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        長鏈非編碼RNA linc-STXBP5-1在宮頸癌中的表達(dá)及其干預(yù)效應(yīng)分析*

        2016-01-31 07:59:09鄒阮敏張文淼陳冠閣蘇華芳
        中國病理生理雜志 2016年6期
        關(guān)鍵詞:長鏈非編碼RNA

        鄒阮敏, 余 霞, 張文淼, 陳冠閣, 朱 華△, 蘇華芳

        (溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院1婦產(chǎn)科,2病理科,3放化療科,浙江 溫州 325000)

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        長鏈非編碼RNA linc-STXBP5-1在宮頸癌中的表達(dá)及其干預(yù)效應(yīng)分析*

        鄒阮敏1,余霞2,張文淼1,陳冠閣1,朱華1△,蘇華芳3△

        (溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院1婦產(chǎn)科,2病理科,3放化療科,浙江 溫州 325000)

        [摘要]目的: 檢測長鏈非編碼RNA linc-STXBP5-1在宮頸癌組織中的表達(dá)及意義,細(xì)胞學(xué)水平分析其對宮頸癌細(xì)胞活力及侵襲力的影響。方法: Real-time PCR檢測48例宮頸鱗癌組織、9例宮頸上皮內(nèi)瘤變(CIN)Ⅱ-Ⅲ、20例CINⅠ和20例正常宮頸組織 linc-STXBP5-1的表達(dá)水平;分析linc-STXBP5-1在不同病理級別和臨床分期宮頸鱗癌中的表達(dá)情況; linc-STXBP5-1 siRNA干預(yù)HPV16(+) SiHa宮頸癌細(xì)胞后,檢測細(xì)胞活力;Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)檢測沉默linc-STXBP5-1后SiHa宮頸癌細(xì)胞的侵襲能力;最后檢測linc-STXBP5-1在宮頸癌細(xì)胞胞漿及胞核的定位表達(dá)。結(jié)果: 宮頸鱗癌及CINⅡ-Ⅲ組織linc-STXBP5-1表達(dá)明顯高于CINⅠ及正常宮頸組織(P<0.05);宮頸鱗癌與CINⅡ-Ⅲ之間以及CINⅠ與正常宮頸組織間linc-STXBP5-1表達(dá)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性;linc-STXBP5-1表達(dá)與宮頸癌臨床病理分析顯示,病理分級屬于G3的宮頸鱗癌組織linc-STXBP5-1的表達(dá)量明顯高于G1、G2組織(P<0.05);臨床分期中屬于Ⅲ和Ⅳ期的宮頸鱗癌組織也明顯高于Ⅰ和Ⅱ期(P<0.05);linc-STXBP5-1表達(dá)水平與不同年齡、腫瘤直徑和腫瘤類型未見顯著相關(guān)性。利用siRNA下調(diào)SiHa宮頸癌細(xì)胞linc-STXBP5-1表達(dá)后,細(xì)胞活力和侵襲能力顯著降低;定位表達(dá)分析提示linc-STXBP5-1主要表達(dá)于宮頸癌細(xì)胞的細(xì)胞核中,僅有少許表達(dá)于細(xì)胞漿中。結(jié)論: 腫瘤組織上調(diào)表達(dá)的linc-STXBP5-1可作為促癌基因參與宮頸癌的發(fā)生發(fā)展過程。

