宋旭日,馮驚濤,2,邢微微,喻鑫玲
(1.岳陽(yáng)職業(yè)技術(shù)學(xué)院醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)部,湖南岳陽(yáng)414000;2.湖南康潤(rùn)藥業(yè)有限公司,湖南岳陽(yáng)414000;3.軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所基因組工程研究室,北京100850;4.湖南省血吸蟲(chóng)病防治所免疫診斷研究室,湖南岳陽(yáng)414000)
日本血吸蟲(chóng)病是一種對(duì)人體健康危害嚴(yán)重、防治難度大、且影響范圍廣的寄生蟲(chóng)病,流行于我國(guó)、日本和菲律賓等地,其病原體是日本血吸蟲(chóng)(Schistosoma japonicum)。目前,由于缺乏對(duì)日本血吸蟲(chóng)病的簡(jiǎn)單且有效的診斷方法,我國(guó)基層血防單位仍主要采用Kato-Katz涂片糞檢法、毛蚴孵育法(MHT)等傳統(tǒng)病原學(xué)方法對(duì)日本血吸蟲(chóng)病進(jìn)行診斷[1],這些方法不但費(fèi)時(shí)、費(fèi)力,而且疫區(qū)群眾依從性低;更為重要的是,隨著吡喹酮的應(yīng)用,疫區(qū)群眾的感染率和感染度明顯下降,這些方法的敏感性也隨之下降,極易造成漏檢[1-2],不利于日本血吸蟲(chóng)病的防治。
日本血吸蟲(chóng)的免疫類(lèi)檢測(cè)方法有皮試、尾蚴膜試驗(yàn)、環(huán)卵沉淀試驗(yàn)(COPT)、間接血凝試驗(yàn)(IHA)、多種酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)和直接免疫檢測(cè)等許多方法,這些方法或特異性不強(qiáng)、或敏感性不高等,限制了它們的應(yīng)用[1,3-4]。血吸蟲(chóng)核酸檢測(cè)是診斷血吸蟲(chóng)病潛在的優(yōu)良檢測(cè)方法,該類(lèi)方法不僅用時(shí)少、成本低,而且具有確診血吸蟲(chóng)病患者的意義。目前,以PCR 法或熒光定量PCR法為基礎(chǔ)的核酸擴(kuò)增技術(shù)已被引入血吸蟲(chóng)診斷領(lǐng)域,國(guó)內(nèi)外均有相關(guān)報(bào)道。但是,PCR或熒光定量PCR 等方法對(duì)儀器設(shè)備和技術(shù)人員的要求相對(duì)都比較高,且結(jié)果判定也較為復(fù)雜,在基層血防單位難以推廣。而核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)對(duì)儀器設(shè)備要求相對(duì)比較低、操作也比較簡(jiǎn)單[5-6],為解決這一問(wèn)題提供了潛在的可能性。環(huán)介導(dǎo)核酸恒溫?cái)U(kuò)增(LAMP)技術(shù)是目前應(yīng)用比較廣泛的核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)之一,本課題組開(kāi)發(fā)的“可視化日本血吸蟲(chóng)核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑”便是依托該技術(shù)的檢測(cè)體系,已經(jīng)在日本血吸蟲(chóng)感染性釘螺的檢測(cè)中獲得了良好的應(yīng)用。通過(guò)建立類(lèi)似的檢測(cè)體系,檢測(cè)經(jīng)日本血吸蟲(chóng)尾蚴感染的新西蘭大白兔等試驗(yàn),探索可視化核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)技術(shù)在日本血吸蟲(chóng)病篩查和診斷中應(yīng)用的可能性。
日本血吸蟲(chóng)感染性釘螺、新西蘭大白兔由湖南省血吸蟲(chóng)病防治所提供。
1.2.1 日本血吸蟲(chóng)感染兔模型建立和樣本采集
1.2.1.1 獲得日本血吸蟲(chóng)尾蚴 將30只感染性釘螺置于三角燒瓶里加水至瓶口1cm~2cm 處,瓶口放尼龍篩網(wǎng)防止釘螺爬出。等到尾蚴逸出至肉眼可見(jiàn)乳白一層后,用解剖針小心挑取尾蚴至蓋玻片上,解剖鏡下計(jì)數(shù)。
1.2.1.2 用日本血吸蟲(chóng)尾蚴感染新西蘭大白兔 取2 kg左右的清潔級(jí)新西蘭大白兔21只,隨機(jī)分為7組,每組3只。第1組作為對(duì)照組,第2組~第7組用腹壁拔毛貼片法[7]分別感染日本血吸蟲(chóng)尾蚴50、100、200、500、1 000、2 000 條。于 感 染 后 第7 天 和 第7周[8],每只兔子各取血清1.5mL~2mL,于-20℃凍存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 兔血清或血漿中的基因組DNA 提取
