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        靶向沉默轉(zhuǎn)化生長因子β1表達(dá)的短發(fā)夾RNA的篩選*

        2015-12-04 07:28:42李新強(qiáng)付琳琳唐小燕付素珍
        關(guān)鍵詞:真核高糖腎小管

        李 敏,李新強(qiáng),付琳琳,吳 余,王 虹,唐小燕,付素珍#

        1)新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院兒內(nèi)科 衛(wèi)輝453100 2)新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院病理學(xué)教研室 新鄉(xiāng)453003

        腎臟纖維化是所有慢性腎臟疾病發(fā)展至腎功能衰竭的共同通路,其中腎小管-腎間質(zhì)纖維化以細(xì)胞外基質(zhì)(extracellular matrix,ECM)的過度沉積為主要病理特征[1]。腎小管上皮細(xì)胞-間充質(zhì)轉(zhuǎn)分化(epithelial to mesenchymal transition,EMT)與腎小管-腎間質(zhì)纖維化密切相關(guān)。轉(zhuǎn)化生長因子β1(transforming growth factor β1,TGF-β1)在腎小管上皮細(xì)胞EMT 過程中發(fā)揮重要作用,是目前公認(rèn)的有效的促纖維化因子[2]。因此,抑制TGF-β1 的表達(dá)對于防治腎小管-腎間質(zhì)纖維化具有重要意義。作者擬覆蓋TGF-β1 基因cDNA 全長,設(shè)計和篩選靶向沉默TGF-β1 表達(dá)的短發(fā)夾RNA(short hairpin RNA,shRNA),以期為進(jìn)一步研究參與TGF-β1 誘導(dǎo)腎小管-腎間質(zhì)纖維化的下游分子奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料 人腎小管上皮細(xì)胞株HKC 購自中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院細(xì)胞庫,p-Genesil-1 空載質(zhì)粒和E.coli DH 5α 大腸桿菌為新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院病理學(xué)教研室保存,BamHⅠ限制性內(nèi)切酶、HindⅢ限制性內(nèi)切酶、SalⅠ限制性內(nèi)切酶、T4 DNA 連接酶均為大連TaKaRa 公司產(chǎn)品,D-葡萄糖為美國Aladdin 公司產(chǎn)品,兔抗TGF-β1 多克隆抗體為美國Abcam 公司產(chǎn)品,鼠抗人β-actin 單克隆抗體、辣根酶標(biāo)記的山羊抗兔和辣根酶標(biāo)記的兔抗鼠二抗為美國Santa Cruz 公司產(chǎn)品,增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光試劑盒為武漢博士德公司產(chǎn)品。

        1.2 靶向沉默TGF-β1 表達(dá)的shRNA 的設(shè)計和制備 按照siRNA 設(shè)計原則,覆蓋TGF-β1 基因cDNA全長,設(shè)計靶向沉默TGF-β1 的shRNA 5 條(表1),并進(jìn)行同源性分析。shRNA 的DNA 序列送大連TaKaRa 公司合成并退火。

        1.3 靶向沉默TGF-β1 表達(dá)的shRNA 真核重組表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定 構(gòu)建含沉默TGF-β1 shRNA的p-Genesil-shRNA 真核表達(dá)重組質(zhì)粒及含無關(guān)shRNA 的p-Genesil-1-shRNA-vect 重組質(zhì)粒。將目的片段shRNA 和質(zhì)粒載體p-Genesil-1 在T4 DNA連接酶作用下16℃連接過夜,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入DH5α 感受態(tài)細(xì)胞中,37℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)18 h 后挑取單克隆,37℃搖床過夜振搖擴(kuò)增,取1 mL 菌液送大連TaKaRa 公司測序鑒定;菌液中提取質(zhì)粒行SalⅠ酶切鑒定,質(zhì)粒p-Genesil-1 的多克隆位點(diǎn)如下:-XbaⅠ-SalⅠ-EcoRⅠ-U6 Promotor-BamHⅠ-shRNA-HindⅢ-;在插入的shRNA 的3'端設(shè)計了一個SalⅠ的酶切位點(diǎn)GTCGAC(表1),若插入正確,SalⅠ單酶切時可切出一條約400 bp 的DNA 條帶。

