廖亞平 張 鼎 周 偉 劉長(zhǎng)青 董淮富
(蚌埠醫(yī)學(xué)院細(xì)胞生物學(xué)教研室,安徽 蚌埠 233030)
亞甲基四氫葉酸還原酶和胱硫醚-β-合成酶基因多態(tài)與唐氏綜合征發(fā)生的關(guān)系
廖亞平 張 鼎 周 偉 劉長(zhǎng)青 董淮富1
(蚌埠醫(yī)學(xué)院細(xì)胞生物學(xué)教研室,安徽 蚌埠 233030)
目的 探討母體5,10-亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHFR)基因和胱硫醚-β-合成酶(CβS)基因多態(tài)性與唐氏綜合征(DS)發(fā)生的關(guān)系。方法 應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法檢測(cè)70例DS患兒母親和117例對(duì)照女性的MTHFR 兩個(gè)多態(tài)位點(diǎn)(C677T、A1298C),利用SHEsis在線分析軟件進(jìn)行單體型和連鎖不平衡分析;PCR法檢測(cè)CβS 844Ins68基因型。Pearson χ2 檢驗(yàn)各基因和基因型頻率分布的差異。計(jì)算比值比評(píng)價(jià)相對(duì)危險(xiǎn)度。結(jié)果 MTHFR基因兩個(gè)多態(tài)位點(diǎn)及CβS 844Ins68突變基因頻率和基因型頻率在病例組和對(duì)照組中分布無(wú)顯著差異(P>0.05)。MTHFR 677T/T / 1298(C/C+C/A)聯(lián)合基因型顯著地增加DS發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)(OR=8.46,95%CI:0.90~79.51,P<0.05)。MTHFR 兩個(gè)多態(tài)位點(diǎn)存在連鎖不平衡(D′=0.68);677T-1298C單體型與DS發(fā)生顯著相關(guān)(OR=5.22,95%CI:1.37~19.94,P<0.01)。結(jié)論 MTHFR兩個(gè)位點(diǎn)變異聯(lián)合分析及677T-1298C單體型可能是DS發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)因素,不能排除葉酸代謝酶基因多態(tài)在DS發(fā)生中的作用。
唐氏綜合征;5,10-亞甲基四氫葉酸還原酶;胱硫醚-β-合成酶;基因多態(tài)性
唐氏綜合征(DS)又稱21三體綜合征,主要表現(xiàn)為智力低下和發(fā)育遲緩,該征病因明確,但誘發(fā)因素和發(fā)病機(jī)制仍不清楚。女性高齡生產(chǎn)是該病較為明確的風(fēng)險(xiǎn)因素,但超過(guò)80%的DS患兒母親年齡<35歲。近年一些研究顯示母體葉酸缺乏及葉酸代謝相關(guān)基因多態(tài)可能與DS的發(fā)生相關(guān)〔1,2〕。5,10-亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHFR)是葉酸代謝的關(guān)鍵酶,其基因編碼區(qū)存在2個(gè)常見單核苷酸多態(tài)(C677T、A1298C)。這兩個(gè)位點(diǎn)的變異可影響葉酸代謝和DNA甲基化。目前,葉酸代謝相關(guān)基因多態(tài)與DS發(fā)生的關(guān)系國(guó)內(nèi)外報(bào)道不一〔1,3~7〕。MTHFR基因單體型及胱硫醚-β-合成酶(CβS)基因844位插入一個(gè)68 bp的多態(tài)性片段(844Ins68)與DS發(fā)生的關(guān)系國(guó)內(nèi)未見報(bào)道。本研究以安徽蚌埠地區(qū)漢族人群為研究對(duì)象,探討母源MTHFR基因C677T和A1298C位點(diǎn)及CβS 844Ins68多態(tài)與DS發(fā)生的關(guān)系。
