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        基于SCI—E的我國(guó)蕨類植物研究進(jìn)展分析

        2016-10-14 01:15:17嚴(yán)歡歡肖娟梁永書南文斌楊永清
        安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年9期
        關(guān)鍵詞:文獻(xiàn)計(jì)量分析

        嚴(yán)歡歡 肖娟 梁永書 南文斌 楊永清

        摘要 分析了Web of Science(SCIE)數(shù)據(jù)庫中我國(guó)蕨類植物相關(guān)研究的文獻(xiàn)數(shù)據(jù),結(jié)果表明:蕨類植物研究累計(jì)發(fā)文量呈指數(shù)增長(zhǎng)趨勢(shì),發(fā)文最多的機(jī)構(gòu)為中國(guó)科學(xué)院,占比高達(dá)52.897%;發(fā)文最多的作者為中科院植物所的張憲春研究員,發(fā)文占比高達(dá)6.297%;發(fā)文量最多的期刊為《AMERICAN FERN JOURNAL》,發(fā)文占比3.778%。研究熱點(diǎn)主要集中在蕨類植物對(duì)污染物的吸收及其機(jī)理研究、蕨類植物分子系統(tǒng)發(fā)生與分類兩方面。

        關(guān)鍵詞 蕨類植物;文獻(xiàn)計(jì)量分析;Web of Science;Citespace

        中圖分類號(hào) S126 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 0517-6611(2016)09-280-04

        Abstract Researches on fern was evaluated based on bibliometric analysis by retrieving articles from Web of Science (SCIE). The results showed that accumulative publications of fern exhibited a trend of exponential growth. Chinese Academy of Sciences exceeded all other institutes in research production, with the proportion of 52.897% of total articles. The most productive author was Zhang XC (from Chinese Academy of Sciences, Institute of Botany), who contributed 6.297% of total publications. American Fern Journal was the predominant journal that published 3.778% of total articles. Researches on mechanism of pollutants accumulation, molecular phylogeny and classification were the mainly two research hotspots.

        Key words Fern; Bibliometric analysis; Web of Science; Citespace

        蕨類植物是植物界的6大門類之一,其分類地位介于苔蘚植物和種子植物之間。我國(guó)蕨類植物資源豐富,達(dá)2 600多種[1],占世界現(xiàn)代蕨類物種數(shù)(約12 000多種)的1/5強(qiáng)。蕨類植物是生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,在生物多樣性與生態(tài)系統(tǒng)穩(wěn)定性的維持方面具有重要功能;同時(shí),其作為一個(gè)古老的類群,在研究物種起源、進(jìn)化與分類方面亦極具價(jià)值;此外,其在環(huán)境治理、生態(tài)修復(fù)、食用、藥用和景觀園林等方面亦有廣泛應(yīng)用。文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)是對(duì)文獻(xiàn)進(jìn)行定量分析的科學(xué),被公認(rèn)為能定量測(cè)度基礎(chǔ)科學(xué)活動(dòng)、學(xué)科布局和學(xué)科發(fā)展動(dòng)態(tài)的重要方法,已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于各學(xué)科的分析,從宏觀上把握科學(xué)研究的方向。因此,總結(jié)和歸納相關(guān)研究文獻(xiàn),對(duì)客觀全面把握蕨類植物研究的熱點(diǎn)和前沿具有十分重要的意義。近年來,文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的新方法特別是信息可視化手段不斷完善,其中,陳超美[2]開發(fā)的基于JAVA平臺(tái)的CiteSpace軟件,在檢測(cè)科學(xué)文獻(xiàn)中出現(xiàn)的研究前沿、熱點(diǎn)、趨勢(shì)和動(dòng)向的各種模式方面具有獨(dú)到之處,正成為科學(xué)計(jì)量學(xué)普遍應(yīng)用的新手段。目前,在蕨類植物的起源、系統(tǒng)發(fā)育、分子系統(tǒng)、細(xì)胞分類、區(qū)系地理,繁殖培養(yǎng)等方面,已有不少專題綜述發(fā)表[2-8],但從文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)角度,特別是利用信息可視化手段,從宏觀層面對(duì)我國(guó)蕨類植物研究的綜述還未見報(bào)道。

