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        二株鴨源H11N9亞型禽流感病毒的遺傳進(jìn)化及致病性分析

        2015-06-18 11:27:42黃建龍王昌建何世成王衛(wèi)國唐小明朱春霞范仲鑫汪洪冰劉道新鄧國華
        關(guān)鍵詞:致病性毒株禽流感

        譚 丹,黃建龍,王昌建,何世成,王衛(wèi)國,唐小明,朱春霞,范仲鑫,汪洪冰,劉道新*,鄧國華

        (1.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所農(nóng)業(yè)部動(dòng)物流感重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室/獸醫(yī)生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,黑龍江哈爾濱 150001;2.長沙市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,湖南長沙 410006;3.湖南省動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,湖南長沙 410129)

        禽流感是由正黏病毒科A型流感病毒屬禽流感病毒引起的一種禽類(家禽和野禽)傳染病[1],禽流感病毒在野生水鳥、大多數(shù)家養(yǎng)水禽、海鷗中廣泛存在[2-3]。由于其基因組的分節(jié)段性及復(fù)制過程中RNA聚合酶缺乏矯正功能,導(dǎo)致AIV變異頻繁[4]。一直以來高致病性禽流感對(duì)養(yǎng)禽業(yè)的嚴(yán)重危害性和公共衛(wèi)生意義倍受關(guān)注。而低致病性禽流感病毒感染家禽后表現(xiàn)溫和,但仍存在潛在的臨床危險(xiǎn),有可能為高致病性禽流感病毒形成提供基因片段,間接地導(dǎo)致禽流感的暴發(fā)流行[5]。

        禽流感毒株基因的頻繁變異給禽流感的防控帶來非常大的難度。本研究對(duì)近年來由湖南省洞庭湖區(qū)的正常監(jiān)測樣品中分離的2株H11N9亞型禽流感毒株進(jìn)行HA、NA基因序列比較分析和對(duì)SPF雞致病性的研究,旨在從分子生物學(xué)角度了解H11N9亞型禽流感在湖南省洞庭湖區(qū)的變異特點(diǎn)、進(jìn)化規(guī)律及致病性特征,為該地區(qū)禽流感的防控提供一些理論依據(jù),從而有效預(yù)防和控制禽流感,保護(hù)人類健康和公共衛(wèi)生安全。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 毒株 2株H11N9亞型禽流感病毒均來自湖南省洞庭湖區(qū)正常監(jiān)測樣品,由哈爾濱獸醫(yī)研究所國家禽流感參考實(shí)驗(yàn)室分離保存,病毒命名為:A/DK/HuN/S4013/2011 (H11N9) (簡 寫 為HuN20114013); A /DK/HuN/ S4443/2011(H11N9)(簡寫為 HuN20114443)。

        1.1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 11日齡SPF雞胚和4周齡SPF雞由哈爾濱獸醫(yī)研究所SPF實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心提供。

        1.2 方法

        1.2.1 病毒增殖 病毒經(jīng)血凝抑制試驗(yàn)及PCR擴(kuò)增鑒定為H11N9亞型,按104~109有限稀釋度接種10日齡SPF接胚,每次收取有血凝價(jià)且最高稀釋度的雞胚尿囊液作為下一次純化種毒,如此純化3次后,以最適合的稀釋度接種11日齡SPF雞胚,48h后收取雞胚尿囊液,收集的尿囊液經(jīng)過HA-HI試驗(yàn)驗(yàn)證及無菌檢測后,分裝,置-70℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物的回收 根據(jù)GenBank中H11N9亞型禽流感病毒各基因片段序列選擇同源性最高的區(qū)域設(shè)計(jì)引物。PCR擴(kuò)增HA、NA基因片段后,PCR產(chǎn)物在10g/L瓊脂糖凝膠上電泳,凝膠成像系統(tǒng)分析鑒定結(jié)果,然后按照試劑盒說明書進(jìn)行PCR產(chǎn)物回收。

