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        改進(jìn)的分水嶺算法用于X光醫(yī)學(xué)圖像分割

        2015-12-18 13:17:18橙,陳
        電子科技 2015年6期
        關(guān)鍵詞:分水嶺灰度預(yù)處理

        戴 橙,陳 勝

        (上海理工大學(xué)光電信息與計算機學(xué)院,上海 200093)

        醫(yī)學(xué)圖像包含病變區(qū)域和背景區(qū)域,對醫(yī)生來說,病變區(qū)域包含了重要價值的診斷信息,盡管病變區(qū)域在整個圖像中所占的面積小,提取代價高,但價值也高。因此,分割病變區(qū)域一直是醫(yī)學(xué)圖像處理的重要環(huán)節(jié)。目前用于圖像分割的算法有多種,但還沒有一種適用于醫(yī)學(xué)界的可靠圖像分割方法,主要原因是醫(yī)學(xué)圖像的復(fù)雜性和多樣性。

        分水嶺算法最早由Beucher S和 Vincen L提出[2-3],它是基于一種數(shù)字形態(tài)學(xué)理論的分水嶺算法(Watershed),由于它簡單、直觀、速度快可并行處理,對微弱的邊緣信息敏感,且可得到單像素、連通、位置準(zhǔn)確的輪廊,因此,近年來,風(fēng)水嶺算法已經(jīng)得到了廣泛應(yīng)用。但同時該方法又有一些嚴(yán)重的缺點,它對噪聲敏感,且容易造成過分割的問題。通??朔@些問題的方法有兩種:(1)在引用分水嶺算法前對圖像進(jìn)行預(yù)處理。(2)是在引用分水嶺算法后通過一定的合并方法對圖像小區(qū)域進(jìn)行合并整合[4-5]。

        很多學(xué)者對此做了相關(guān)研究。文獻(xiàn)[6]提出了一種分水嶺變換后進(jìn)行基于空間模式聚類算法合并方案的分水嶺算法;文獻(xiàn)[7]提出了一種自適應(yīng)標(biāo)記提取的分水嶺分割算法。但由于醫(yī)學(xué)圖像的固有特性,分割結(jié)果并不理想。

        本文綜合醫(yī)學(xué)圖像中病變區(qū)域的獨特特點,在現(xiàn)有分水嶺算法的基礎(chǔ)上做了改進(jìn):(1)在引用分水嶺算法前,通過一個有效的最小閾值分離ROI的背景和前景,去除背景非病變區(qū)域;然后用二值形態(tài)學(xué)腐蝕運算處理前景區(qū),等到大量的連接與非連接區(qū),并根據(jù)標(biāo)記像素點保留連接區(qū);最后用膨脹運算處理連接區(qū)域,得到重建后的候選區(qū)圖像。(2)用傳統(tǒng)的分水嶺算法分割圖像后,候選區(qū)被分割成若干個像素區(qū)域,通過像素聚類合并準(zhǔn)則把與主像素類有相同特性的次像素聚類加入到分割結(jié)果中,實現(xiàn)分割區(qū)域的有效合并,取得了良好的效果。圖1為本文的算法分割流程。

        圖1 算法分割流程圖

        1 圖像分割前的預(yù)處理

        選取一張包含病變區(qū)域的待分割的感興趣區(qū)域圖像(Region of Interesting,ROI),ROI圖像已經(jīng)經(jīng)過前期處理,包括對病變區(qū)域的中心點像素標(biāo)記。在引用分水嶺算法前,先對待ROI圖像進(jìn)行一定的預(yù)處理,對圖像進(jìn)行預(yù)處理主要還是避免過分割的問題。本文對輸入圖像的預(yù)處理包含2個步驟:(1)最小閾值法處理ROI。(2)二值形態(tài)學(xué)腐蝕和膨脹運算得到侯選區(qū)。

        1.1 最小閾值法

        閾值分割法是圖像分割中的一種重要分割算法。由于圖像閾值處理的直觀性和易于實現(xiàn)的特點,以及閾值分割總能用封閉而連通的邊界定義不交疊的區(qū)域,使得閾值化分割算法成為圖像分割中較為常見的分割方法之一。它特別適合于目標(biāo)和背景占據(jù)不同灰度級范圍的圖像。