1.2.2.1 NaOH 煮沸法 取兔血清或血漿50μL,加入等體積的100mmol/L NaOH,充分混勻,沸水浴30 min,水浴過(guò)程中,顛倒混勻混合液3~5次;水浴后,將樣本靜置冷卻,取上清10μL,用等體積的1mmol/L Tris-HCl(pH 8.0)中和,置-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2.2 Qiagen試劑盒法 取兔血清或血漿500 μL,用試劑盒QIAamp DNA Blood Mini Kit抽提基因組DNA,操作步驟按照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,提取的基因組DNA于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2.3 酚氯仿抽提法 取兔血清或血漿500μL,加 入1 000μL 提 取 緩 沖 液(0.15 mol/L NaCl、10 mmol/L EDTA、10 mmol/L Tris-HCl、2%的SDS、5μg/mL鮭魚(yú)精DNA、250μg/mL蛋白酶K,pH7.6),55℃下消化10min,等體積酚氯仿異戊醇(25∶24∶1)抽提2次,12 000r/min離心5min,棄上清,再用氯仿異戊醇(24∶1)抽提,12 000r/min離心5min,棄上清,加入1/10體積NaAc(3mol/L)和2倍體積冷無(wú)水乙醇,在-20℃下沉淀30min,12 000r/min離心10min,棄上清,常溫下750mL/L乙醇洗沉淀2次,第1次浸泡2h,第2 次浸泡30 min,并不時(shí)振蕩。12 000r/min離心5 min,棄上清,60℃溫箱干燥10 min,加20μL TE緩沖液溶解沉淀,于-20℃冰箱保存?zhèn)溆茫?]。
1.2.2.4 TaKaRa 通用型快速試劑盒法 取兔血清或血漿500μL,用試劑盒TaKaRa MiniBEST Universal Genomic DNA Extraction Kit Ver.3.0抽提基因組DNA,操作步驟按照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,提取的基因組DNA于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 可視化核酸恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系的建立 引物設(shè)計(jì):選定日本血吸蟲(chóng)特異性基因片段SJR2(AY027869),用軟件PrimerExplorer V4設(shè)計(jì)該基因的LAMP技術(shù)引物(內(nèi)引物F1P:GAT CAA TAG AGT CAA ACG CCG CCT TTC AGA CGC CCA ACA A,B1P:TTG AAA GGT GTA CCG GAG AAG TCC ATA AGC TCT AAC ACG ACA;外引物F3:GAC AGG TTC TGG AAC ATA GG,B3:GGT CAA TTC CGA AGA CAA TC),交由上海生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
反應(yīng)體系建立:根據(jù)LAMP技術(shù)的特點(diǎn),在PCR反應(yīng)管中加入10×ThermoPol Reaction buffer 2.5 μL,100mmol/L MgC21.5μL,dATP、dCTP和dGTP各1.4 mmol/L,dUTP 2.8 mmol/L,Betaine 0.8 mol/L,Calcein 0.05mmol/L,MnCl20.6mmol/L,引物F3和B3各0.4μmol/L,引物FIP 和BIP 各1.6 μmol/L,Uracil-DNA Glycosylase(1u/μL)0.5μL,Bst DNA Polymerase(8u/μL)1μL,待測(cè)樣本1μL,然后用雙蒸水補(bǔ)足至25μL/反應(yīng)體系。將上述反應(yīng)體系于37℃水浴2 min~15 min(根據(jù)產(chǎn)物污染情況而定),65℃水浴60min~90min(根據(jù)對(duì)試劑靈敏度要求而定),85℃滅活5min。陰、陽(yáng)性結(jié)果根據(jù)反應(yīng)體系的顏色變化判定。正常情況下,陰性結(jié)果的反應(yīng)體系顯示為棕黃色,陽(yáng)性結(jié)果的反應(yīng)體系顯示為熒光綠色。
