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        浙江省非小細(xì)胞肺癌血液EGFR基因突變檢測(cè)專家共識(shí)

        2016-01-26 21:28:05浙江省抗癌協(xié)會(huì)抗癌藥物專業(yè)委員會(huì)專家組
        浙江醫(yī)學(xué) 2016年4期
        關(guān)鍵詞:基因突變血漿標(biāo)本

        浙江省抗癌協(xié)會(huì)抗癌藥物專業(yè)委員會(huì)專家組

        ●專家解讀

        浙江省非小細(xì)胞肺癌血液EGFR基因突變檢測(cè)專家共識(shí)

        浙江省抗癌協(xié)會(huì)抗癌藥物專業(yè)委員會(huì)專家組

        肺癌是目前我國(guó)發(fā)病率及死亡率最高的腫瘤,早期診斷、精準(zhǔn)治療、監(jiān)測(cè)復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移,對(duì)提高肺癌的整體治療水平和治療效果尤為重要。非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)約占所有肺癌的80%~85%,以表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)為靶點(diǎn)的小分子酪氨酸激酶抑制劑(TKI)為晚期NSCLC的治療帶來(lái)了新的曙光;而EGFR基因突變狀態(tài)是決定EGFR-TKI療效最重要的預(yù)測(cè)因子,檢測(cè)EGFR基因的突變狀態(tài)是決定患者是否能夠應(yīng)用EGFR-TKI治療的先決條件[1]。

        腫瘤組織樣本(手術(shù)、活檢、細(xì)胞蠟塊)是檢測(cè)晚期NSCLC EGFR突變狀態(tài)最適合的樣本來(lái)源。然而并非所有患者都能提供足夠的組織樣本,可通過(guò)經(jīng)支氣管鏡、經(jīng)皮肺穿刺活檢或胸腔積液標(biāo)本來(lái)進(jìn)行突變檢測(cè),但仍不能覆蓋所有晚期患者[2-3]。在IFUM研究中,僅19%的入組患者能夠到檢測(cè)腫瘤EGFR突變狀態(tài),無(wú)法檢測(cè)的原因包括:無(wú)法活檢,腫瘤組織樣本的質(zhì)量不合格或所含腫瘤細(xì)胞數(shù)量不夠等[4];組織標(biāo)本存在空間和時(shí)間的異質(zhì)性也給腫瘤基因的精準(zhǔn)檢測(cè)帶來(lái)了極大的挑戰(zhàn)。而近年來(lái)的研究顯示存在于外周血中的游離腫瘤DNA(ctDNA)與腫瘤組織基因組DNA具有極為相似的遺傳學(xué)特性[5-6],且在腫瘤患者中外周血ctDNA含量顯著高于健康人群。數(shù)據(jù)顯示血液EGFR檢測(cè)水平已經(jīng)接近組織檢測(cè)的水平,配對(duì)樣本檢測(cè)一致性在60%~95%之間[7]。2014年9月歐洲藥品管理局已批準(zhǔn)可采用ctDNA標(biāo)本來(lái)評(píng)估EGFR突變狀態(tài)。中國(guó)國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理局(CFDA)在2015年2月也已批準(zhǔn)Gefitinib說(shuō)明書(shū)更新,在推薦所有NSCLC患者的腫瘤組織都應(yīng)進(jìn)行EGFR突變檢測(cè)基礎(chǔ)上,補(bǔ)充了如果腫瘤標(biāo)本不可評(píng)估,則可使用從血液(血漿)標(biāo)本中獲得的ctDNA。

