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        恩施州漁塘壩硒礦區(qū)天然高富硒微生物的篩選與鑒定

        2016-05-24 06:26:04帥超群向極釬楊永康殷紅清覃大吉陳菲菲
        化學(xué)與生物工程 2016年4期
        關(guān)鍵詞:篩選鑒定

        帥超群,向極釬,談 弋,楊永康,殷紅清,覃大吉,陳菲菲

        (1.武漢大學(xué)藥學(xué)院,湖北 武漢 430072;2.恩施清江生物工程有限公司,湖北 恩施 445000;3.恩施州農(nóng)科院藥物與園藝研究所,湖北 恩施 445000;4.恩施州硒應(yīng)用技術(shù)與產(chǎn)品開發(fā)研究院,湖北 恩施 445000)

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        恩施州漁塘壩硒礦區(qū)天然高富硒微生物的篩選與鑒定

        帥超群1,2,4,向極釬2,4,談弋1,楊永康2,3,殷紅清2,4,覃大吉2,3,陳菲菲2,3

        (1.武漢大學(xué)藥學(xué)院,湖北 武漢 430072;2.恩施清江生物工程有限公司,湖北 恩施 445000;3.恩施州農(nóng)科院藥物與園藝研究所,湖北 恩施 445000;4.恩施州硒應(yīng)用技術(shù)與產(chǎn)品開發(fā)研究院,湖北 恩施 445000)

        摘要:采用富集培養(yǎng)及平板劃線法分離恩施州漁塘壩硒礦區(qū)中天然高富硒微生物。通過在基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基中添加不同濃度亞硒酸鈉,篩選出一株高富硒微生物XS-1,該菌株培養(yǎng)物最高硒含量可達(dá)34 782.52×10-6。通過形態(tài)學(xué)觀察及ITS序列分析鑒定該菌株為異常威克漢姆酵母(Wickerhamomyces anomalus),對硒具有極高的耐受及富集能力。

        關(guān)鍵詞:硒礦區(qū);富硒微生物;篩選;鑒定

        硒是動(dòng)物生長必不可少的微量元素,是人體多種功能酶的活性中心,如谷胱甘肽過氧化物酶(GPx)家族[1]、脫碘酶(ID)家族[2]等,在機(jī)體抗氧化、提高免疫力等方面發(fā)揮著重要的作用。

        世界上包括中國在內(nèi)的40多個(gè)國家和地區(qū)屬于缺硒地區(qū)。據(jù)《地方疾病與環(huán)境因素圖集》記載,我國72%地區(qū)屬于低硒地區(qū),其中30%為嚴(yán)重缺硒地區(qū)。

        缺硒可能導(dǎo)致癌癥、心肌梗塞等多種疾病的發(fā)生,通過膳食攝取足夠的硒可起到預(yù)防相關(guān)疾病的作用[3]。大部分天然食物中的硒含量極低,遠(yuǎn)不能滿足人體正常需求?,F(xiàn)有補(bǔ)硒方式主要為食用富硒保健品、富硒食物等,根據(jù)硒的形態(tài)將硒源分為無機(jī)硒源和有機(jī)硒源。無機(jī)硒毒性高、吸收率低、環(huán)境污染大;有機(jī)硒毒性低、吸收率高、環(huán)境污染小[4]。因此,有機(jī)硒是今后補(bǔ)硒的主要方式。目前有機(jī)硒源主要為微生物,即利用傳統(tǒng)的食用菌或者已經(jīng)馴化的真菌資源,進(jìn)行人工補(bǔ)硒誘導(dǎo)培養(yǎng)以獲得具有高耐受力、強(qiáng)富硒力的菌株[5-7]。但目前人工培育菌株大多存在穩(wěn)定性較差、富硒能力有限、生產(chǎn)成本較高等問題。

        恩施被譽(yù)為“世界硒都”,恩施州恩施市雙河鄉(xiāng)漁塘壩是迄今為止全球唯一探明的獨(dú)立硒礦床所在地。漁塘壩核心礦區(qū)礦石中硒含量均值為3 637.5×10-6,最高硒含量達(dá)6 300×10-6,為硒地殼豐度(0.05×10-6)的171 800倍。恩施硒礦床的發(fā)現(xiàn),改寫了“硒不能形成獨(dú)立工業(yè)礦床”的學(xué)術(shù)界論斷[8]。

        作者對漁塘壩硒礦區(qū)中微生物進(jìn)行篩選,并對其進(jìn)行鑒定,以期發(fā)現(xiàn)天然高富硒微生物,為有機(jī)硒源微生物的開發(fā)奠定基礎(chǔ)。

        1實(shí)驗(yàn)

