金露 李一帆 陳獨(dú)群 蘇鄭明 劉家駒 楊尚琪 桂耀庭 毛向明 來永慶
腎細(xì)胞癌又稱腎癌,約占成人惡性腫瘤的3%,是泌尿系統(tǒng)常見的惡性腫瘤,也是泌尿系統(tǒng)惡性腫瘤中致死率最高的腫瘤[1-2]。最近的腫瘤統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)表明,在美國(guó)腎癌的發(fā)生率和死亡率均位于前十,僅2013年腎癌的新發(fā)病例就有65 150例,而且有8 780例死于腎癌[3]。腎癌發(fā)生的早期無相應(yīng)的臨床表現(xiàn),患者多在體檢或做其他疾病檢查時(shí)被發(fā)現(xiàn),約30%的患者因遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移癥狀而就診[4]。如果不予治療,腎細(xì)胞癌的5年生存率約為2%,生存時(shí)間的中位數(shù)約8個(gè)月[5]。目前腎癌的發(fā)生、發(fā)展機(jī)制尚不明確,臨床也尚未應(yīng)用一些生物標(biāo)志物來診斷、治療腎癌或評(píng)估其預(yù)后。因此,以腎癌的發(fā)生機(jī)制為基礎(chǔ)來尋找可用于腎癌早期診斷或靶向治療、判斷預(yù)后的生物標(biāo)志物是很有必要的。
微小RNA(MicroRNA/miRNA/miR)是一種短鏈非編碼RNA,約有22個(gè)核苷酸,miRNA能非特異性結(jié)合mRNA上的靶基因,通過使其降解或抑制其轉(zhuǎn)錄來調(diào)控基因的表達(dá)[6-7]。研究表明,miRNA在多個(gè)細(xì)胞進(jìn)程中均扮演著重要的角色,包括細(xì)胞的增殖、分化、新陳代謝和凋亡等[7-8]。截至目前,在大量人類的癌組織中都發(fā)現(xiàn)了miRNA的異常表達(dá)或突變。據(jù)推測(cè),超過60%的人類蛋白編碼基因都能和miRNA結(jié)合[9]。另外,miRNA在人血清中不容易被降解而且穩(wěn)定存在,容易被檢測(cè),是良好的生物標(biāo)記物[10-11]。為了探究miR-20b在腎癌中的作用機(jī)制,本研究以前期測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),對(duì)腎癌和癌旁組織中具有差異表達(dá)的miR-20b進(jìn)行RT-qPCR驗(yàn)證比較,分析miR-20b的表達(dá)量是否與患者臨床病理特點(diǎn)有關(guān),為miR-20b在腎癌的發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)制以及其在腎癌中的診斷價(jià)值等后續(xù)研究奠定基礎(chǔ)。
本研究隨機(jī)選取42例深圳市重大疾病臨床資料和生物資源標(biāo)本庫(kù)保存的腎癌及其配對(duì)的癌旁正常組織標(biāo)本(2010年1月至2013年10月收集于安徽、北京、深圳等各大醫(yī)院,每例標(biāo)本均為手術(shù)切除,且均得到就診醫(yī)院和北京大學(xué)深圳醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn),并獲得患者知情同意,簽署知情同意書)。每例標(biāo)本包括經(jīng)病理切片證實(shí)的腎癌組織及配對(duì)的癌旁正常組織(取自根治性腎切除術(shù)距離癌組織>5cm的正常腎組織,且經(jīng)病理證實(shí)無癌組織浸潤(rùn))各1份,患者均有完整的臨床病理資料(表1)。標(biāo)本來源的腎癌患者包括女15例,男27例,平均年齡50.28(14~78)歲,中位年齡53歲。組織學(xué)分類采用WHO2004年腎細(xì)胞癌病理分類標(biāo)準(zhǔn),臨床分期則采用2009年國(guó)際抗癌組織(UICC)/美國(guó)癌癥聯(lián)合會(huì)(AJCC)臨床分期標(biāo)準(zhǔn)。
