測(cè)序PCR反應(yīng),最后分析得出XRCC1 Arg399Gln的基因型。結(jié)果EB病毒感染能增加鼻咽癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),VCA-IgA、EA-IgA和Rta-IgG抗體三項(xiàng)陽(yáng)性時(shí)可以增加鼻咽癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),但單項(xiàng)VCA-IgA陽(yáng)性是鼻咽癌發(fā)病的最強(qiáng)危險(xiǎn)因素(OR=26.526,95% CI:11.190~62.884),單因素條件Logistic回歸分析顯示,與攜帶XRCC-1 Arg399Gln的AA基因型相比,攜帶XRCC-1 Arg399Gln的GG基因型可增加鼻咽癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=4.3,95%CI:1.184~15.618);XRCC-1 Arg399Gln的GA基因型與VCAIgA存在交互作用(OR=20.755,95%CI:5.312~81.094)。結(jié)論XRCC-1基因的Arg399Gln基因多態(tài)性能夠增加患鼻咽癌的風(fēng)險(xiǎn),且Arg399Gln的GA基因型與EB病毒感染具有一定的交互作用。

        XRCC1;鼻咽癌;基因多態(tài)性;VCA-IgA;EA-IgA;Rta-IgG

        研究顯示,鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma,NPC)的發(fā)生發(fā)展可能與一些DNA修復(fù)基因有一定的聯(lián)系,如人類X射線交錯(cuò)互補(bǔ)修復(fù)基因1(X-ray repair cross-complementing gene 1,XRCC1)、著色性干皮病基因D(XPD)、人8-羥基鳥(niǎo)嘌吟糖苷酶1(h OGG1)等。XRCC1基因是人體細(xì)胞DNA因電離輻射和氧化損傷引起的堿基切除和單鏈斷裂修復(fù)的重要參與基因[3],對(duì)維持基因組穩(wěn)定十分關(guān)鍵。人XRCC1基因位于19q13.2,其編碼的蛋白質(zhì)通過(guò)多聚ADP核糖聚合酶(PARP)、DNA連接酶Ⅲ(LigⅢ)及DNA多聚酶β(Polβ)的相互作用參與DNA堿基修復(fù)及DNA單斷裂修復(fù)[1]。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)XRCC1基因編碼區(qū)的3個(gè)SNP位點(diǎn)C263047T(Arg194Trp)、G27466A(Arg280His)和G28152A(Arg399Gln)基因多態(tài)性與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展有關(guān)[2],包括肺癌[4]、食管癌[5]、結(jié)腸癌[6]等。

        本研究擬采用病例-對(duì)照研究方法,結(jié)合分子生物學(xué)技術(shù)和流行病方法,從分子水平上探討XRCC1-Arg399Gln多態(tài)性與鼻咽癌易感性的關(guān)系,同時(shí)研究基因與基因之間,基因和EBV之間的交互作用,從而為鼻咽癌的預(yù)防措施提供有力的科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 研究對(duì)象選擇2014年4月至2014年12月期間,在我院收治的90例NPC患者為病例組,門(mén)診體檢的健康者75例作為對(duì)照組。兩組均為漢族,長(zhǎng)期居住在福州地區(qū),其中患者男性62例,女性28例,平均年齡43歲,健康對(duì)照組男性51例,女性24例,平均年齡41歲。NPC納入標(biāo)準(zhǔn):⑴所有的患者均為新發(fā)病例,并經(jīng)過(guò)病理檢查確診為NPC的患者;⑵簽署了知情同意書(shū);⑶心電圖、肝腎功能檢查正常;⑷無(wú)職業(yè)致癌物接觸史者;⑸本實(shí)驗(yàn)經(jīng)醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)執(zhí)行。對(duì)照組納入采用同時(shí)期在本院門(mén)診體檢的福建地區(qū)健康體檢者,與病例1∶1匹配,匹配條件包括:與病例同種族、同性別、年齡與病例發(fā)病年齡(以診斷時(shí)年齡為準(zhǔn))±3歲,無(wú)血緣關(guān)系,出生居住地域接近,血常規(guī)、肝、腎功及心電圖檢查各項(xiàng)指標(biāo)均無(wú)明顯異常等。