1.1 研究對(duì)象 收集安徽蚌埠地區(qū)曾生育DS患兒的母親血樣70份,年齡19~45歲,漢族,相互間沒有血緣關(guān)系,染色體核型分析正常。正常對(duì)照血樣117份,與病例母親生活環(huán)境相同,年齡在22~45歲,未曾生育DS患兒且沒有不良妊娠史,無(wú)糖尿病、冠心病和高血壓等病史。
1.2 試劑與方法
1.2.1 DNA提取,目的片段PCR擴(kuò)增 無(wú)菌采集外周靜脈血4 ml,EDTA抗凝,-20℃保存。柱式全血基因組DNA抽提試劑盒提取DNA。基因組DNA抽提試劑盒購(gòu)自上海生工生物工程有限公司,PCR擴(kuò)增試劑盒購(gòu)自MBI Fermentas試劑公司。操作按說(shuō)明書進(jìn)行。PCR擴(kuò)增引物:MTHFR A1298C正義引物:5′-CTTTGGGGAGCTGGACTACTAC-3′,正義引物:5′-CACTTTGTGACCATTCCGGTTTG-3′;MTHFR C677T正義引物:5′-TGAAGGAGAAGGTGTCTGCGGGA-3′,正義引物:5′-AGGACGGTGCGGTGAGAGTG-3′;CβS 844Ins68正義引物:5′-CTGGCCTTGAGCCCTGAA-3′,正義引物:5′-GGCCGGGCTCTGGACTC-3′。
引物由上海Sangon公司合成。PCR擴(kuò)增體系含10倍緩沖液2.5 μl,dNTPs 2.5 μl(2 mmol/L),MgCl22 μl(終濃度1.5 mmol/L),正、反義游引物各0.5 μl(10 pmol/μl),Taq酶0.5 μl(2 U /μl),DNA 1 μl(約100 mg),總體積25 μl。PCR反應(yīng)條件94℃預(yù)變性5 min,94℃變性30 s,MTHFR A1298C、C677T和CβS 844Ins68分別退火60 s、63 s和59 s,延伸30 s,共35個(gè)循環(huán)。擴(kuò)增產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
1.2.2 PCR-RFLP分析 限制性核酸內(nèi)切酶Hinf Ⅰ 、MboⅡ購(gòu)自MBI Fermentas試劑公司。將PCR產(chǎn)物純化后酶切,酶切反應(yīng)體系30 μl,包括PCR擴(kuò)增產(chǎn)物10 μl,限制性核酸內(nèi)切酶10 U,緩沖液2 μl,ddH2O 17 μl。反應(yīng)體系在37℃水浴鍋中溫浴10 h,經(jīng)3%瓊脂糖凝膠(含EB)電泳分析,紫外凝膠成像儀下觀察帶型并攝像,根據(jù)帶型判讀基因型,隨機(jī)選取各基因型測(cè)序驗(yàn)證。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 計(jì)算基因型頻率和等位基因頻率,Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)確認(rèn)研究樣本的群體代表性。采用Pearsonχ2檢驗(yàn)比較病例組與對(duì)照組基因型、基因頻率和各基因聯(lián)合基因型分布,必要時(shí)采用Fisher精確概率檢驗(yàn)。計(jì)算比值比(ORs)評(píng)價(jià)相對(duì)危險(xiǎn)度。單體型(haplotype)和連鎖不平衡分析采用SHEsis軟件采用SPSS17.0軟件。
2.1 MTHFR C677T、A1298C和CβS 844Ins68多態(tài)位點(diǎn)檢測(cè) MTHFR C677T目的片段擴(kuò)增產(chǎn)物198 bp,Hinf I酶切后純合突變型T/T為175、23 bp,雜合基因型C/T為198、175、23bp,野生基因型C/C為198bp(圖1)。MTHFR A1298C目的片段擴(kuò)增產(chǎn)物163 bp,MboⅡ酶切后產(chǎn)生56、31、30、28、18 bp片段為A/A基因型,84、56、31、30、28、18 bp為A/C基因型,84、31、30、28 bp為C/C基因型(圖2)。CβS目的片段擴(kuò)增242 bp為844 Ins68純合子,出現(xiàn)242、174 bp兩個(gè)片段為雜合子,只有174 bp片段為未插入基因型純合子(圖3)。
