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        太子參中蕪菁花葉病毒的RT-PCR檢測

        2016-11-01 07:16:01黃穎楨陳菁瑛朱景花劉保財趙云青
        福建農(nóng)業(yè)學(xué)報 2016年6期
        關(guān)鍵詞:檢測

        黃穎楨,陳菁瑛,朱景花,劉保財,趙云青

        (福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)生物資源研究所,福建 福州 350003)

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        太子參中蕪菁花葉病毒的RT-PCR檢測

        黃穎楨,陳菁瑛*,朱景花,劉保財,趙云青

        (福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)生物資源研究所,福建福州350003)

        建立并應(yīng)用太子參中蕪菁花葉病毒的檢測技術(shù)。采用RT-PCR技術(shù),設(shè)計特定引物從太子參病株中的不同部位擴(kuò)增特定片段,且進(jìn)行序列分析和比對。序列比對結(jié)果表明,擴(kuò)增得到的片段為蕪菁花葉病毒外殼蛋白基因序列片段,本研究建立了一種簡便可靠太子參中蕪菁花葉病毒的檢測方法,并且從太子參根、莖、葉和花中均檢測到病毒目標(biāo)序列。

        太子參;TuMV;RT-PCR

        太子參Pseudostellaria heterophylla(Miq.)PaxetHoffm為石竹科異葉假繁縷屬植物,又名孩兒參、童參等,是常用中藥材之一,以干燥塊根提供藥用[1]。福建省柘榮縣被譽為全國太子參之鄉(xiāng),全縣90%以上農(nóng)民種植太子參[2]。長期以來,太子參均以塊根進(jìn)行無性繁殖,體內(nèi)浸染并積累多種病毒,嚴(yán)重影響了太子參的產(chǎn)量和質(zhì)量。

        太子參病毒病又稱花葉病,是太子參產(chǎn)區(qū)發(fā)生普遍、危害嚴(yán)重的病害之一,嚴(yán)重影響產(chǎn)量和品質(zhì)[3]。染病葉常表現(xiàn)為花葉、斑駁花葉、皺縮、扭曲、畸形、葉緣卷曲、葉質(zhì)脆硬,病株矮小、塊根小且根數(shù)明顯減少,嚴(yán)重者整株死亡[4]。目前已知危害太子參的病原有4種[5],分別為煙草花葉病毒(Tobaccomosaicvirus,TMV),蕪菁花葉病毒(Turnipmosaicvirus,TuMV),黃瓜花葉病毒(Cucumbermosaicvirus,CMV)和蠶豆萎蔫病毒(Broadbeanwilivirus,BBMV),其中以蕪菁花葉病毒廣泛分布于全國太子參各產(chǎn)區(qū)[6],是為害太子參的主要病毒病原。

        近年來,太子參的相關(guān)研究集中在栽培技術(shù)和藥材質(zhì)量方面,而對太子參中各種病毒的檢測研究較少。本研究針對高度保守的蕪菁花葉病毒CP基因,采用RT-PCR技術(shù),對太子參病株的各個部位進(jìn)行了蕪菁花葉病毒檢測,以期為太子參的病毒防治和脫毒種苗制備提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1材料與試劑

        材料及采集保存:太子參病株樣品來源于福建省寧德市柘榮縣。采集新鮮植物組織,迅速移入液氮保存,用于總RNA提取。

        1.2試驗方法

        1.2.1引物設(shè)計根據(jù)GenBank中已登錄的TuMVCP基因的核苷酸序列(登錄號為AJ000690.1)設(shè)計TuMV引物,引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。上游引物F:5′-ACCAAGACCGACCATACA-3′;下游引物R:5′-CCATAAGCGAGAATACTAACG-3′。

        1.2.3RT-PCR檢測病毒PCR反應(yīng)體系50 mm3:10×PCR Buffer(含Mg2+)5 mm3,dNTP(2.5 mmol·dm-3)4 mm3,正、反向引物(10 μmol·dm-3)各2 mm3,TaqDNA Polymerase(5 U·mm-3)0.5 mm3,cDNA模板量約2 mm3,補足雙蒸水至總體積為50 mm3。PCR反應(yīng)程序:94℃ 預(yù)變性5 min;94℃ 變性30 s,55℃ 退火30 s,72℃ 延伸30 s,共40個循環(huán);72℃ 延伸10 min;4℃ 停止。擴(kuò)增得到的PCR產(chǎn)物經(jīng)1.5 %瓊脂糖凝膠電泳分析,目的條帶送測序,測序結(jié)果進(jìn)行比對分析。

        1.2.4序列及分析PCR產(chǎn)物直接測序,方法簡便可靠。將擴(kuò)增得到的PCR產(chǎn)物直接送鉑尚生物技術(shù)(上海)有限公司測序,測序結(jié)果在NCBI上進(jìn)行Blast比對分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1總RNA提取

        紫外分光光度計檢測所提取的太子參病葉總RNAOD260/OD280比值在1.8 ~ 2.0范圍內(nèi)。瓊脂糖凝膠電泳表明,所提取的RNA主帶清晰,沒有明顯降解,符合試驗要求(圖1)。

        2.2TuMV CP基因RT-PCR及序列分析

        太子參cDNA中擴(kuò)增得到目的CP基因序列電泳圖(圖2)。對擴(kuò)增得到的目的片段進(jìn)行測序分析(圖3),經(jīng)過NCBI Blast分析,擴(kuò)增得到的序列與煙草花葉病毒的CP基因片段相似度高(圖4),結(jié)果表明目的片段為蕪菁花葉病毒的CP基因片段。