        1.2 研究方法

        1.2.1 EBV抗體的檢測(cè)采用酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)檢測(cè)病例組與對(duì)照組的血清學(xué)指標(biāo):EBV-VCA-IgA、EBV-EA-IgA和EBV-Rta-IgG三種抗體。EBVVCA-IgA、EBV-EA-IgA采用德國(guó)歐蒙試劑盒,EBV-Rta-IgG采用北京同昕生物公司的ELISA試劑盒,各指標(biāo)均為臨床成熟檢驗(yàn)項(xiàng)目,具體操作與結(jié)果判定按說(shuō)明書(shū)及Tecan Freedom EVOlyzer酶免疫分析儀操作規(guī)程進(jìn)行操作。

        1.2.2 基因組提取和純化采集入組患者靜脈血,置乙二胺四乙酸二納抗凝管中,于2h內(nèi)分裝,放置低溫冰箱中保存。使用血液基因組提取試劑盒進(jìn)行血液樣本基因組的提取和純化,操作步驟按照血液基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)。提取和純化后的DNA采用紫外分光光度計(jì)進(jìn)行檢測(cè),OD260/280值應(yīng)在1.8~2.0之間,高于此范圍說(shuō)明該DNA樣本可能被RNA污染,低于此范圍說(shuō)明蛋白質(zhì)含量超標(biāo)。

        1.2.3 引物設(shè)計(jì)與合成利用Primer 5.0軟件設(shè)計(jì)XRCC1-399 PCR擴(kuò)增引物序列:上游5'-ACTGTCACCGCATGCGT-3',下游5'-AGTAGTCTGCTGGCTCTG-3'。由上海博尚生物公司合成。

        1.2.4 PCR擴(kuò)增及酶解PCR反應(yīng)體系包括XRCC1-399PCR反應(yīng)液C(Buffer、dNTPs、引物、探針等)、Taq酶混合液(Taq酶+UDG酶)、已處理樣本或質(zhì)控品,采用上述擴(kuò)增引物在ABI7300型熒光實(shí)時(shí)定量PCR儀上擴(kuò)增。具體反應(yīng)條件:UDG酶反應(yīng)37℃2min→預(yù)變性95℃3min→變性94℃15s及退火、延伸60℃45s共45個(gè)循環(huán)。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的酶解:SAP酶混合液(CIAP+ExoI)加入到PCR產(chǎn)物中,DTC普通基因擴(kuò)增熱循環(huán)儀上進(jìn)行酶解,酶解程序如下:37℃60min,80℃15min。酶解產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳證實(shí),符合預(yù)期,目的條帶清晰單一。

        1.2.5 測(cè)序PCR反應(yīng)及產(chǎn)物純化反應(yīng)體系包括酶解后的擴(kuò)增產(chǎn)物、測(cè)序試劑(Bigdye及緩沖液)和XRCC1 399測(cè)序引物(5'-TCCTCCAGCCTTTTCTGATA-3'),在ABI7300型熒光實(shí)時(shí)定量PCR儀上擴(kuò)增。反應(yīng)條件:預(yù)變性96℃1min→變性96℃10s→退火50℃5s→延伸60℃2min共30個(gè)循環(huán)。測(cè)序產(chǎn)物采用醋酸鈉-乙醇純化后,Hi-Di Formamide溶解DNA,在DTC普通基因擴(kuò)增熱循環(huán)儀上變性:95℃4min,4℃4min。

        1.2.6 DNA測(cè)序上機(jī)電泳,在ABI3130型全自動(dòng)基因測(cè)序分析儀上進(jìn)行測(cè)序。

        1.3 統(tǒng)計(jì)分析采用SPSS 18.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。采用χ2檢驗(yàn)分析病例組和對(duì)照組人口學(xué)特征的差異,對(duì)照組進(jìn)行基因型實(shí)際頻數(shù)與理論頻數(shù)的χ2檢驗(yàn),Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)。病例組和對(duì)照組基因型頻率與等位基因頻率的比較采用χ2檢驗(yàn);單因素logistic回歸及交互作用計(jì)算比值比(odds ratios,OR)及其95%可信區(qū)間(CI)表示相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度。

        2 結(jié)果

        2.1 NPC組和健康對(duì)照組一般資料比較NPC組中男62例,女28例,年齡43±12歲,對(duì)照組中男51例,女24例,年齡41±13歲,兩組間性別、年齡差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),具有可比性。

