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        基因芯片與傳統(tǒng)羅氏培養(yǎng)檢測結(jié)核分支桿菌藥敏結(jié)果分析

        2015-09-21 06:50:42
        安徽醫(yī)學(xué) 2015年12期
        關(guān)鍵詞:基因突變結(jié)核結(jié)核病

        張 偉

        結(jié)核病是由結(jié)核桿菌感染引起的慢性傳染病,結(jié)核病可蔓延至全身各個(gè)器官,但以肺臟為主,并通過呼吸道傳播[1,2]。該病目前無徹底治愈的方法,臨床主要以殺菌以及對癥治療為主,但部分患者停藥后結(jié)核病又復(fù)發(fā),病情甚至較之前加重。根據(jù)我院多年臨床結(jié)核患者治療資料顯示,于結(jié)核發(fā)病早期對患者進(jìn)行積極化療,能有效提高臨床療效,將結(jié)核控制在較小范圍。此外,對于部分耐藥菌的診斷更是重中之重,因結(jié)核病治療周期較長,早期發(fā)現(xiàn)耐藥菌,可以提早使用針對性藥物,為結(jié)核治療爭取更多時(shí)間,需要在臨床加以重視[3-6]。結(jié)核桿菌耐藥基因芯片診斷能有效增加結(jié)核桿菌耐藥菌檢出率,且該方法快速簡便,可大規(guī)模開展[7,8]。為此,我院對116 株結(jié)核菌株進(jìn)行檢測,現(xiàn)報(bào)道如下。

        1 材料與方法

        1.1 檢測材料結(jié)核分支桿菌均由我院檢驗(yàn)部提供,包括臨床分離培養(yǎng)的結(jié)核桿菌菌株84 株(包括活檢、肺泡或支氣管灌洗以及胸腔積液中分離的菌株)以及痰標(biāo)本結(jié)核桿菌菌株64 例。分離培養(yǎng)的結(jié)核桿菌以及痰標(biāo)本均搜集自本院2013 年5 月至2015 年5 月于我院收治的結(jié)核病患者。以上菌株均于我院按照結(jié)核病細(xì)菌學(xué)檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)化規(guī)程進(jìn)行分離培養(yǎng)以及鑒定。菌株培養(yǎng)采用改良羅氏法,細(xì)菌的藥敏試驗(yàn)采用絕對濃度法。

        1.2 方法用取菌環(huán)刮取培養(yǎng)基上的菌落,將菌落溶于10 mL 雙蒸水,用玻璃棒攪拌后放入離心機(jī)。以12 000 r/min 離心10 min,去除過濾出沉淀物,倒去上清液,用雙蒸水繼續(xù)溶解混勻,加入700 μmol/L 氫氧化鈉溶液靜置2 h,繼續(xù)以12 000 r/min 離心10 min,濾出沉淀,用雙蒸水洗凈后,依次加入適量裂解液,吸附劑,煮沸,震蕩后離心10 min,取上清液,用UNIQ-10柱對上清進(jìn)行純化并濃縮至150 μL 以待PCR 反應(yīng)。隨后分別經(jīng)過rpoB 基因擴(kuò)增、陽性擴(kuò)增產(chǎn)物的回收、濃縮、測序以及測序產(chǎn)物的純化。最后將產(chǎn)物用310型全自動(dòng)DNA 測序儀(南京金斯瑞生物科技有限公司)進(jìn)行測序,觀察并記錄下測序結(jié)果。

        1.3 評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)結(jié)果判定采用WHO 公布的標(biāo)準(zhǔn),細(xì)菌在40 ~50 μg/mL 的異煙肼(isoniazid,INH)和利福平(rifampicin,RFP)的培養(yǎng)基上可以生長即判定為耐藥。1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 21.0 進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)數(shù)資料以例或百分比表示,統(tǒng)計(jì)分析采用χ2檢驗(yàn),以P <0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 兩種檢測方法結(jié)果比較我院按照全國結(jié)核病細(xì)菌學(xué)檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)化規(guī)程進(jìn)行分支桿菌分類以及鑒定,選取臨床分離的結(jié)核桿菌84 株,其中耐INH 和耐RFP 菌株67 株,INH 或RFP 敏感菌株17 株?;驒z測中耐藥菌株69 株,65 株結(jié)果正確,敏感株檢出15 株,13 株符合真實(shí)結(jié)果。耐藥基因檢測法靈敏度為97.01%,特異度為76.52%。陽性預(yù)測值為94.24%,陰性預(yù)測值為86.73%,兩種檢測方法的靈敏度和特異度差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.19,P >0.05)。見表1。

        2.2 兩種檢測方法痰標(biāo)本檢測結(jié)果比較我院選取痰標(biāo)本中結(jié)核桿菌64 株,其中耐INH 和RFP 菌株32株,INH 或RFP 敏感菌株32 株。基因檢測結(jié)果中耐藥菌株36 株,28 株結(jié)果與羅氏培養(yǎng)結(jié)果一致,敏感株檢出28 株,24 株符合真實(shí)結(jié)果。耐藥基因檢測法靈敏度為87.56%,特異度為75.00%。陽性預(yù)測值為77.81%,陰性預(yù)測值為85.73%,與羅氏培養(yǎng)檢驗(yàn)的敏感度和特異度差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.17,P >0.05)。見表2。

        表1 兩種檢測方法分離菌株檢測結(jié)果比較(例)

        表2 兩種檢測方法痰標(biāo)本檢測結(jié)果比較(例)