        [關(guān)鍵詞]長鏈非編碼RNA; 宮頸癌; 細(xì)胞活力; 細(xì)胞侵襲

        非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),尤其是轉(zhuǎn)錄本長度超過200 nt的長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)與腫瘤的關(guān)系近年來受到重視。許多研究均證實(shí),異常表達(dá)的lncRNA參與了多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展進(jìn)程[1-2]。Linc-STXBP5-1是一條定位于Chr6:147480061-147502128、長度為453 nt的lncRNA。我們前期的lncRNA表達(dá)譜芯片檢測顯示,與正常宮頸組織比較,linc-STXBP5-1在宮頸癌組織中表達(dá)明顯上調(diào)。本研究進(jìn)一步檢測48例宮頸癌組織、19例宮頸上皮內(nèi)瘤變(cervical intraepithelial neoplasia, CIN)Ⅱ-Ⅲ、20例CINⅠ及20例正常宮頸組織linc-STXBP5-1的表達(dá),分析其表達(dá)與宮頸癌臨床病理特征的關(guān)系,并在細(xì)胞水平進(jìn)行干預(yù),分析細(xì)胞基本生物學(xué)特征的變化,探討其在宮頸癌發(fā)生、發(fā)展中可能的調(diào)控作用及意義。

        材料和方法

        1實(shí)驗(yàn)材料

        SiHa宮頸癌細(xì)胞株購自中科院上??茖W(xué)研究所細(xì)胞庫;DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清、Opti-MEM培養(yǎng)基、0.05% trypsin、脂質(zhì)體(Lipofectamine 2000) 和TRIzol試劑購自Invitrogen;ReverTra Ace逆轉(zhuǎn)錄試劑盒、SYBR Master Mix等購自Toyobo;胞核和胞漿蛋白提取試劑盒購自Thermo Fisher;Matrigel購自BD Bioscience;Transwell小室購自Costar;CCK-8試劑盒購自Dojindo。siRNA由上海吉瑪制藥技術(shù)有限公司設(shè)計(jì)并合成,引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成。

        2實(shí)驗(yàn)方法

        2.1標(biāo)本采集48例宮頸鱗癌組織取自溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院2012年1月~2014年9月就診患者,活檢取材,之前均未行手術(shù)和放、化療?;颊吣挲g34~70歲,中位年齡48.7歲。腫瘤直徑<4 cm 19例,≥4 cm 29例。腫瘤類型:外生型19例,內(nèi)生型15例,潰瘍型10例,頸管型4例。病理分級:G1 10例,G2 14例,G3 24例。臨床分期:按國際婦產(chǎn)科聯(lián)盟(FIGO)的分期標(biāo)準(zhǔn),Ⅰ期8例,Ⅱ期26例,Ⅲ~Ⅳ期14例。19例CINⅡ-Ⅲ患者年齡31~58歲,中位年齡45.6歲。20例CINⅠ患者年齡34~55歲,中位年齡41.4歲。另取同期年齡匹配的應(yīng)子宮肌瘤手術(shù)的正常宮頸組織20份作對照。標(biāo)本離體后30 min內(nèi)置于液氮保存。宮頸癌、CIN診斷及常規(guī)病理資料由2位病理科醫(yī)師盲法閱片后提供。

        2.2RNA的提取取液氮保存的組織標(biāo)本,在液氮中碾碎至粉狀,按TRIzol試劑說明書提取總RNA。為去除可能污染的DNA,抽提的RNA經(jīng)DNaseⅠ處理、酚-氯仿抽提后,純化的RNA以DEPC水溶解。利用Agilent 2100 Bioanalyzer檢測RNA濃度和完整性。 提取SiHa細(xì)胞RNA,依照胞漿胞核分離提取試劑盒操作。

        2.3Linc-STXBP5-1表達(dá)的檢測參照ReverTra Ace逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書,取4 μg總RNA以隨機(jī)引物(hexamer)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。反應(yīng)條件為42 ℃ 60 min、75 ℃ 15 min, 反應(yīng)結(jié)束后-20 ℃保存。以20 μL反應(yīng)體系進(jìn)行定量PCR檢測。表1為相關(guān)的引物序列。定量熒光PCR反應(yīng)體系包括1 μL 逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物、1×SYBR Green I Master Mix、0.5 μmol/L特異前向引物和0.5 μmol/L 特異反向引物。反應(yīng)條件為95 ℃ 2 min;95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,40 個(gè)循環(huán)。Real-time PCR使用ABI Step One儀器進(jìn)行。所有樣品做3復(fù)孔。根據(jù)待測標(biāo)本的Ct值,以GAPDH作為內(nèi)參照,采用2-ΔΔCt法計(jì)算目的基因表達(dá)。