        1.2.3 HA基因序列的測定 紫外透射儀測定PCR產(chǎn)物的濃度并按測序要求計(jì)算所需DNA量,PCR反應(yīng)結(jié)束后加入2.0μL終止液。測序反應(yīng)產(chǎn)物在終止反應(yīng)后加入60μL 950mL/L冰乙醇,混勻于-20 ℃ 15min后,12 000r/min 4 ℃ 下 離 心20min,小心棄去上清,加70μL 700mL/L冰乙醇,12 000r/min 4℃下離心10min洗脫殘留的鹽,重復(fù)1次,倒于紙上室溫晾干,加入15μL甲酰胺,使DNA沉淀充分溶解,最后全部加入測序板內(nèi),并進(jìn)行高溫變性,采用ABI測序儀進(jìn)行測序。

        1.2.4 序列的拼接和分析 病毒各基因片段序列采用DNA Star軟件中Seqman程序?qū)y定各個(gè)基因的原始序列進(jìn)行拼接,采用MegAlign程序?qū)Ω鱾€(gè)基因片段進(jìn)行核苷酸及氨基酸的同源性比較;應(yīng)用Mega 5軟件包對(duì)病毒各個(gè)基因進(jìn)行多序列比對(duì)和進(jìn)化樹的繪制與分析。

        1.2.5 SPF雞感染試驗(yàn) 按每只106EID50/100μL的病毒懸液鼻腔接種11只SPF雞,同時(shí)放入2只SPF雞作為同居感染對(duì)照,于負(fù)壓隔離器中飼養(yǎng)。感染后每隔24h采集泄殖腔和喉頭拭子放入1mL的含有雙抗的PBS中,置-80℃保存,連續(xù)采集14 d,拭子接種雞胚進(jìn)行病毒滴度測定,以分析其排毒規(guī)律。雞感染后第3天,每個(gè)病毒感染雞群隨機(jī)處死3只雞,取組織臟器(腦、胸腺、氣管、心、肝、脾、肺、腎、胰臟、盲腸扁桃體、法氏囊)用于病毒分離滴定。

        2 結(jié)果

        病毒的核苷酸序列分析表明,湖南分離的2株H11N9病毒HA基因開放性閱讀框?yàn)? 698bp,共編碼565個(gè)氨基酸,其NA開放閱讀框?yàn)? 713bp,共編碼470個(gè)氨基酸。

        2.1 基因裂解位點(diǎn)、糖基化位點(diǎn)、受體結(jié)合位點(diǎn)變異情況

        分離的2株H11N9病毒HA裂解位點(diǎn)都為PAIASR/GLF,沒有多個(gè)堿性氨基酸的插入。2株病毒HA基因均有7個(gè)潛在糖基化位點(diǎn),即26(NNS)、27(NST)、39(NVT)、181NNT)、305(NKS)、496(NGT)和556(NGS)。NA基因上均有7個(gè)潛在的糖基化位點(diǎn),分別為42、52、63、66、87、147、202。HA基因上受體結(jié)合位點(diǎn)(以人H3計(jì))T98、T136、A138、S144、W153、H156、Q157、Y161、H183、K189、E190、L194、G225、Q226、A227、G228基本都保守,除HuN20114443受體結(jié)合位點(diǎn)144(S)發(fā)生改變?yōu)镹,所有這些位點(diǎn)均不具備人受體結(jié)合位點(diǎn)。NA基因上的HB受體結(jié)合位點(diǎn)均沒發(fā)生突變(表1和表2)。

        表1 HA基因特征位點(diǎn)氨基酸序列分析Table 1 The analysis of special sites of amino acids in HA gene

        表2 NA基因特征位點(diǎn)氨基酸序列分析Table 2 The analysis of special sites of amino acids in NA gene

        2.2 HA和NA基因的同源性及遺傳進(jìn)化關(guān)系

        對(duì)2株H11N9病毒HA序列進(jìn)行遺傳演化分析,2株核苷酸同源性為87.0%之間,與參考毒株HA基因序列同源性在88.0%~96.7%,主要分為2大分支,Ⅰ與Ⅱ分支核苷酸同源性較低,同源性在88.0%~89.5%之間,與日本、澳大利亞、越南、荷蘭等國家H11參考毒株關(guān)系比較密切,可能有共同的祖先來源(圖1)。將與其同源性相近的毒株進(jìn)行進(jìn)化樹分析,這2株NA基因同源性在96.4%之間,處于同一分支株,均與在周邊國家野鳥中分離的H11N9亞型毒株關(guān)系密切,與其核苷酸同源性在95.9%~98.2%(圖2)。

