中外科學(xué)家近日在美國《國家科學(xué)院學(xué)報(bào)》上報(bào)告說,他們已經(jīng)繪制出小豆的基因組草圖。這將有助于從基因水平上分析小豆性狀,培育更多小豆新品種。
北京農(nóng)學(xué)院和國際半干旱熱帶作物研究所等機(jī)構(gòu)的研究人員利用第二代測(cè)序技術(shù)完成了小豆全基因組的測(cè)序,組裝出了高質(zhì)量的小豆基因組框架圖,結(jié)果顯示小豆有3.4 萬多個(gè)基因。研究人員還分析了小豆與其他已知豆類基因組的進(jìn)化關(guān)系,結(jié)果顯示小豆與菜豆親緣關(guān)系最近。
研究人員測(cè)序分析了49 份野生小豆、半野生小豆、栽培小豆的基因,證實(shí)半野生小豆與栽培小豆的關(guān)系近于野生小豆,說明半野生小豆是小豆馴化過程中的初始農(nóng)家品種。
小豆不同于大豆等其他豆科作物,脂肪含量非常低,平均僅為0.59%,而總淀粉含量較高,平均為57.06%。與此相比,大豆淀粉含量為25.3%,而脂肪含量多達(dá)22.5%。新研究表明,相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄水平差異導(dǎo)致了上述差異。
研究負(fù)責(zé)人之一、北京農(nóng)學(xué)院的萬平教授告訴新華社記者:“小豆是中國傳統(tǒng)小雜糧,研究基礎(chǔ)薄弱。通過基因組測(cè)序、組裝和基因注釋,將促進(jìn)小豆重要農(nóng)藝性狀基因的鑒定與克隆和分子育種,提升中國小豆的研究水平,加快小豆的遺傳改良?!?/p>
萬平、中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所的凌宏清、華大基因研究院的王俊以及國際半干旱熱帶作物所的拉吉夫 瓦爾什尼為研究報(bào)告的共同通訊作者。
小豆俗名紅小豆、赤豆等,起源于中國,早在1.2萬年前已被馴化。小豆是理想的高蛋白、低脂肪、補(bǔ)血的營養(yǎng)食品,其中人體必須的8種氨基酸含量是禾谷類作物的2~3倍,富含B族維生素、鐵、鈣等礦物質(zhì)和萜類、異黃酮、皂苷等生物活性物質(zhì)。中國是世界上最大的小豆生產(chǎn)和出口國,出口量約占世界的80%,產(chǎn)品銷往世界上30 多個(gè)國家和地區(qū)。
(中國農(nóng)業(yè)新聞網(wǎng))
日前,由中國農(nóng)科院油料所張秀榮研究員領(lǐng)銜的芝麻與特色油料遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)與中國科學(xué)院國家基因研究中心等單位合作,在國際上率先完成了芝麻高密度單倍型圖譜構(gòu)建和主要農(nóng)藝性狀大規(guī)模的全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)掘了一批關(guān)聯(lián)位點(diǎn)和候選基因。該研究為芝麻的遺傳改良和主要農(nóng)藝性狀的遺傳解析奠定了基礎(chǔ),也為油菜、大豆等主要油料作物的相關(guān)研究和分子育種提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和參考借鑒。日前,《自然通訊》雜志在線發(fā)表了這一研究成果。
芝麻是重要的油料作物,含油量高,富含不飽和脂肪酸、芝麻素等人體有益物質(zhì)。芝麻為二倍體,基因組較小,是油脂相關(guān)性狀研究的理想作物。對(duì)芝麻含油量的遺傳分析表明,芝麻含油量不僅受油脂代謝酶類調(diào)控,還受到其他基因調(diào)控,研究還發(fā)現(xiàn)芝麻一系列產(chǎn)量相關(guān)基因,這些基因的優(yōu)異等位基因的積累是芝麻育成品種產(chǎn)量較地方種高的重要因素。
(農(nóng)民日?qǐng)?bào))
水稻胚乳是人類最主要的糧食來源之一,其結(jié)構(gòu)包含內(nèi)側(cè)的淀粉胚乳和外側(cè)的糊粉層。葉片光合作用產(chǎn)生的碳水化合物主要以蔗糖形式從篩管組織運(yùn)輸?shù)阶蚜?。前人研究認(rèn)為蔗糖在到達(dá)籽粒之后先分解成果糖和葡萄糖,然后通過單糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白運(yùn)輸至淀粉胚乳進(jìn)而合成淀粉。蔗糖是否直接進(jìn)入、如何進(jìn)入淀粉胚乳的機(jī)制一直不很清楚。
近日,中國科學(xué)院植物研究所劉春明研究組利用芯片雜交、熒光定量PCR 和原位雜交等實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)在水稻籽粒背側(cè)糊粉層特異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子OsNFYB1,并通過CRISPR-Cas9 和RNAi 等技術(shù)對(duì)該基因進(jìn)行了敲除和表達(dá)干擾,發(fā)現(xiàn)OsNF-YB1 直接調(diào)控水稻的灌漿和淀粉累積,并且OsNF-YB1 敲除突變體籽粒中的蔗糖、葡萄糖和果糖含量均大幅度下降。進(jìn)一步生化分析發(fā)現(xiàn)OsNF-YB1 通過直接結(jié)合于三個(gè)蔗糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白OsSUT1、OsSUT3 和OsSUT4 的基因表達(dá)調(diào)控區(qū)來調(diào)控蔗糖直接進(jìn)入胚乳。
(中國科學(xué)院網(wǎng))