        2.4Linc-STXBP5-1干預(yù)對細(xì)胞活力的檢測HPV16(+) SiHa宮頸癌細(xì)胞用含10%胎牛血清的DMEM高糖培養(yǎng)基, 置于37 ℃、含5% CO2飽和濕度培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng), 2~3 d傳代 1 次。狀態(tài)良好的細(xì)胞以每孔1×105細(xì)胞(100 μL)接種96孔板,linc-STXBP5-1 siRNA轉(zhuǎn)染細(xì)胞,設(shè)20 nmol、40 nmol/L和80 nmol/L 3個(gè)不同濃度的siRNA干預(yù)組、無關(guān)序列對照組及不含siRNA的空白組。按Lipofectamine 2000說明書轉(zhuǎn)染細(xì)胞。轉(zhuǎn)染48 h后,加入CCK-8溶液(每孔10 μL),繼續(xù)培養(yǎng)4 h。用酶標(biāo)儀測定在450 nm處的吸光度。

        2.5Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)檢測細(xì)胞的侵襲能力按Costar 24-Well TranswellTM說明書操作。將凍存于-20 ℃的Matrigel 4 ℃過夜預(yù)冷成液態(tài),無血清培養(yǎng)液將Matrigel冰上操作1∶1稀釋,混勻后加入Transwell小室,每孔15 μL。37 ℃包被1 h,無血清培養(yǎng)液洗3次后備用。消化SiHa細(xì)胞后用無血清培養(yǎng)液洗2次,計(jì)數(shù)。向上部培養(yǎng)嵌室內(nèi)加入細(xì)胞懸液(含1×105個(gè)細(xì)胞)并加入無血清DMEM稀釋至400 μL,每組設(shè)3個(gè)復(fù)孔。向底部培養(yǎng)室加入600 μL含15% FBS的DMEM完全培養(yǎng)液。37 ℃、5% CO2培養(yǎng)24 h。吸去嵌室內(nèi)的液體,用棉棒擦去嵌室底部內(nèi)表面上的細(xì)胞,將嵌室浸入固定液(50%甲醇)固定15 min,PBS洗3遍。結(jié)晶紫染色30 min。風(fēng)干后,熒光顯微鏡下每個(gè)培養(yǎng)孔隨機(jī)選擇6個(gè)視野拍照計(jì)數(shù)并計(jì)算每個(gè)視野的平均數(shù)。

        3統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

        采用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)處理。宮頸組織linc-STXBP5-1表達(dá)以中位數(shù)和四分位數(shù)間距表示,兩組間差異分析采用Mann-WhitneyU檢驗(yàn),多組差異表達(dá)分析采用Kruskal-WallisH檢驗(yàn);細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)表示,兩組間均數(shù)比較采用t檢驗(yàn),多組間均數(shù)比較采用單因素方差分析及Bonferroni檢驗(yàn)。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        結(jié)果

        1宮頸鱗癌、CIN及正常宮頸組織linc-STXBP5-1的表達(dá)

        以GAPDH為內(nèi)參照,linc-STXBP5-1在宮頸鱗癌、CINⅡ-Ⅲ、CINⅠ及正常宮頸組織中的相對表達(dá)量分別為16.73(3.92,28.49)、12.46(5.55,17.50)、4.46(0.91,7.21)和2.05(0.58,3.20)。秩和檢驗(yàn)結(jié)果表明,宮頸鱗癌及CINⅡ-Ⅲ的linc-STXBP5-1表達(dá)明顯高于CINⅠ及正常宮頸組織(P<0.05),且宮頸鱗癌與CINⅡ-Ⅲ之間以及CINⅠ與正常宮頸組織間linc-STXBP5-1表達(dá)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性,見圖1。

        Figure 1.Expression of linc-STXBP5-1 in cervical cancer (CC), CINⅡ-Ⅲ, CINⅠ and normal cervical (NC) tissues.*P<0.05vsnormal;#P<0.05vsCINⅠ.