        2.3病株不同部位病毒檢測

        按照本試驗建立的RT-PCR方法對太子參病株的不同組織分布進(jìn)行檢測,選取帶花的太子參植株進(jìn)行檢測,選取部位包括葉肉、葉脈、花、莖上部、莖中部、莖下部、根上部、根中部、根下部和須根。通過RT-PCR技術(shù)檢測,結(jié)果(圖5)顯示感染蕪菁花葉病毒的太子參在各部位均有分布。

        3 討 論

        本試驗建立太子參中蕪菁花葉病毒的RT-PCR檢測方法,同時應(yīng)用該方法對太子參病株不同部位的蕪菁花葉病毒進(jìn)行檢測分析。

        相對于傳統(tǒng)的病毒分離電鏡檢查、ELISA、核酸雜交和基因芯片等其他病毒檢測方法,RT-PCR方法具有靈敏度高、操作簡便、特異性較高和成本較低等優(yōu)點[7-8],能夠滿足了大規(guī)模病毒樣品的分析。

        福建省柘榮縣太子參病毒種類多樣,除蕪菁花葉病毒,本課題組還在不同的樣品中檢測到蠶豆萎蔫病毒、煙草花葉病毒。多種病毒的作用造成了太子參病毒病危害嚴(yán)重,造成太子參減產(chǎn)和農(nóng)民減收,所以本文建立的太子參的病毒檢測技術(shù),進(jìn)而進(jìn)行多種病毒的多重檢測技術(shù)研發(fā),為太子參病毒防治,開發(fā)太子參脫毒種苗,提高太子參的產(chǎn)量和質(zhì)量提供技術(shù)保障。

        [1]肖培根,李大鵬,楊世林. 新編中藥志:第一卷[M]. 北京:化學(xué)工業(yè)出版社,2002:191-193.

        [2]袁小坦,袁家雄. 柘榮縣太子參產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀與對策[J]. 福建農(nóng)業(yè)科技,2014,(7)::68-70.

        [3]吳朝峰, 林彥銓. 藥用植物太子參的研究進(jìn)展[J]. 福建農(nóng)林大學(xué)學(xué)報: 自然科學(xué)版, 2005, 33(4): 426-430.

        [4]劉清琪, 等.太子參花葉病病原及其防治的初步研究[J].中藥材科技, 1953, (2): 11.

        [5]宋榮浩,濮祖芹. 太子參病毒病病原鑒定[J].上海農(nóng)業(yè)學(xué)報,1991,7(2):80-85.

        [6]朱艷, 周小華, 秦民堅. 太子參病毒病及其脫病毒研究進(jìn)展[J]. 中國野生植物資源, 2005, 24(2): 31-32.

        [7]王新, 莫笑晗, 林良斌. 分子生物學(xué)技術(shù)在植物病毒檢測中的應(yīng)用[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué), 2009, 37(28):13498-13500.

        [8]周利飛,劉映紅,孫現(xiàn)超,等。 煙草蕪菁花葉病毒的ELISA和RT-PCR快速檢測技術(shù)研究[J]. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報,2007,20(4):758-761.

        (責(zé)任編輯:柯文輝)

        RT-PCR Detection of Turnip Mosaic Virus onPseudostellariaheterophylla

        HUANG Ying-zhen, CHEN Jing-ying*, ZHU Jing-hua, LIU Bao-cai, ZHAO Yun-qing

        (InstituteofAgriculturalBio-resourcesFujianAcademyofAgriculturalScience,F(xiàn)uzhou,F(xiàn)ujian350003,China)

        Amethodtodetecttheturnipmosaicvirus(TuMV)ondiseasedPseudostellaria heterophyllawasestablishedandapplied.SpecificgeneticfragmentsatdifferentlocationsinTuMVwasamplifiedbyRT-PCR,sequenced,andaligned.Thesequencealignmentindicatedthatthefragmentwasthecoatprotein(CP)geneofTuMV.Hence,asimple,reliabledetectionmethodbasedontheCPgenesequenceofTuMVforthediagnosisondiseasedP. heterophyllawasestablished.Usingthemethod,thetargetsequencewasdetectedintheroot,stem,leaf,andflowerofP. heterophylla.

        Pseudostellaria heterophylla;turnipmosaicvirus;RT-PCR

        黃穎楨,陳菁瑛,朱景花,等.太子參中蕪菁花葉病毒的RT-PCR檢測[J].福建農(nóng)業(yè)學(xué)報,2016,31(6):616-619.

        HUANG Y-Z,CHEN J-Y,ZHU J-H,et al.RT-PCR Detection of Turnip Mosaic Virus onPseudostellariaheterophylla[J].FujianJournalofAgriculturalSciences,2016,31(6):616-619.

        2016-03-02初稿;2016-04-15修改稿

        黃穎楨(1976-),男,助理研究員,主要從事藥用植物分子生物學(xué)研究 (E-mail:hyzmprc@163.com)

        陳菁瑛(1966-),女,研究員,主要從事植物生物技術(shù)和藥用植物資源利用研究(E-mail:cyj6601@163.com)

        福建省種業(yè)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化工程項目(2014S1477-12);福建省自然科學(xué)基金項目(2015J01292)

        S436.3

        A

        1008-0384(2016)06-616-05

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