宋濤平 邱華麗 王淑娟 彭新凱 楊麗霞(長沙市食品質(zhì)量安全監(jiān)督檢測中心,湖南 長沙 410013)
近期中國衛(wèi)計(jì)委通報(bào)了2014年全國食物中毒事件情況,突發(fā)公共衛(wèi)生事件網(wǎng)絡(luò)直報(bào)系統(tǒng)全年共收到26個(gè)省份(含自治區(qū)、直轄市)食物中毒類突發(fā)公共衛(wèi)生事件報(bào)告160起,中毒人數(shù)5 657人,其中死亡人數(shù)110人;而微生物性食物中毒人數(shù)最多,占中毒人數(shù)67.7%;且微生物性食物中毒事件主要由沙門氏菌、金黃色葡萄球菌等引起[1]。在美國由金黃色葡萄球菌腸毒素引起的食物中毒事件也占到整個(gè)細(xì)菌性食物中毒事件的33%;加拿大更高達(dá)45%[2]。
金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是革蘭氏陽性菌,為全球最常見的食源性致病菌之一,其引起的食物中毒在細(xì)菌性食物中毒中占有較大比例[3]。人類因食用受其污染的肉、奶、魚、蛋類及其制品等食品而感染,主要會引起食物中毒及肺炎、心包炎、敗血癥等疾病[4-6]。金黃色葡萄球菌可在溫度7.0~48.5℃、pH 4.2~9.3及高鹽(高達(dá)15%NaCl)的環(huán)境條件下生存,這些特點(diǎn)皆有利于其污染不同的食品[7]。因此,建立快速、靈敏、可靠的食源性致病菌金黃色葡萄球菌的檢測方法,對預(yù)防和控制致病菌引起的中毒事件發(fā)生,增強(qiáng)食品安全性具有重要意義。
傳統(tǒng)致病菌檢測以生化培養(yǎng)檢測方法為主,檢測時(shí)間較長,且靈敏度較低。PCR技術(shù)靈敏度高、特異性強(qiáng),常被用于致病菌檢測,但需要后續(xù)電泳檢測,增加了污染的風(fēng)險(xiǎn)[8,9]。同時(shí),實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)也可用于致病菌檢測[10-12],但其設(shè)備、試劑昂貴,且需經(jīng)過專業(yè)培訓(xùn)的人員操作,對實(shí)驗(yàn)室環(huán)境條件的要求也較高,只有專業(yè)實(shí)驗(yàn)室才能具備上述條件,基層單位難以開展此類檢測。
環(huán) 介 導(dǎo) 等 溫 擴(kuò) 增 (loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技術(shù)是利用BstDNA聚合酶在60~65℃恒溫條件下完成核酸的擴(kuò)增[13]。BstDNA聚合酶在較高鎂離子濃度條件下,才具有5'→3'外切酶活性[14]。該酶80℃處理15min即可失活。在LAMP反應(yīng)中,需要針對靶基因的6個(gè)區(qū)域設(shè)計(jì)4種特異引物,在恒溫條件下進(jìn)行核酸擴(kuò)增[13]。環(huán)引物的加入可縮短反應(yīng)時(shí)間[15]。LAMP技術(shù)已廣泛應(yīng)用于致病菌的檢測,包括金黃色葡萄球菌[16]、大腸桿菌O157[17]、沙門 氏 菌[18,19]、副 溶 血 性 弧 菌[20,21]、綠 膿 假 單 胞菌[22]、單核細(xì) 胞 增 多 性 李 斯 特 菌[23]、阪 崎 腸 桿 菌[24]。 目 前已報(bào)道的LAMP技術(shù)主要是采用濁度儀或反應(yīng)后加入顯色劑,根據(jù)濁度或顏色的變化進(jìn)行結(jié)果判斷,濁度法需要較為貴重的濁度儀,而反應(yīng)后加入顯色劑SYBR GreenⅠ,開蓋容易造成氣溶膠污染,反應(yīng)前加入高濃度SYBR GreenⅠ對反應(yīng)有抑制作用。因此,急需建立一種更適合基層使用的反應(yīng)前加入顯色劑,且無需開蓋、無需大型儀器設(shè)備的LAMP擴(kuò)增技術(shù)。
