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        基于NP968核酸提取儀 (磁珠法)的實時熒光定量PCR系統(tǒng)檢測HBVDNA的性能評價

        2015-05-10 02:01:50王建偉孫嘉峰黃毅
        實驗與檢驗醫(yī)學 2015年5期
        關鍵詞:磁珠精密度檢出限

        王建偉,孫嘉峰,黃毅

        (1、福建省立醫(yī)院南院福建省立金山醫(yī)院檢驗科,福建 福州350008;2、福建省立醫(yī)院檢驗科,福建 福州350001)

        乙型肝炎病毒DNA(hepatitis B virus Deoxyribonucleic acid,HBV DNA)是反映HBV復制活躍程度及傳染性的最直接指標,也是觀察抗病毒藥物療效、預后和指導抗病毒藥物應用的重要指標之一。HBVDNA定量檢測從根本上突破了免疫學方法等間接方法的局限性,通過直接檢測病毒核酸水平,可真實反應患者體內(nèi)病毒水平[1-3]。目前提取HBVDNA主要采用煮沸法,該法不能有效去除干擾物質(zhì)如血紅蛋白,提取的血漿HBV DNA含量較低,接近臨界值標本的提取結(jié)果不穩(wěn)定,在臨床檢測中容易產(chǎn)生假陰性[4]。本研究應用西安天隆NP968自動核酸提取儀(磁珠法)提取HBVDNA,相比傳統(tǒng)的煮沸法,具有快速、簡便、減少人工誤差等特點。根據(jù)ISO15189醫(yī)學實驗室認可標準[5],必須對其檢測系統(tǒng)進行性能評價,本文通過分析其精密度、線性、回收率、最低檢出限,并將檢測結(jié)果與傳統(tǒng)煮沸法進行對比,分析其相關性,從而評價該法對HBVDNA檢測的性能。

        1 材料與方法

        1.1 標本來源 來自2014年10月13日至10月17日我院PCR實驗室接收的79例門診患者血漿標本及我院免疫室接收的20份我院國內(nèi)體檢健康人血清標本。

        1.2 儀器與試劑

        1.2.1 試劑 HBVDNA熒光定量PCR檢測試劑盒與HBVDNA標準品(廣州達安公司);核酸提取(磁珠法)試劑盒(西安天隆公司)。

        1.2.2 儀器 NP968核酸提取儀(NP968,西安天隆公司);ABI7300實時熒光PCR儀 (ABI7300,美國ABI公司)。

        1.3 檢測方法

        1.3.1 HBVDNA提取與檢測

        1.3.1.1 煮沸法 按照達安公司HBVDNA熒光定量PCR檢測試劑盒說明書取待測血漿樣本、HBVDNA熒光定量PCR檢測試劑盒內(nèi)陽性對照品、陰性對照品、標準品和自制高值、低值質(zhì)控品各30μl,分別加入70μl核酸提取液,充分振蕩混勻后 ,100℃ 恒 溫 處 理 10±1min,12000r/min 離 心5min,取 20μl上清液加入反應管,在 ABI7300實時熒光PCR儀上進行HBVDNA的定量檢測。

        1.3.1.2 磁珠法 按照NP968自動核酸提取儀 (磁珠法)試劑盒說明書,取待測血漿、達安試劑盒陽性對照品、陰性對照品、標準品和質(zhì)控品各200μl,加入預先分裝好自動核酸提取液的板孔內(nèi),放入NP968自動核酸提取儀內(nèi),按預定的提取程序自動執(zhí)行核酸提取,最終得到100μl洗脫液,取20μl上清液加入反應管,在ABI7300實時熒光PCR儀上進行HBVDNA的定量檢測。

        1.3.2 精密度評價 按照CLSI EP15-A2標準:2個濃度水平,5d實驗,每天一批,每批每個水平重復測定3次,所有測定數(shù)據(jù)均轉(zhuǎn)化為對數(shù)值。