RNA 提取試劑 Trizol(Invitrogen,USA),microRNA 熒光試劑 miScript SYBR Green PCR Kit(Qiagen,Germany),microRNA 專用反轉(zhuǎn)錄試劑盒miScript Reverse Transcription Kit(Qiagen,Germany),NanoDrop 2000c紫外分光光度計(jì)(Thermo Scientific,USA),普 通 RT-PCR 儀 (BIO-RAD,USA),LC 480 熒光定量 PCR 儀(Applied Biosystems,USA),常規(guī)試劑及儀器等由北京大學(xué)深圳醫(yī)院男性生殖與遺傳中心實(shí)驗(yàn)室所提供。
本研究前期測(cè)序由深圳華大基因研究所采用Illumina Hiseq2000測(cè)序儀完成。通過第二代測(cè)序方法篩選在腎癌組織和癌旁配對(duì)正常組織中表達(dá)有差異的miRNAs。因目前在其他腫瘤組織中已經(jīng)有關(guān)于miR-20b作為促癌因素的報(bào)道,而腎癌組織中miR-20b表達(dá)下調(diào),提示其在腎癌發(fā)生發(fā)展中有著不同的作用機(jī)制,因此本研究選用差異表達(dá)的miR-20b[log2(T/N)=-0.89,P=0.030 3]作為研究對(duì)象進(jìn)行進(jìn)一步的研究及探討。
將選取的42例標(biāo)本在液氮下碾磨后,按照說明書使用Trizol試劑提取碾磨后標(biāo)本中的總RNA,之后測(cè)定提取得到的總RNA濃度(使用NanoDrop 2000c紫外分光光度計(jì)測(cè)定)。
根據(jù) miScript Reverse Transcription Kit說明書所述,在反應(yīng)體系中加入1μg總RNA,在普通PCR儀上進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。反應(yīng)條件:37℃60min,95℃5min。合成的cDNA置于-40℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
根據(jù) miScript SYBRGreen PCR Kit說明書所述,以逆轉(zhuǎn)錄合成的cDNA為模版在LC 480熒光定量PCR儀上進(jìn)行qPCR反應(yīng)。反應(yīng)體系:模板cDNA 1μl,2*QuantiTectSYBR Green PCR Master Mix 10μl,miR-20b上游引物1μl,10*miScript通用引物2μl,加無酶水至總反應(yīng)體積20μl。miR-20b上游引物為5′-AAGTGCTCATAGTGCAG-3′,下游引物使用Qiagen公司提供的通用引物。內(nèi)參基 因 采 用 U6snRNA,其 上 游 引 物 是:5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′,下 游 引 物:5′-ACGCTTCACGAATTTGCGT-3′。反應(yīng)條件:95℃15min,94℃15s,之后55℃30s,70℃30s,共計(jì)40個(gè)循環(huán)。
以U6為內(nèi)參進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理,RT-qPCR所得數(shù)據(jù)使用ΔΔCT法分析:ΔCT= CTmiR-20b-CTU6,ΔΔCT=ΔCTRCC-ΔCTNormal。通過計(jì)算2-△CT將得到的ΔCT值還原為miR-20b的相對(duì)表達(dá)量,經(jīng)過對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換,符合正態(tài)分布。通過計(jì)算2-△△CT得到癌組織中miR-20b表達(dá)量相對(duì)于配對(duì)癌旁組織表達(dá)量的倍數(shù),采用SPSS 17.0分析數(shù)據(jù)。采用配對(duì)t檢驗(yàn)比較腎癌和癌旁正常組織中miR-20b表達(dá)水平,采用四格表χ2檢驗(yàn)或Fisher確切概率分析miR-20b表達(dá)水平與患者的臨床病理特征的聯(lián)系,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
