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        “開放科學 數(shù)據(jù)共享 軟件共享”, 你準備好了嗎?

        2016-02-28 18:47:35
        心理科學進展 2016年6期
        關鍵詞:科學研究開放性指南

        朱 瀅

        (北京大學心理系, 北京 100871)

        當前, “開放科學、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”(Open science, data sharing, software sharing)的趨勢十分明顯, 它是科學的未來(Gewin, 2016)。那么,“開放科學、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”是如何體現(xiàn)的呢?

        它的最明確的信號是刊登在2015年《科學》雜志上的“促進期刊透明性和開放性的指南” (以下簡稱指南) (Nosek, et al. 2015)一文, 接受該指南的雜志或研究團體, 就意味著它們支持科學的透明性、開放性和重現(xiàn)性(reproducibility, 一項實驗可以由原作者或其他人重復進行)。具體說來,就是可以僅僅刊登實驗設計, 廣泛征求意見后再進行實驗; 實驗結束后將原始數(shù)據(jù)公布, 以便人們使用或檢查; 刊登無顯著差別的發(fā)現(xiàn)以及重復的研究, 等等。這些做法可以改善科研的重現(xiàn)性,擴大科學觀察的范圍。據(jù)報道, 名為《Research Ideas and Outcomes》(RIO)的雜志已于2015年11月正式登場。它可以僅僅刊登研究設想, 或方法,或工作流程(Workflows), 或數(shù)據(jù), 或報告, 或軟件。一句話, 它可以僅僅刊登研究周期中的任何一項產(chǎn)品(參見2015年9月《Science》News)。這樣的雜志正好體現(xiàn)了當今的科學精神——科學的開放性。它與過去的刊物僅僅刊登科研的最后成果——論文不同, 更關心做科學的做法(Take more care about the modus operandi of doing science than only the publication of results)。這樣, 科研的每一環(huán)節(jié)都可以得到監(jiān)控, 從而大大提高了科學自身的糾錯能力, 并改善了科研的重現(xiàn)性。另外, 有一類雜志的總稱叫 PLOS, 它包括生物學及醫(yī)學各分支的8份期刊。PLOS從2014年3月起要求作者在投稿時包含一項數(shù)據(jù)可用性的聲明, 讓讀者可以得到該數(shù)據(jù)。PLOS相信, 數(shù)據(jù)可用性允許數(shù)據(jù)重復, 再分析, 新分析, 解釋, 或包含在元分析中, 從而促進研究的重現(xiàn)性, 所有這些都會提供一個更好的“貨真價實”的科學研究。

        目前, 538個出版社和雜志(包括 Elserier和Springer出版社)以及 57個研究團體(包括美國科學促進會)已采用指南。另外, 實行數(shù)據(jù)公開政策的基金會也愈來愈多, 他們要求申請者在科研中公開數(shù)據(jù)。這些基金會包括美國國家科學基金會(the US National Science Foundation)以及一些慈善基金會(the Bill & Melinda Gates Foundation in Seattle, Washington, and the Wellcome Trust in London)。還有一些基金會目前對公開數(shù)據(jù)不作硬性要求, 但鼓勵人們這樣做。因此, 有人認為, 如果不走“開放科學、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”這條道路,今后做科學研究將會變得十分艱難(Gewin, 2016)。

        但是, 許多年輕人包括研究生與博士后還沒有決定是否接受數(shù)據(jù)共享。一方面是因為他/她們的老板才有選擇的權利, 因為老板為他/她們提供科研經(jīng)費; 另一方面, 人們擔心數(shù)據(jù)共享可能的副作用。例如, 數(shù)據(jù)共享后有可能會讓別人在科研上搶先一步做出成果; 公布數(shù)據(jù)后要回答來信詢問, 會花很多時間, 等等。提倡數(shù)據(jù)共享的人提醒說, 參與開放科學的人們有可能得到三種引用:引用數(shù)據(jù), 引用軟件和引用最后的文章。這些引用最終會導致好的名聲, 即知名度——這是申請基金和找工作的一個極為重要的條件。至于一些可能的副作用也不必擔心, 例如, 根據(jù)數(shù)據(jù)、軟件公布的時間是可以防止剽竊行為的; 在公布數(shù)據(jù)的同時附上怎樣使用數(shù)據(jù)的說明, 可以節(jié)約作者的許多時間。還有, 當前共享數(shù)據(jù)不存在什么技術障礙。例如, 線上的存儲庫如Fig Share或Zenodo使數(shù)據(jù)存儲愈來愈容易。