        筆者運(yùn)用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的方法,從文獻(xiàn)數(shù)量、年代分布、研究學(xué)科分布、研究機(jī)構(gòu)、核心作者和期刊刊源分布等方面著手,并借助CiteSpace息可視化軟件分析國(guó)內(nèi)外蕨類植物研究現(xiàn)狀及熱點(diǎn),揭示其研究發(fā)展趨勢(shì)。

        1 文獻(xiàn)采集與信息處理

        在Web of Science(WOS,SCIE)數(shù)據(jù)庫中,為了全面準(zhǔn)確地檢索到我國(guó)蕨類植物研究的相關(guān)論文,以主題為:“Fern”“Pteridophyte”“Lycopod”“Lycophyte”以及中國(guó)植物志中包含的蕨類植物39科的科名,中間以“OR” 為布爾邏輯符,地址為“China”進(jìn)行檢索,共獲得文獻(xiàn)794篇。 檢索時(shí)間為2015年10月30日。在泛讀的基礎(chǔ)上對(duì)相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行核對(duì),并借助CiteSpace息可視化軟件繪制科學(xué)知識(shí)圖譜(該研究所用版本為CiteSpaceⅢ 4.0 R1),分析文獻(xiàn)的特征,總結(jié)研究的熱點(diǎn)和前沿問題。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 蕨類植物研究文獻(xiàn)年代分布

        蕨類植物相關(guān)研究的文獻(xiàn)量及年代分布見圖1。在SCIE數(shù)據(jù)庫中,最早的相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)表于1983年,1983~1996年發(fā)文量時(shí)斷時(shí)續(xù),年發(fā)文量都沒有超過3篇,直到1996年之后,才每年維持一定的發(fā)文量,且年發(fā)文量緩慢上升,2004年后,發(fā)文量呈直線上升,2012年達(dá)歷史最高水平,發(fā)文86篇,盡管2013年略有下降,但2014年亦高達(dá)81篇,到目前為止,2015年也已經(jīng)可以檢索到74篇。累計(jì)發(fā)文量呈顯著的指數(shù)增長(zhǎng)趨勢(shì)(R2=0.992 3),亦反映蕨類植物研究不斷受到重視。

        2.2 蕨類植物研究的科研機(jī)構(gòu)和核心作者

        表1列舉了蕨類植物研究發(fā)文量超過10篇的科研機(jī)構(gòu)。由表1可知,中國(guó)科學(xué)院發(fā)文量遙遙領(lǐng)先于其他機(jī)構(gòu),占總發(fā)文量的52.897%,超過其他所有機(jī)構(gòu)的總和;一些綜合性大學(xué)(北京大學(xué)、云南大學(xué)、中山大學(xué)、中國(guó)科學(xué)院大學(xué)、武漢大學(xué)、南京大學(xué)、中國(guó)科技大學(xué)和浙江大學(xué)等)和師范大學(xué)(上海師范大學(xué)、重慶師范大學(xué)、哈爾濱師范大學(xué)和云南師范大學(xué)等)在蕨類植物研究方面亦有不俗表現(xiàn);此外,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國(guó)醫(yī)科大學(xué)和中國(guó)礦業(yè)大學(xué)等發(fā)文量亦較多,除中國(guó)大陸的科研機(jī)構(gòu)外,密蘇里植物園、“中央研究院”(中國(guó)臺(tái)灣)、英國(guó)自然歷史博物館、佛羅里達(dá)大學(xué)和香港浸會(huì)大學(xué)等機(jī)構(gòu)發(fā)文或合作發(fā)文量較多。運(yùn)用普萊斯定律[6],依據(jù)公式M=0.749(Nmax)1/2(式中,Nmax 為所統(tǒng)計(jì)時(shí)段中最高產(chǎn)的作者論文數(shù)),計(jì)算出核心作者發(fā)表論文數(shù)的門檻值M。在SCIE數(shù)據(jù)庫中,發(fā)文最多的為中國(guó)科學(xué)院植物所的張憲春(ZHANG XC)研究員,高達(dá)50篇,則MWOS=5.30,發(fā)文數(shù)量6篇以上者為核心作者;限于篇幅,該研究?jī)H列出發(fā)文數(shù)量在前15位的發(fā)文作者(表2)。其中,中科院植物所的張憲春研究員和中科院成都生物研究所的張麗兵(ZHANG LB)研究員發(fā)文分別占比6.297%和4.912%,2人合計(jì)貢獻(xiàn)了11.21%的發(fā)文量。