1:C/C基因型;2,3~5:C/T基因型;4:T/T基因型
1,3,4,6,7:A/A基因型;2:A/C基因型;5:C/C基因型;M:Low MW DNA 標(biāo)準(zhǔn)
M:100 bp DNA標(biāo)準(zhǔn);1~3,5~7:Ins-/Ins-基因型;4:Ins+/Ins-基因型
2.2 MTHFR C677T、A1298C和CβS 844Ins68等位基因和基因型頻率的分布 經(jīng)Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)病例組和對(duì)照組各基因型達(dá)到遺傳平衡(P>0.05),具有群體代表性。病例組 MTHFR 677T 和1298C 等位基因頻率均高于對(duì)照組,但未達(dá)統(tǒng)計(jì)顯著性水平(P>0.05)。CβS 844Ins68等位基因頻率在兩組中分別為0.7%和0.4%,經(jīng)χ2檢驗(yàn)差異無(wú)顯著性(表1)。MTHFR C677T、A1298C和CβS 844Ins68 各基因型頻率在兩組間分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(表1)。見圖1~圖3。兩組均未檢出CβS 844Ins68 突變純合子,在中國(guó)人群中該插入頻率較低。
2.3 聯(lián)合基因型分析與單體型分析 分析存在的聯(lián)合基因型分布,評(píng)價(jià)潛在的基因與基因之間及相同基因不同多態(tài)位點(diǎn)的相互作用。MTHFR 677(T/T)/ 1298(C/C+A/C)聯(lián)合基因型顯著地增加DS發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)(OR=8.46,95%CI:0.90~79.51,P<0.05)(表2)。單體型分析顯示,MTHFR C677T、A1298C 存在較緊密連鎖不平衡(D′=0.68),該調(diào)查人群中存在MTHFR 677T-1298C 單體型,該單體型與DS發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)(OR=5.22,95%CI:1.37~19.94,P<0.01)(表3)。其他相關(guān)基因型的交互作用與DS發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
表1 MTHFR A1298C、C677T和CβS 844Ins68基因型、等位基因頻率及分布〔n(%)〕
表2 兩組MTHFR兩個(gè)位點(diǎn)聯(lián)合基因型的相互作用〔n(%)〕
表3 兩組MTHFR C677T 和 A1298C單體型分析(%)
女性年齡的增大可能導(dǎo)致其體內(nèi)紡錘體組裝檢驗(yàn)點(diǎn)等保障染色體精確分離的功能被“磨損”削弱而最終導(dǎo)致染色體分離異常,然而多數(shù)DS患兒母親較年輕,提示可能存在其他的易感因素〔2,8,9〕。葉酸缺乏及代謝障礙可影響DNA甲基化,使DNA鏈不穩(wěn)定,引起DNA鏈斷裂、染色體重排和不分離〔9〕。葉酸代謝相關(guān)基因變異可能導(dǎo)致葉酸代謝障礙和葉酸功能性缺乏有關(guān)。
MTHFR基因存在2個(gè)常見多態(tài)位點(diǎn),MTHFR C677T多態(tài)性可產(chǎn)生不耐熱的突變體而導(dǎo)致酶活性下降,進(jìn)而引起血漿同型半胱氨酸(Hcy)水平上升,葉酸及一碳單位代謝障礙〔1〕。MTHFR基因的另一個(gè)常見突變位點(diǎn)為A1298C并產(chǎn)生了一個(gè)MboⅡ酶切位點(diǎn),對(duì)應(yīng)編碼的谷氨酸被丙氨酸替代。該位點(diǎn)同樣可以影響酶的活性,特別是與C677T多態(tài)位點(diǎn)合并分析時(shí)。James等〔1〕提出:MTHFR酶活性降低,可影響葉酸和一碳單位代謝,導(dǎo)致DNA低甲基化,是DS發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)因素。