        血液ctDNA EGFR檢測(cè)具有無(wú)創(chuàng)、便捷、實(shí)時(shí)可獲取的特點(diǎn)能在一定程度上幫助解決組織樣本量不足、異質(zhì)性及反復(fù)動(dòng)態(tài)活檢的問(wèn)題。但目前血液ctDNA EGFR檢測(cè)尚存在臨床應(yīng)用范圍、適用人群、檢測(cè)方法等方面標(biāo)準(zhǔn)的不統(tǒng)一,如何有效合理的應(yīng)用血液EGFR檢測(cè)已成為臨床上亟待解決的問(wèn)題。2015年5月,浙江省抗癌協(xié)會(huì)抗癌藥物專業(yè)委員會(huì)在杭州組織我省相關(guān)領(lǐng)域?qū)<曳磸?fù)討論了針對(duì)目前血液檢測(cè)臨床應(yīng)用的幾個(gè)重點(diǎn)問(wèn)題,并就浙江省NSCLC血液EGFR基因突變檢測(cè)的每個(gè)問(wèn)題逐一討論并形成共識(shí),具體如下:

        1 哪一種方法更加適合血液樣本的EGFR檢測(cè)?

        目前已有許多血液EGFR基因突變檢測(cè)方法的報(bào)道,如高分辨熔點(diǎn)曲線分析法(HRM)、變性高效液相色譜技術(shù)(DHPLC)、突變擴(kuò)增阻遏系統(tǒng)(ARMS法)、數(shù)字PCR方法等[8-10]。不同血漿游離核酸EGFR檢測(cè)方法各有優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì)。

        HRM利用不同長(zhǎng)度DNA序列具備不同溶解曲線特性,擴(kuò)增后直接運(yùn)行高分辨溶解完成對(duì)樣本的突變分析,操作簡(jiǎn)單。然而其只能分析純度單一的小片段DNA,并要求有足夠的PCR模板才能得到穩(wěn)定可靠的結(jié)果。DHPLC基于發(fā)生錯(cuò)配的雜合與完全匹配的純合雙鏈DNA解鏈特征差異分離。但DHPLC不能檢測(cè)突變類型,結(jié)果判讀容易出錯(cuò),并且多個(gè)檢測(cè)步驟增加了工作量[11]。數(shù)字PCR在血漿EGFR突變檢測(cè)上具有較高的靈敏度和特異度[12-13],但目前報(bào)道的該方法檢測(cè)EGFR突變位點(diǎn)相對(duì)有限(19外顯子缺失,21號(hào)外顯子L858R突變以及20號(hào)外顯子T790M突變),仍處在摸索、累積經(jīng)驗(yàn)階段;其對(duì)操作人員和環(huán)境均有較高的要求,未來(lái)應(yīng)用于臨床尚需大規(guī)模臨床數(shù)據(jù)驗(yàn)證。以二代測(cè)序技術(shù)(NGS)為代表的新技術(shù)擴(kuò)展了基因突變檢測(cè)的深度和廣度[14],但其臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用更需要海量數(shù)據(jù)積累。

        目前成熟且常用檢測(cè)血液EGFR基因突變的方法是ARMS法,相比于腫瘤組織EGFR檢測(cè),該方法檢測(cè)血漿EGFR敏感型突變的靈敏度在65%~88%,特異度在90%~100%[15-17]。

        專家組推薦:檢測(cè)基因突變常用的方法是ARMS法,歐盟批準(zhǔn)用于指導(dǎo)Gefitinib治療的血液檢測(cè)方法也是ARMS檢測(cè)方法[15-17]。檢測(cè)方法必需都進(jìn)行嚴(yán)格的驗(yàn)證及質(zhì)控,檢測(cè)試劑須使用經(jīng)國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局(CFDA)批準(zhǔn)的檢測(cè)試劑盒。

        2 血液EGFR檢測(cè)能否替代組織樣本,還是作為一個(gè)補(bǔ)充方案?