        2.2 基因提取及測(cè)序結(jié)果XRCC1基因提取后進(jìn)行Arg399Gln位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果片段長(zhǎng)度為161bp,條帶清晰,符合預(yù)期。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行基因測(cè)序,結(jié)果采用Chromas軟件分析峰圖,人工讀取具有雙峰的堿基,即為雜合子,若為單峰的堿基則為純合子(圖1)。

        圖1 基因測(cè)序峰圖

        2.3 確定各組樣本的基因型分布是否符合Hardyweinberg平衡根據(jù)群體遺傳學(xué)原理,只有符合Hardy-Weinberg平衡的群體才具有可比性。165例受試者(90名NPC患者和75例健康對(duì)照者)參與XRCC1基因1個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)與NPC風(fēng)險(xiǎn)性關(guān)聯(lián)的研究,鼻咽癌組和對(duì)照組rs1052576基因型實(shí)際值和預(yù)測(cè)值比較見(jiàn)表1。位點(diǎn)P>0.05,均符合Hardy-Weinberg平衡,說(shuō)明所選取的樣本具有代表性和可比性。

        2.4 NPC組和正常對(duì)照組rs1052576的基因型及等位基因頻率NPC病例組和健康對(duì)照組中不同VCA-IgA、EA-lgA和Rta-IgG定性結(jié)果對(duì)應(yīng)的XRCC-1 Arg399Gln基因型及等位基因例數(shù)見(jiàn)表2。

        表1 Hardy-Weinberg平衡定律檢驗(yàn)(n/%)

        表2 XRCC-1 Arg399Gln基因型及等位基因表

        2.5 XRCC-1 Arg399Gln單因素Logistic回歸分析XRCC-1Arg399Gln單因素Logistic回歸分析,XRCC1-Arg399Gln、VCA-IgA、EA-lgA、Rta-IgG均有一定危險(xiǎn)度,OR分別為1.790、26.526、4.655,95% CI分別為1.006~3.182、11.190~62.884、2.170~9.982、3.570~14.427;XRCC1~Arg399Gln中僅GG基因型具有一定危險(xiǎn)度,OR=4.3,95%CI:1.184~15.618;GA基因型和GG基因型分別與AA基因型比較,AA基因型-GG基因型具有危險(xiǎn)度,OR= 4.838,95%CI:1.257~18.624,見(jiàn)表3。

        表3 XRCC-1 Arg399Gln單因素Logistic分析表

        2.6 XRCC-1 Arg399Gln交互作用Logistic回歸分析VCA-IgA、EA-lgA、Rta-IgG與XRCC1-Arg399Gln均具有交互作用(P<0.01),其中GG基因型和GA基因型與AA基因型比較,三種抗體與XRCC-1 Arg399Gln交互性以GG基因型與AA基因型比較危險(xiǎn)度更高(P<0.01),OR值分別為35.150、28.308、6.899,95%CI分別為11.442~107.981、3.698~216.679、2.818~16.891;各基因型與VCA-IgA、EA-lgA、RTA-IgG交互分析,GA*VCA、AA*VCA、AA*RTA具有交互作用,OR值分別為20.755、17.146、3.830,95%CI分別為5.312~81.094、4.971~59.142和1.243~11.802(見(jiàn)表4)。

        表4 XRCC-1 Arg399Gln交互作用Logistic回歸分析表

        3 討論

        NPC是我國(guó)東南地區(qū)常見(jiàn)的上皮源性惡性腫瘤,一般發(fā)病于40歲以上的成年人,男女比例約為3∶1,但近年來(lái)發(fā)病年齡呈現(xiàn)年輕化趨勢(shì)。NPC是一種多因素影響的復(fù)雜性疾病,到目前為止其具體發(fā)病機(jī)制仍不明確,多數(shù)學(xué)者認(rèn)為是多種因素共同作用的結(jié)果,即遺傳因素、病毒感染及環(huán)境因素。我國(guó)著名學(xué)者曾毅院士提出了NPC病因?qū)W假說(shuō):即遺傳因素是發(fā)病基礎(chǔ),病毒感染在NPC的發(fā)病過(guò)程中起著重要的作用,而環(huán)境中的暴露因素(比如致癌物:芳香烴、煤油、煤焦油及雜酌油等)等起著協(xié)同作用[7]。NPC的發(fā)病有著顯著的地域差異和種族差異,這提示遺傳易感性可能是其發(fā)病的基礎(chǔ)。