        1.1材料與培養(yǎng)基

        土壤、水體均取自漁塘壩硒礦區(qū)內(nèi)。土壤取樣點(diǎn)為硒礦坑內(nèi)外,水體取樣點(diǎn)為硒礦坑附近河溝小溪。

        富集培養(yǎng)基:肉湯培養(yǎng)基、PD培養(yǎng)基、黃豆芽汁培養(yǎng)基。

        分離培養(yǎng)基:牛肉膏蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基、孟加拉紅培養(yǎng)基、PDA培養(yǎng)基。各類培養(yǎng)基中亞硒酸鈉濃度梯度為1 000×10-6、2 000×10-6、4 000×10-6、8 000×10-6、16 000×10-6、32 000×10-6。

        種子培養(yǎng)基:PD培養(yǎng)基。

        發(fā)酵培養(yǎng)基:PD培養(yǎng)基中添加亞硒酸鈉,起始濃度為2 000×10-6。

        1.2方法

        1.2.1分離純化

        1)采集漁塘壩硒礦坑內(nèi)土樣6份、水樣2份,坑前土樣9份,礦坑下行100m出水溝水樣1份,礦坑附近三角洲處水樣3份、巖石樣3份、水中腐殖物5份,礦坑木橋下水溝中水體附著物1份。將采集的樣本預(yù)處理后進(jìn)行富集培養(yǎng)。富集培養(yǎng)條件:肉湯培養(yǎng)基為25 ℃、100r·min-1、24h;PD培養(yǎng)基、黃豆芽汁培養(yǎng)基為25 ℃、100r·min-1、48h。

        2)富集完成后,肉湯培養(yǎng)基中培養(yǎng)物采用稀釋平板法接種到各個(gè)亞硒酸鈉濃度梯度的牛肉膏蛋白胨瓊脂平板上進(jìn)行分離純化;PD培養(yǎng)基中培養(yǎng)物采用稀釋平板法接種到各個(gè)亞硒酸鈉濃度梯度的PDA平板上進(jìn)行分離純化;黃豆芽汁培養(yǎng)基中培養(yǎng)物采用稀釋平板法接種到各個(gè)亞硒酸鈉濃度梯度的孟加拉紅平板上進(jìn)行分離純化。

        3)接種完畢后,將各接種平板轉(zhuǎn)入培養(yǎng)室中于25 ℃、自然光照下培養(yǎng)5~7d后,觀察不同平板上菌落生長狀況,選取有菌落生長的最高亞硒酸鈉濃度的平板培養(yǎng)物,對其采用平板劃線法再次進(jìn)行分離純化,重復(fù)分離純化直至菌落形態(tài)一致時(shí),作為預(yù)發(fā)酵菌株備用。

        1.2.2菌株篩選

        將預(yù)發(fā)酵菌株接入種子培養(yǎng)基中于25 ℃、100r·min-1搖瓶培養(yǎng)5d,再接入2 000×10-6亞硒酸鈉發(fā)酵培養(yǎng)基中于25 ℃、100r·min-1搖瓶培養(yǎng)5d,離心,取沉淀,用蒸餾水清洗3遍,50 ℃烘干,檢測硒含量。選取硒含量最高的1~2種菌株作為目標(biāo)菌株。

        1.2.3菌種鑒定

        對篩選的目標(biāo)菌株進(jìn)行形態(tài)學(xué)觀察和ITS序列分析。

        1)形態(tài)學(xué)觀察

        將目標(biāo)菌株接種于PDA平板上,25 ℃、黑暗條件下培養(yǎng)7d,觀察并記錄菌落形態(tài)、質(zhì)地和顏色等特征。在高倍顯微鏡下觀察菌株形態(tài)。

        2)ITS序列分析

        采用CTAB法提取DNA,將DNA的OD260/OD280值調(diào)至1.6~1.8之間進(jìn)行PCR擴(kuò)增。ITS序列擴(kuò)增引物為:正向ITS4,反向ITS5。50μLPCR反應(yīng)體系為:ddH2O37.2μL、10×Buffer5.0μL、dNTPs3.0μL、Primer1.6μL、DNA3.0μL(30ng)、Taq酶 0.2μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃ 5min;94 ℃ 45s,36 ℃ 45s,72 ℃ 45s,共35個(gè)循環(huán);72 ℃ 5min。將PCR產(chǎn)物回收,送生工生物工程股份有限公司測序,測序結(jié)果提交GenBank進(jìn)行比對分析。

        2結(jié)果與討論

        2.1分離純化

        各樣本富集培養(yǎng)物在32 000×10-6亞硒酸鈉平板上均有菌落生成,表明礦區(qū)不同環(huán)境中均存在硒耐受微生物。不同培養(yǎng)基菌落生長狀況如表1所示。

