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        江西省急性髓系白血病NPM1和FLT3-ITD基因突變分析

        2015-05-10 02:01:48簡(jiǎn)正偉石淙聞芳萬(wàn)臘根張長(zhǎng)林
        關(guān)鍵詞:突變率核型中位數(shù)

        簡(jiǎn)正偉 ,石淙 ,聞芳 ,萬(wàn)臘根 ,張長(zhǎng)林

        (1、南昌大學(xué)第四附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,江西 南昌330003;2、南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,江西 南昌330006)

        急性髓細(xì)胞白血病 (acute myeloid leukemia,AML)是多能干細(xì)胞發(fā)生突變所形成的一類具有細(xì)胞和分子遺傳學(xué)特征的高度異質(zhì)性疾病。隨著分子生物學(xué)技術(shù)不斷的應(yīng)用于臨床,越來(lái)越多的基因突變檢測(cè)對(duì)臨床的治療起著重要提示作用。其中NPM1和FLT3-ITD基因是突變率最多見的兩類,2010年美國(guó)血液學(xué)會(huì) (American Society of hematology)會(huì)議已明確[1],NPM1基因突變是AML,尤其是正常核型AML預(yù)后良好的指標(biāo),而具有FLT3-ITD基因突變患者預(yù)后較差。本研究分析187例初發(fā)急性髓細(xì)胞白血病患者NPM1和FLT3-ITD基因突變情況,并分析其臨床特征。

        1 材料與方法

        1.1 臨床病例 收集2011年6月至2013年2月南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院急性髓細(xì)胞白血病初發(fā)病例187例,所有患者都經(jīng)細(xì)胞形態(tài)學(xué)和流式細(xì)胞術(shù)免疫學(xué)分型,并參照《血液病診斷及療效標(biāo)準(zhǔn)》[2]確診為AML的病例。其中M1占9例,M2占72例,M3占50例,M4占20例,M5占24例,M6占4例。男女比例100:87,中位年齡41(13~79)歲。

        1.2 染色體分析 取肝素抗凝的骨髓液2ml,換算成有核細(xì)胞約(1~2)×106/ml,然后分別用直接法和短期培養(yǎng)法制備染色體,采用G顯帶技術(shù)進(jìn)行核型分析。染色體核型描述參照《人類細(xì)胞遺傳學(xué)國(guó)際命名體制(ISCN 2005)》。

        1.3 NPM1和FLT3-ITD突變檢測(cè) 取200μlEDTA抗凝骨髓,參照飛捷生物科技公司的微量基因組DNA極速抽提試劑盒提取基因組DNA,獲得的基因組DNA通過(guò)紫外分光光度計(jì)進(jìn)行定量,取50~100ng/μl基因組DNA進(jìn)行基因突變檢測(cè)。NPM1突變檢測(cè)方法見參考文獻(xiàn)[3]。以特異性引物擴(kuò)展FLT3-ITD基因突變區(qū),上游引物為5’gcaatttaggtatgaaagccagc-3’, 下游引物為 5’ctttcagattttgacggcaacc-3’,擴(kuò)展產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析,野生型FLT3擴(kuò)展產(chǎn)物為329bp,存在ITD突變會(huì)在野生型條帶上游出現(xiàn)特異性條帶。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 應(yīng)用SPSS17.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行分析,以中位數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì),P<0.05有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 NPM1和FLT-ITD突變檢測(cè) 采用等位基因特異性PCR(Allele-specific PCR,AS-PCR)方法檢測(cè)NPM1基因突變,該方法可以檢測(cè)到4種常見的NPM1基因突變(圖1)。采用PCR擴(kuò)展FLT3基因第12外顯子,通過(guò)觀察PCR產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠電泳的遷移情況判斷FLT3-ITD突變(圖2)。在收集到的187初發(fā)急性髓系白血病患者中,共檢查到67例(35.83%)患者存在基因突變,其中39例(20.68%)AML患者存在單一 NPM1突變,15例(8.02%)出現(xiàn)單一FLT3-ITD突變,13例(6.95%)患者同時(shí)存在NPM1和FLT3-ITD突變。