miR-20b在腎癌組織中的表達(dá)水平明顯低于配對(duì)癌旁組織。通過2-△CT計(jì)算miR-20b在腎癌組織和配對(duì)組織中的相對(duì)表達(dá)量并作圖,結(jié)果如圖1所示,配對(duì)t檢驗(yàn)分析P<0.05。通過2-△△CT計(jì)算miR-20b在腎癌組織中表達(dá)量相對(duì)配對(duì)癌旁組織表達(dá)量倍數(shù)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤,為1.020±0.210,最小值為0.051,最大值為7.013;其中,表達(dá)量倍數(shù)高于1.020+0.210的視為表達(dá)上調(diào),低于1.020-0.210的視為表達(dá)下調(diào),其余則為表達(dá)無明顯差異。腎癌組織miR-20b表達(dá)量與配對(duì)癌旁組織表達(dá)量比值進(jìn)行l(wèi)og2(T/N)轉(zhuǎn)換,結(jié)果如圖2所示,表達(dá)下調(diào)的為29例(69.048%),表達(dá)上調(diào)的為11例(26.190%),表達(dá)無明顯差異的為2例(4.762%)。
以腎癌組織miR-20b相對(duì)表達(dá)量平均值1.104為界,將研究病例分為高表達(dá)組、低表達(dá)組,其中低表達(dá)29例,高表達(dá)13例。按性別分為男性組及女性組,以患者年齡中位數(shù)51歲為界將患者分為<51歲組和≥51歲組。進(jìn)行四格表χ2檢驗(yàn)分析,結(jié)果顯示腎癌中miR-20b表達(dá)水平與患者年齡、腎癌組織類型、性別、AJCC臨床分期、TNM分期無明顯相關(guān)性(P>0.05),結(jié)果見表1。但該研究結(jié)果不能排除病例數(shù)較少所致偏倚,需要擴(kuò)大樣本量進(jìn)一步驗(yàn)證。
圖1 miR-20b在腎癌組織和癌旁組織中的ΔCT比較(ΔCT=CTmiR-20b-CTU6)
圖2 miR-20b在42例配對(duì)的腎癌和癌旁組織中的相對(duì)表達(dá)量比值(橫坐標(biāo)為標(biāo)本序號(hào),縱坐標(biāo)為miR-20b在腎癌與正常組織中表達(dá)量比值的對(duì)數(shù)值;條帶:灰色為表達(dá)下調(diào),黑色為表達(dá)上調(diào),白色為表達(dá)無明顯差異)
表1 miR-20b表達(dá)量與臨床病理特征之間的關(guān)系
和大多數(shù)腫瘤一樣,腎癌發(fā)生發(fā)展的具體分子機(jī)制尚不清楚。三分之一的腎癌患者在初次診斷時(shí)已經(jīng)存在遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,其中近30%的病例手術(shù)后會(huì)有復(fù)發(fā)或者轉(zhuǎn)移[2]。因此尋找可用于腎癌早期診斷的生物標(biāo)志物顯得尤為重要。雖然目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)一些和腎癌診斷及惡性程度相關(guān)的生物標(biāo)志物,但在臨床上并無相關(guān)標(biāo)志物的應(yīng)用,關(guān)于這些標(biāo)志物的作用機(jī)制仍需要進(jìn)一步的研究。現(xiàn)階段常規(guī)的臨床分期和病理分期在腎癌預(yù)后的判斷中仍起主要作
用[12]。
從miRNA被發(fā)現(xiàn)到現(xiàn)在,人們對(duì)miRNA的研究在逐漸深入。多項(xiàng)研究表明,miRNAs在多種腫瘤細(xì)胞中存在異常表達(dá),比如在黑色素瘤中低表達(dá)的 miR-205、miR-211[13],在結(jié)腸癌中高表達(dá)的miR-31[14],因此根據(jù)miRNA的表達(dá)水平不同可以把miRNA分為促癌miRNA和抑癌miRNA,即腫瘤組織中高表達(dá)的miRNA可能起到類似于促癌基因的作用,而低表達(dá)的miRNA可能具有抑癌基因的作用。