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        RPT方法在多元游程檢驗(yàn)中的應(yīng)用

        2016-06-24 02:48:31凱李
        中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì) 2016年2期
        關(guān)鍵詞:游程衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)總數(shù)

        朱 凱李 悅

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        RPT方法在多元游程檢驗(yàn)中的應(yīng)用

        朱 凱1李 悅2△

        1.江西師范大學(xué)科學(xué)技術(shù)學(xué)院(330027)

        2.南昌大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院

        游程檢驗(yàn)是根據(jù)樣本標(biāo)志表現(xiàn)排列所形成的游程的多少進(jìn)行判斷的檢驗(yàn)方法,在檢驗(yàn)樣本的隨機(jī)性及判斷數(shù)據(jù)的規(guī)律性等方面有著重要的作用。本文針對多元小樣本隨機(jī)游程檢驗(yàn)問題,介紹可以有效解決這一問題的方法——randomized permutation test(簡稱RPT),并運(yùn)用Matlab軟件編寫程序?qū)崿F(xiàn)該方法。

        隨機(jī)游程檢驗(yàn)簡介

        設(shè)二元序列中0和1的個(gè)數(shù)分別為n1和n2,n1+ n2=n,一般來說n1和n2都大于0,設(shè)R表示總游程數(shù),則R的最小值是2,最大值為n,若游程總數(shù)R的值過大(即0和1呈周期性變化的趨勢),或游程總數(shù)R的值過小(即序列二元0和1的出現(xiàn)過于集中),可認(rèn)為樣本數(shù)據(jù)受到了某些非隨機(jī)因素的干擾,它不符合隨機(jī)抽取的原則[1]。

        在實(shí)際應(yīng)用中,隨機(jī)游程對某一樣本觀測值序列進(jìn)行檢驗(yàn)時(shí),通常有參數(shù)法和確切概率兩種方法。當(dāng)n1,n2都較大時(shí),可使用參數(shù)法。利用檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量(游程)近似服從正態(tài)分布的特性,通過矩法估計(jì)求出其參數(shù),再根據(jù)現(xiàn)有樣本的游程數(shù)得出p值[2]。但對小樣本數(shù)據(jù)參數(shù)法會產(chǎn)生較大的誤差。此外,當(dāng)樣本序列中出現(xiàn)了類似于0,1,2的三元或三元以上的序列時(shí),游程數(shù)的確切分布更加難以獲得,國內(nèi)目前尚沒有涉及三元及以上游程檢驗(yàn)方法的文獻(xiàn)報(bào)道。顯然參數(shù)法只能針對游程為二元的大樣本數(shù)據(jù)使用。于是基于確切概率的非參數(shù)檢驗(yàn)方法可用于游程檢驗(yàn),該方法既可以避免小樣本數(shù)據(jù)的誤差,又能夠用于分析多元游程數(shù)據(jù),故此法較傳統(tǒng)的參數(shù)法有很多優(yōu)勢。其基本過程為:首先計(jì)算現(xiàn)有樣本的游程總數(shù),記為Robs,稱Robs為游程總數(shù)的臨界值,然后找出該樣本所有可能組合及各組合對應(yīng)的游程,根據(jù)各組合對應(yīng)的游程求出大于(或小于)Robs的頻率,即為p值。該方法為全排列方法,即exact permutation test(簡稱EPT)。當(dāng)樣本量偏大時(shí)往往由于排列較為復(fù)雜且組合數(shù)太多(當(dāng)n1=10,n2=18時(shí),組合數(shù)為C1028=13123110),難以獲得游程數(shù)的確切分布,此時(shí)基于全排列的EPT方法難以實(shí)現(xiàn)。故可以在所有的排列中隨機(jī)抽取其中一部分排列,得出游程數(shù)的近似分布,該方法稱之為random permutation test(RPT方法)[4]。RPT的實(shí)現(xiàn)過程為:利用軟件產(chǎn)生的隨機(jī)數(shù),對所有可能的排列進(jìn)行抽樣,得到游程總數(shù)R的近似抽樣分布,即對所有可能的組合進(jìn)行隨機(jī)抽樣后計(jì)算抽樣游程總數(shù)大于臨界值Robs的頻率,該方法在游程檢驗(yàn)中的關(guān)鍵步驟如下:

        1.建立假設(shè),確定檢驗(yàn)水準(zhǔn),H0:樣本序列符合隨機(jī)抽取的原則,α=0.05(單側(cè)檢驗(yàn));

        2.計(jì)算現(xiàn)有樣本的游程數(shù)Robs,稱Robs為R的臨界值;

        3.利用軟件對構(gòu)成現(xiàn)有的元素進(jìn)行隨機(jī)排列,得到與現(xiàn)有樣本各元素?cái)?shù)均相同的隨機(jī)樣本,計(jì)算其游程數(shù)R,反復(fù)進(jìn)行該步驟得到檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量R的經(jīng)驗(yàn)抽樣分布;

        實(shí)例應(yīng)用與Matlab實(shí)現(xiàn)

        例:在某次臨床隨機(jī)試驗(yàn)中,共入選14人?,F(xiàn)用字母代表他們的病情程度,A、B、C分別代表重度、中度、輕度。按照入組時(shí)間的先后順序,這14人實(shí)驗(yàn)前的病情程度依次為:A A B C C C B A C B B A A B。

        試問:能否認(rèn)為該實(shí)驗(yàn)病人入選順序隨機(jī),α=0.05。

        解:H0:病人入選順序是隨機(jī)的,H1:病人入選順序非隨機(jī)