        3.1 EBV與NPC的關(guān)系EBV是一種人類皰疹病毒(Human herpesvirus 4,HHV-4),它主要侵襲人類口咽上皮細(xì)胞和B淋巴細(xì)胞,可引起人類多種疾病,如Burkitt淋巴瘤、NPC及霍杰金淋巴瘤等[8],其中最嚴(yán)重的是NPC,也是研究報(bào)道最多的一種。EBV可產(chǎn)生多種抗原,如EBV核抗原(nuclear antigen,NA)、早期抗原(early antigen,EA)、膜抗原(membrance antigen,MA)和衣殼抗原(virus capsid antigen,VCA)等。通過(guò)檢測(cè)NA、EA、Rta、VCA對(duì)應(yīng)的抗體IgA和IgG,對(duì)早期診斷NPC及闡明EBV與NPC的關(guān)系有重要意義[9]。本研究發(fā)現(xiàn)EBVVCA-IgA在NPC病例組及對(duì)照組人群中的陽(yáng)性率分別達(dá)89.89%和10.35%,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,EA-IgA在NPC病例組及對(duì)照組人群中的陽(yáng)性率分別為達(dá)46.59%和3.1%,Rta-IgG在NPC病例組及對(duì)照組人群中的陽(yáng)性率分別為63.25%和5.1%??梢?jiàn)EBV感染是NPC發(fā)生的重要風(fēng)險(xiǎn)因素。雖然EBV在人群中的感染率高達(dá)90%,但最終只有少部分人發(fā)展為NPC。在我們研究中,NPC組和健康對(duì)照組之間EBV-VCA-IgA、EA-IgA、Rta-IgG陽(yáng)性率具有顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,提示EB病毒VCA-IgA、EA-IgA、Rta-IgG可作為篩查NPC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的條件,其EB病毒DNA載量與NPC進(jìn)展存在密切關(guān)系[26]。大量的流行病學(xué)調(diào)查資料顯示,中國(guó)高發(fā)區(qū)居民移居美國(guó)、歐洲等低發(fā)病率國(guó)家數(shù)年后,NPC發(fā)病率雖然有所下降,并且NPC的發(fā)病率隨著代數(shù)的增加而減少,但仍遠(yuǎn)高于當(dāng)?shù)鼐用瘢?0-12]。這些研究結(jié)果提示個(gè)體的遺傳基因在NPC的發(fā)生中起到一定作用。因此EBV感染與遺傳易感性共同作用可能促使NPC的發(fā)生。

        3.2 XRCC-1基因多態(tài)性與NPC的關(guān)系人體細(xì)胞DNA常受有害環(huán)境因素的損傷,如活性氧化物質(zhì)、甲基化、脫氨基和經(jīng)基化等作用引起的DNA損傷[13,14],但機(jī)體內(nèi)有完整的DNA修復(fù)系統(tǒng),其作用主要是修復(fù)這些損傷以保護(hù)細(xì)胞基因組的穩(wěn)定性。已有研究表明,當(dāng)DNA修復(fù)能力低于一般人群平均水平的個(gè)體時(shí)對(duì)腫瘤易感[6]。X射線損傷交叉互補(bǔ)蛋白1(XRCC1)是一種重要DNA堿基切除修復(fù)基因,是第一個(gè)能夠影響細(xì)胞對(duì)電力輻射敏感性的哺乳動(dòng)物基因,它通過(guò)DNA堿基切除修復(fù)(Base excision repair,BER)途徑影響其DNA單鏈修復(fù)作用。它編碼的蛋白質(zhì)與DNA連接酶Ⅲ、DNA聚合酶β、多(二磷酸腺苷—核糖)多聚酶(poly ADP-ribose polymerase,PARP)相互作用,修復(fù)DNA單鏈斷裂和進(jìn)行堿基切除修復(fù)。在此修復(fù)過(guò)程中,XRCC1基因起整體調(diào)控的重要作用[15,16]。