        最小閾值法是一種簡單、易于實現(xiàn)的圖像分割技術(shù)。其原理是利用圖像目標(biāo)區(qū)域與背景區(qū)域的灰度值不同,在選取一個合適的最小閾值后,通過灰度圖像中的每個灰度值與此閾值進(jìn)行逐一比較,從而把圖像分為不同灰度級的兩類。由于前景區(qū)中包含有重要信息的病變區(qū)域,在去除ROI中非病變區(qū)域時要保證病變區(qū)域信息不丟失,這里設(shè)定的最小閾值T1起了關(guān)鍵性的作用,可以明顯改善病變區(qū)域的面積大小。

        輸入圖像是一幅處理后的灰度圖像,其每個點的像素值表示為S(i,j),在選取合適的閾值T1后,通過簡單的數(shù)值比較算法,其算法為

        式中,若像素值s(i,j)大于最小閾值T1,則將保存此像素值,并把其標(biāo)記為1。反之若小于閾值T1,則標(biāo)記為0,最終把這些保存下來的全部像素顯示,得到前景圖像,即輸出圖像 D(i,j)。

        1.2 形態(tài)學(xué)的腐蝕和膨脹運算

        圖像形態(tài)學(xué)的變換不得不涉及到圖像處理中最常用到的兩個圖像運算:腐蝕和膨脹[8],這兩種操作是形態(tài)學(xué)處理的基礎(chǔ),幾乎大部分形態(tài)學(xué)運算都是由這兩種基本的算法組合而成。

        在形態(tài)學(xué)的著述中,關(guān)于腐蝕的定義:若A和B為Z中的集合,使用B對A進(jìn)行腐蝕,可用表示為

        式(2)表明,使用B對A進(jìn)行腐蝕就是所有的B中包含于A中的點Z的集合用Z平移。式(2)并不是腐蝕唯一的定義形式,但在形態(tài)學(xué)實際應(yīng)用過程中,此公式運用更為頻繁。如圖2顯示了腐蝕的過程。

        圖2 腐蝕的過程

        膨脹可以看作是腐蝕的對偶運算,關(guān)于膨脹的定義也不唯一。如果A和B是Z2中的集合,A被B膨脹定義為

        式(3)是以得到B的相對它自身原點的映像,并且進(jìn)行位移為基礎(chǔ)的。把結(jié)構(gòu)元素B看成是一個卷積模板時,這種定義方式更直觀。盡管膨脹以集合運算為基礎(chǔ),卷積以算術(shù)運算為基礎(chǔ),但相對與B的原點對B進(jìn)行翻轉(zhuǎn),而后逐步移動B以便B能滑過集合A,如圖3顯示了膨脹的過程。

        圖3 膨脹的過程

        為了進(jìn)一步去除前景區(qū)中不需要的信息,還需對前景區(qū)進(jìn)行腐蝕運算。對前景區(qū)進(jìn)行腐蝕運算處理后會得到大量的連通與非連通區(qū)域,因為連通區(qū)域中包含病變區(qū),根據(jù)之前標(biāo)記的病變區(qū)域像素點,定位到這片連接區(qū),然后保留那片連接區(qū)域,去除不屬于該連接區(qū)域的部分;由于對圖像進(jìn)行了腐蝕操作,病變區(qū)域有可能丟失一部分,因此還需對該連接區(qū)域用膨脹運算來處理,以此還原分割區(qū)域的大小,保證病變區(qū)域的大小不變,最終得到將要分割的粗略候選區(qū)。

