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        埃博拉病毒傳染機(jī)制與研藥策略的數(shù)模分析

        2015-12-22 07:46:26紀(jì)元昕朱家明王茜瑤胡學(xué)峰
        關(guān)鍵詞:疫情模型

        紀(jì)元昕,朱家明,王茜瑤,胡學(xué)峰

        (安徽財(cái)經(jīng)大學(xué)統(tǒng)計(jì)與應(yīng)用數(shù)學(xué)學(xué)院;安徽蚌埠233030)

        埃博拉病毒經(jīng)歷了大爆發(fā)穿過非洲大陸在2014年,感染人數(shù)之多,死亡率之高引起了全球廣泛關(guān)注。同時(shí),埃博拉病毒的傳染居然周期爆發(fā)性,主要針對(duì)非洲一帶地區(qū)。因此研究埃博拉的傳染機(jī)制與內(nèi)在規(guī)律是進(jìn)一步抵制并消除病毒的必要前提[1-3];之后,是否應(yīng)研制藥物,研發(fā)周期與研藥量均是需要解決的問題;最后,政府如何選取制藥公司進(jìn)行低成本高水平的制藥開發(fā)是我們?cè)诩膊±碚摶A(chǔ)上展開實(shí)際解決方案的手段。

        1 埃博拉病毒傳染機(jī)制模型

        1.1 數(shù)據(jù)分析

        查找到Guinea,Liberia,Sierra Leone等國家感染人數(shù)各天累計(jì)的感染人數(shù)加和作為總體的患病情況,通過相關(guān)數(shù)據(jù)我們可以觀察到的是在該病毒從爆發(fā)到傳染的較長一段時(shí)間內(nèi)該病毒,該病毒滿足指數(shù)增長模型,該疫情被發(fā)現(xiàn)的前中期,因?yàn)槿狈Ρ匾尼t(yī)療手段和醫(yī)療常識(shí),該病毒的繁衍速度可近似看作是自然條件下種群的增長[4-6]。

        為了有效將時(shí)間進(jìn)行排序,定義2014年3月25日為發(fā)現(xiàn)疫情的第一天,以后分別按照天數(shù)間隔進(jìn)行排序,根據(jù)散點(diǎn)圖的大概走勢,猜測在前期及0~220 d之間,感染人數(shù)的增長趨勢呈指數(shù)增長,令:x(t)=x0ert對(duì)函數(shù)進(jìn)行擬合。

        兩邊同時(shí)取 ln,y=rt+a,y=ln x,a=ln x0,利用 Matlab 輸入相關(guān)數(shù)據(jù)處理得擬合函數(shù):y=0.02x+4.7,x0=109.95;所以有:

        做出在0~300內(nèi)的預(yù)測曲線和在真實(shí)變化趨勢。

        從圖1中可以看出基本上在0~255 d內(nèi),感染人數(shù)基本上呈指數(shù)增長型趨勢,但在255天以后真實(shí)的感染人數(shù)較指數(shù)增長明顯減緩,這從宏觀上說明埃博拉病毒的傳播速度在一定程度上受到了阻礙。

        1.2 模型建立

        結(jié)合阻滯增長模型和SIS模型進(jìn)行建模。

        在人類還沒有有效措施能夠制止埃博拉疫情的傳播并治愈已經(jīng)感染的病人時(shí),將埃博病毒的傳播看成是一個(gè)病毒種群在自然環(huán)境下的種群數(shù)量增長情況。因此可以運(yùn)用阻滯增長模型—logistic模型對(duì)其發(fā)展規(guī)律進(jìn)行研究。

        求出阻滯模型變化率曲線,得出在253 d時(shí)非洲三國埃博拉病毒的感染者增長率最大為320,大概從500 d開始,病人總數(shù)趨于穩(wěn)定,最大感染人數(shù)為40000人。

        現(xiàn)在針對(duì)三個(gè)國家的疫情在自然增長情況下分別進(jìn)行建模。從三個(gè)國家的患病人數(shù)與時(shí)間變化圖中,我們可以發(fā)現(xiàn)三個(gè)國家的感染情況基本符合阻滯增長的形式,這一點(diǎn)與總的趨勢也相同。三個(gè)國家的患病人數(shù)初始階段呈現(xiàn)指數(shù)增長模式,后來增加速度在250 d之后普遍出現(xiàn)變慢,這說明疫情在隔離,治療等相關(guān)措施下受到了一定控制。