        目前研究最多的是XRCC1基因序列第194、280和399密碼子的單核苷酸多態(tài)性,而僅第399位密碼子(A突變?yōu)镚,第399氨基酸由精氨酸變?yōu)楣劝滨0罚涀鰽eg399Gln)位于己知的XRCC1功能域上[2],由此提示XRCC1第399位氨基酸的突變對(duì)DNA修復(fù)功能的影響可能顯得更為重要。有學(xué)者在體外用爭(zhēng)光霉素和二經(jīng)苯丙花(BPDE)作為誘變劑,結(jié)果顯示純合子Gln/Gln個(gè)體中每個(gè)細(xì)胞染色體斷裂數(shù)大于純合子Arg/Arg和雜合子Arg/Gln個(gè)體[18]。Li等[19]的研究表明,XRCC-1 Arg基因多態(tài)性可能與化學(xué)誘導(dǎo)性基因損傷有關(guān),且純合子Gln/Gln個(gè)體的損傷程度大于雜合子Arg/ Gln。以上研究提示,提示XRCC-1 Arg399Gln基因多態(tài)性影響機(jī)體DNA修復(fù)功能,且純合子Gln/Gln影響程度大于雜合子Arg/Gln。

        關(guān)于XRCC-1 Arg399Gln基因多態(tài)性與NPC之間的易感性國(guó)內(nèi)外的學(xué)者已經(jīng)有過(guò)一些研究和報(bào)道,但多數(shù)研究結(jié)果顯示XRCC-1 Arg399Gln基因多態(tài)性與NPC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)沒(méi)有關(guān)聯(lián)[20-22]。Laantri[23]等學(xué)者結(jié)果顯示XRCC-1 Arg399 A/G基因型和A/A基因型相比,A/G基因型更能夠增加NPC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.976,95%CI:1.389~2.321)。Li等[24]研究結(jié)果顯示,XRCC-1 Arg399 A/G基因型與NPC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)(OR=1.675,95%CI:1.183-2.371),并且XRCC-1Arg399 A/A基因型可降低NPC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.534,95%:0.377~0.757)。本研究結(jié)果顯示,XRCC-1Arg399 G/G純合突變與NPC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)(OR=4.3,95%CI:1.184~15.618),而XRCC-1Arg399 A/G雜合突變與NPC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)沒(méi)有關(guān)聯(lián)(OR=0.981,95%CI:0.468~2.055)。本實(shí)驗(yàn)研究結(jié)果之所以與前人報(bào)道不一致,考慮可能是由于地區(qū)種族差異造成的。例如,Laantri等[23]人研究的個(gè)體是非洲人群,而本次研究納入的是中國(guó)福建地區(qū)人群。由此可見(jiàn)族差異可能影響著XRCC-1 Arg399基因多態(tài)性對(duì)腫瘤易感性,而且可能與環(huán)境因素之間存在一定關(guān)聯(lián)。

        3.3 EBV感染-XRCC-1 Arg399Gln基因多態(tài)性交互作用與NPC早在1997年美國(guó)環(huán)境衛(wèi)生研究所(NIEHS)便提出了環(huán)境基因組計(jì)劃(EGP),旨在研究基因多態(tài)性或基因變異與環(huán)境之間的交互作用。即使暴露于相同的環(huán)境危險(xiǎn)因素中,也只有少數(shù)個(gè)體發(fā)病。這說(shuō)明個(gè)體的反應(yīng)存在很大差別,而且在很多情況下這種差別如果僅從環(huán)境因素方面難以進(jìn)行合理解釋,因?yàn)闄C(jī)體內(nèi)在遺傳因素在疾病發(fā)生中的也發(fā)揮重要的作用[25]。因此探討XRCC-1 Arg399基因遺傳多態(tài)性與環(huán)境因素之間的關(guān)聯(lián),將成為研究NPC發(fā)病機(jī)制的重要方向,為NPC的預(yù)防和早期診斷提供一個(gè)新思路。