        1.4 質(zhì)粒的轉(zhuǎn)染 以腎小管上皮細(xì)胞HKC 為研究對象,常規(guī)培養(yǎng)高糖(0.5 mol/L)或Ang Ⅱ(10-3mol/L)刺激的HKC 至對數(shù)生長期時,按Invitrogen公司Lipofectamine 2000 說明書進(jìn)行質(zhì)粒轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染8 h 后,去除含有轉(zhuǎn)染混合物的培養(yǎng)基,換成新鮮的細(xì)胞生長培養(yǎng)基,48 h 后用G418 進(jìn)行篩選,篩選后擴(kuò)增細(xì)胞并進(jìn)行后續(xù)實驗。轉(zhuǎn)入p-Genesil-shRNA 1~5重組質(zhì)粒及p-Genesil-1-shRNA-vect 質(zhì)粒的細(xì)胞分別命名為p-Genesil-shRNA1~5 細(xì)胞和p-Genesil-1-vect 細(xì)胞。

        1.5 高糖刺激后各組細(xì)胞中TGF-β1 表達(dá)的Western blot 檢測 收集HKC 細(xì)胞及高糖或AngⅡ刺激的HKC 細(xì)胞、p-Genesil-1-vect 細(xì)胞和各組p-Genesil-shRNA 細(xì)胞,提取細(xì)胞總蛋白,并按Bradford方法進(jìn)行定量,變性處理后進(jìn)行SDS-PAGE 電泳和轉(zhuǎn)膜,50 g/L 脫脂牛奶封閉,室溫2 h,一抗室溫?fù)u育2 h,二抗室溫?fù)u育2 h,按照增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光試劑盒操作步驟進(jìn)行顯色、曝光,最后顯影、定影、掃描。以β-actin 為內(nèi)參照,蛋白上樣量均為150 μg,鼠抗人β-actin 單克隆抗體、兔抗TGF-β1 多克隆抗體、辣根酶標(biāo)記的山羊抗兔和辣根酶標(biāo)記的兔抗鼠二抗的稀釋度分別為1 ∶1 000、1 ∶300、1 ∶5 000 和1∶5 000。通過Quantity one 軟件分析Western blot目的條帶與內(nèi)參照條帶的灰度比值。每組均設(shè)5個平行對照組。

        表1 靶向沉默TGF-β1 表達(dá)的shRNA 序列

        1.6 統(tǒng)計學(xué)處理 采用SPSS 16.0 進(jìn)行分析。應(yīng)用單因素方差分析和LSD-t 檢驗比較高糖刺激或Ang Ⅱ刺激后各組細(xì)胞中TGF-β1 表達(dá)的差異,檢驗水準(zhǔn)α=0.05。

        2 結(jié)果

        2.1 靶向沉默TGF-β1 表達(dá)的shRNA 真核表達(dá)重組質(zhì)粒的鑒定 見圖1。構(gòu)建的p-Genesil-shRNA1、2、3、4 和5 真核表達(dá)重組質(zhì)粒通過SalⅠ酶切鑒定結(jié)果顯示5個shRNA 重組質(zhì)粒均可切出與預(yù)計相符的400 bp 的片段。測序結(jié)果也顯示所有重組質(zhì)粒中,目的片段插入位點(diǎn)和方向正確,無堿基突變、插入、丟失,與實驗設(shè)計相一致。

        圖1 靶向沉默TGF-β1 表達(dá)的shRNA 真核表達(dá)重組質(zhì)粒酶切鑒定結(jié)果

        2.2 靶向沉默TGF-β1 表達(dá)的shRNA 的篩選 見圖2、3 和表2、3。Western blot 結(jié)果顯示:與HKC 細(xì)胞相比,高糖或Ang Ⅱ刺激的HKC 細(xì)胞和p-Genesil-1-vect 細(xì)胞中TGF-β1 表達(dá)均增高,高糖或AngⅡ刺激的HKC 細(xì)胞和p-Genesil-1-vect 細(xì)胞中TGFβ1 表達(dá)差異無統(tǒng)計學(xué)意義。與高糖或Ang Ⅱ刺激的p-Genesil-1-vect 細(xì)胞相比,高糖或Ang Ⅱ刺激的各組p-Genesil-shRNA 細(xì)胞中TGF-β1 表達(dá)均降低。

