李志喜 胡 明 劉超 楊曉亮
(南京大學化學化工學院,配位化學國家重點實驗室,南京210093)
基于Cyclam衍生物的單核金屬配合物的結(jié)構(gòu)及核酸酶活性
李志喜 胡 明 劉超 楊曉亮*
(南京大學化學化工學院,配位化學國家重點實驗室,南京210093)
以1,8-二甲基-1,4,8,11-四氮雜環(huán)十四烷為原料,以N,N′-二叔丁氧羰基-2-甲璜酰氧基-1,3-二氨基丙烷為烷基化試劑,合成了cyclam衍生物:1,8-二(N,N′-二叔丁氧羰基-1,3-二氨基異丙基)-4,11-二甲基-1,4,8,11-四氮雜環(huán)十四烷(L1);及其對應的系列單核金屬配合物,Zn(L1)Cl2(1),Ni(L1)Cl2(2)和Cu(L1)Cl2(3);核磁結(jié)果表明,L1為C2對稱結(jié)構(gòu),且cyclam環(huán)上每一個亞甲基碳上的2個氫化學不等價;利用2D[1H,15N]HSQC對比配體配位前后N-H化學位移的變化,確定配合物的結(jié)構(gòu)是金屬與配體cyclam環(huán)上的4個氮原子配位;利用變溫核磁1H NMR和13C NMR,結(jié)合2D[1H,15N]HSQC核磁共振波譜表明,配合物1在溶液中主要以兩種構(gòu)型并存,并主要以trans-Ⅲ構(gòu)型存在。此外,用凝膠電泳研究了配體與單核金屬配合物對超螺旋pBR322質(zhì)粒DNA切割活性;實驗結(jié)果表明,配合物3在抗壞血酸存在的條件下具有核酸酶活性,而配體(L1),配合物1和配合物2在實驗條件下,無論是氧化切割還是水解切割都顯陰性。
Cyclam衍生物;單核金屬配合物;構(gòu)型;人工核酸酶
大環(huán)多胺化合物與許多金屬離子有良好的結(jié)合能力,通常在結(jié)合過程中伴隨著大環(huán)的構(gòu)型變化[1-2]。Cyclam(1,4,8,11-四氮雜環(huán)十四烷)是最常用的大環(huán)多胺之一,也是配位化學領域中使用最為廣泛的配體之一。Cyclam衍生物在與金屬的結(jié)合過程中,由于N-取代基空間分布的不同,會產(chǎn)生五種可能的構(gòu)型:RSRS、RSRR、SSRR、RSSR以及RRRR,分別命名為trans-Ⅰ~trans-Ⅴ[3]。
近年來,金屬小分子化合物作為DNA的切割試劑得到廣泛的研究[4-5],特別是人工水解切割酶的設計與合成,因為水解切割除了能得到含有粘性末端的斷裂產(chǎn)物外,同時還具有高選擇性、高效率的特點[6-7]。而大環(huán)多胺類的銅,鋅和鎳配合物被用于人工核酸酶研究,具有良好的DNA切割活性[8-10]。
為了尋求有效的cyclam衍生物的金屬人工核酸酶,本文以1,8-二甲基-1,4,8,11-四氮雜環(huán)十四烷為原料,N,N′-二叔丁氧羰基-2-甲璜酰氧基-1,3-二氨基丙烷為烷基化試劑,合成得到了cyclam衍生物:1,8-二(N,N′-二丁氧羰基-1,3-二氨基異丙基)-4,11-二甲基-1,4,8,11-四氮雜環(huán)十四烷(L1);及其對應的系列單核金屬配合物:Zn(L1)Cl2(1),Ni(L1)Cl2(2)和Cu(L1)Cl2(3);利用1H、13C NMR及2D[1H,15N]HSQC對比配體和配合物側(cè)鏈N-H化學位移的變化,確定了配合物的結(jié)構(gòu)是金屬與cyclam環(huán)上的4個N進行配位;利用變溫核磁1H NMR和13C NMR,結(jié)合2D[1H,15N]HSQC核磁共振波譜表明,配合物1在溶液中以2種構(gòu)型并存,并主要以trans-Ⅲ構(gòu)型存在。用凝膠電泳研究了配體和單核金屬配合物對超螺旋pBR322質(zhì)粒DNA切割活性。
1.1 試劑和儀器
常用化學試劑例如:乙酸乙酯,甲醇,二氯甲烷,乙腈,二甲基亞砜,乙醚,異丙醇,丙酮,三乙胺,碳酸鉀,氯化鈉,石油醚,正己烷,硫酸鈉,水合氯化銅,水合氯化鎳,碳酸氫鈉,氯化鋅等為分析純,均從試劑公司購得,使用前未做進一步純化。其中無水二氯甲烷,無水三乙胺和無水乙腈是在氫化鈣存在下,回流數(shù)小時進行無水處理。1,8-二甲基-1,4,8,11-四氮雜環(huán)十四烷購自Aldrich公司,1,3-二氨基-2-丙醇購自安耐吉公司。紅外光譜在Bruker VECTOR 22紅外光譜儀上測定(4 000~400 cm-1,KBr壓片)。1H NMR、13C NMR均在Bruker AVANCEⅢ600核磁儀上測定(298.5 K),變溫13C NMR在Bruker AVANCEⅢ400核磁儀上測定。電噴霧質(zhì)譜在LCQ電噴霧質(zhì)譜儀(ESI-MS,F(xiàn)innigan)上測定,配合物的組成通過比較實測同位素峰形和ISOPRO 3.0程序的模擬峰形確定。