        圖1 HA基因進(jìn)化樹Fig.1 Phylogenetic tree of HA gene

        圖2 NA基因進(jìn)化樹分析Fig.2 Phylogenetic tree of NA gene

        2.3 感染雞臨床癥狀及排毒情況

        2株H11N9亞型禽流感毒株鼻腔接種SPF雞后,HuN20114443毒株能使雞感染并通過喉頭和泄殖腔排毒,但HuN20114013毒株不引起雞泄殖腔排毒,只能在喉頭樣品中檢測到H11N9亞型禽流感病毒,感染的雞均不表現(xiàn)明顯的臨床癥狀。對(duì)感染雞的排毒情況進(jìn)行連續(xù)觀察,排毒期主要集中在1d~4d。對(duì)同居雞的喉頭和泄殖腔樣品也進(jìn)行了檢測,均不能檢測到H11N9亞型禽流感病毒,可判斷這2株H11N9亞型禽流感毒株均不能使同居雞感染排毒,說明這些毒株在雞群中不具有水平傳播能力。從感染雞臟器中病毒的復(fù)制情況看,在2個(gè)毒株感染雞的腦、肺臟、肝臟、心臟、腎臟、脾臟、胰腺、法氏囊等組織臟器中均未檢到病毒復(fù)制。

        3 討論

        HA是AIV毒力和宿主特異性的主要決定因素[6],大多數(shù)高致病力毒株的HA在其裂解位點(diǎn)附近有多個(gè)堿性氨基酸插入,在無類胰蛋白酶的情況下就能發(fā)生裂解,造成感染禽全身系統(tǒng)衰竭,導(dǎo)致死亡。分離的2株H11N9亞型禽流感毒株的HA裂解位點(diǎn)為PAIASR/GLF,均沒有多個(gè)連續(xù)的堿性氨基酸插入,屬于低致病性病毒。因此,在這2株H11N9亞型禽流感毒對(duì)SPF雞致病性的試驗(yàn)中,只引起SPF雞短暫的排毒,而感染的雞均不表現(xiàn)明顯的臨床癥狀。

        有研究表明流感病毒HA受體特異性及NA唾液酸酶活性劑特異性與病毒感染的宿主范圍、組織嗜性及致病力的強(qiáng)弱有關(guān)[7-8]。HuN20114443株毒株能使雞感染并通過喉頭和泄殖腔排毒,但HuN20114013毒株不引起雞泄殖腔排毒,只能在喉頭樣品檢測到H11N9亞型禽流感病毒。本研究2株H11N9毒株其HA的受體結(jié)合位點(diǎn)均非常保守,HuN20114443受體結(jié)合位點(diǎn)144(S)發(fā)生改變?yōu)镹,是否是由于該位點(diǎn)基因發(fā)生突變而導(dǎo)致這2株毒株引起SPF雞排毒差異還有待研究。

        湖南洞庭湖地區(qū)作為“東亞-澳大利亞遷徙線”上候鳥和我國候鳥遷徙主要停歇地,候鳥在禽流感跨地域傳播中起著很重要的作用[9]。有許多研究表明,在候鳥遷徙地分離的毒株均被發(fā)現(xiàn)有不同亞型或同亞型不同基因之間的重組現(xiàn)象[10-11]。本研究中NA基因組序列進(jìn)行遺傳演化分析來看,這2株H11N9亞型禽流感毒株與在周邊國家野鳥中分離的H11N9亞型毒株關(guān)系密切,與其核苷酸同源性在95.7%~98.2%,說明這些不同亞型毒株之間可能發(fā)生了NA基因的重排。提示該地區(qū)長期的野鳥遷徙對(duì)家鴨AIV的感染影響很大,同時(shí)這些毒株在家禽中相互循環(huán)使得其內(nèi)部基因有所變異。因此,繼續(xù)加強(qiáng)對(duì)該地區(qū)流感病毒的監(jiān)測顯然具有重要的公共衛(wèi)生意義。

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