        1.3.3 線性評價 選擇1份高值患者血漿標本,濃度接近廠家試劑盒說明書給出的線性范圍上限(5.00E8 IU/ml),按1:10用正常人血漿倍比稀釋此高值標本直至濃度接近線性范圍下限 (1.00E2 IU/ml),形成濃度由高到低7份待測實驗樣品。每份實驗樣品在檢測系統(tǒng)上重復測定2次,結(jié)果轉(zhuǎn)換為對數(shù),取2次測定的均值作為實測值(Y);以其系列稀釋后理論上應含有的濃度(亦取對數(shù))作為預期值(X),將所有結(jié)果點在X-Y坐標圖上,計算回歸方程:Y=bX+a。

        1.3.4 回收率 選擇廠家配套低值標準品為基礎樣本,取180μl基礎樣本和20μl蒸餾水作為對照樣本, 分別取 180μl基礎樣本和 20μl濃度為2.0E6IU/ml、2.0E5IU/ml和 2.0E4IU/ml的標準品作為回收樣品。每份樣品在檢測系統(tǒng)上測定3次,結(jié)果轉(zhuǎn)換為對數(shù),取平均值。根據(jù)以下公式計算回收率:回收率=回收濃度/加入濃度×100%;回收濃度=最終測定濃度-基礎樣本濃度;加入濃度=標準品濃度×標準品體積/(標準品體積+基礎樣本體積)[6]。

        1.3.5 最低檢出限 依據(jù)YY/T 1182-2010中華人民共和國醫(yī)藥行業(yè)標準 《核酸擴增檢測用試劑(盒)》之6.8.2條款要求[7],采用無菌注射用水將購自衛(wèi)生部臨床檢驗中心的HBVDNA血清標準物質(zhì)(1.20±0.24)E6 IU/ml按 1:10000 進行稀釋,使其濃度達到廣州達安公司HBVDNA試劑聲明的最低檢出限(1.00E2 IU/ml)后,進行25次重復檢測,以至少22次結(jié)果≥1.00E2 IU/ml為最低檢出限驗證通過;如不符合此要求,應查找原因,并補充數(shù)據(jù)或重新實驗。

        1.3.6 參考區(qū)間 參考NCCLSC28-A2,通過測定29份我院國內(nèi)體檢健康人血清標本 (標本從我科免疫組獲得,乙肝兩對半模式為全陰/或-+---/或-+--+)的 HBV DNA 濃度,對〈1.00E3 IU/ml的生物參考區(qū)間進行驗證;若20份標本的檢測結(jié)果均在參考區(qū)間內(nèi)或僅有2個標本超出,則驗證通過。否則,進行參考區(qū)間確立實驗。

        1.3.7 相關性評價 分別采用煮沸法和磁珠法提取79例患者血漿標本進行熒光定量PCR,比較兩種方法的相關性。

        1.4 統(tǒng)計學方法 將定量HBVDNA拷貝數(shù)轉(zhuǎn)化為對數(shù)值,所有統(tǒng)計學處理均在SPSS20.0統(tǒng)計軟件包上進行。

        2 結(jié)果

        2.1 精密度驗證 低、高水平樣本檢測的批內(nèi)精密度均<3/5TEa,批間精密度均<4/5TEa。該檢測方法的批內(nèi)及批間精密度均符合廠家要求小于5%(見表1)。

        表1 精密度驗證結(jié)果

        2.2 線性范圍驗證 HBV-DNA在4.16E2-4.16E8 IU/ml范圍內(nèi)具良好線性關系 (廠家線性范圍1.0E2-5.0E8 IU/ml),R2=0.989,b=1.01 在 0.97~1.03范圍內(nèi);a=0.271,經(jīng)t檢驗顯示a與0無顯著性差異(P>0.05)(見表 2,如圖 1)。

        表2 線性范圍驗證結(jié)果

        圖1線性驗證數(shù)據(jù)散點圖

        2.3 回收實驗 根據(jù)相關公式計算的檢測平均回收率為104%。見表3。

        2.4 最低檢出限驗證 廠家聲明的最低檢出限(1.00E2 IU/ml)驗證試驗通過。見表4。

        2.5 參考區(qū)間 參考區(qū)間為<1.00E3 IU/ml。見表5。2.6兩種方法檢測結(jié)果的相關性分析 以煮沸法檢測結(jié)果為X,以磁珠法檢測結(jié)果為Y,經(jīng)分析顯示兩者相關性良好(Y=0.995X+0.526,R2=0.951。見圖2。