        針對(duì)利比里亞,我們進(jìn)行作圖分析可得,見圖2,3。

        圖1 預(yù)測曲線與真實(shí)曲線比較圖

        圖2 利比內(nèi)亞感染人數(shù)變化圖

        圖3 利比內(nèi)亞患病增加率

        1.3 結(jié)果綜述

        從表中可看出,最早達(dá)到增長高峰的是幾內(nèi)亞為191 d,最遲的是塞拉利昂在256 d,按照患病前在人數(shù)的多少獲取權(quán)重進(jìn)行求和,研發(fā)期限最長為為244.35 d。

        表1 各國患病情況信息表

        2 藥物研發(fā)必要性判別

        2.1 研究思路

        為了研究是否有其他疾病需要新藥研制,我們選取該地區(qū)較為顯著的疾病種類:肺結(jié)核,艾滋病與馬來熱。根據(jù)這三種疾病在該階段內(nèi)的感染人數(shù),將其與埃博拉感染人數(shù)進(jìn)行比較判斷,進(jìn)行方差檢驗(yàn),若有顯著差異說明該種疾病需要新藥的救治。在對(duì)疾病進(jìn)行判斷之后,我們對(duì)各疾病每年感染人數(shù)提取異常值,即疾病未得到有效控制有進(jìn)一步爆發(fā)趨勢的年份,將其作為研制新藥的最遲開始時(shí)間,制藥期限以病情下次大爆發(fā)為界,進(jìn)行控制。

        2.2 模型建立

        由于在上一題中我們估測出了埃博拉病毒的感染人數(shù),且該估測是在無其他新藥開發(fā)的情況下得到的。因此在本題的求解中,我們可依據(jù)埃博拉病毒感染數(shù)作為基準(zhǔn)來研究其他疾病感染的波動(dòng)情況。由于疾病類型的復(fù)雜多樣,為了簡便計(jì)算,我們選取了烏干達(dá)地區(qū)較為顯著的三大類傳染性疾病:肺結(jié)核,艾滋病以及登革熱。肺結(jié)核與艾滋病數(shù)據(jù)較為完整齊全,而登革熱數(shù)據(jù)有所缺失,因此我們采用多項(xiàng)式擬合近似求的其他年份的感染數(shù)據(jù)。

        根據(jù)現(xiàn)有的2000到2008年的烏干達(dá)登革熱患病人數(shù),用多項(xiàng)式擬合出2009-2012年的患病人數(shù)。具體患病數(shù)見圖4。我們將登革熱患病人數(shù)與肺結(jié)核和艾滋病感染人數(shù)進(jìn)行簡單加權(quán)作為總體患病人數(shù)進(jìn)行綜合分析。此時(shí),為了判斷該階段是否需要研制新藥,可將整體的疫情數(shù)據(jù)與之前估測的埃博拉感染數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析檢驗(yàn),若有顯著差異,說明整體的疾病未如同埃博拉一般得到一定控制,而有持續(xù)爆發(fā)加重的趨勢,則需要研發(fā)新藥。若無顯著差異,則無需研制新藥。

        通過方差分析,得到:F=529.97,F(xiàn) 值較大,且 P=0<0.05,通過了顯著性檢驗(yàn),認(rèn)為兩個(gè)數(shù)據(jù)之間存在顯著性差異,即總體疾病疫情上有存在其他疾病肆虐的情況,需要研發(fā)新藥物進(jìn)行治療。

        對(duì)于藥物研制的最遲期限與可能的總產(chǎn)量,通過對(duì)每年的總體疾病感染人數(shù)進(jìn)行觀測,找出數(shù)據(jù)的異常波動(dòng)點(diǎn),作為研發(fā)開端的依據(jù),并將藥物研制周期控制在疾病的下一次異常爆發(fā)之前,使之得以投入市場,阻止疫情的下一次爆發(fā)。

        通過Matlab做出總體患傳染病人數(shù)的波動(dòng)圖,見圖5。

        由圖可看出,在2004年以前總體疾病人數(shù)趨于平緩,但在2004年開始突然大幅度增長,說明此時(shí)有新的疫情的爆發(fā),并為需研制新藥的最佳開始時(shí)間。

        圖4 登革熱患病率變化圖

        圖5 總患病人數(shù)波動(dòng)圖

        3 制藥公司的選取與合作

        3.1 原理分析

        考慮到公司聯(lián)合降低制藥要有效降低成本和風(fēng)險(xiǎn),就需要在一定公司范圍內(nèi)選取關(guān)于制藥過程中幾個(gè)花費(fèi)和風(fēng)險(xiǎn)最低的部分進(jìn)行組合,這些部分來源的公司便是最優(yōu)組合的公司。