本研究擬采用實(shí)時(shí)熒光LAMP技術(shù),根據(jù)擴(kuò)增時(shí)間和熒光強(qiáng)度篩選最佳引物組合,并最終運(yùn)用金屬離子指示劑羥基萘酚藍(lán)[25](hydroxy naphthol blue,HNB)判定反應(yīng)結(jié)果,使LAMP的結(jié)果判斷更簡單直觀,旨為建立適合在基層檢測單位推廣使用的金黃色葡萄球菌LAMP可視化快速檢測方法。
金黃色葡萄球菌、單增李斯特菌、大腸埃希氏桿菌、阪崎腸桿菌、銅綠假單胞菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌、糞腸球菌、副溶血性弧菌:美國典型菌種保藏中心(ATCC);
鼠傷寒沙門氏菌、蠟樣芽孢桿菌、β溶血性鏈球菌、志賀氏菌:中國醫(yī)學(xué)微生物菌種保藏管理中心(CMCC);
大腸埃希氏菌O157:H7:英國國家標(biāo)準(zhǔn)菌種保藏中心(NCTC);
金黃色葡萄球菌:由本實(shí)驗(yàn)室依據(jù)GB/T 4789.10—2010從食品中分離鑒定。
細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒:天根生化科技(北京)有限公司;
DNA等溫?cái)U(kuò)增試劑盒:廣州迪澳生物科技有限公司;
羥基萘酚藍(lán)(HNB):美國Sigma公司;
DL 1,000DNA Marker、Premix TaqTM:大連寶生物工程有限公司;
超微量核酸蛋白分析儀:BD1000型,北京五洲東方科技發(fā)展有限公司;
干式恒溫器:K30B型,杭州奧盛儀器有限公司;
實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀:7500FAST型,美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司。
按細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒使用說明書操作。
針對金黃色葡萄球菌的特異性基因nuc和femA,參照文獻(xiàn)[26]和SN/T 2754.1—2011中引物序列(見表1),合成2套LAMP引物,用于篩選最佳引物組合,引物由上海生工生物工程有限公司合成。
表1 引物序列Table 1 Sequences of primers
LAMP反應(yīng)體系25μL,包括:F3、B3濃度為0.2μmol/L,F(xiàn)IP、BIP濃度為1.6μmol/L,LB、LF濃度為0.3μmol/L(無環(huán)引物加雙蒸水補(bǔ)足體積),2×反應(yīng)緩沖液12.5μL,8UBst DNA聚合酶1μL,DNA模板2μL。將反應(yīng)體系于63℃恒溫反應(yīng)45min。實(shí)時(shí)熒光LAMP反應(yīng)體系中加SYTO-9熒光染料0.5μL,在實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀上完成反應(yīng);顯色法加3mmol/L HNB 0.5μL,在干式恒溫器上完成反應(yīng)。
將100ng/μL的金黃色葡萄球菌基因組DNA進(jìn)行10倍梯度稀釋,使得濃度梯度依次為100,10,1,0.1,0.01,0.001,0.000 1ng/μL。以此為模板進(jìn)行LAMP擴(kuò)增。平行進(jìn)行PCR法檢測金黃色葡萄球菌靈敏度的試驗(yàn),對比分析兩種方法的檢測靈敏度。PCR法反應(yīng)體系:2×Premix Taq 12.5μL,引物nuc-F3/nuc-B3(10μmol/L)各0.5μL,100ng DNA模版,補(bǔ)滅菌蒸餾水至25μL。反應(yīng)程序?yàn)?4℃5min;94℃30s,58℃30s,72℃30s共進(jìn)行35個(gè)循環(huán),最后72℃5min。
利用建立的LAMP法對表2中菌株的基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增,驗(yàn)證本方法的特異性。同時(shí),使用金黃色葡萄球菌可視化LAMP檢測法對按照GB/T 4789.10—2010的方法從肉類及蛋奶制品等樣品中分離得到的野生菌株進(jìn)行驗(yàn)證檢測,并平行進(jìn)行普通PCR檢測。