        2.3 耐藥結(jié)核桿菌基因檢測結(jié)果耐藥結(jié)核桿菌檢測結(jié)果如下:基因突變片段為516Mat 12 株,基因突變片段為526Mcg8 株,基因突變片段為526Mct 5 株,基因突變片段為526Mag 5 株,基因突變片段為531Mct 40 株,基因突變片段為516Mgt 5 株,其它基因突變片段14 株,可見耐藥基因突變片段以531Mct 為主,其次為516Mat、526Mcg 以及526Mct、526Mag、516Mgt 等。

        3 討論

        結(jié)核病是由結(jié)核分支桿菌感染引起的慢性傳染病,結(jié)核病可侵犯人體多個(gè)系統(tǒng),如呼吸、循環(huán)、免疫系統(tǒng),對人體造成極大的損害[9,10]。雖然我國加大了結(jié)核病的防治力度,總的發(fā)病增長率有所下降,但我國結(jié)核病患者基數(shù)仍然比較龐大,需引起重視。結(jié)核的治療是一個(gè)長期過程,目前各種關(guān)于結(jié)核桿菌藥物的研究正在開展,但與此同時(shí),隨著抗結(jié)核藥的廣泛使用,以及部分患者藥物濫用,各地不斷報(bào)道有多耐藥結(jié)核桿菌(multi drug resistant mycobacterium tuberculosis,MDR-TB)的出現(xiàn)。2002 ~2006 年,WHO 在進(jìn)行了大規(guī)模的結(jié)核調(diào)查,調(diào)查結(jié)果顯示多耐藥結(jié)核菌正在全球迅速蔓延;在WHO 對全球184 個(gè)國家結(jié)核病患者的研究中發(fā)現(xiàn),新近結(jié)核桿菌感染患者中出現(xiàn)242 794例MDR-TB 感染者,約占2.7%。而既往已接受治療的患者中MDR-TB 感染率甚至達(dá)到了18.5%[11,12]。此外,同時(shí)感染HIV 和結(jié)核桿菌的患者中56%感染了MDR-TB。更加令人擔(dān)憂的是部分地區(qū)對于多耐藥結(jié)核桿菌的診斷受到多種因素的制約,無法第一時(shí)間對多耐藥結(jié)核桿菌做出診斷,導(dǎo)致患者在長期使用各種常規(guī)化療藥物治療后病情仍無緩解,甚至加重。臨床常用的結(jié)核桿菌耐藥性檢查就是藥敏試驗(yàn),但該方法對于設(shè)備以及操作的要求較高,部分地區(qū)醫(yī)院無法開展[13]。此外,操作中失誤很容易造成最后結(jié)果出現(xiàn)假陽性或者假陰性,因此在臨床難以普及。近年來,也有學(xué)者提出多種檢測耐藥菌株的方法,如:噬菌體熒光素酶法、氧化還原酶活性檢測、BACTEC、微孔法[14,15]等,但要滿足臨床檢測,尚需深入研究,以縮短檢查所需時(shí)間。本研究主要針對結(jié)核病患者的耐藥基因芯片檢測技術(shù),通過對116 株結(jié)核桿菌菌株進(jìn)行研究,取得了一定的成果。

        我院按照全國結(jié)核病細(xì)菌學(xué)檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)化規(guī)程進(jìn)行分支桿菌分類以及鑒定,選取臨床分離的結(jié)核桿菌84株,其中耐INH 和耐RFP 菌株67 株,INH 或RFP 敏感菌株17 株?;驒z測中耐藥菌株69 株,65 株結(jié)果正確,敏感株檢出15 株,13 株符合真實(shí)結(jié)果。耐藥基因檢測法靈敏度為97.01%,特異度為76.52%。陽性預(yù)測值為94.24%,陰性預(yù)測值為86.73%,兩種檢測方法無明顯差異。基因檢測技術(shù)對于分離培養(yǎng)的耐藥結(jié)核菌株的檢出,與藥敏法無明顯差異,效果可靠。我院選取痰標(biāo)本中結(jié)核桿菌64 株,其中耐INH 和耐RFP菌株32 株,INH 或RFP 敏感菌株32 株?;驒z測中耐藥菌株36 株,28 株結(jié)果與羅氏培養(yǎng)結(jié)果一致,敏感株檢出28 株,24 株符合真實(shí)結(jié)果。耐藥基因檢測法靈敏度為87.56%,特異度75.00%。陽性預(yù)測值為77.81%,陰性預(yù)測值為85.73%,兩種檢測方法檢驗(yàn)效果無明顯差異?;驒z測技術(shù)對于痰標(biāo)本中的耐藥結(jié)核菌株的檢出,與藥敏法無明顯差異,效果可靠?;蛲蛔兤畏謩e為516Mat 12 株、526Mcg 8 株、526Mct 5株、526Mag 5 株、531Mct 40 株、516Mgt 5 株、其它基因突變片段14 株,可見耐藥基因突變片段以531Mct 為主,其次為516Mat、526Mcg 以及526Mct、526Mag、516Mgt等,臨床對于結(jié)核桿菌基因型診斷需引起重視。

        綜上所述,結(jié)核桿菌耐藥基因芯片檢測技術(shù),檢測結(jié)果與羅氏培養(yǎng)藥敏試驗(yàn)結(jié)果無明顯差異,且用時(shí)較培養(yǎng)短,可大規(guī)模操作,值得在臨床廣泛推廣。

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