1.2 L1的合成
配體L1的合成路線如Scheme 1所示,其中烷基化試劑A1按文獻方法[11]在本實驗室合成得到。配體L1按文獻方法合成[12],在100 mL的三頸瓶中,依次稱取1,8-二甲基-1,4,8,11-四氮雜環(huán)十四烷(1.0 g,4.4 mmol),無水碳酸鉀(2.0 g,14.0 mmol),KI(1.5 g,9.3 mmol),烷基化試劑A1(3.6 g,9.6 mmol),加入無水乙腈(100.0 mL),氮氣保護下回流48 h。冷卻后過濾,真空濃縮后得到黃色油狀液體。柱層析分離:=100∶10∶0.2)(硅膠300~400目)。濃縮得白色固體,收率:15%。L1的高分辨質(zhì)譜:m/z=795.5685[L1+Na]+(Found),m/z=795.568 4[L1+Na]+(Calcd.)。1H NMR(600 MHz,DMSO-d6)δ:3.40(bs,2H,-CH),3.05~3.09(d,4H,CH2NHBoc),2.54(d,2H,α-CH2),2.58(s,2H,CH2NHBoc),2.53(s,4H,α-CH2),2.36(m, 4H,α-CH2),2.23(2H,d,α-CH2),2.21(s,2H,CH2NHBoc),2.17(s,6H,NCH3),1.75(bs,2H,β-CH2),1.51(bs,2H,β-CH2),1.37(s,36H,C(CH3)3)。13C NMR(150 MHz,DMSO-d6)δ:156.41,155.91,77.86,54.96,53.04,52.31, 51.65,49.40,48.53,43.83,42.08,28.73,28.66,24.74。紅外光譜(KBr壓片):3385,2970,2795,1 691,1 513, 1 369,1 171 cm-1。
Scheme 1Synthesis of L1
1.3 單核金屬配合物的合成[13]與表征
分別將ZnCl2(0.15 mmol),NiCl2·2.5H2O(0.15 mmol)和CuCl2·2H2O(0.15 mmol)與L1(0.05 mmol)溶于甲醇(5.0 mL)中,回流4 h,將混合溶液濃縮至1.0 mL,將其滴加到乙醚中,離心,干燥,得灰色粉末Zn(L1)Cl2(1),深綠色粉末Ni(L1)Cl2(2)和深藍色粉末Cu(L1)Cl2(3)。對于鎳和銅配合物,由于順磁性的影響,對其進行表征主要利用電噴霧質(zhì)譜。
配合物1(ZnC38H76N8O8Cl2)的電噴霧質(zhì)譜:m/z=873.7[1-Cl]+,m/z=835.7[1-2Cl+H]+。1的1H NMR(600 MHz,DMSO-d6)δ:1.31~1.52(m,40H),1.55~2.46(m,16H),2.54~3.32(m,16H)。紅外光譜(KBr壓片):3 445,2 989,1 687,1 633,1 145,1 070,535 cm-1。
配合物2(NiC38H76N8O8Cl2)的電噴霧質(zhì)譜:m/z= 865.5[2-Cl]+,m/z=830.5[2-2Cl-H]+。紅外光譜(KBr壓片):3 354,2 982,2 926,1 703,1 518,1 368,1 252,1 171 cm-1。
配合物3(CuC38H76N8O8Cl2)的電噴霧質(zhì)譜:m/z= 871.3[3-Cl]+,m/z=835.3[3-2Cl-H]+。紅外光譜(KBr壓片):3424,2978,1678,1633,1127,1043,533 cm-1。
圖1 配合物1~3的ESI-MS與程序模擬峰Fig.1 ESI-MS spectra of complexes 1~3 in a methanol solution
1.4 配體與單核金屬配合物的對DNA的切割實驗
以超螺旋pBR322質(zhì)粒DNA為底物,Tris-HCl電泳緩沖液(50 mmol·L-1Tris-HCl/50 mmol·L-1NaCl,pH 7.4)的水溶液介質(zhì)中,分別考察了配體和單核金屬配合物對DNA的切割活性。實驗條件為:DNA的濃度為200 ng·L-1,實驗溫度為37℃或55℃,在電泳分離前,底物與各化合物孵化1 h或6 h,抗壞血酸的物質(zhì)的量為化合物的100倍。每份樣品利用凝膠電泳分析結(jié)果,用UVP凝膠成像系統(tǒng)完成電泳圖的成像。