        由表1可知,孟加拉紅培養(yǎng)基中絮狀菌落及黏稠狀菌落均有生長,且與牛肉膏蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基和PDA培養(yǎng)基生長狀況相近,表明含亞硒酸鈉的不同培養(yǎng)基可能具有篩選一致性。

        2.2菌株篩選

        選擇在最高亞硒酸鈉濃度的培養(yǎng)基中生長狀況良好的菌株進(jìn)行搖瓶培養(yǎng),2 000×10-6亞硒酸鈉培養(yǎng)基中菌落形態(tài)及培養(yǎng)物硒含量如表2所示。

        由表2可知,在32 000×10-6亞硒酸鈉平板上生長情況較好的5株菌株在2 000×10-6亞硒酸鈉培養(yǎng)基搖瓶培養(yǎng)中的形態(tài)差異明顯,渾濁狀、米粒狀、蠶豆?fàn)?、異型等形態(tài)均有出現(xiàn);對硒的富集能力也有顯著差異(圖1)。對BP6-1菌株進(jìn)一步測試表明,其培養(yǎng)物硒含量可達(dá)34 782.52×10-6。

        表1

        不同培養(yǎng)基中菌落生長狀況

        Tab.1

        Growth status of colonies in different media

        表2

        2000×10-6亞硒酸鈉培養(yǎng)基搖瓶培養(yǎng)中菌落形態(tài)及培養(yǎng)物硒含量

        Tab.2

        Morphology of colonies and selenium content of shake flask culture in medium containing 2000×10-6 sodium selenite

        注:BP6-1、BP6-16、BP6-13、BP6-24、BP6-18為在32 000×10-6亞硒酸鈉平板上生長情況較好的5株菌株。

        2.3菌種鑒定

        2.3.1形態(tài)學(xué)特征(圖2)

        菌株BP6-1在PDA平板上生長較快,25 ℃、黑暗條件下培養(yǎng)7 d,菌落直徑達(dá)10~15 mm,正反面和邊緣、中央部位的顏色均為白色,質(zhì)地均勻,邊緣整齊(圖2a);其顯微特征為:菌株形態(tài)為球狀,直徑25.0~50.0 μm,無鞭毛,不能游動(dòng),多邊芽殖(圖2b,圖2c)。

        圖1 不同微生物培養(yǎng)物中的硒含量

        2.3.2ITS序列分析

        經(jīng)PCR擴(kuò)增后菌株BP6-1的ITS序列全長602 bp(KU301793),GenBank比對分析結(jié)果顯示,該序列與異常威克漢姆酵母(Wickerhamomycesanomalus)(GQ376076.1)的相似性為99%。

        綜上,菌株BP6-1可鑒定為異常威克漢姆酵母(Wickerhamomycesanomalus),命名為XS-1。

        2.4討論

        微生物對極端環(huán)境有著極強(qiáng)的耐受性,且往往對極端環(huán)境具有極強(qiáng)的改造性[9]。漁塘壩屬于礦質(zhì)極端環(huán)境,2008年,中國科學(xué)院地球化學(xué)研究所對漁塘壩微生物形態(tài)硒或硒化物的形成機(jī)理開展研究,證實(shí)了硒化物微體化石的細(xì)菌成因,提出微生物充當(dāng)“冶煉師”的角色。本研究在分離純化過程中發(fā)現(xiàn)多種耐、富硒微生物,從旁佐證了上述研究結(jié)果。

        本研究發(fā)現(xiàn),硒對部分微生物的搖瓶生長形態(tài)影響顯著,搖瓶培養(yǎng)物出現(xiàn)畸變現(xiàn)象。如菌株BP6-18在種子培養(yǎng)基中,菌球近圓形,但在亞硒酸鈉發(fā)酵培養(yǎng)基中則出現(xiàn)扁形、長條形等多種異形菌體(2-E),甚至還有菌體聚合的現(xiàn)象發(fā)生。表明部分菌株對硒敏感性較大。硒對微生物的畸變作用機(jī)理有待進(jìn)一步研究。

        本研究分離篩選出的天然高富硒微生物XS-1屬異常威克漢姆酵母(Wickerhamomycesanomalus),其培養(yǎng)物硒含量可達(dá)34 782.52×10-6。該酵母在發(fā)酵領(lǐng)域應(yīng)用十分廣泛,被譽(yù)為“生香酵母”,本研究也發(fā)現(xiàn),培養(yǎng)液均有異香散發(fā)。該酵母的“生香”及“超富硒”能力,預(yù)示其在食品領(lǐng)域具有極好的市場應(yīng)用前景,開發(fā)潛力巨大。

