張振良++郝德榮++陳國(guó)清++陸虎華+石明亮+冒宇翔++吳嘉點(diǎn)+黃小蘭+程玉靜+周廣飛++薛林
摘要:采用NY/T 1432—2014《玉米品種鑒定技術(shù)規(guī)程SSR標(biāo)記法》中的20對(duì)簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)引物對(duì)市場(chǎng)上抽檢的蘇玉糯11、蘇玉糯901、蘇玉糯13、蘇玉糯14、蘇玉糯639等5個(gè)糯玉米品種進(jìn)行真實(shí)性鑒定。結(jié)果表明,每個(gè)抽檢品種與標(biāo)準(zhǔn)品種至少有6個(gè)差異位點(diǎn),這5個(gè)品種均與相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)品種不同;此外,umc1545y2、umc1335y5、umc2105k3、umc1705w1、umc1125y3、umc2007y4、phi053k2、bnlg2305k4等8對(duì)引物多態(tài)性較好,在今后糯玉米品種鑒定中可優(yōu)先采用。
關(guān)鍵詞:糯玉米;SSR標(biāo)記;品種;鑒定;應(yīng)用
中圖分類號(hào): S513.03文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2016)06-0104-02
收稿日期:2015-05-15
作者簡(jiǎn)介:張振良(1987—),男,山東東平人,碩士,研究實(shí)習(xí)員,研究方向?yàn)橛衩追肿舆z傳和育種。E-mail:zhenliang1110@163.com。
通信作者:薛林,研究員,研究方向?yàn)橛衩子N。E-mail:417803648@qq.com。糯玉米因其營(yíng)養(yǎng)豐富、風(fēng)味獨(dú)特、適口,越來(lái)越受到廣大消費(fèi)者歡迎。糯玉米種植面積越來(lái)越大,品種數(shù)量逐年上升,品種真實(shí)性鑒定需求也急劇增加。糯玉米育種中由于少數(shù)骨干親本的集中應(yīng)用,造成品種間遺傳基礎(chǔ)狹窄,僅從形態(tài)上鑒定存在一定困難,給玉米品種的生產(chǎn)、經(jīng)營(yíng)、使用以及種子管理部門的監(jiān)督帶來(lái)一定挑戰(zhàn)。隨著DNA指紋圖譜技術(shù)的發(fā)展,以簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)為代表的分子標(biāo)記技術(shù)逐漸成熟并應(yīng)用于農(nóng)業(yè)種子生產(chǎn)研究和種子質(zhì)量管理[1-2]。2014年,中國(guó)農(nóng)業(yè)部公布了一系列主要農(nóng)作物品種鑒定的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),如NY/T 1432—2014《玉米品種鑒定技術(shù)規(guī)程SSR標(biāo)記法》、NY/T 1433—2014《水稻品種鑒定技術(shù)規(guī)程SSR標(biāo)記法》,代替了2007年公布的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),使SSR標(biāo)記技術(shù)對(duì)農(nóng)作物品種真實(shí)性鑒定的方法更加完善和準(zhǔn)確。為進(jìn)一步明確SSR標(biāo)記在糯玉米品種真實(shí)性鑒定中的作用,本研究采用NY/T 1432—2014《玉米品種鑒定技術(shù)規(guī)程SSR標(biāo)記法》標(biāo)準(zhǔn)鑒定5個(gè)疑似套牌糯玉米雜交種的真實(shí)性,同時(shí)探討SSR分子標(biāo)記技術(shù)在糯玉米品種真實(shí)性鑒定中的應(yīng)用前景。
1材料與方法
1.1材料
市場(chǎng)上抽檢的蘇玉糯11、蘇玉糯901、蘇玉糯13、蘇玉糯14、蘇玉糯639等5個(gè)糯玉米品種,疑是套牌種子依次編號(hào)為A、B、C、D、E,標(biāo)準(zhǔn)品種分別編號(hào)為A1、B1、C1、D1、E1。其中套牌種子由種子管理部門提供,標(biāo)準(zhǔn)品種由江蘇沿江地區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所玉米室提供。分別對(duì)每個(gè)樣品(品種)的5個(gè)個(gè)體單獨(dú)進(jìn)行分析。
1.2DNA提取