        2.1 血液檢測(cè)與組織檢測(cè)的一致性 IFUM研究中ctDNA標(biāo)本檢測(cè)EGFR突變的高特異度(99.8%)和高靈敏度(65.7%)支持ctDNA可作為NSCLC患者EGFR基因突變檢測(cè)的樣本[16]。因此,歐洲藥品管理局2014年9月已批準(zhǔn)可采用ctDNA標(biāo)本評(píng)估EGFR突變狀態(tài),進(jìn)而鑒別出最可能從EGFR-TKI治療中受益的NSCLC患者[18]。Liu等[15]的研究發(fā)現(xiàn),與組織樣本相比,血漿EGFR基因突變檢測(cè)靈敏度為67.5%,特異度為100%;同時(shí),方法學(xué)比較顯示ARMS方法是檢測(cè)血漿中EGFR基因突變的最佳方法,該數(shù)據(jù)與IFUM研究結(jié)果一致。因此,中國(guó)國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理局在2015年2月已批準(zhǔn)Gefitinib說(shuō)明書(shū)更新。IGNITE研究表明幾乎一半的組織陽(yáng)性患者血漿中可以直接檢測(cè)到EGFR突變,NSCLC患者血漿中EGFR突變率腺癌為26.3%,非腺癌為6.9%[19]。

        2.2 血液EGFR突變狀況與臨床療效 IPASS研究中日本亞組人群血清ctDNA EGFR突變狀況(ARMS法)與臨床療效的研究數(shù)據(jù)提示,血清ctDNA EGFR突變陽(yáng)性的患者接受Gefitinib治療較標(biāo)準(zhǔn)化療的無(wú)進(jìn)展生存時(shí)間(PFS)顯著延長(zhǎng)(HR 0.29)[17]。歐洲IFUM研究也提供了在高加索人群基于血漿ctDNA EGFR突變陽(yáng)性的NSCLC患者(ARMS法)接受Gefitinib治療的療效證據(jù),在腫瘤組織陽(yáng)性,腫瘤組織和血漿標(biāo)本均陽(yáng)性及腫瘤組織陽(yáng)性而血漿標(biāo)本陰性3組中,其客觀緩解率分別為70%、76.9%、59.5%[16]。在FASTACT2研究中,血漿EGFR突變患者接受Erlotinib與化療聯(lián)合治療的客觀緩解率(74.6%、19.7%)和PFS(HR 0.21)均優(yōu)于單純化療組[20]。國(guó)內(nèi)一項(xiàng)230例晚期NSCLC患者的臨床觀察[21]及其他多項(xiàng)臨床研究都顯示血液標(biāo)本的EGFR突變對(duì)于預(yù)測(cè)靶向藥物治療的臨床獲益與組織突變者高度一致。

        專家組推薦:雖然血液檢測(cè)與組織樣本檢測(cè)一致性在60%~95%之間,血液EGFR檢測(cè)靈敏度尚有提升的空間,組織樣本檢測(cè)仍然是金標(biāo)準(zhǔn)。血液檢測(cè)用于篩選EGFR-TKI適治患者是重要補(bǔ)充,特別是對(duì)于沒(méi)有合適組織標(biāo)本供突變檢測(cè)的患者,可作為組織檢測(cè)的補(bǔ)充[16]。

        3 EGFR血液檢測(cè)適用于哪些NSCLC患者?

        血漿游離DNA在腫瘤患者中的含量高于健康人,這為血液檢測(cè)奠定了基礎(chǔ),Wang等[22]研究發(fā)現(xiàn)NSCLC和健康對(duì)照外周血中游離DNA含量分別為5.82ng/μl和4.37ng/μl(P<0.001)。但并非是所有患者都適用于血液EGFR檢測(cè),不同疾病分期患者的血液ctDNA含量是不同的。Bettegowda等[23]比較了不同期別腫瘤中ctDNA的檢出率,結(jié)果顯示Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期分別為47%、55%、69%和82%,相關(guān)系數(shù)0.337,這說(shuō)明ctDNA含量與腫瘤分期相關(guān)。而EGFR的豐度只有在ctDNA達(dá)到一定檢出限時(shí)才可以被檢測(cè)到,在Ⅲ期以下的患者檢測(cè)的靈敏度不高,因此最為適合的是Ⅲ~Ⅳ期患者。