        “開放科學、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”的開放精神,源于當下科學研究的需要, 即改善科學的重現(xiàn)性。2015年在《科學》雜志上撰寫“促進期刊透明性和開放性的指南”的作者(Nosek, B. et al.2015), 就是在2015年在《科學》雜志上刊登實驗報告, 報道100項心理學實驗成功重現(xiàn)的不足1/2的作者(Open Science Collaboration, 2015), 這絕不是偶然的!因為心理科學研究重現(xiàn)性差的問題在科學界具有普遍意義??蒲邪l(fā)現(xiàn)必須能夠重復,它才能成為累積起來的科學知識, 成為科學長城中的一塊磚或是一顆沙粒; 科研發(fā)現(xiàn)如果不能重復, 它就會被拋棄掉。因此, 科學的進步既依賴創(chuàng)新也依賴重現(xiàn)(Open Science Collaboration, Science,2015)。而改善科學重現(xiàn)性的唯一方法就是提倡“開放科學、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”的開放精神, 這涉及科研人員, 學術期刊與出版社, 資助科研的基金會及各種學術團體, 以及公眾對科學的關注與參與, 可以說, 這就是當代的科學精神。

        心理學科學研究的重現(xiàn)性不佳, 更為迫切地要求公開數(shù)據(jù)(朱瀅, 伍錫洪, 2016)。為此,《Psychological Science》雜志采取措施鼓勵人們進行重復性研究。具體的做法是, 如果作者愿意,該雜志給某些文章貼上“公開數(shù)據(jù)”的標簽, 清楚地告訴讀者, 這些數(shù)據(jù)在哪里可以找到。據(jù)報道,從2013年到2015年貼有“公開數(shù)據(jù)”標簽的文章由10%增加到38%, 這也就是“數(shù)據(jù)共享”比例的增長。

        國內(nèi)心理學學者已經(jīng)開始對“開放科學”進行了有益的探索。如復旦大學心理系教授張學新與同行發(fā)起了學術期刊的“公評”審稿制度, 他們正在創(chuàng)辦由多個高校共建的雙語期刊《中國心理學家》(Chinese Psychologist)。這份期刊所發(fā)表的科研報告將在網(wǎng)上做公開評審, 作者也可以與評論者在網(wǎng)上展開相互討論(黃永明, 南方周末,2015?11?05)。中國科學院心理研究所研究員、副所長劉勛正在加緊建設一個網(wǎng)絡服務器平臺, 并設計移動客戶端與該平臺交換數(shù)據(jù), 包括大規(guī)模行為數(shù)據(jù)和腦成像數(shù)據(jù)。借此達到數(shù)據(jù)共享的目的, 推動心理學實驗任務的標準化(私人通信2016)。

        “開放科學、數(shù)據(jù)共享、軟件共享”依賴互聯(lián)網(wǎng)讓科學成為更多人的科學(有人稱為“公民科學” (citizen science)), 使科學更健康地發(fā)展。有人用一句話總結“開放科學”:“科學有問題, 但網(wǎng)絡可以修復” (Science has its problems, but the Web could be fix)。

        致謝:本文得到陸巖女士大力幫助, 在此表示感謝!

        朱瀅, 伍錫洪. (2016).《科學》和《自然》雜志 2015 年的兩篇心理學文章.心理科學, 39(2), 474?477.

        Gewin, V. (2016). An open mind on open data. Nature,529,117?119

        Nosek, B, et al. (2015). Supplementary materials for promoting an open research culture.Science, 348, 1422?1425. DOI:10. 1126/science.aab2734

        Open Science Collaboration. (2015). Estimating the reproducibility of psychological science.Science, 349,aac4716 DOI: 10. 1126/science.aac4716

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