取約0.2 g玉米幼嫩葉片于液氮中研磨,轉(zhuǎn)入2 mL離心管中,加入800 μL預(yù)熱65 ℃的CTAB提取緩沖液,混勻,水浴60 min,每隔10 min小心搖動(dòng)離心管;取出離心管,待冷卻至25 ℃,加入800 μL三氯甲烷 ∶ 異戊醇(24 ∶ 1),小心充分搖動(dòng)試管至有機(jī)相呈深綠色,室溫下于8 000 r/min離心 10 min;用剪口的1 mL槍頭將上清液轉(zhuǎn)移到另一離心管中,加入2/3體積預(yù)冷的異丙醇(-20 ℃),小心混勻;8 000 r/min 離心 2 min,棄上清液,用5 00 μL 70%乙醇清洗2次,棄上清液,干燥沉淀,加150 μL TE溶解。
1.3PCR擴(kuò)增
根據(jù)NY/T 1432—2014《玉米品種鑒定技術(shù)規(guī)程SSR標(biāo)記法》標(biāo)準(zhǔn),選用bnlg439w1、umc1335y5、umc2007y4、bnlg1940k7、umc2105k3、phi053k2、phi072k4、bnlg2291k4、umc1705w1、bnlg2305k4、bnlg161k8、bnlg1702k1、umc1545y2、umc1125y3、bnlg240k1、phi080k15、phi065k9、umc1492y13、umc1432y6、umc1506k12等20對(duì)SSR標(biāo)記,均勻分布在玉米10對(duì)染色體上。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。PCR反應(yīng)體系(10 μL)為:1 μL 模板DNA (100~150 ng),上、下游引物(10 μmol/L)各0.2 μL、1 μL 10×Taq buffer、0.7 μL MgCl2、0.8 μL dNTP(2.5 mmol/L)、DNA Polymerase(2.5 U/μL)0.2 μL(TIANGEN),其余以超純水補(bǔ)足至所需體積。反應(yīng)液上加蓋15 μL石蠟油,以防反應(yīng)過(guò)程中水分蒸發(fā)。PCR程序?yàn)椋?94 ℃,5 min;94 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,共31個(gè)循環(huán);72 ℃ 10 min,4 ℃恒溫冷藏。
1.4非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳及顯色。
PCR產(chǎn)物用6%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,銀染顯色。
1.5品種真實(shí)性鑒定標(biāo)準(zhǔn)
從樣品中隨機(jī)抽取5個(gè)單株作為檢測(cè)樣本。根據(jù)抽檢樣本電泳譜帶和標(biāo)準(zhǔn)品種電泳譜帶的一致性鑒定品種的真實(shí)性。結(jié)果按照農(nóng)業(yè)部頒布的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)NY/T 1432—2014《玉米品種鑒定技術(shù)規(guī)程SSR標(biāo)記法》判定。當(dāng)樣品間差異位點(diǎn)數(shù)≥2,判定為不同;當(dāng)樣品間差異位點(diǎn)數(shù)=1,判定為近似;當(dāng)樣品間差異位點(diǎn)數(shù)=0,判定為極近似或相同。
2結(jié)果與分析
2.1糯玉米雜交種DNA檢測(cè)
對(duì)提取的糯玉米基因組DNA進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖1。結(jié)果表明,提取的玉米基因組DNA主帶清晰一致,適合進(jìn)一步的SSR分析。
2.2品種內(nèi)遺傳一致性分析
20對(duì)引物中有umc1125y3、bnlg161k8、umc1506k12等3對(duì)引物在品種內(nèi)發(fā)生變異,均發(fā)生在抽檢的蘇玉糯13、蘇玉糯14、蘇玉糯639中,且都屬于在5個(gè)單株檢測(cè)重復(fù)中只發(fā)現(xiàn)1個(gè)不一致的情況(圖2)。20對(duì)引物對(duì)10個(gè)糯玉米雜交種的200次擴(kuò)增中,出現(xiàn)了共計(jì)5次品種內(nèi)變異,占2.5%,說(shuō)明品種內(nèi)變異較小,電泳譜帶比較結(jié)果是可靠的。
2.3糯玉米SSR鑒定分析