2.1 L1的結(jié)構(gòu)研究
圖2 配體L1的13C譜(600 MHz,DMSO-d6)Fig.2 13C NMR spectrum of L1(600 MHz,DMSO-d6)
圖3 配體L1的2D[1H,13C]HSQC譜(600 MHz,DMSO-d6)Fig.3 2D[1H,13C]HSQC spectrum of L1(600 MHz, DMSO-d6)
在合成得到配體L1后,其結(jié)構(gòu)經(jīng)IR、MS、1H NMR、13C NMR及2D NMR進行確定,該化合物的核磁共振氫譜共有10組峰,碳譜共有14組峰(圖2),據(jù)此可以推測L1呈C2對稱結(jié)構(gòu);在其2D[1H,13C]HSQC(圖3)中,結(jié)合2D COSY,通過對配體L1歸屬可發(fā)現(xiàn),配體L1的cyclam環(huán)上的每一個亞甲基碳上的2個氫都是化學不等價;在側(cè)鏈上,同側(cè)1,3-位2個亞甲基的1H,13C(3.06/42.08,2.21/48.53)化學位移也不相同。
2.2 配合物1的配位點及構(gòu)型研究
2.2.1 2D[1H,15N]HSQC對配合物1配位點的研究
早期對于cyclam衍生物的金屬配合物構(gòu)型研究時,通常選用未經(jīng)結(jié)構(gòu)修飾的cyclam或用橋連基團將cyclam環(huán)固定而得到的衍生物為模板,利用核磁滴定或通過合成的方法得到其金屬配合物,來研究溶液狀態(tài)下不同金屬以及同種金屬不同陰離子的條件下cyclam衍生物金屬配合物的構(gòu)型問題[3,14]。本研究中單核鋅配合物1由配體L1與ZnCl2反應得到。在圖4中比較配合物1和配體L1的1H NMR可以看到:配合物1 cyclam環(huán)上的烷基峰信號(3.9~1.9)和配體相比,有很大的改變,其中N-Me化學位移由2.17向低場移至2.42,而側(cè)鏈上的烷基氫及氮氫化學位移變化不大;配合物1的13C NMR中,cyclam環(huán)上的烷基碳的化學位移分別是:61.46,62.30(C2);44.37,44.60(C3);57.85,57.53(C4);51.50(C5);55.40,55.08(C9)。與對應的配體L1的54.96(C2);43.83(C3);51.65(C4);52.32(C5);53.04(C9)相比明顯的向低場移動。核磁共振氫譜、碳譜均表明鋅是與cyclam環(huán)上的氮原子進行配位;為了進一步研究配合物的配位點,我們利用2D[1H,15N]HSQC核磁技術(shù),對比配體在配位前后N-H化學位移的變化來研究其配位點。在配體L1的2D[1H,15N]HSQC (圖5)中,因側(cè)鏈化學環(huán)境的不同,可以看到2組交叉峰,即H1(7.01,79.65)和H2(6.90,90.47),分別對應為側(cè)鏈1,3-位亞甲基相連的2個Boc保護的伯胺氮原子上的氫;而在配合物1的2D[1H,15N]HSQC中,可以看到3個交叉峰,即H1(7.07,80.33),H2(6.94, 79.96),以及H3(6.98,94.22),通過對比可以發(fā)現(xiàn),配體L1在配位前后,其側(cè)鏈15N和1H的化學位移都未發(fā)生明顯變化,因此可以推測金屬鋅在與配體L1進行配位時,其側(cè)鏈的N并未參與配位,此外根據(jù)N-H相關(guān)峰的組數(shù),也可以發(fā)現(xiàn)配合物1呈一個對稱的結(jié)構(gòu),結(jié)合Zn的配位特點(四配位,五配位和六配位),可推測配合物1的結(jié)構(gòu)是金屬Zn是與cyclam環(huán)上的4個N進行配位。
圖4 配合物1與配體L1的1H NMR譜(600 MHz, DMSO-d6)Fig.4 Compare of1H NMR of complex 1 and L1(600 MHz,DMSO-d6)
圖5 配體L1和配合物1的2D[1H,15N]HSQC(600 MHz,DMSO-d6)Fig.5 2D[1H,15N]HSQC spectrum of L1and complex 1(600 MHz,DMSO-d6)