按上述反應(yīng)體系,以金黃色葡萄球菌DNA為模板,運(yùn)用2套LAMP引物分別進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光LAMP擴(kuò)增,比較其擴(kuò)增效率篩選最佳引物組合,圖1為最佳引物篩選結(jié)果。由圖1可知,nuc、femA引物組的擴(kuò)增出峰時(shí)間分別為11.7,31.6min,而nuc引物組的擴(kuò)增熒光強(qiáng)度明顯高于femA引物組。因此選擇nuc引物組進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。
在反應(yīng)前加入HNB作為LAMP擴(kuò)增的指示劑,根據(jù)HNB的顏色變化進(jìn)行結(jié)果判定,陽性呈天藍(lán)色,陰性為紫羅蘭色。用nuc引物組,以金黃色葡萄球菌DNA為模板,用去離子水進(jìn)行10倍系列稀釋,分別進(jìn)行LAMP、PCR法檢測,比較兩者靈敏度,結(jié)果見圖2。由圖2可知,LAMP法和PCR法靈敏度基本相同,都可以達(dá)到0.001ng/μL,但PCR法在0.001ng/μL的電泳條帶較弱。
圖1 最佳引物篩選Figure 1 Screening the best primers
圖2 金黃色葡萄球菌檢測靈敏度結(jié)果Figure 2 Detection sensitivity of Staphylococcus aureus
從試驗(yàn)易操作性、結(jié)果判定直觀角度考慮,LAMP可視化檢測法更適合現(xiàn)場快速檢測。
利用建立的金黃色葡萄球菌LAMP法對表2中的13個(gè)種類共計(jì)27株細(xì)菌進(jìn)行特異性試驗(yàn),采用去離子水作為陰性對照。其中15株金黃色葡萄球菌為LAMP陽性結(jié)果、其他菌為陰性結(jié)果,與平行進(jìn)行的普通PCR法檢測結(jié)果一致,表明本試驗(yàn)所用的LAMP引物具有高度特異性。
表2 特異性分析結(jié)果Table 2 Results of LAMP specific amplification
本研究通過實(shí)時(shí)熒光LAMP法對金黃色葡萄球菌的2套LAMP引物進(jìn)行篩選,比較其出峰時(shí)間、熒光強(qiáng)度確定最佳引物組合。采用在反應(yīng)前添加金屬離子指示劑HNB,通過肉眼直接觀察顏色變化進(jìn)行判定,若反應(yīng)液由紫羅蘭變?yōu)樘焖{(lán)色,即為陽性。本試驗(yàn)建立了金黃色葡萄球菌可視化LAMP反應(yīng)體系,檢測靈敏度為0.001ng/μL,與普通PCR相當(dāng),且特異性良好,與其他種類的致病菌無交叉反應(yīng)。HNB作為LAMP反應(yīng)顯色劑,結(jié)果易于識別,且與普通PCR一致,說明基于HNB染料的LAMP檢測結(jié)果可信。
本研究建立了金黃色葡萄球菌可視化快速檢測方法,在63℃恒溫條件下反應(yīng)45min便可直接判定結(jié)果,無需特殊儀器設(shè)備,簡便易行,可用于食品安全現(xiàn)場監(jiān)督檢驗(yàn)和基層快速檢測。
1 中華人民共和國國家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會.國家衛(wèi)生計(jì)生委辦公廳關(guān)于2014年全國食物中毒事件情況的通報(bào)[EB/OL].(2015—02—15)[2015-05-11].http://www.nhfpc.gov.cn/yjb/s3585/201502/91fa4b047e984d3a89c16194722ee9f2.shtml.
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