        表3 回收實驗結(jié)果

        表4 最低檢出限驗證實驗結(jié)果

        表5 參考區(qū)間驗證結(jié)果

        圖2磁珠法與煮沸法檢測結(jié)果相關性分析

        3 討論

        我國人群對HBV普遍易感,HBVDNA是HBV感染最直接、特異性強和靈敏性高的指標。HBVDNA陽性提示HBV復制和有傳染性,其含量越高表示病毒復制越厲害,傳染性越強。因此,HBV DNA定量檢測對于判斷乙型肝炎傳染性強弱、乙型肝炎病毒復制情況、乙型肝炎抗病毒治療效果等都有十分重要的意義[8-11]。

        病毒核酸的檢測是生命科學領域一個重要的分支,在臨床病原體檢測、傳染性疾病及基因診斷方面具有獨特的應用價值。核酸提取是核酸檢測中關鍵的步驟,直接影響后續(xù)實驗結(jié)果[12]。目前,實驗室一般采用傳統(tǒng)的手工提取方法(煮沸法、柱提取法等)。煮沸法直接將病毒DNA從病毒顆粒中釋放出來,離心后的上清液中不僅含有病毒核酸,還含有少量血紅蛋白等一些干擾PCR的抑制性雜質(zhì);并且在處理臨床標本時,存在生物安全等問題。因此,臨床實驗室迫切需要自動化方法來進行核酸提取[13]。隨著納米技術的發(fā)展,極大的推動了基于磁珠微球的自動核酸提取法的發(fā)展,目前自動核酸提取法(磁珠法)已經(jīng)應用于臨床核酸(DNA和RNA)等多種物質(zhì)的分離和純化[14]。磁珠法方法提取的核酸純度高,能夠除去大多干擾PCR的抑制因子,如蛋白質(zhì)、多糖、酚類等物質(zhì),使實時熒光定量PCR檢測方法更靈敏、更準確[15]。NP968自動核酸提取儀具有自身的優(yōu)勢:(1)提取速度快,操作時間短,30~60min/次,通量大,每次可同時提取32份樣品;(2)內(nèi)置紫外光殺菌功能可自我清潔;(3)嚴格控制孔間污染及批次間污染;(4)能有效避免人工操作引起的差異及錯誤,結(jié)果穩(wěn)定,重復性好。

        精密度評價實驗按照EP15-A2文件進行,實驗數(shù)據(jù)顯示基于NP968自動核酸提取儀 (磁珠法)的實時熒光定量PCR系統(tǒng),檢測HBVDNA的低、高水平批內(nèi)精密度均<3/5TEa,批間精密度均<4/5TEa,精密度良好。線性評價實驗根據(jù)CLSI EP6-A文件,采用簡便的平均斜率法,結(jié)果顯示基于NP968自動核酸提取儀(磁珠法)的實時熒光定量PCR系統(tǒng)檢測HBVDNA,在4.16E2~4.16E8 IU/ml范圍內(nèi)具有良好的線性關系,達到廠家的檢測聲明。最低檢出限驗證 依據(jù)YY/T 1182-2010中華人民共和國醫(yī)藥行業(yè)標準 《核酸擴增檢測用試劑(盒)》之6.8.2條款要求,廠家聲明的最低檢出限(1.00E2 IU/ml)驗證試驗通過。在定量分析驗證時,準確度通常可用回收率表示,回收率越接近100%表明分析方法準確度越高。本研究回收實驗結(jié)果顯示,基于磁珠法的HBVDNA檢測回收率為104%,接近100%,準確度高。根據(jù)NCCLSC28-A2,參考區(qū)間<1.00E3IU/ml驗證試驗通過。此外,通過對79例患者血漿標本磁珠法與煮沸法HBVDNA檢測結(jié)果的比較,表明兩者相關性良好(Y=0.995X+0.526,R2=0.951)。總之,基于NP968自動核酸提取儀(磁珠法)的實時熒光定量PCR系統(tǒng),實現(xiàn)了快速、自動化提取HBVDNA,對HBVDNA具有良好檢測性能,適合臨床實驗室推廣使用。

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