        血液檢測(cè)可動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)EGFR基因突變的變化,特別是耐藥突變的出現(xiàn);Oxnard等[12]用數(shù)字PCR檢測(cè)NSCLC患者血漿T790M突變,檢測(cè)靈敏度為0.5%~0.05%,特異度為100%,可在影像學(xué)進(jìn)展前16周檢測(cè)出血漿T790M突變,并且與19號(hào)外顯子缺失突變量呈平行的變化關(guān)系。今年ASCO上Zheng等[24]報(bào)道了EGFR-TKI治療后耐藥的NSCLC患者外周血ctDNA中T790M突變的檢出率為47%,血液T790M的發(fā)現(xiàn)比臨床進(jìn)展提前了中位時(shí)間2.2個(gè)月。另外,今年ASCO上一項(xiàng)Rociletinib(Co-1686)治療血漿T790M陽(yáng)性患者療效的研究顯示血液T790M檢測(cè)與組織檢測(cè)一致性達(dá)到81%,具有良好的靈敏度與特異度。血漿T790M陽(yáng)性和陰性患者的ORR為53%、39%,無(wú)論是血漿T790M陽(yáng)性還是組織陽(yáng)性O(shè)RR均為53%,進(jìn)一步驗(yàn)證了血液檢測(cè)的穩(wěn)定性[25]。

        專家組推薦:初治患者方面,一般篩選條件是較晚期的,最好Ⅲ期以上,鑒于組織檢測(cè)為金標(biāo)準(zhǔn),考慮無(wú)組織標(biāo)本情況下再選擇血液檢測(cè)。對(duì)于經(jīng)治患者(或復(fù)發(fā)、PD),由于原先的組織樣本或前期的EGFR檢測(cè)結(jié)果對(duì)經(jīng)治后的腫瘤分子病理狀態(tài)缺少實(shí)時(shí)參考意義,且很難再取標(biāo)本,即可選擇血液檢測(cè),為患者爭(zhēng)取機(jī)會(huì)。早期患者,由于EGFR豐度低以及考慮現(xiàn)有的循證醫(yī)學(xué)證據(jù),不推薦血液EGFR檢測(cè)。但在早期監(jiān)測(cè)耐藥突變等臨床研究中,可考慮血液EGFR檢測(cè)。

        4 血液EGFR檢測(cè)的樣本收集和DNA提取

        全血中血漿和血清均能分離出ctDNA,但通過(guò)和相匹配的血清樣本比較,血漿中EGFR有更高的檢出率[26]。血漿ctDNA通常片段較短,且在血液中濃度通常非常低[27-28]。抽血后延遲血漿分離會(huì)導(dǎo)致血細(xì)胞裂解,釋放出基因組DNA(gDNA)至血漿中;大量增加的gDNA會(huì)稀釋腫瘤來(lái)源的ctDNA,使得突變難以檢出[29]。因此在標(biāo)本的采集、運(yùn)輸及儲(chǔ)存過(guò)程中,防止游離DNA的降解是首要考慮的因素;其次,也應(yīng)防止血液中白細(xì)胞的裂解,避免因野生型DNA背景的增加導(dǎo)致ctDNA中的突變DNA無(wú)法檢測(cè)出。