        2 改進(jìn)的分水嶺算法

        傳統(tǒng)風(fēng)水嶺算法的基本思想是:將一幅灰度圖像看成是一座有山峰和山谷的模擬盆地,灰度圖像中灰度值高則看成是盆地的山峰,灰度值較低的則看成是山谷,然后對其進(jìn)行模擬水侵。模擬水侵可以看作是注水的過程。假設(shè)在盆地的每個山谷最低處存在一個水源,然后水慢慢從底部往上面上升,在水上升的過程中,如果碰到兩個屬于不同盆地的水源將要匯合,則在其兩個水源的中間出建立一個水壩,直至水位上升到把全部的山脈淹沒,只剩下水壩。最終水壩連接形成了一個個區(qū)域,即分水嶺[9]。盡管分水嶺算法可得到單像素、連通、位置準(zhǔn)確的輪廊,但傳統(tǒng)的分水嶺存在一個嚴(yán)重的問題,那就是過分割現(xiàn)象,它會把圖像中的單一目標(biāo)分割成兩個甚至多個區(qū)域,因此在分水嶺變換后,往往需要對分割后的圖像進(jìn)行區(qū)域的合并操作。為了有效解決過分割現(xiàn)象,提高分割的精確性,本文運用一種改進(jìn)的分水嶺算法,采用一種聚類合并技術(shù)。

        由于灰度醫(yī)學(xué)圖像中病變區(qū)的像素點其灰度值往往比周圍非病變區(qū)灰度值小,亮度亮,因此,在分水嶺算法應(yīng)用于醫(yī)學(xué)圖像前,對輸入圖像進(jìn)行灰度值的反轉(zhuǎn)。本文算法具體的步驟是:首先,反轉(zhuǎn)候選區(qū)圖像的灰度值,使相應(yīng)的山峰變成山谷,便于檢測病變區(qū)域。然后先用傳統(tǒng)的分水嶺算法處理此圖像,把候選區(qū)分成多個集水盆地。這樣候選區(qū)中每個最小值點都被集水盆包圍,即出現(xiàn)一個或多個波谷被可構(gòu)成匯水盆地的連接像素聚類包圍。最后,對分割的區(qū)域圖像再次反轉(zhuǎn),使得相應(yīng)的聚水盆底變成山峰。緊接著對病變候選區(qū)進(jìn)行像素聚類的檢測合并操作,其合并遵循如下方法:(1)在分割后的一個個像素聚類中,如果某個聚類包含有病變區(qū)域的像素標(biāo)記點,則將此像素聚類定義為主聚類。(2)通過合并準(zhǔn)則來判斷與主聚類相鄰的聚類是否有相同特性,從而決定是否把這些相鄰的聚類包含至主聚類中實現(xiàn)合并。

        首先對合并方法(2)中的合并準(zhǔn)則進(jìn)行說明。假設(shè)如圖4(a)是傳統(tǒng)分水嶺變換后圖像,算法將圖像分成多個聚水盆地,圖中1,2,3區(qū)域。再次將變換后的圖像進(jìn)行灰度值的反轉(zhuǎn),可得得到對應(yīng)圖4(a)圖反轉(zhuǎn)的圖像,如圖4(b)所示結(jié)果。

        圖4 算法分割的結(jié)果

        如圖4(b)所示,每個山峰對應(yīng)存在一個峰值為P1,P2,P3在峰值之間必存在一個極小值,如在 P1和P2之間存在Min1,在P2與P3之間存在Min2,定義合并準(zhǔn)則如下通過極小值Min與閾值T2進(jìn)行比較,如果極小值Min大于給定的閾值T2,則認(rèn)為,這個次像素聚類與主像素聚類相鄰并具有相同的特性,滿足合并準(zhǔn)則,可以實現(xiàn)合并。如果Min比T2大,則視為不滿足條件,將其聚類刪除。最終,得到分割好后的結(jié)果只包含1,2兩個區(qū)域。