        圖1宮頸鱗癌、CINⅡ-Ⅲ、CINⅠ及正常宮頸組織中l(wèi)inc-STXBP5-1的表達(dá)水平

        2Linc-STXBP5-1表達(dá)與宮頸鱗癌臨床病理特征相關(guān)性分析

        如表2 所示,linc-STXBP5-1表達(dá)在不同病理分級及臨床分期的宮頸鱗癌組織存在明顯差異(P<0.05),病理分級屬于G3的宮頸鱗癌組織linc-STXBP5-1的表達(dá)量明顯高于G1、G2組織(P<0.05);臨床分期中屬于Ⅲ和Ⅳ期的宮頸鱗癌組織也明顯高于Ⅰ和Ⅱ期(P<0.05)。Linc-STXBP5-1表達(dá)水平與不同年齡、腫瘤直徑和腫瘤類型未見顯著相關(guān)性。

        表2Linc-STXBP5-1表達(dá)與宮頸癌臨床病理因素的相關(guān)性分析

        Table 2.Correlation between clinicopathological features and linc-STXBP5-1 expression in 48 specimens

        *The data were presented as median and interquatile range.

        3沉默linc-STXBP5-1的對宮頸癌細(xì)胞惡性生物學(xué)行為的影響

        為分析linc-STXBP5-1的效應(yīng),本研究進(jìn)一步利用siRNA沉默HPV16(+) SiHa細(xì)胞株中l(wèi)inc-STXBP5-1表達(dá)。20、40和80 nmol/L siRNA干預(yù)均可明顯降低細(xì)胞內(nèi)linc-STXBP5-1的表達(dá)。40 nmol/L siRNA與50 nmol/L siRNA干擾效果差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,為此選擇40 nmol/L 進(jìn)行后續(xù)干預(yù)實(shí)驗(yàn)。如圖2所示,40 nmol/L siRNA干預(yù)后,CCK-8法檢測發(fā)現(xiàn)細(xì)胞活力顯著降低。如圖3所示,Transwell小室侵襲實(shí)驗(yàn)檢測遷移侵襲能力發(fā)現(xiàn),沉默linc-STXBP5-1可顯著降低細(xì)胞的侵襲能力。

        Figure 2. The viability of SiHa cells after by silencing of linc-STXBP5-1.Mean±SD.n=3.*P<0.05vsnormal control (NC).

        圖2沉默linc-STXBP5-1對SiHa細(xì)胞活力的影響

        Figure 3.The cell invasion after silencing of linc-STXBP5-1. Mean±SD.n=3.*P<0.05vsNC.

        圖3沉默linc-STXBP5-1對SiHa細(xì)胞侵襲能力的影響

        4Linc-STXBP5-1在宮頸癌細(xì)胞的定位表達(dá)分析

        利用胞漿胞核分離提取試劑盒,分別提取SiHa細(xì)胞的胞漿及胞核RNA,利用real-time PCR方法檢測linc-STXBP5-1的表達(dá)水平,如圖4,結(jié)果發(fā)現(xiàn)該lncRNA主要表達(dá)于細(xì)胞核中,僅有少許表達(dá)于細(xì)胞漿中。

        Figure 4.The subcellular localization of linc STXBP5-1 expressed in the SiHa cells. Mean±SD.n=3.*P<0.05vscytoplasm.