對(duì)抽檢的5個(gè)糯玉米雜交種和標(biāo)準(zhǔn)品種電泳譜帶比較可知,抽檢的蘇玉糯11與標(biāo)準(zhǔn)品種相比有11個(gè)差異位點(diǎn),占引物總數(shù)的55%;蘇玉糯901與標(biāo)準(zhǔn)品種相比有7個(gè)差異位點(diǎn),占引物總數(shù)的35%;蘇玉糯13與標(biāo)準(zhǔn)品種相比有6個(gè)差異位點(diǎn),占引物總數(shù)的30%;蘇玉糯14與標(biāo)準(zhǔn)品種相比有9個(gè)差異位點(diǎn),占引物總數(shù)的45%;蘇玉糯901與標(biāo)準(zhǔn)品種有6個(gè)差異位點(diǎn),占引物總數(shù)的30%(表1)。按照農(nóng)業(yè)部頒布的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)NY/T 1432—2014《玉米品種鑒定技術(shù)規(guī)程 SSR標(biāo)記法》,可判定待檢測(cè)的5個(gè)抽檢樣品與相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)品種為不同品種。
2.4引物多態(tài)性分析
umc1545y2在5個(gè)品種鑒定中均為差異位點(diǎn)(圖3),umc1335y5、umc2105k3、umc1705w1、umc1125y3在4個(gè)品種中均檢測(cè)到差異位點(diǎn),umc2007y4、phi053k2、bnlg2305k4、bnlg1702k1 在3個(gè)品種中均檢測(cè)到差異位點(diǎn)(表1)。上述差異位點(diǎn)均在多個(gè)抽檢品種與標(biāo)準(zhǔn)品種間檢測(cè)到,說(shuō)明這些位點(diǎn)多態(tài)性較高。
3結(jié)論與討論
SSR分子標(biāo)記為共顯性遺傳,反映的是具體DNA片段的大小,既不受組織器官及發(fā)育階段的影響,也不受季節(jié)和環(huán)境因素的制約,與傳統(tǒng)田間種植鑒定相比,是一種更加快速、準(zhǔn)確鑒定品種真實(shí)性的方法,廣泛應(yīng)用于種質(zhì)資源分析和農(nóng)作物品種鑒定[3-7]。本研究采用SSR標(biāo)記對(duì)市場(chǎng)上抽檢的5份糯玉米品種進(jìn)行鑒定,結(jié)果表明,抽檢的5個(gè)糯玉米品種均與相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)品種不同,與田間鑒定結(jié)果一致,說(shuō)明SSR標(biāo)記鑒定結(jié)果可靠準(zhǔn)確。
引物篩選是SSR標(biāo)記鑒定品種真實(shí)性的關(guān)鍵,選用多態(tài)性高、染色體上分布均勻、穩(wěn)定性好的引物可有效提高工作效率、降低成本[7-8]。本研究采用農(nóng)業(yè)部公布的NY/T 1432—2014《玉米品種鑒定技術(shù)規(guī)程SSR標(biāo)記法》中的前20對(duì)引物,這20個(gè)SSR位點(diǎn)的帶型清晰、穩(wěn)定性較好,平均分布在玉米的10條染色體上,其中有9對(duì)引物在至少3個(gè)糯玉米品種中檢測(cè)出差異位點(diǎn),說(shuō)明這9對(duì)引物在糯玉米品種中多態(tài)性較好,在今后糯玉米品種鑒定中可優(yōu)先采用,以減少工作量、降低成本。
由于剩余遺傳效應(yīng)作用,品種內(nèi)變異普遍存在,品種內(nèi)變異導(dǎo)致品種內(nèi)不同個(gè)體之間重復(fù)帶型不一致,在品種真實(shí)性鑒定中會(huì)干擾判斷[3]。為避免糯玉米品種內(nèi)產(chǎn)生遺傳變異造成的誤差,本研究對(duì)每份糯玉米雜交種均采用5個(gè)單株重復(fù)。結(jié)果表明,20對(duì)引物只有3對(duì)引物發(fā)生品種內(nèi)變異,且5個(gè)單株檢測(cè)重復(fù)中只發(fā)現(xiàn)1個(gè)不一致情況,屬于可控范圍內(nèi)。針對(duì)品種內(nèi)重復(fù)性差的樣品,則需要擴(kuò)大檢測(cè)樣品的重復(fù)次數(shù)。
品種真實(shí)性鑒定作為種子生產(chǎn)和種子檢驗(yàn)的重要環(huán)節(jié),應(yīng)得到種子管理部門的高度重視。SSR標(biāo)記因其多態(tài)性高、重復(fù)性強(qiáng)的特點(diǎn)已被農(nóng)業(yè)部確定為品種真實(shí)性鑒定的有效方法。SSR分子標(biāo)記技術(shù)在種子管理工作中應(yīng)充分發(fā)揮作用,一方面應(yīng)用于市場(chǎng)糯玉米種子質(zhì)量監(jiān)督抽查,以阻止套牌侵權(quán)品種上市流通,保障農(nóng)民合法權(quán)益;另一方面應(yīng)用于糯玉米品種審定區(qū)域試驗(yàn),以維護(hù)區(qū)試工作中的公正、公平,維護(hù)育種單位以及廣大種子生產(chǎn)者的利益。
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