1.2.4 主要試劑 Bst DNA Polymerase(Large fragment)、10×Thermo Pol reaction buffer和Magnesium sulfate solution(100mmol/L)購(gòu)自New England Biolabs公司;Tris-base、十二烷基磺酸鈉(Sodium dodecyl sulfate,SDS)、Betaine和Calcein 購(gòu) 自Sigma 公 司;dATP、dCTP、dGTP、dUTP 和Uracil-DNA Glycosylase購(gòu)自Thermoscientific公司;蛋白酶K購(gòu)自Sigma公司;TaKaRa MiniBEST Universal Genomic DNA Extraction Kit Ver.3.0購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司;QIAamp DNA Blood Mini Kit購(gòu)自Qiagen(德國(guó));引物購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司;其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
NaOH 煮沸法抽提的兔血清或血漿中基因組DNA經(jīng)可視化日本血吸蟲(chóng)核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑檢測(cè),均為陰性結(jié)果,即便是500條以上血吸蟲(chóng)尾蚴感染組的新西蘭大白兔血清或血漿提取物也均未觀察到陽(yáng)性結(jié)果(圖1)。
Qigen試劑盒法抽提的兔血清或血漿(第7天)中基因組DNA經(jīng)可視化日本血吸蟲(chóng)核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑檢測(cè),陰性對(duì)照組和50條血吸蟲(chóng)尾蚴感染組為陰性結(jié)果,100條以上血吸蟲(chóng)尾蚴感染組為陽(yáng)性結(jié)果(圖2)。
酚氯仿法抽提的兔血清或血漿(第7天)中基因組DNA經(jīng)可視化日本血吸蟲(chóng)核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑檢測(cè),陰性對(duì)照組和50條血吸蟲(chóng)尾蚴感染組為陰性結(jié)果,200條以上血吸蟲(chóng)尾蚴感染組為陽(yáng)性結(jié)果,100條血吸蟲(chóng)尾蚴感染組均為可疑陽(yáng)性結(jié)果(圖3)。
TaKaRa通用型快速試劑盒法抽提的兔血清或血漿(第7天)中基因組DNA 經(jīng)可視化日本血吸蟲(chóng)核酸檢測(cè)試劑檢測(cè),陰性對(duì)照組、50、100和200條血吸蟲(chóng)尾蚴感染組為陰性結(jié)果,500條以上血吸蟲(chóng)尾蚴感染組為陽(yáng)性結(jié)果(圖4)。
圖1 可視化日本血吸蟲(chóng)核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑檢測(cè)NaOH煮沸法抽提的兔血清中基因組DNA 結(jié)果Fig.1 The detecting results of rabbit serum genomic DNA extracted by boiling method
圖2 可視化日本血吸蟲(chóng)核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑檢測(cè)Qiagen試劑盒法抽提的兔血清中基因組DNAFig.2 The detecting results of rabbit serum genomic DNA extracted by QIAamp DNA Blood Mini Kit(Qiagen)
圖3 可視化日本血吸蟲(chóng)核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑檢測(cè)酚氯仿法抽提的兔血清中基因組DNAFig.3 The detecting results of rabbit serum genomic DNA extracted by phenol chloroform method
圖4 可視化日本血吸蟲(chóng)核酸檢測(cè)試劑檢測(cè)TaKaRa通用型快速試劑盒法抽提的兔血清中基因組DNAFig.4 The detecting results of rabbit serum genomic DNA extracted by TaKaRa MiniBEST Universal Genomic DNA Extraction Kit Ver.3.0