        圖4linc-STXBP5-1在SiHa細(xì)胞株中的亞細(xì)胞定位表達(dá)

        討論

        近年越來越多的研究表明,lncRNA在轉(zhuǎn)錄水平、轉(zhuǎn)錄后水平以及表觀遺傳等多個(gè)層面參與了X染色體沉默、基因組印記以及染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運(yùn)輸?shù)榷喾N重要的調(diào)控過程[3],異常表達(dá)的lncRNA不但是腫瘤特異標(biāo)記物,也可以作為腫瘤治療的分子靶點(diǎn)[4]。但lncRNA與宮頸癌關(guān)系的研究目前尚處于起步階段。有報(bào)道MALAT1、HOTAIR、CCHE1、CCAT2、CET、EBIC等lncRNA的上調(diào)表達(dá)和MEG3、LET及GAS5等的下調(diào)表達(dá)參與促進(jìn)宮頸癌的發(fā)生發(fā)展[5-10]。

        Linc-STXBP5-1是一條定位于人染色體6q24.3、長度為453 nt的典型基因間lncRNA[11]。其功能迄今尚未有相關(guān)研究報(bào)道。我們前期lncRNA表達(dá)譜芯片檢測顯示,與正常宮頸組織比較,linc-STXBP5-1在宮頸癌組織中表達(dá)明顯上調(diào)。本研究通過real-time PCR進(jìn)一步證實(shí)了芯片篩選的結(jié)果。分析其在CINⅡ-Ⅲ和CINⅠ組織表達(dá)顯示,linc-STXBP5-1不但在宮頸癌,而且在CINⅡ和Ⅲ的表達(dá)也明顯高于CINⅠ及正常宮頸組織。與宮頸癌臨床病理特征相關(guān)分析顯示,病理分級屬于G3的宮頸鱗癌組織linc-STXBP5-1的表達(dá)量明顯高于G1、G2組織,臨床分期中屬于Ⅲ和Ⅳ期的宮頸鱗癌組織明顯高于Ⅰ和Ⅱ期宮頸鱗癌組織。沉默宮頸癌細(xì)胞linc-STXBP5-1表達(dá)后,可顯著降低其活力及侵襲能力,提示linc-STXBP5-1是宮頸癌的一個(gè)新的促癌基因。既往的研究發(fā)現(xiàn),宮頸腫瘤組織上調(diào)表達(dá)的MALAT1和HOTAIR可促進(jìn)宮頸癌細(xì)胞活力、侵襲和遷移,可作為宮頸癌不良預(yù)后的一個(gè)生物標(biāo)志[9,12-15]。本研究發(fā)現(xiàn)的linc-STXBP5-1也將是一個(gè)新的宮頸癌診斷生物標(biāo)志及潛在的治療靶點(diǎn)。

        目前僅少數(shù)的lncRNA在宮頸癌中的作用機(jī)制被闡明。MALAT1可通過miR-124、miR-145及上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)分化等作用參與宮頸癌的發(fā)展[12,16-17],而HOTAIR不但可通過調(diào)節(jié)VEGF、MMP-9及其它EMT相關(guān)基因表達(dá)促進(jìn)宮頸癌細(xì)胞增殖遷移[13-15],而且可抑制p21促進(jìn)宮頸癌惡性表型和放射治療的抵抗[18]。但是,關(guān)于linc-STXBP5-1調(diào)控機(jī)制迄今尚無相關(guān)研究報(bào)道。本研究通過檢測細(xì)胞核和細(xì)胞漿中的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)linc-STXBP5-1主要分布于細(xì)胞核內(nèi)。研究顯示,約50%的lincRNA可通過招募多種染色質(zhì)修飾復(fù)合物,如PCR2蛋白復(fù)合體,發(fā)揮表觀遺傳學(xué)調(diào)控作用[19]。而基因組染色體上linc-STXBP5-1相鄰的區(qū)域含TCF21、SYNE1、AKAP12、IL20RA、ACAT2等高度甲基化的抑癌基因[20]。是否linc-STXBP5-1通過招募染色體修飾復(fù)合物影響其鄰近區(qū)域抑癌基因啟動(dòng)子區(qū)的表觀遺傳學(xué)調(diào)控有待進(jìn)一步研究。