        專家組推薦:為了采集到最佳血漿標(biāo)本用于后續(xù)提取游離DNA及EGFR突變檢測(cè),建議使用如下兩種方法之一采集10ml全血并進(jìn)一步分離血漿:(1)用含有游離DNA保護(hù)劑及防細(xì)胞裂解保護(hù)劑的專用常溫采血管采集全血后輕搖混勻,常溫(6~30℃)放置不超過(guò)5~7d;以足夠的離心力將全血充分離心2次,從而分離出不含細(xì)胞成分的血漿,放置于-70℃凍存直至DNA抽提,或直接進(jìn)入DNA抽提步驟。(2)建議用常規(guī)EDTA抗凝管(嚴(yán)禁使用肝素抗凝管)采集全血后,2h內(nèi)以足夠的離心力將全血充分低溫離心兩次[29-30],分離出不含細(xì)胞成分的血漿,放置-70℃凍存直至DNA抽提,或直接進(jìn)入DNA抽提步驟。為保證ctDNA濃度,建議使用10ml全血分離出的血漿(4~5ml)。ctDNA的提取有很多方法,建議采用國(guó)家藥監(jiān)部門(mén)批準(zhǔn)的、大容量血漿游離DNA分離試劑盒。

        5 EGFR突變檢測(cè)質(zhì)控及報(bào)告

        為保證檢測(cè)結(jié)果的可靠性與報(bào)告的及時(shí)性,專家組推薦:EGFR基因突變的檢測(cè)須在符合臨床核酸擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)條件的實(shí)驗(yàn)室內(nèi)開(kāi)展,進(jìn)行檢測(cè)的操作人員必須是接受過(guò)培訓(xùn)且技能熟練的工作人員,持PCR培訓(xùn)合格證上崗,同時(shí)需要有質(zhì)量控制和質(zhì)量保證人員進(jìn)行質(zhì)控和監(jiān)督,以保證檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。為及時(shí)滿足臨床診治需求,建議各分子檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室從接收標(biāo)本到發(fā)出報(bào)告周期控制在5個(gè)工作日以內(nèi)。

        血液EGFR檢測(cè)的臨床應(yīng)用將會(huì)對(duì)NSCLC臨床診療策略帶來(lái)影響:(1)很多患者無(wú)法檢測(cè),初期無(wú)法進(jìn)行靶向治療。血液檢測(cè)可以擴(kuò)大受益人群,給患者一個(gè)受益的機(jī)會(huì)。(2)縮短診斷周期:專業(yè)化EGFR分子檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室,通過(guò)建立高效率的分子檢測(cè)平臺(tái),優(yōu)化流程,從接收標(biāo)本到發(fā)出報(bào)告周期,建議不超過(guò)5個(gè)工作日,以及時(shí)滿足臨床需求。血液檢測(cè)由于其便捷性,診斷周期或可縮短,利于臨床及時(shí)制定治療方案。(3)NSCLC患者在TKI治療過(guò)程當(dāng)中會(huì)發(fā)生耐藥,不少文獻(xiàn)報(bào)道甚至有多次藥物敏感、耐藥交替出現(xiàn)[31]。檢測(cè)不同時(shí)間的EGFR突變狀態(tài),發(fā)現(xiàn)各個(gè)時(shí)期不同的突變狀態(tài),進(jìn)行藥物靈敏度的預(yù)測(cè),及時(shí)使用合適的藥物。腫瘤不同時(shí)期、治療的不同階段,利用便捷的血液檢測(cè),動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)突變狀態(tài),調(diào)整治療方案,合適的時(shí)間將合適藥物用在合適的患者身上,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療,意義重大。

        6 小結(jié)

        液體活檢入選2015年十大突破技術(shù),腫瘤細(xì)胞在凋亡、壞死過(guò)程中,會(huì)釋放腫瘤DNA至血液中,成為血液用于腫瘤個(gè)體化診斷的理論基礎(chǔ)。血液檢測(cè)用于篩選EGFR-TKI適治患者是重要補(bǔ)充,特別對(duì)于沒(méi)有合適組織標(biāo)本供突變檢測(cè)的患者,可作為組織檢測(cè)的補(bǔ)充[16];血液檢測(cè)可動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)腫瘤標(biāo)志物變化,特別是耐藥突變的出現(xiàn)[12];血液檢測(cè)用于晚期NSCLC有望實(shí)現(xiàn),但對(duì)于早期NSCLC有待檢測(cè)技術(shù)不斷的發(fā)展和進(jìn)步。