        3結(jié)論

        通過富集培養(yǎng)及平板劃線法從恩施州漁塘壩硒礦區(qū)篩選出一株高富硒微生物XS-1,該菌株屬異常威克漢姆酵母(Wickerhamomycesanomalus),培養(yǎng)物最高硒含量可達(dá)34 782.52×10-6,對硒具有極高的耐受和富集能力。

        本研究雖篩選出天然高富硒微生物XS-1,但對其培養(yǎng)物中硒的形態(tài)未做深入研究,而富硒微生物中硒的形態(tài)特征對理論研究和實(shí)際應(yīng)用均有重大價(jià)值;該菌株所具有的高硒富集能力,必然有其特殊的代謝轉(zhuǎn)化機(jī)理,對它的深入研究同樣有著較大的理論價(jià)值。對上述兩個(gè)問題進(jìn)行研究探索,將進(jìn)一步為天然高富硒微生物的開發(fā)應(yīng)用奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

        參考文獻(xiàn):

        [1]ROTRUCK J T,POPE A L,GANTHER H E,et al.Selenium:Biochemical role as a component of glutathione peroxidase[J].Science,1973,179(4073):588-590.

        [2]SMITH J L,GOOS S.Selenium nutriture in total parenteral nutrition patients:Intake levels[J].Acta Chir Scand Suppl,1979,494:95-97.

        [3]FINLEY J W,DAVIS C D,FENG Y.Selenium from high selenium broccoli protects rats from colon cancer[J].J Nutr,2000,130(9):2384-2389.

        [4]McADAM P A,LEVANDER O A.Chronic toxicity and retention of dietary selenium fed to rats as D- or L-selenomethionine,selenite,or selenate [J].Nutrition Res,1987,7(6):601-610.

        [5]鄧桂春,侯松嵋,田冬梅,等.富硒蛹蟲草中硒多糖的分離與分析[J].光譜學(xué)與光譜分析,2006,26(3):522-525.

        [6]宋照軍,王樹寧,潘潤淑,等.富硒乳酸菌的分離、篩選、馴化及富硒研究[J].中國釀造,2004,(11):4-6.

        [7]范秀英,郭雪娜,傅秀輝,等.高生物量富硒酵母的選育及培養(yǎng)條件初步優(yōu)化[J].生物工程學(xué)報(bào),2003,19(6):720-724.

        [8]彭祚全.微量元素硒與恩施硒資源[J].湖北社會(huì)科學(xué),2000,(6):41-42.

        [9]陳駿,連賓,王斌,等.極端環(huán)境下的微生物及其生物地球化學(xué)作用[J].地學(xué)前緣,2006,13(6):199-207.

        Screening and Identification of Natural Selenium Super-Enriched Microorganisms in Enshi Yutangba′s Selenium Ore Area

        SHUAI Chao-qun1,2,4,XIANG Ji-qian2,4,TAN Yi1,YANG Yong-kang2,3,YIN Hong-qing2,4,QIN Da-ji2,3,CHEN Fei-fei2,3

        (1.SchoolofPharmaceuticalSciences,WuhanUniversity,Wuhan430072,China;2.EnshiQingjiangBio-EngineeringCo.,Ltd.,Enshi445000,China;3.MedicineandHorticulturalResearchInstitute,EnshiAcademyofAgriculturalSciences,Enshi445000,China;4.EnshiSeleniumInstituteofAppliedTechnologyandProductDevelopment,Enshi445000,China)

        Abstract:The natural selenium super-enriched microorganisms in Enshi Yutangba′s selenium ore area were isolated by enrichment culture and streak plate methods.The selenium super-enriched microorganism XS-1 was screened by adding different concentrations of sodium selenite into the fermentation medium,and the highest selenium content in the fermentation products was 34 782.52×10-6.The microorganism XS-1 was identified to be Wickerhamomyces anomalus by morphological observation and ITS sequence analysis.This microorganism has high tolerance and enrichment capacity to selenium.

        Keywords:selenium ore area;selenium enriched microorganism;screening;identification

        中圖分類號:TQ 920.1

        文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A

        文章編號:1672-5425(2016)04-0051-04

        doi:10.3969/j.issn.1672-5425.2016.04.013

        作者簡介:帥超群(1987-),男,湖北荊門人,初級農(nóng)藝師,研究方向:功能微生物的開發(fā)與利用,E-mail:woshiscq@163.com。

        收稿日期:2015-12-22

        基金項(xiàng)目:湖北省科技支撐計(jì)劃資助項(xiàng)目(2013BEC048)

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