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        (責(zé)任編輯: 林白霜, 羅森)

        Expression and intervention effect of long noncoding RNA linc-STXBP5-1 in cervical cancer

        ZOU Ruan-min1, YU Xia2, ZHANG Wen-miao1, CHEN Guan-ge1, ZHU Hua1, SU Hua-fang3

        (1DepartmentofObstetrics&Gynecology,2DepartmentofPathology,3DepartmentofRadiationOncology,TheFirstAffiliatedHospitalofWenzhouMedicalUniversity,Wenzhou325000,China.E-mail: 23444176@qq.com; 12602639@qq.com)

        [KEY WORDS]Long noncoding RNA; Cervical carcinoma; Cell viability; Cell invasion

        [ABSTRACT]AIM: To determine the expression of long noncoding RNA linc-STXBP5-1 in cervical cancer and its clinical significance, and to further explore its effect on the viability and invasion of cervical cancer cell line.METHODS: The expression levels of linc-STXBP5-1 in the cervical squamous-cell carcinoma tissues, cervical intraepithelial neoplasia (CIN)Ⅱ-Ⅲ, CINⅠ, and normal cervical tissues were detected by real-time PCR. The correlation between linc-STXBP5-1 expression and clinicopathological features of cervical cancer was further analyzed. Linc-STXBP5-1 knockdown was established by transfecting siRNA into human cervical cancer SiHa cells. The effect of linc-STXBP5-1 on cell viability and invasion ability was evaluated by CCK-8 assay and transwell assay, respectively. To determine the subcellular localization of linc-STXBP5-1 expression, the nuclear and cytoplasmic RNA fractions were isolated, and linc-STXBP5-1 expression was quantified by real-time PCR.RESULTS: Compared with CINⅠand normal cervical tissues, the level of linc-STXBP5-1 was significantly upregulated in the cervical squamous-cell carcinoma and CINⅡ-Ⅲ (P<0.05). No significant difference was observed either between the cervical squamous-cell carcinoma and CINⅡ-Ⅲ, or between CINⅠ and the normal cervical tissues. The clinical correlation analysis suggested that linc-STXBP5-1 expression in G3 cervical squamous-cell carcinoma tissues was obviously higher than that in G1 and G2 (P<0.05). At the same time, linc-STXBP5-1 expression in the cervical squamous-cell carcinoma with stage Ⅲ -Ⅳ was significantly higher than that with stage Ⅰ-Ⅱ (P<0.05). The expression level of linc-STXBP5-1 did not relate to age, tumor size and tumor type. Knockdown of linc-STXBP5-1 expression by siRNA reduced the viability and invasion in HPV16 (+) SiHa cervical cancer cells. Analysis of subcellular localization indicated that the transcript of linc-STXBP5-1 was mainly expressed in the nucleus of SiHa cells, rarely in cytoplasm. CONCLUSION: The upregulation of linc-STXBP5-1 expression may function as an oncogene in the development and progression of cervical carcinoma.

        [文章編號]1000- 4718(2016)06- 1127- 06

        [收稿日期]2016- 03- 24[修回日期] 2016- 04- 26

        *[基金項(xiàng)目]浙江省自然科學(xué)青年基金科研資助項(xiàng)目(No. LQ15C010002);溫州市科技局科研基金資助項(xiàng)目(No. Y20140308)

        通訊作者△Tel: 0577-88069216; E-mail: 朱華 23444176@qq.com; 蘇華芳 12602639@qq.com

        [中圖分類號]R730.23;R711.74

        [文獻(xiàn)標(biāo)志碼]A

        doi:10.3969/j.issn.1000- 4718.2016.06.028

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