        2.3 蕨類植物研究文獻(xiàn)的學(xué)科和期刊來源分布

        蕨類植物相關(guān)研究文獻(xiàn)在WOS數(shù)據(jù)庫中分布在PLANT SCIENCES、ENVIRONMENTAL SCIENCES、BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOG、CHEMISTRY MEDICINAL、EVOLUTIONARY BIOLOGY、PHARMACOLOGY PHARMACY、MULTIDISCIPLINARY SCIENCES、GEOSCIENCES MULTIDISCIPLINARY、PALEONTOLOGY 、ECOLOGY等學(xué)科(表3)。載文前15位的期刊發(fā)文量總計(jì)占總發(fā)文量的35.139%,各期刊發(fā)文占總發(fā)文量的1%~4%的范圍之類,占比較為均勻;其中,以植物系統(tǒng)進(jìn)化與分類期刊為主,如《AMERICAN FERN JOURNAL》《JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION》《NOVON》《PHYTOTAXA》《REVIEW OF PALAEOBOTANY AND PALYNOLOGY》《ACTA PHYTOTAXONOMICA SINICA》(現(xiàn)名《Journal of Systematics and Evolution》)《CHINESE SCIENCE BULLETIN》,《INTERNATIONAL JOURNAL OF PLANT SCIENCES》《ACTA BOTANICA SINICA》(現(xiàn)名《Journal of Integrative Plant Biology》)《BOTANICAL STUDIES》《TAXON》,其次為環(huán)境科學(xué)類期刊《INTERNATIONAL JOURNAL OF PHYTOREMEDIATION》《ENVIRONMENTAL POLLUTION》,醫(yī)藥類期刊,如《PHYTOCHEMISTRY》《PLANTA MEDICA》,開放獲取期刊《PLOS ONE》;載文量最多的為美國(guó)蕨類雜志《AMERICAN FERN JOURNAL》,發(fā)文占比3.778%(表4)。

        2.4 蕨類植物研究的熱點(diǎn)

        研究熱點(diǎn)通常指在某一時(shí)間段內(nèi),具有內(nèi)在聯(lián)系且數(shù)量相對(duì)較多的一組論文所探討的科學(xué)問題或?qū)n}。從文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)角度看,在某學(xué)科領(lǐng)域被引頻次最高的研究型文獻(xiàn)通常是該領(lǐng)域研究熱點(diǎn)的集中體現(xiàn)。CiteSpace是一款用于可視化分析科學(xué)文獻(xiàn)趨勢(shì)和范式的計(jì)量學(xué)軟件,其繪制的科學(xué)知識(shí)圖譜能夠顯示某一學(xué)科或科學(xué)主題在某一時(shí)段的發(fā)展趨勢(shì)與動(dòng)向,其提供的突現(xiàn)檢測(cè)(Burst Detection)功能,將那些頻次變化率高、增長(zhǎng)速度快的突現(xiàn)詞(burst terms)從大量的主題詞中檢測(cè)出來,用詞頻的變化率,來反映出學(xué)科的前沿領(lǐng)域和發(fā)展趨勢(shì)[2] 。為了提煉我國(guó)蕨類植物研究最新的熱點(diǎn),該研究利用CitespaceIII軟件繪制了2005~2015年WOS數(shù)據(jù)庫中中國(guó)學(xué)者發(fā)表文獻(xiàn)的共引知識(shí)圖譜和關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜,并總結(jié)了近年來突現(xiàn)度高的關(guān)鍵詞、機(jī)構(gòu)和作者。