        我們選取科研攻關(guān)能力a,原材料生產(chǎn)能力b,藥物檢驗(yàn)?zāi)芰,藥物后期跟蹤與反饋能力d。

        查閱文獻(xiàn)資料,給出如下四個(gè)指標(biāo)的計(jì)算公式:科研攻關(guān)能力a,原材料生產(chǎn)能力b,藥物檢驗(yàn)試驗(yàn)?zāi)芰,該公司資金流動(dòng)能力d,并研究這四個(gè)指標(biāo)對(duì)降低制藥成本和風(fēng)險(xiǎn)的影響。

        3.2 模型建立

        對(duì)任一制藥公司i,令x1為該公司科研部門人數(shù),X是該公司總?cè)藬?shù),平均研制一款新藥的速度v1,平均每年專利申請(qǐng)數(shù)t,可建立數(shù)學(xué)表達(dá)式:

        令y1為該公司近三年平均每年生產(chǎn)藥物量,Y為同年該型藥物研制總量,v2為平均生產(chǎn)一噸新藥速度:

        令ys為該公司該年生產(chǎn)實(shí)際銷售該種藥品總數(shù),y為該年該藥物生產(chǎn)量,v2為該公司檢驗(yàn)藥品科研人數(shù),

        令g,c分別為該年該公司近三年平均每年?duì)I業(yè)額和所有成本,r%為該公司營業(yè)額增長率,R為

        建立一種限制數(shù)量上不斷增長的方法:在選定的公司中如果對(duì)于一定范圍內(nèi)i=1,2…m…k(k≥m),隨著i的不斷增長T也不斷增長。

        首先對(duì)任意公司i求出其綜合能力:T=λ1ai+λ2bi+λ3ci+λ4di然后按照綜合能力排序 Tm>Tk>Tl>…>Tmin,按照從大到小的順序依次作出構(gòu)造一個(gè)在數(shù)量上隨著i增長 T 不斷增長的數(shù)列 y1,y2,y3…yn+k。求其增長速度 ρ,以及閾值η,在增長速度小于閾值時(shí)我們認(rèn)為此時(shí)增加公司的數(shù)目已經(jīng)沒有必要。

        因此,在滿足條件時(shí),選用公司組合進(jìn)行聯(lián)合制藥的效率最高。

        圖6 ρ變化圖

        4 結(jié)論

        以上各模型經(jīng)過各軟件的檢驗(yàn),具有一定的合理性。但同時(shí)模型的建立必須依靠必要的假設(shè),在本文中我們假設(shè)埃博拉病毒與其他疾病無交叉作用,并在第二題運(yùn)用第一題的埃博拉傳染病模型時(shí)忽略該病毒的周期性,因此與實(shí)際的疾病數(shù)會(huì)有偏差。綜上來說,我們依據(jù)埃博拉現(xiàn)有的感染病例數(shù)建立了較符合它傳播特征的傳染病模型。同時(shí)對(duì)藥物研發(fā)方面進(jìn)行了研究與推測,最后對(duì)制藥公司的評(píng)估與選擇提供了較新穎的理論方案。

        [1]Xinxin Wang,Shengqiang Liu.An epidemic model with different distributed latencies [J].Applied Mathematics and Computation 2014,241:259-266.

        [2]Li D,Gui C,Luo X.Impulsive Vaccination SEIR Model with Nonlinear Incidence Rate and Time Delay [J].MathematicalProblemsin Engineering,2013.

        [3]Buonomo B,d’Onofrio A,Lacitignola D.Modeling of pseudo-rational exemption to vaccination for SEIRdiseases[J].Journal of Mathematical Analysisand Applications,2013,404(2):385-398.

        [4]Zhang J,Jia J,Song X.Analysis of an SEIREpidemic Model with Saturated Incidence and Saturated Treatment Function[J].The Scientific World Journal,2014.

        [5]Liu M,Bai C,Wang K.Asymptotic stability of a two-group stochastic SEIRmodel with infinite delays[J].Communications in Nonlinear Scienceand Numerical Simulation,2014,19(10):3444-3453.

        [6]Wang X,Wei L,Zhang J.Dynamical analysisand perturbation solution of an SEIR epidemic model[J].Applied Mathematics and Computation,2014,232:479-486.

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