        3 試驗結(jié)果與分析

        為驗證本文試驗結(jié)果的準(zhǔn)確性,本文運用此改進(jìn)的分水嶺算法來分割胸部X光的肺結(jié)節(jié)病變區(qū)域圖像。首先選取了一張經(jīng)過CAD處理,已標(biāo)記出肺結(jié)節(jié)病變區(qū)域的圖像,如圖5(a)所示;然后對感興趣區(qū)域圖像進(jìn)行圖像的一個預(yù)處理。本文選取最小閾值T1為5個像素值,對圖像進(jìn)行最小閾值法的處理后得到圖像如圖5(b)所示。用7×7的方形結(jié)構(gòu)元素模板對圖5(b)進(jìn)行腐蝕運算得到結(jié)果如圖5(c)所示,根據(jù)之前標(biāo)記在病變區(qū)域中的像素點,保留該片連接區(qū)如圖5(d)。同樣用7×7的方形結(jié)構(gòu)模板對得到的連接區(qū)進(jìn)行腐蝕操作,得到如圖5(e)所示的候選區(qū)域,完成圖像的預(yù)處理工作。最后運用本文改進(jìn)的分水嶺算法對候選區(qū)進(jìn)行分割和聚類合并,得到終極分割的肺結(jié)節(jié)圖像如圖5(f)所示。

        圖5 肺結(jié)節(jié)分割圖

        圖像分割結(jié)果的好壞目前沒有統(tǒng)一的評價標(biāo)準(zhǔn),但通常以金標(biāo)準(zhǔn)圖像作為參考,由于各病變區(qū)域不同,目前所謂金標(biāo)準(zhǔn)圖像都是由相關(guān)專業(yè)的醫(yī)生給出。因此,為了說明本文改進(jìn)分水嶺算法的精確性和有效性,本文選擇醫(yī)院放射科的相關(guān)醫(yī)生畫出的肺結(jié)節(jié)圖像作為金標(biāo)準(zhǔn)圖像。從試驗結(jié)果來看,傳統(tǒng)分水嶺算法得到的分割區(qū)域雖然準(zhǔn)確包含了肺結(jié)節(jié),但其面積卻比金標(biāo)準(zhǔn)圖像大很多,其精確性不高。而本文算法得到的結(jié)果更接近金標(biāo)準(zhǔn)圖像,其精確度更高。從有效性來看,本文的改進(jìn)算法在分水嶺變換前對圖像進(jìn)行預(yù)處理,大幅簡化了圖像處理面積,減少了分割的復(fù)雜性,使得分割的處理時間較快,避免了分割時算法還需要識別大量偽區(qū)域情況,較好地保留了肺結(jié)節(jié)輪廓信息。之后運用改進(jìn)的分水嶺算法,得到肺結(jié)節(jié)圖像的分割結(jié)果,區(qū)域輪廓數(shù)目明顯減少,使得算法更加有效。圖6為最終結(jié)果圖,圖6(a)為傳統(tǒng)分水嶺變換得到的結(jié)果圖像,圖6(b)是本文算法得到的結(jié)果圖像,圖6(c)是專家給出的金標(biāo)準(zhǔn)圖像。

        圖6 最終結(jié)果圖

        4 結(jié)束語

        本文提出了一種改進(jìn)的分水嶺分割方法。首先對輸入圖像進(jìn)行預(yù)處理,簡化圖像處理的面積,包括最小閾值法,腐蝕運算精簡待處理的圖像,膨脹運算對精簡圖像進(jìn)行重建得到候選區(qū)。最后對候選區(qū)運用改進(jìn)的分水嶺算法進(jìn)行分割、合并操作,有效地減輕了過分割問題,得到較為精確的病變區(qū)域輪廓圖像。本文算法具有快速和精度較高等特點,該方法能夠較好地抑制過分割,具有良好的分割效果。

        但本文的方法還存在一些缺點和不足,如得到的分割結(jié)果還不夠理想,分割結(jié)果可能存在漏包含肺結(jié)節(jié)病變區(qū)域。未來的工作將著眼于:(1)改善文中算法,如改進(jìn)算法前的預(yù)處理,或算法后的合并準(zhǔn)則,使算法更加的可靠和精確,分割結(jié)果更加接近金標(biāo)準(zhǔn)圖像。(2)拓展文中算法的圖像應(yīng)用范圍,使得本文的算法除了應(yīng)用于X光醫(yī)學(xué)圖像,還可應(yīng)用于CT圖像,甚至非醫(yī)學(xué)圖像。

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