在一定的條件下,miRNA通過非特異性結(jié)合靶基因mRNA3′端非編碼區(qū)來抑制其轉(zhuǎn)錄或使其降解來調(diào)控靶基因表達(dá),從而發(fā)揮著基因調(diào)控作用[15-16]。由于 miRNA結(jié)合的不完全性,一個(gè)miRNA可以和多個(gè)基因結(jié)合,而多個(gè)miRNA也可以和同一個(gè)基因結(jié)合,從而構(gòu)成一個(gè)復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。目前在腫瘤的靶向治療方面,靶點(diǎn)的選擇只是局限于單個(gè)異?;颍玬iRNA可以和多個(gè)基因位點(diǎn)結(jié)合,通過調(diào)節(jié)組織中miRNA的水平即可達(dá)到同時(shí)調(diào)控多個(gè)基因的目的。因此,在腫瘤的分子靶向治療方面miRNA有著獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),所以有必要深入研究miRNA對(duì)靶基因的調(diào)控機(jī)制,以期在腫瘤分子靶向治療方面取得新的突破。
在先前測(cè)序及篩選的基礎(chǔ)上,本研究通過逆轉(zhuǎn)錄及RT-qPCR檢測(cè)標(biāo)本中miR-20b的表達(dá)水平,并分析其與病例臨床特征的相關(guān)性。經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析,miR-20b表達(dá)水平與患者臨床特征無明顯相關(guān)性?,F(xiàn)階段的研究表明,miR-20b在其他病變組織中也存在著異常表達(dá)。目前已有報(bào)道證實(shí)在乳腺癌中miR-20b表達(dá)水平升高,且可通過作用于人第10號(hào)染色體缺失的磷酸酶及張力蛋白同源的基因來促進(jìn)細(xì)胞增殖[17]。另外,也有研究發(fā)現(xiàn)miR-20b可以通過和RORγt、STAT3結(jié)合來抑制Th17細(xì)胞的分化以及腦脊髓炎的發(fā)生[18]。
本研究發(fā)現(xiàn)miR-20b在腎癌細(xì)胞中表達(dá)下降,表明其在腎癌中的作用機(jī)制與在乳腺癌中有所不同。miR-20b在腎癌組織中明顯的低表達(dá),其表達(dá)水平是癌旁組織的1.020±0.210倍,提示其可能在基因調(diào)控方面發(fā)揮著抑癌基因的作用,這可能在腎癌的早期診斷及預(yù)后判斷方面有一定的臨床意義。確定miR-20b表達(dá)存在差異后,下一步將是收集更多腎癌標(biāo)本檢測(cè)miR-20b的表達(dá),進(jìn)一步驗(yàn)證miR-20b與腎癌患者臨床病理特征及預(yù)后的關(guān)系并通過體外轉(zhuǎn)染的方法對(duì)miR-20b進(jìn)行功能研究,主要包括研究轉(zhuǎn)染后腫瘤細(xì)胞的增殖能力、侵襲能力、凋亡水平等方面的變化。目前普遍認(rèn)為,miRNA通過復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)來調(diào)節(jié)細(xì)胞的生物學(xué)行為,因此我們下一步的研究將是如何有效地將特異性較高的miR-20b和其抑制物導(dǎo)入到腎癌細(xì)胞中,通過對(duì)轉(zhuǎn)染后細(xì)胞的功能研究,進(jìn)一步明確miR-20b在腎癌的發(fā)生發(fā)展過程中所起的作用。
總之,本研究發(fā)現(xiàn)miR-20b在腎癌組織中表達(dá)下調(diào),且其表達(dá)水平與患者臨床病理特征無明顯相關(guān)性。目前關(guān)于miR-20b的功能研究尚處于探索階段,但根據(jù)目前研究狀況,探究其對(duì)癌細(xì)胞功能的影響,尋找其靶基因及作用通路已成為明確目標(biāo)。本研究為miR-20b在腎癌發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)制以及其在腎癌中的診斷價(jià)值等后續(xù)研究奠定了基礎(chǔ)。
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