        對(duì)于ctDNA,基于ARMS平臺(tái)優(yōu)化后的方法已有較為成熟的步驟應(yīng)用于臨床服務(wù);而具有高靈敏度的數(shù)字PCR方法目前檢測(cè)EGFR突變位點(diǎn)相對(duì)有限(19外顯子缺失,21號(hào)外顯子L858R突變以及20號(hào)外顯子T790M突變)[12-13]。以二代測(cè)序技術(shù)(NGS)為代表的新技術(shù)擴(kuò)展了基因突變檢測(cè)的深度和廣度[14],但其臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用更需要海量數(shù)據(jù)積累。在未來(lái),期待通過(guò)多元化基因檢測(cè)平臺(tái)及技術(shù)的不斷發(fā)展與成熟,血液EGFR基因突變檢測(cè)可實(shí)現(xiàn)從定性到定量檢測(cè)、從靜態(tài)至動(dòng)態(tài)檢測(cè)、從單基因到多基因、基因組/外顯子組檢測(cè),從而推動(dòng)NSCLC精準(zhǔn)靶向治療的不斷進(jìn)步。

        浙江省非小細(xì)胞肺癌血液EGFR基因突變檢測(cè)專家共識(shí),是在浙江省抗癌協(xié)會(huì)抗癌藥物專業(yè)委員會(huì)的倡導(dǎo)下,從臨床檢測(cè)的角度出發(fā),結(jié)合我國(guó)肺癌患者(約占全球1/3)眾多的現(xiàn)狀,綜合最新的研究數(shù)據(jù)和CFDA批準(zhǔn)的藥物和伴隨診斷方法,供臨床實(shí)踐參考。本專家共識(shí)將根據(jù)實(shí)際情況定期更新,期望能為未來(lái)進(jìn)一步優(yōu)化EGFR陽(yáng)性肺癌患者的診斷和治療提供指導(dǎo)。

        本版共識(shí)專家組成員(按姓氏排序):陳恩國(guó),浙江大學(xué)附屬邵逸夫醫(yī)院呼吸內(nèi)科;鄧清華,杭州市腫瘤醫(yī)院放療科;胡煒,臺(tái)州市中心醫(yī)院放療科;江洪,杭州市第一人民醫(yī)院胸外科;林能明:杭州市第一人民醫(yī)院藥學(xué)部;盧麗琴,浙江省人民醫(yī)院腫瘤內(nèi)科;馬勝林,杭州市第一人民醫(yī)院腫瘤科;潘月龍,杭州市腫瘤醫(yī)院腫瘤內(nèi)科;沈韋羽,寧波醫(yī)療中心李惠利醫(yī)院胸外科;王利民,杭州市第一人民醫(yī)院呼吸科;王建芳,紹興市人民醫(yī)院腫瘤內(nèi)科;謝聰穎,溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院放化療科;徐如君,杭州市第一人民醫(yī)院病理科;許頌霄,浙江大學(xué)附屬邵逸夫醫(yī)院病理科;夏冰,杭州市腫瘤醫(yī)院MDT中心;楊新妹,嘉興市第一醫(yī)院腫瘤內(nèi)科;周建英,浙江大學(xué)附屬第一醫(yī)院呼吸內(nèi)科;張沂平,浙江省腫瘤醫(yī)院腫瘤內(nèi)科;趙瓊,浙江大學(xué)附屬第一醫(yī)院肺移植及胸部腫瘤科;張仕蓉,杭州市第一人民醫(yī)院杭州市轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心

        執(zhí)筆:張仕蓉(E-mail:shirley4444@gmail.com),馬勝林(E-mail:mashenglin@medmail.com.cn)

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        2015-11-25)

        (本文編輯:嚴(yán)瑋雯)

        馬勝林,杭州市第一人民醫(yī)院,E-mail:mashenglin@ medmail.com.cn

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