鄭磊,樊海平,吳斌,曾占?jí)眩娙?,張新艷
(福建省淡水水產(chǎn)研究所,福建福州 350002)
隨著羅非魚養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展,羅非魚鏈球菌病日趨嚴(yán)重,其發(fā)病面積之廣、危害程度之重已成為羅非魚養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展的主要障礙,并造成重大的經(jīng)濟(jì)損失[1].農(nóng)業(yè)部2008年新修訂的《一、二、三類動(dòng)物疫病病種名錄》,魚類鏈球菌病被列為三類動(dòng)物疫病,其主要的病原菌是無乳鏈球菌(Streptococcus agalactiae)和海豚鏈球菌(Streptococcus iniae).羅非魚鏈球菌病的病魚主要癥狀為:體色發(fā)黑,臨死前于水面打轉(zhuǎn)或間隙性竄游,部分病魚眼球突出或混濁發(fā)白,腹部體表具點(diǎn)狀或斑塊出血或潰瘍,鰓蓋內(nèi)側(cè)出血,肝臟、膽囊、脾臟腫大,嚴(yán)重時(shí)糜爛,腸道和胃積水或積黃色粘液.此病危害各種大小的魚,100 g以上規(guī)格容易感染,傳染性強(qiáng),發(fā)病率達(dá)10%~30%,死亡率達(dá)25% ~80%,造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失.目前,國內(nèi)羅非魚鏈球菌病害防控沒有特效的藥物,因此,建立羅非魚無乳鏈球菌快速檢測(cè)體系對(duì)羅非魚養(yǎng)殖的健康發(fā)展能夠起到積極作用.無乳鏈球菌鏈球的多重PCR及real-time PCR鑒定已有報(bào)道[2-4],但其檢測(cè)方法耗時(shí)、設(shè)備要求高.環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一種新穎的核酸擴(kuò)增方法,具有特異性高、操作簡(jiǎn)單、肉眼判斷結(jié)果的特點(diǎn),已被廣泛應(yīng)用于病原微生物及寄生蟲的檢測(cè)[5-8].其中,王永等[9]和Kimura等[10]分別針對(duì)牛源的無乳鏈球菌FBS基因及人源的無乳鏈球菌CFB基因設(shè)計(jì)LAMP檢測(cè)引物組,建立了LAMP檢測(cè)方法.
無乳鏈球菌的血清學(xué)分類是依據(jù)其菌株的莢膜多糖的特異性,目前已經(jīng)鑒定出10種不同的莢膜類型(Ia、Ib、II、III、IV、V、VI、VII、VII和 IX).其中 Ia、Ib和 III型為目前確定的水生動(dòng)物源血清型[11-12].Brodeur等[13]的動(dòng)物實(shí)驗(yàn)表明無乳鏈球菌表面免疫相關(guān)蛋白(surface immunogenic protein,SIP)廣泛存在于多種血清型(Ia、Ib、II、III、V和VI)中,表明SIP基因存在于水生動(dòng)物源的三種血清型.此外,SIP基因序列(登錄號(hào):FJ752159.1)Blast結(jié)果顯示其與數(shù)據(jù)庫中其它登陸SIP基因序列相似性為97%~100%,表明SIP具有高度的序列保守性,可成為羅非魚無乳鏈球菌檢測(cè)的重要候選基因.
本研究首次針對(duì)羅非魚無乳鏈球菌SIP基因設(shè)計(jì)了LAMP檢測(cè)引物組,對(duì)無乳鏈球菌病進(jìn)行檢測(cè),優(yōu)化反應(yīng)條件,驗(yàn)證了方法的特異性和靈敏度,并應(yīng)用該方法檢測(cè)人工攻毒樣品.
包括2株羅非魚無乳鏈球菌株,8株其它鏈球菌屬菌株及6株水體常見菌株,詳見表1.
表1 實(shí)驗(yàn)菌株Tab.1 Bacterial strains
細(xì)菌DNA提取試劑盒及SYBR Green I購自廈門泰京生物技術(shù)公司;BstDNA聚合酶購自New England Biolabs公司;甜菜堿(Betain)購自Sigma公司;dNTPs、MgCl2、DL2000 DNA Marker和Premix Ex Taq購自TaKaRa公司;細(xì)菌培養(yǎng)基購自北京陸橋公司.
1.3.1 細(xì)菌DNA提取
無乳鏈球菌(ScTnB0902L)接種腦心浸液培養(yǎng)基(BHI),28℃過夜培養(yǎng),采用細(xì)菌DNA提取試劑盒提取DNA,-20℃保存?zhèn)溆?
1.3.2 引物設(shè)計(jì)
根據(jù)GenBank公布的無乳鏈球菌SIP基因序列(登錄號(hào):FJ752159.1),用Primer Explorer IV軟件分析設(shè)計(jì)一套引物(F3、B3、FIP、BIP),分別是前外引物F3,后外引物B3,前內(nèi)引物FIP,后內(nèi)引物BIP,見表2.
表2 LAMP引物Tab.2 Specific primer sequences for LAMP
1.3.3 LAMP 方法的建立
LAMP反應(yīng)體系為25 μL.優(yōu)化后的反應(yīng)組分見表3.反應(yīng)條件:混勻后將反應(yīng)液放入恒溫水浴鍋,61℃反應(yīng)60 min.反應(yīng)產(chǎn)物采用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)或直接加入2 μL熒光顯色劑SYBR Green I(稀釋100倍),觀察顏色變化.