Cyclam衍生物在與金屬的結(jié)合過程中,由于N取代基空間分布的不同,在溶液中,金屬配合物會以多種構(gòu)型共存。而當溫度逐漸升高時,構(gòu)型之間就會發(fā)生轉(zhuǎn)換而趨向于形成熱力學最為穩(wěn)定的構(gòu)型[15],因此可以利用變溫核磁進行實時原位的跟蹤,來研究溶液中配合物的構(gòu)型之間的轉(zhuǎn)換。在圖4中,比較配合物1在不同溫度下的的1H NMR譜可以看出:當溫度升高到70℃時,配合物的耦合裂分由于構(gòu)型的轉(zhuǎn)換而更加清晰。進一步利用變溫核磁碳譜驗證了配合物在溶液中以多種構(gòu)型的共存。從圖6碳譜上可以明顯看到,隨著溫度的升高,碳譜峰的組數(shù)逐漸減少,最后以一個熱力學最為穩(wěn)定的構(gòu)型存在。根據(jù)配合物的結(jié)構(gòu)特點,結(jié)合2D[1H,15N]HSQC,在配體L1的2D[1H,15N]HSQC中,由于側(cè)鏈化學環(huán)境的不同,可以看到兩組交叉峰,分別為側(cè)鏈1,3-位亞甲基相連的2個Boc保護的伯胺氮原子上的氫;在配合物1的2D[1H,15N]HSQC中,有3個交叉峰,可能存在一種主要構(gòu)型,據(jù)文獻可以推測該構(gòu)型為trans-Ⅲ(圖7)構(gòu)型[16]。
圖6 配合物1在不同溫度下的13C NMR譜(400 MHz, DMSO-d6)Fig.6 13C NMR spectrum of complex 1 at different temperature(400 MHz,DMSO-d6)
圖7 cyclam衍生物的trans-Ⅰ~trans-Ⅴ構(gòu)型Fig.7 trans-Ⅰ~trans-ⅤConfiguration of cyclam derivatives
2.3 配體和金屬配合物對DNA的切割
金屬小分子化合物作為DNA的切割試劑得到廣泛的研究,特別是人工水解切割酶的設計與合成。以超螺旋pBR322質(zhì)粒DNA為底物,在Tris-HCl電泳緩沖液(50 mmol·L-1Tris-HCl/50 mmol·L-1NaCl,pH 7.4)的水溶液介質(zhì)中,分別考察了配體和金屬配合物對DNA的切割活性。通過實驗發(fā)現(xiàn),配合物3在抗壞血酸存在的條件下具有核酸酶活性,其切割的機理可能是[17]:Cu得到一個電子形成Cu,Cu在化學還原試劑(抗壞血酸)存在下與氧分子反應生成超氧自由基,與DNA的磷酸二酯鍵發(fā)生氧化還原反應,使磷酸二酯鍵發(fā)生斷裂;而配體(L1),配合物1和配合物2在實驗條件下,無論是氧化切割還是水解切割都顯陰性,對于配合物1和配合物2,分析可能是因為cyclam環(huán)上的4個N與金屬配位后,由于N的給電子效應降低了金屬的路易斯酸性,使其在實驗條件下不能有效的降低中心原子的電荷密度,從而對DNA無論是氧化切割還是水解切割都顯陰性;基于此假設,我們通過改變cyclam環(huán)上的取代基,設計合成了系列單核鋅的金屬配合物,在對其核酸酶活性研究中發(fā)現(xiàn),當cyclam環(huán)上的N為吸電子取代基時,其對應的鋅配合物表現(xiàn)出核酸酶活性,目前這部分工作還在整理過程中。
圖8 pBR322(200 ng·μL-1)質(zhì)粒DNA與L1(a),1(b), 2(c)和3(d)的凝膠電泳圖Fig.8 Agarose gel electrophoresis for cleavage of the pBR322 plasmid DNA(200 ng·μL-1)by L1(a), 1(b),2(c)and 3(d)
本研究以1,8-二甲基-1,4,8,11-四氮雜環(huán)十四烷為原料,以N,N′-二叔丁氧羰基-2-甲璜酰氧基-1,3-二氨基丙烷為烷基化試劑,合成得到了cyclam衍生物配體L1以及其對應的系列單核金屬配合物:Zn(L1)Cl2(1),Ni(L1)Cl2(2)和Cu(L1)Cl2(3);核磁結(jié)果表明,L1為C2對稱結(jié)構(gòu),且cyclam環(huán)上每一個亞甲基碳上的2個氫化學不等價;利用2D[1H,15N]HSQC對比配體在配位前后,N-H化學位移的變化,確定配合物的結(jié)構(gòu)是金屬與配體cyclam環(huán)上的4個N進行配位;利用變溫核磁,結(jié)合2D[1H,15N]HSQC,發(fā)現(xiàn)配合物1在溶液中以2種構(gòu)型并存,并主要以trans-Ⅲ構(gòu)型存在。此外用凝膠電泳研究了配體與單核金屬配合物對超螺旋pBR322質(zhì)粒DNA切割活性。發(fā)現(xiàn)配合物3在抗壞血酸存在的條件下具有核酸酶活性,而配體L1,配合物1和配合物2在實驗條件下,無論是氧化切割還是水解切割都顯陰性。對于配合物1和配合物2,分析可能是因為cyclam環(huán)上的4個N與金屬配位,由于N的給電子效應降低了金屬的路易斯酸性,使其在實驗條件下不能有效的降低中心原子的電荷密度,從而對DNA無論是氧化切割還是水解切割都顯陰性,該研究結(jié)果可為以cyclam衍生物為基礎的人工核酸酶的設計與合成提供一定的參考。