        在CiteSpaceIII界面中選中Node Types 為“cited reference”,設(shè)置單個(gè)時(shí)間分區(qū)長(zhǎng)度(time slicing)的值為1,整個(gè)時(shí)間跨度為2005~2015 年,數(shù)據(jù)抽取對(duì)象為Top30,繪制文獻(xiàn)共被引聚類圖譜(圖2);選擇Node Types為“key word”,其他設(shè)置不變,繪制關(guān)鍵詞聚類時(shí)區(qū)圖譜(圖3)。從圖2可以看出,近10年來我國(guó)蕨類植物的研究文獻(xiàn)中,最大的4個(gè)主要聚類為砷酸鹽(arsenate)、鐵線蕨屬(adiantum)、洞穴植被(cave flora)和分子系統(tǒng)發(fā)生(molecular phylogeny)等,其分別包含43、42、26和22個(gè)節(jié)點(diǎn)(文獻(xiàn))。共被引頻次最高的文獻(xiàn)為聚類 #0中的Ma LQ,2001,NATURE,V409,P579(71次)和聚類#3中SMITH AR,2006,TAXON,V55,P705(61次),遠(yuǎn)超其他文獻(xiàn)的共被引頻次。Ma等[11]發(fā)表的題為“A fern that hyperaccumulates arsenic”的論文,發(fā)現(xiàn)蕨類植物蜈蚣草(Pteris vittata,brake fern)對(duì)砷具有超富集能力。此后,有關(guān)蕨類植物對(duì)金屬或非金屬污染物的吸收或在環(huán)境治理方面的應(yīng)用成為蕨類植物研究最熱門的一個(gè)方面。而Smith等[12]在綜合當(dāng)前蕨類分子系統(tǒng)研究新證據(jù)的基礎(chǔ)上提出了一個(gè)新的世界蕨類植物分類系統(tǒng),該系統(tǒng)受到世界蕨類植物研究學(xué)者的廣泛認(rèn)可。從圖3的高頻關(guān)鍵詞聚類時(shí)區(qū)圖譜可以發(fā)現(xiàn),研究熱點(diǎn)主要集中在吸收(uptake)、鱗毛蕨科(dryopteridaceae)和耳蕨屬(polystichum)等3大聚類。從高頻關(guān)鍵詞的分布不難發(fā)現(xiàn),對(duì)污染物的吸收(如arsenic,hyperaccumulator,soils,removal cadmium,phytoremediation,heavymetal,contaminated soils,tolerance,uptake kinetics,hyperacculation等)和系統(tǒng)發(fā)生與分類(evolution,diversity,speciation,diversification,new species,chooroplast dna,trnlf,morphology,molecular phylogeny,classification等)為2005~2015年蕨類植物研究的兩大熱點(diǎn)主題。此外,從高突現(xiàn)度關(guān)鍵詞、研究機(jī)構(gòu)和作者(表5)中可以發(fā)現(xiàn),分子系統(tǒng)發(fā)生(molecular phylogeny),擬南芥(arabidopsisthaliana),最大似然法(maximumlikelihood)和進(jìn)化(evolution)等關(guān)鍵詞突現(xiàn)度持續(xù)至今,亦表明蕨類植物的分子系統(tǒng)與進(jìn)化,污染物吸收的分子機(jī)理(重要基因功能在擬南芥中的驗(yàn)證)兩方面仍將作為蕨類植物研究的前沿課題,而中國(guó)科學(xué)院大學(xué)和中科院成都生物研究所的張良(ZHANG L),為最近突現(xiàn)度較高的機(jī)構(gòu)和作者,發(fā)文量增加較快。

        3 結(jié)論

        從檢索到的資料來看,Web of Science數(shù)據(jù)庫中蕨類植物的相關(guān)研究呈現(xiàn)逐漸上升的趨勢(shì),特別是近10年來呈現(xiàn)快速增長(zhǎng)的勢(shì)頭,表明蕨類植物相關(guān)研究越來越受科技界重視。以中國(guó)科學(xué)院為主的研究機(jī)構(gòu)對(duì)國(guó)內(nèi)蕨類植物相關(guān)研究做出了巨大貢獻(xiàn);發(fā)文量最多的期刊為《AMERICAN FERN JOURNAL》。結(jié)合載文期刊、核心作者、文獻(xiàn)共被引聚類圖譜、關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜以及高突現(xiàn)度關(guān)鍵詞和作者,可以發(fā)現(xiàn),我國(guó)蕨類植物相關(guān)研究主要集中在植物和環(huán)境2大學(xué)科,研究熱點(diǎn)主要集中在蕨類植物對(duì)污染物的吸收及其機(jī)理研究、蕨類植物分子系統(tǒng)發(fā)生與分類兩方面。

        參考文獻(xiàn)

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