        圖1白血病病人NPM1突變檢測(cè)

        圖2 FLT3-ITD突變檢測(cè)

        2.2 NPM1和FLT-ITD突變與FAB分型關(guān)系 見表1。

        表1 白血病病人基因突變情況n(%)

        2.3 臨床資料特征 在187例患者中,有NPM1突變患者和非NPM1突變患者之間在男女比例、中位年齡、血小板中位數(shù)和骨髓原始細(xì)胞比例中位數(shù)均沒有差異性,但是白細(xì)胞中位數(shù)二者有差異(表2)。在FLT3-ITD突變患者臨床特征分析中,在男女比例、中位年齡、血小板中位數(shù)和非FLT3-ITD突變患者沒有差異性,兩者在白細(xì)胞中位數(shù)和骨髓原始細(xì)胞比例中位數(shù)有差異性,F(xiàn)LT3-ITD突變患者白細(xì)胞中位數(shù)和骨髓原始細(xì)胞比例中位數(shù)都比非FLT3-ITD突變患者高(表3)。

        表2 NPM1突變患者臨床特征分析

        表3 FLT3-ITD突變患者臨床特征分析

        2.4 突變和細(xì)胞遺傳學(xué)的關(guān)系 在187例白血病患者中,有72例患者沒有檢測(cè)染色體或者檢測(cè)了未檢見分裂相,在可分析的115例患者中,80例正常核型當(dāng)中,有17例(21.3%)NPM1突變;在35例異常核型組中,檢見13例NPM1突變;在正常核型中同時(shí)檢測(cè)出11例FLT3-ITD突變,突變率為13.8%,而在異常核型組中,檢出8例FLT3-ITD突變,突變率為22.9%,但兩者之間均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(表 4)。

        表4 比較白血病病人NPM1和FLT3-ITD突變患者染色體情況

        2.5突變型和野生型療效的比較 187例患者治療效果比較,其中NPM1突變型52例,野生型135例,2組之間≤2個(gè)治療周期CR緩解率分別為79.5%和35.8%(P<0.05);FLT3-ITD突變患者28例,野生型159例,兩者之間≤2個(gè)治療周期CR緩解率分別為27.6%和72.8%(P<0.05);隨訪時(shí)間1~25.6月,中位隨訪周期9.6月。

        此外,我們把187例患者分成NPM1+/FLT3-ITD-組、NPM1-/FLT3-ITD-組、NPM1+/FLT3-ITD+組和NPM1-/FLT3-ITD+組進(jìn)行療效觀察,2個(gè)治療周期CR緩解率分別為82.3%、65.8%、52.9%和26.8%。其中單獨(dú)NPM1突變組完全緩解率最高,而單獨(dú)FLT3-ITD突變組完全緩解率最低。

        3 討論

        急性髓系白血病AML是起源于造血干細(xì)胞的惡性克隆性疾病,具有高度的異質(zhì)性。一直以來(lái),我們都是通過(guò)檢測(cè)白血病患者染色體的變異來(lái)區(qū)分病人的預(yù)后情況。但是對(duì)于一些染色體正常核型病人,我們不能很好地區(qū)分患者的預(yù)后情況。隨著分子生物學(xué)技術(shù)不斷地應(yīng)用于臨床,一些新型基因突變檢測(cè)可以很好地對(duì)病人治療、預(yù)后提供指導(dǎo)價(jià)值。在這些基因突變中,NPM1和FLT3-ITD是突變率最高,對(duì)預(yù)后評(píng)估最有價(jià)值的兩類基因。