而相關(guān)研究顯示MTHFR C677T和A1298C多態(tài)性與DS發(fā)生的關(guān)系尚存在爭(zhēng)議〔10〕。本研究發(fā)現(xiàn),MTHFR A1298C位點(diǎn)變異在安徽皖北人群中頻率較C677T多態(tài)頻率低,和國(guó)內(nèi)相關(guān)研究相符〔4,11〕;本文病例組 C677T 和A1298C 變異基因頻率和基因型頻率均高于對(duì)照組,但未達(dá)統(tǒng)計(jì)顯著性水平,但MTHFR 677(T/T)/ 1298(C/C+ A/C)聯(lián)合基因型與DS發(fā)生顯著相關(guān),與王文等〔4〕研究相符。
本文顯示無(wú)論在病例組還是對(duì)照組,T-A單體型呈現(xiàn)強(qiáng)連鎖,而T-C頻率較低,說(shuō)明人群中存在對(duì)T-C單體型的負(fù)性選擇〔12,13〕。來(lái)自巴西、意大利等地的多項(xiàng)研究肯定了該基因2個(gè)位點(diǎn)的相互作用并認(rèn)為是DS發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)因素〔14,15〕,該結(jié)果也在本研究中得到證實(shí)。最近,Wu等〔16〕Meta分析亦支持MTHFR多態(tài)與DS的發(fā)生相關(guān)。
CβS是Hcy代謝的一種關(guān)鍵酶,催化Hcy轉(zhuǎn)變?yōu)殡琢蛎选;蜃儺惪梢鹈富钚愿淖儚亩绊懷獫{Hcy水平。CβS基因第8外顯子第844 位存在68 bp 片段的插入(844ins68),該插入導(dǎo)致了酶蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的改變,進(jìn)而降低了酶活性。目前認(rèn)為該插入突變與先天性心臟病、神經(jīng)管缺陷和唇腭裂有關(guān)。21三體胎兒含有3份CβS基因,導(dǎo)致體內(nèi)Hcy水平下降形成所謂的“甲基葉酸陷阱”和功能性葉酸缺乏可能導(dǎo)致胚胎的難以存活〔17〕。母體CβS 基因變異導(dǎo)致血漿總Hcy水平增高可能是維持21三體胎兒存活而免于流產(chǎn)的一個(gè)原因。本研究未發(fā)現(xiàn)CβS 844ins68多態(tài)與DS的發(fā)生相關(guān),與Scala等〔14〕和Fintelman-Rodrigues等〔18〕研究相符。本組資料顯示CβS 844ins68發(fā)生頻率相當(dāng)?shù)?,未發(fā)現(xiàn)純合插入突變,與美國(guó)、意大利和巴西人群存在差異,和國(guó)內(nèi)報(bào)道的相符〔14,18~20〕。
綜上所述,雖然葉酸代謝與DS發(fā)生關(guān)系尚存一定爭(zhēng)議,本研究結(jié)果表明不能排除中國(guó)人群葉酸代謝相關(guān)基因特別是MTHFR基因突變?cè)贒S發(fā)生中的作用。進(jìn)一步研究應(yīng)獲取葉酸代謝異常、甲基化障礙而導(dǎo)致卵母細(xì)胞21號(hào)染色體不分離的直接實(shí)驗(yàn)證據(jù),以解釋流行病學(xué)的研究結(jié)果。
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〔2013-09-17修回〕
(編輯 趙慧玲/曹夢(mèng)園)
安徽省自然科學(xué)基金青年基金項(xiàng)目(1208085QC67);蚌埠醫(yī)學(xué)院自然科學(xué)研究項(xiàng)目(BY1019)
廖亞平(1977-),男,副教授,碩士,主要從事非整倍體疾病研究。
R394
A
1005-9202(2015)12-3370-04;
10.3969/j.issn.1005-9202.2015.12.086
1 蚌埠醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院兒科