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Structural Characterization and Artificial Nuclease Activity of Transition Metal Complexes of Cyclam Derivatives
LI Zhi-XiHU MingLIU ChaoYANG Xiao-Liang*
(State Key Laboratory of Coordination Chemistry,Chemistry and Chemical Engineering, Nanjing University,Nanjing 210093,China)
A cyclam-based ligand:tetratert-butyl((4,11-dimethyl-1,4,8,11-tetraazacyclotetradecane-1,8-diyl)bis (propane-3,2,1-triyl))tetracarbamatev(L1),and its metal complexes[Zn(L1)Cl2](1),[Ni(L1)Cl2](2)and[Cu(L1)Cl2] (3)were designed and synthesized.L1has a C2 symmetrical structure and the1H chemical shift of the same carbon was different because of the influence of cyclam ring.The metal binding site of the L1was confirmed by 2D[1H,15N]HSQC by comparing the chemical shift of N of the branched chains of the ligand that of with the corresponding metal complex.The co-existence of two configuration was characterized by13C VT NMR combined with 2D[1H,15N]HSQC NMR and trans-Ⅲwas confirmed to be the main configuration for complex 1.The cleavage activity of the ligand L1and the complexes 1~3 was investigated in detail under physiological conditions.Agarose gel electrophoresis experiments showed that the complex 3 possesses interesting nuclease activity in the present of ascorbate;No matter the hydrolysis or oxidation,the ligand L1and complex 1,and 2 were negative to DNA at the experimental conditions.
cyclam derivatives;mono-metal complex;configuration;artificial nuclease
O614.24+1;O614.81+3;O614.121
A
1001-4861(2015)01-0127-06
10.11862/CJIC.2015.023
2014-08-11。收修改稿日期:2014-10-24。
國家自然科學基金(No.21131003)資助項目。
*通訊聯(lián)系人。E-mail:yxlnmr@nju.edu.cn