        圖2 高糖刺激時各組細(xì)胞中TGF-β1 表達(dá)的Western blot 檢測

        圖3 Ang Ⅱ刺激時各組細(xì)胞中TGF-β1 表達(dá)的Western blot 檢測

        表2 高糖刺激時各組細(xì)胞中TGF-β1 表達(dá)的Western blot 檢測結(jié)果(n=5)

        表3 Ang Ⅱ刺激時各組細(xì)胞中TGF-β1 表達(dá)的Western blot 檢測結(jié)果(n=5)

        3 討論

        EMT 在腎小管-腎間質(zhì)纖維化中發(fā)揮重要作用,其發(fā)生發(fā)展受TGF-β/Smad 多條信號傳導(dǎo)途徑的調(diào)控;TGF-β1 是最為關(guān)鍵的促纖維化生長因子,有研究[3]報道TGF-β1 在腎臟纖維化進(jìn)展過程中發(fā)揮了重要作用。TGF-β1 主要在腎臟中表達(dá),由腎小管上皮細(xì)胞和腎小球系膜細(xì)胞等多種細(xì)胞合成和分泌,它不僅可以誘導(dǎo)多種ECM 成分的表達(dá),而且可以通過減少蛋白酶及其激活物的表達(dá),如基質(zhì)金屬蛋白酶,增加蛋白酶抑制劑以及金屬蛋白酶組織抑制劑來抑制ECM 的降解。另外,TGF-β1 還是強(qiáng)大的免疫調(diào)節(jié)因子,對巨噬細(xì)胞等有強(qiáng)大的趨化作用。因此,TGF-β1 不僅對腎臟纖維化形成過程有重要作用,而且對慢性炎癥的發(fā)生發(fā)展也可能產(chǎn)生潛在性的影響。因此,沉默TGF-β1 的表達(dá)有可能阻斷、逆轉(zhuǎn)或至少延緩腎臟纖維化的發(fā)生[4-7],有利于對腎臟纖維化發(fā)病機(jī)制和治療策略進(jìn)行深入的研究。因此,為了研究參與TGF-β1 誘導(dǎo)腎小管-腎間質(zhì)纖維化的下游分子,該研究對靶向沉默TGF-β1 表達(dá)的方法進(jìn)行了探索。

        隨著RNA 干擾(RNA interference,RNAi)技術(shù)在基因功能、腫瘤等研究中的廣泛應(yīng)用[8-9],以DNA為模板胞內(nèi)合成shRNA 表達(dá)載體的RNAi 技術(shù)為研究提供了更為簡便和實用的方法。shRNA 表達(dá)載體導(dǎo)入細(xì)胞中后,經(jīng)過細(xì)胞內(nèi)酶切機(jī)制形成siRNA,從而使靶基因沉默數(shù)周甚至數(shù)月。到目前為止,僅有學(xué)者[10]通過siRNA 沉默TGF-β1,觀察了其對大鼠系膜細(xì)胞纖維連接蛋白和Ⅳ型膠原的影響,未見以腎小管上皮細(xì)胞為研究對象的siRNA 沉默TGFβ1 的相關(guān)報道。因此,該研究覆蓋TGF-β1 基因cDNA 全長,設(shè)計和制備了靶向沉默TGF-β1 的5 條shRNA,并構(gòu)建和鑒定了含TGF-β1 shRNA 的p-Genesil-shRNA 真核表達(dá)重組質(zhì)粒。

        該研究進(jìn)結(jié)果顯示,與HKC 細(xì)胞相比,高糖或AngⅡ刺激的HKC 細(xì)胞和p-Genesil-1-vect 細(xì)胞中TGF-β1 表達(dá)均增高,而后二者之間TGF-β1 表達(dá)差異無統(tǒng)計學(xué)意義;與高糖或AngⅡ刺激的p-Genesil-1-vect 細(xì)胞相比,高糖或AngⅡ刺激的各組p-Genesil-shRNA 細(xì)胞中TGF-β1 表達(dá)均降低。

        綜上所述,作者篩選出1 條可靶向沉默TGF-β1表達(dá)的shRNA,為進(jìn)一步研究參與TGF-β1 誘導(dǎo)腎小管-腎間質(zhì)纖維化的下游分子奠定了基礎(chǔ)。

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