        我們?cè)?87例初發(fā)白血病患者中分別檢測(cè)出NPM1突變率為27.80%(52/187);檢測(cè)出FLT3-ITD突變率為14.97%(28/187)。 和日本學(xué)者Suzuki T(24.9%NPM1,22.6%FLT3-ITD)[4];德國(guó)學(xué)者 Thiede C(27.5%NPM1,21%FLT3-ITD)[5]、泰國(guó)學(xué)者 Boonthimat C (26%NPM1,33%FLT3-ITD)[6]相比較,NPM1突變率基本接近,但是他們FLT3-ITD突變率都比我們的研究結(jié)果要高,可能是由于樣本分布不同和種族差異有關(guān)。

        在本研究中NPM1突變主要存在于M5、M2和M1中。丁子軒等[7]研究656例中國(guó)急性髓系白血病患者NPM1基因突變情況,其中有169例突變,突變率大約25.8%,其中以M5、M1多見。Jeon Y等[8]研究發(fā)現(xiàn),在83例AML患者中有NPM1突變19例,突變率為22.9%,在形態(tài)學(xué)亞型中多見于M5和M2。這和我們的研究結(jié)果相近。但是我們研究FLT3-ITD突變多存在于M1、M4中較多見,而國(guó)外學(xué)者研究病例中FLT3-ITD突變多存在于M3[9],這可能是病例樣本組成不同或者國(guó)內(nèi)外樣本差異有關(guān)。

        我們研究FLT3-ITD突變患者在年齡 、性別和血小板中位數(shù)之間差異沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,但是突變陽(yáng)性患者比陰性患者在白細(xì)胞中位數(shù)和骨髓原始細(xì)胞比例中位數(shù)均顯著偏高,這和國(guó)外研究結(jié)果相一致[10]。這可能與FLT3-ITD突變引起近膜區(qū)空間構(gòu)型改變引起RTK持續(xù)激活,導(dǎo)致細(xì)胞增殖有關(guān)[11]。而NPM1突變患者在年齡 、性別、血小板中位數(shù)和骨髓原始細(xì)胞比例中位數(shù)同陰性患者之間無(wú)顯劇差異,但是突變陽(yáng)性患者白細(xì)胞中位數(shù)較陰性患者偏高[12]。

        國(guó)內(nèi)外研究認(rèn)為NPM1和FLT3-ITD突變?cè)谌旧w正常核型多見[13],但我們?cè)?87病例中只有115例可分析染色體核型,兩者突變?cè)谡:诵秃彤惓:诵椭g并沒有差異性,這與國(guó)外研究結(jié)果不一致,可能是國(guó)內(nèi)外病例組成不同;另外我們有72例患者沒有檢測(cè)出染色體,可能這部分病例有較多正常核型樣本,所以對(duì)正異常核型比有一定影響。

        一般研究認(rèn)為NPM1基因突變是預(yù)后良好的指標(biāo),存在NPM1基因突變的患者緩解率高,生存期長(zhǎng),并且在疾病進(jìn)展中比較穩(wěn)定[14,15]。而FLT3-ITD突變意義則相反,一般預(yù)后較差。2008年世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)和歐洲造血與血液病理學(xué)協(xié)會(huì)共同制定AML新的分型分類計(jì)劃,認(rèn)為NPM1基因突變的可以作為AML亞群中獨(dú)立的預(yù)后指標(biāo)[16]。我們把NPM1和FLT3-ITD突變陽(yáng)性和陰性患者在2個(gè)治療周期CR緩解率進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)NPM1陽(yáng)性患者在2個(gè)治療周期CR緩解率較陰性患者效果好,而FLT3-ITD突變陽(yáng)性患者則CR緩解率效果差,兩者之間差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。同時(shí)我們按NPM1和FLT3-ITD突變陰陽(yáng)性分成四組,發(fā)現(xiàn)單獨(dú)NPM1突變組完全緩解率最高,而單獨(dú)FLT3-ITD突變組完全緩解率最低,這與國(guó)內(nèi)外研究結(jié)果相符[17]。

        通過(guò)同時(shí)檢測(cè)NPM1和FLT3-ITD突變情況,可以給臨床白血病患者治療、預(yù)后提供指導(dǎo)意義。

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