        由題中數(shù)據(jù)可知總例數(shù)n =14,nA=5,nB=5,nC=4,共有3個(gè)A游程,4個(gè)B游程,2個(gè)C游程,游程數(shù)觀察值為Robs=9。用RPT模擬100000次,即對5 個(gè)A,5個(gè)B,4個(gè)C進(jìn)行隨機(jī)排序,重復(fù)進(jìn)行100000次,分別求出每次模擬中總游程數(shù),再求總游程數(shù)R大于Robs的頻率。筆者編寫了相應(yīng)的Matlab程序?qū)崿F(xiàn)該方法,程序[3]及注釋如下:

        a =[0 0 1 2 2 2 1 0 2 1 1 0 0 1];%0 1 2分別代表A B C有三種結(jié)果

        t =youcheng(a);%計(jì)算樣本游程數(shù)對應(yīng)的概率

        n =100000;%模擬次數(shù)

        m =length(a);

        p0 =0;

        for i =1:n

        b =matric_randperm(a);%將樣本進(jìn)行隨機(jī)排列,形成一個(gè)模擬抽樣

        y(i)=youcheng(b);%模擬抽樣對應(yīng)的概率

        if y(i)>=t

        p0 =p0 +1;end

        end

        pp =p0/ n;

        p =min(pp,1-pp)

        %以下是主程序中調(diào)用youcheng函數(shù)的代碼

        function[t,b]=youcheng(a)

        t =1;b(1)=1;

        for i =2:length(a)

        if a(i-1)~=a(i)

        t =t +1;b(t)=1;

        else

        b(t)=b(t)+1;

        end

        end

        通過運(yùn)行該程序,得到p =P(RA≥Robs)=0.30503,P值大于0.05,故接受H0,認(rèn)為病人出現(xiàn)順序是隨機(jī)的。若使用EPT方法進(jìn)行全排列,雖然所有不同的組合只有種,但尋找這些不同的組合過程十分困難,需從314=4782969種不同組合中將它們篩選出來,整個(gè)過程涉及多個(gè)復(fù)雜的程序及大量計(jì)算,而且隨著樣本量的增加,EPT方法運(yùn)算次數(shù)還將呈幾何數(shù)增長。故EPT方法在游程檢驗(yàn)中是難以實(shí)現(xiàn)的。該問題游程總數(shù)的確切分布見表1。

        表1 總游程數(shù)R的EPT分布

        根據(jù)表1我們可以得到該問題的確切概率(單側(cè)檢驗(yàn))p =P(RA≥Robs)=0.304196,RPT方法與之的相對誤差僅有0.2742%。據(jù)此我們可知RPT方法較EPT方法簡化了計(jì)算過程且減少了運(yùn)算次數(shù),未引起過大的誤差。RPT方法可以針對多元數(shù)據(jù)進(jìn)行游程檢驗(yàn),突破了參數(shù)法只能進(jìn)行二元游程檢驗(yàn)的局限。此外該方法可根據(jù)實(shí)際情況適當(dāng)調(diào)整抽樣次數(shù),以達(dá)到增加精度或減少計(jì)算量的目的[4]。

        結(jié) 論

        隨機(jī)游程檢驗(yàn)是檢驗(yàn)一個(gè)序列中數(shù)據(jù)出現(xiàn)是否與順序無關(guān)的常用方法。本文將RPT方法應(yīng)用于游程檢驗(yàn),解決了多元游程檢驗(yàn)的問題。但在使用過程中需注意以下三點(diǎn):

        1.在樣本量不大時(shí)使用參數(shù)方法進(jìn)行游程檢驗(yàn),p值會有一定的誤差。RPT方法可有效地提高p值的精度;

        2.本文只討論了二元和三元序列的游程檢驗(yàn),若遇上三元以上序列的游程檢驗(yàn)問題,可直接調(diào)用本文給出的程序求出值;

        3.由于程序運(yùn)行中要用到隨機(jī)數(shù),最終的結(jié)果必然產(chǎn)生一定的誤差,因此建議在計(jì)算機(jī)允許的情況下加大模擬次數(shù),并反復(fù)運(yùn)行程序,待結(jié)果相對穩(wěn)定后再下結(jié)論[5-6]。

        RPT作為EPT的一種近似方法,具有使用方便、誤差小、執(zhí)行效率高的優(yōu)點(diǎn),是一種解決多元游程檢驗(yàn)并有效提高檢驗(yàn)效率的好方法。

        參考文獻(xiàn)

        [1]付云廷.游程檢驗(yàn)法在制訂業(yè)務(wù)計(jì)劃中的應(yīng)用.中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)1990,7(4):42-43.

        [2]王星.非參數(shù)統(tǒng)計(jì).北京:清華大學(xué)出版社2009,68-71.

        [3]丁元林,孔丹莉.多個(gè)樣本及其兩兩比較的秩和檢驗(yàn)SAS程序.中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì),2002,19(5):313-314.

        [4]荀鵬程,趙楊,柏建嶺,等.Permutation Test在假設(shè)檢驗(yàn)中的應(yīng)用.數(shù)理統(tǒng)計(jì)與管理,2006,26(5):616-621.

        [5]Cai JW,Shen Y.Permutation tests for comparing marginal survival functions with clustered failure time data.Statist,Med,2000,19:2963-2973.

        [6]朱凱,李悅.RPT對秩和檢驗(yàn)的改進(jìn)及Matlab實(shí)現(xiàn).中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì),2012,20(4):597-597.

        (責(zé)任編輯:鄧 妍)

        ·綜述·

        通信作者:△李悅,Email:liyue0803@126.com

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