在我國(guó)基層血防單位對(duì)日本血吸蟲(chóng)病的診斷仍主要采用傳統(tǒng)的病原學(xué)診斷方法,不但費(fèi)時(shí)費(fèi)力,而且敏感度有限,容易造成漏檢,并且對(duì)于早期日本血吸蟲(chóng)病無(wú)效。隨著近年來(lái)吡喹酮的廣泛使用,血吸蟲(chóng)病呈現(xiàn)低感染度的流行趨勢(shì),為敏感度有限的傳統(tǒng)病原學(xué)診斷提出了更為嚴(yán)厲的挑戰(zhàn)。其他的診斷方法包括免疫學(xué)診斷方法和核酸診斷方法等,免疫學(xué)診斷方法大多敏感性/特異性不夠強(qiáng),核酸診斷方法大多儀器設(shè)備要求較高,且操作復(fù)雜,無(wú)法推廣使用。
本課題組 根 據(jù)LAMP 技 術(shù) 的 特 點(diǎn)[9-10],開(kāi) 發(fā) 的可視化日本血吸蟲(chóng)核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑是一種儀器設(shè)備要求簡(jiǎn)單、操作容易、結(jié)果判定方便的檢測(cè)試劑,且特異性強(qiáng),敏感性高(相對(duì)病原學(xué)診斷方法),已經(jīng)在日本血吸蟲(chóng)感染性釘螺的檢測(cè)中獲得了良好的應(yīng)用。本研究應(yīng)用該試劑對(duì)不同感染度的日本血吸蟲(chóng)感染兔進(jìn)行檢測(cè),評(píng)價(jià)該試劑在日本血吸蟲(chóng)病的篩查和診斷等工作中應(yīng)用的可能性。該試劑的優(yōu)點(diǎn)是儀器設(shè)備要求簡(jiǎn)單、操作容易、結(jié)果判定方便等,但它必須結(jié)合良好的核酸提取方法組成完整的檢測(cè)試劑。目前,核酸提取工作多比較復(fù)雜,這將抵消該試劑的優(yōu)點(diǎn),使該試劑無(wú)法在基層血防單位推廣使用。根據(jù)報(bào)道,將日本血吸蟲(chóng)感染性釘螺用NaOH 煮沸即可作為L(zhǎng)AMP試劑的DNA 模板[11],因此本研究設(shè)計(jì)了NaOH 煮沸法提取血清中核酸。然而,即便是使用高感染度(500條以上血吸蟲(chóng)尾蚴感染)或感染后期(感染7周后)的新西蘭大白兔血清或者血漿,該檢測(cè)試劑也均未能檢測(cè)到陽(yáng)性結(jié)果。究其原因,可能是血清或血漿中的血吸蟲(chóng)核酸片段數(shù)量非常有限,簡(jiǎn)單的NaOH 煮沸無(wú)法像煮沸釘螺那樣釋放足夠量的日本血吸蟲(chóng)DNA 模板。
為了進(jìn)一步觀察血清作為“可視化日本血吸蟲(chóng)核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑”的樣本的可能性,本研究分別用Qiagen試劑盒法和傳統(tǒng)的酚氯仿法[8]再次提取兔血清樣本中的基因組DNA 作為該試劑的模板。結(jié)果顯示,對(duì)100條以上日本血吸蟲(chóng)尾蚴感染的新西蘭大白兔血清,該試劑均可以檢測(cè)到陽(yáng)性結(jié)果。然而,這兩種血清基因組DNA 提取方法操作都相對(duì)比較復(fù)雜,不適合在基層血防單位推廣使用。因此,本研究又選取了寶生物工程(大連)有限公司生產(chǎn)的通用型基因組DNA 提取試劑盒(TaKaRa MiniBEST Universal Genomic DNA Extraction Kit Ver.3.0)。該試劑盒操作相對(duì)簡(jiǎn)便、快速,但對(duì)200條以下日本血吸蟲(chóng)尾蚴感染的新西蘭大白兔,卻未能檢測(cè)到陽(yáng)性結(jié)果。本課題組還將繼續(xù)對(duì)此進(jìn)行研究。
總之,本研究初步探索了可視化核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)在日本血吸蟲(chóng)病的篩查和診斷中的應(yīng)用可能性。盡管本研究設(shè)計(jì)的檢測(cè)方法(包括核酸提取和核酸擴(kuò)增檢測(cè))暫未能檢測(cè)到低感染度新西蘭兔血清或者血漿中的日本血吸蟲(chóng)核酸片段,但隨著LAMP技術(shù)的進(jìn)步和核酸提取方法的不斷改進(jìn),可視化核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)憑借其儀器設(shè)備要求簡(jiǎn)單、操作容易、結(jié)果判定方便的優(yōu)勢(shì),完全有可能在基層血防單位的日本血吸蟲(chóng)病篩查和診斷等工作中推廣應(yīng)用。
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