        本次研究中分析了EBV感染與NPC之間的交互作用,結(jié)果分析表明,XRCC-1 Arg399AA基因型與VCA-IgA和Rta-IgG有正交互作用,Arg399AG基因型與VCA-IgA有正交互作用。該結(jié)果表明,EBV感染尤其是VCA-IgA抗體陽(yáng)性時(shí)與NPC的發(fā)病有正交互作用。然而本結(jié)果顯示XRCC-1 Arg399 GG基因型與VCA-IgA無(wú)明顯的交互作用,可能是由納入研究樣本量少造成,因此后期仍更需大樣本研究來(lái)證實(shí)XRCC-1 Arg399 GG基因型與VCA-IgA間的交互作用。以上結(jié)果提示,EBV感染會(huì)增加NPC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),且EB病毒VCA-I-gA與XRCC-1 Arg399雜合突變型基因有交互作用。

        目前國(guó)內(nèi)外關(guān)于基因多態(tài)性對(duì)NPC的影響的研究越來(lái)越多,并且許多基因與NPC的發(fā)生相關(guān),但研究結(jié)果卻不一致,可能由于選擇的研究對(duì)象不同、選擇對(duì)象的地域不同、樣本量大小不同及人種差異等原因造成。然而本研究存在樣本量相對(duì)較小等諸多不足,較小的樣本量會(huì)導(dǎo)致統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)效能降低。另外,由于突變基因型在人群中的頻率較低,即使該突變基因型與疾病存在相關(guān)關(guān)系,較小的樣本量也很可能導(dǎo)致較低的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)效能。因此,在今后的NPC遺傳學(xué)研究中應(yīng)加大的樣本量,并應(yīng)對(duì)不同地域、不同民族、不同人種多項(xiàng)研究結(jié)果進(jìn)行匯總分析并分層分析,對(duì)單個(gè)基因的多個(gè)SNPs進(jìn)行聯(lián)合分析,或者是在對(duì)單基因的多態(tài)性進(jìn)行分析的同時(shí),還應(yīng)同時(shí)增加對(duì)不同染色體的多個(gè)基因的遺傳變異的詳細(xì)分析等等。

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        Associations and interactions between EB virus infection and XRCC1 Arg399Gln polymorphism in nasopharyngeal car-cinoma

        GUO Junying,ZHEN Yuhong,CHUI Zhaolei,XIN Xiaoqing,LI Xiaoli,CHEN Yan.
        Department of Clinical Laboratory,F(xiàn)ujian Provincial Key Laboratory of Tumor Biotherapy,F(xiàn)ujian Provincial Cancer Hospital,F(xiàn)ujian Medical University Cancer Hospital,F(xiàn)uzhou 350014,China.

        Objective To investigate the correlations between XRCC1 Arg399Gln polymorphism and the risk of nasopharyngeal carcinoma(NPC),and trace the mutual interactions between XRCC1 polymorphisms and the EB virus infection.Methods In the matched case-control study,90 NPC patients and 75 healthy controls were enrolled.Genome DNA were extracted from the whole blood and then amplified via PCR.The PCR products were further purified and sent for DNA sequencing to get the genotype of XRCC1 Codon399.At the same time,the S/CO values of VCA-IgA,EA-IgA and Rta-IgG were evaluated using ELISA,and the positive as well as the constituent ratios were assessed.Results VCA-IgA,EA-IgA and Rta-IgG positivewas regarded as a high risk factor in NPC occurrence,especially that single VCA-IgA positive seemed to be achieve the highest OR value of 26.526(95% CI:11.190-62.884).Univairate logistic regression analysis showed that the OR value of patients with XRCC-1 Arg399Gln GG genotype was more higher that that of AA genotype;There was the mutual interactions between XRCC-1 Arg399Gln GA genotype and VCA-IgA(OR=20.755,95%CI:5.312-81.094).Conclusions Arg399Gln GG genotype was associated with the susceptibility of NPC;there were interactions between(XRCC1)Arg399Gln single nucleotide polymorphisms and EB virus infection in NPC.

        XRCC1;Polymorphisms;Nasopharyngeal carcinoma;VCA-IgA EA-IgA;Rta-IgG

        R739.6,R730.231+.3

        A

        1674-1129(2016)05-0539-06

        10.3969/j.issn.1674-1129.2016.05.002

        2016-06-21;

        2016-09-29)

        福建省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(2014J01297);福建省衛(wèi)生廳青年科研課題(2012-2-12)

        郭俊英,男,1976年8月生,碩士,主管技師,主要從事血液、腫瘤分子診斷

        陳燕,女,1963年5月生,主任醫(yī)師,教授,主要從事腫瘤分子診斷

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