表3 LAMP反應(yīng)體系組成Tab.3 Reaction composition of LAMP
1.3.4 LAMP 特異性
提取8株鏈球菌屬和6株水體常見病原菌的DNA,采用1.3.3建立的LAMP反應(yīng)體系檢測(cè),反應(yīng)產(chǎn)物采用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè).
1.3.5 LAMP方法檢測(cè)無乳鏈球菌的靈敏度
無乳鏈球菌(ScTnB0902L)接種腦心浸液固體培養(yǎng)基(BHI)純培養(yǎng)后,用滅菌的生理鹽水洗脫,洗脫液進(jìn)行10倍比稀釋,各取每個(gè)稀釋度的菌液1 mL,用試劑盒提取DNA后進(jìn)行LAMP擴(kuò)增.
1.3.6 LAMP 檢測(cè)方法的應(yīng)用
無乳鏈球菌(ScTnB0902L)接種腦心浸液固體培養(yǎng)基(BHI)純培養(yǎng)后,用滅菌的生理鹽水洗脫.羅非魚每尾腹腔注射0.2 mL菌液,菌濃度為2.6×106CFU·mL-1,共注射11尾.24 h后,取其肝、腎和脾,用試劑盒提取DNA后進(jìn)行LAMP擴(kuò)增,同時(shí)采用福建省地方標(biāo)準(zhǔn)DB35/T 1354-2013《羅非魚無乳鏈球菌病雙重PCR診斷規(guī)程》鑒定.
采用1.3.3所述方法,無乳鏈球菌LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物電泳檢測(cè)結(jié)果見圖1,可以觀察到LAMP反應(yīng)的特異性梯狀條帶.圖2為對(duì)應(yīng)的LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物熒光顯色結(jié)果,陰性組保持橙色不變,而加入無乳鏈球菌DNA的反應(yīng)組顏色變?yōu)榫G色,表明優(yōu)化的LAMP反應(yīng)體系可以有效地?cái)U(kuò)增無乳鏈球菌DNA.
采用1.3.4所述方法,特異性試驗(yàn)結(jié)果顯示,以兩株無乳鏈球菌DNA為模板擴(kuò)增出特異性梯狀條帶,而8株鏈球菌屬菌株及6株水體常見菌株均未擴(kuò)增出相應(yīng)產(chǎn)物(見圖3(a)).圖3(b)分別為對(duì)應(yīng)的LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物熒光顯色結(jié)果,2株無乳鏈球菌的反應(yīng)組顏色變?yōu)榫G色,其它14株非無乳鏈球菌保持橙色未變.測(cè)試結(jié)果表明針對(duì)無乳鏈球菌SIP基因?yàn)槟0宓腖AMP檢測(cè)方法具有良好的特異性.
圖1 無乳鏈球菌LAMP產(chǎn)物電泳檢測(cè)結(jié)果Fig.1 Electrophoresis of LAMP products of Streptococcus agalactiae
圖2 無乳鏈球菌LAMP產(chǎn)物熒光染色結(jié)果Fig.2 The LAMP products of Streptococcus agalactiae after adding fluorescent dye
圖3 LAMP檢測(cè)無乳鏈球菌特異性結(jié)果Fig.3 Specificity of LAMP primers detection Streptococcus agalactiae
經(jīng)平板計(jì)數(shù),原始無乳鏈球菌菌液濃度為3.0×108CFU·mL-1.10 倍倍比稀釋菌液并提取DNA進(jìn)行LAMP檢測(cè).電泳檢測(cè)結(jié)果顯示,當(dāng)菌液稀釋到3.0×101CFU·mL-1時(shí)仍可見梯狀擴(kuò)增產(chǎn)物(見圖4),表明LAMP法檢測(cè)靈敏度達(dá)30 CFU·mL-1.
應(yīng)用LAMP方法,對(duì)人工感染的11尾羅非魚的肝、腎和脾進(jìn)行檢測(cè).結(jié)果表明,LAMP方法檢測(cè)11尾魚全部呈陽性,檢測(cè)結(jié)果與福建省地方標(biāo)準(zhǔn)DB35/T 1354—2013《羅非魚無乳鏈球菌病雙重PCR診斷規(guī)程》一致.
圖4 無乳鏈球菌LAMP檢測(cè)靈敏度的電泳圖Fig.4 Sensitivity of LAMP products for Streptococcus agalactiae
相比于PCR檢測(cè)方法,LAMP反應(yīng)過程無需高精密度的溫度循環(huán)裝置,對(duì)設(shè)備要求低,操作簡(jiǎn)單,檢測(cè)成本低,產(chǎn)物可通過離心觀察是否有沉淀,或加入熒光顯色劑觀察是否變色來判斷檢測(cè)結(jié)果,適用于基層水產(chǎn)科研機(jī)構(gòu)、各類水產(chǎn)養(yǎng)殖場(chǎng)的使用,具有實(shí)踐應(yīng)用價(jià)值.
研究結(jié)果顯示,建立的LAMP檢測(cè)方法特異性好,檢測(cè)靈敏度高達(dá)30 CFU·mL-1,1 h即可完成擴(kuò)增,為羅非魚無乳鏈球菌病的快速診斷提供一種重要的技術(shù)手段,對(duì)于羅非魚無乳鏈球菌病的早期診斷具有重要意義.
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