葉 錦, 張靜茹, 覃益民, 劉幽燕
(廣西大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院,廣西 南寧 530004)
纖維素是葡萄糖以β-1,4糖苷鍵組成的大分子多糖,是最豐富的天然可再生生物資源[1-3]。纖維素可通過纖維素酶水解轉(zhuǎn)化為可發(fā)酵性糖,繼而轉(zhuǎn)化為燃料乙醇及相關(guān)化學(xué)品[4]。
纖維素酶是多組分酶系,主要由內(nèi)切β-葡聚糖苷酶(EG)、外切 β-葡聚糖苷酶(CBH)和 β-葡萄糖苷酶3個(gè)主要成分組成[5]。盡管大量研究結(jié)果已表明,只有在這3個(gè)主要成分酶的協(xié)同作用下,纖維素分子最終才能被降解成葡萄糖。但由于纖維素酶的多樣性及不易分離純化,致使人們對(duì)纖維素酶的結(jié)構(gòu)、功能,特別是降解纖維素的作用機(jī)制還缺乏足夠的了解,對(duì)纖維素酶各成分是如何協(xié)同起作用的,學(xué)者們的看法還不盡相同[6],近年來人們還發(fā)現(xiàn)了一些不具有纖維素酶活性的蛋白質(zhì)也能與纖維素酶起協(xié)同作用,并最終能促進(jìn)纖維素的降解[7-8]。因此,開展對(duì)相關(guān)纖維素酶組分的分離純化及其酶學(xué)性質(zhì)研究,無論是對(duì)纖維素酶系各成分酶的協(xié)同作用機(jī)理還是對(duì)纖維素酶系與其他非酶蛋白質(zhì)的協(xié)同增效作用的更深入了解,都將提供重要的方法和理論基礎(chǔ)。
康氏木霉GIMP3.444是1株產(chǎn)纖維素酶系的真菌菌株,覃益民等最近從該菌株中分離純化出一種纖維素酶協(xié)同增效蛋白質(zhì)[9]。本研究對(duì)康氏木霉GIMP 3.444菌株產(chǎn)的纖維素酶系各組分酶進(jìn)行分離純化,并對(duì)其中1種內(nèi)切β-葡聚糖苷酶酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行研究,為纖維素酶的研究奠定基礎(chǔ)。
康氏木霉(Trichodermakoningii)GIMP3.444購(gòu)于廣東省微生物菌種保藏中心,現(xiàn)保藏于廣西大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院生物化工實(shí)驗(yàn)室。
斜面活化培養(yǎng)基:馬鈴薯200.0 g、葡萄糖20.0 g、KH2PO43.0 g、MgSO4·7H2O 1.5 g 、瓊脂粉 20.0 g,加自來水至1 000 ml,調(diào) pH 6.0,121 ℃ 滅菌 20 min。
搖瓶種子培養(yǎng)基:馬鈴薯200.0 g、葡萄糖20.0 g、KH2PO43.0 g、MgSO4·7H2O 1.5 g,加自來水至1 000 ml,調(diào) pH 6.0,121 ℃滅菌20 min。
液體發(fā)酵培養(yǎng)基:甘蔗渣(過80目篩)15.0 g、麥麩粉 8.0 g、(NH4)2SO44.0 g、KH2PO43.0 g、MgSO4·7H2O 1.5 g,加自來水至1 000 ml,調(diào) pH 6.0,121 ℃滅菌 20 min。
取保藏的康氏木霉接種于斜面活化培養(yǎng)基,28℃條件下活化培養(yǎng)3~7 d,刮取平面孢子,用無菌水制成孢子懸浮液,按1%(體積比)接種至種子培養(yǎng)液中,于180 r/min、28℃下培養(yǎng)30~36 h。將搖瓶種子按5%(體積比)接種量接種至裝有150 ml發(fā)酵培養(yǎng)基的500 ml三角瓶中,于180 r/min、28℃下培養(yǎng)120 h。
發(fā)酵液在4℃,8 000 r/min下離心20min,收集上清液,經(jīng)過10 000濾膜壓濾,將濾液用超濾膜濃縮,得到粗酶液。粗酶液用20%飽和度的硫酸銨沉淀,4℃下靜置過夜后,于8 000 r/min離心20 min,取上清液繼續(xù)加入硫酸銨至飽和度為85%,4℃下靜置過夜,離心棄上清液,收集沉淀,加入少量0.1 mol/L pH 8.0的Tris-HCl緩沖液復(fù)溶,再次離心除去不溶的雜質(zhì),濃縮酶液于4℃下充分透析后保存。
1.3.1 DEAE Sepharose FF離子交換層析 粗酶液先用DEAE Sepharose FF離子交換層析法進(jìn)行初步分離,分離柱規(guī)格為 1.6 cm×40.0 cm,用 NaCl濃度梯度從 0 mol/L到 0.8 mol/L的 Tris-HCl(0.1 mol/L、pH 8.0)緩沖液分步洗脫收集,測(cè)定各峰纖維素內(nèi)切酶活力,收集有酶活力的峰,4℃保存。所有的操作都在4℃下進(jìn)行。
1.3.2 Sephadex G-75凝膠過濾層析 用G75凝膠過濾層析法進(jìn)一步分離DEAE Sepharose FF離子交換層析得到的目標(biāo)峰,采用 AKTA pure層析系統(tǒng),用pH 4.8、0.1 mol/L檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液洗脫,收集每個(gè)峰,測(cè)定內(nèi)切β-葡聚糖酶活力,收集有酶活力的洗脫峰,4℃保存。所有的操作都在4℃下進(jìn)行。
1.4.1 蛋白質(zhì)濃度的測(cè)定[10]以牛血清白蛋白質(zhì)為標(biāo)準(zhǔn),用考馬斯亮藍(lán)G-250法測(cè)蛋白質(zhì)濃度。
1.4.2 內(nèi)切 β-葡聚糖苷酶活力測(cè)定 采用3,5-二硝基水楊酸(DNS)法測(cè)定內(nèi)切酶活性[11]。向試管中各加入1.5 ml 1%(質(zhì)量體積比)的羧甲基纖維素鈉檸檬酸-檸檬酸鈉溶液(0.1 mol/L,pH 4.8)及0.5 ml酶液,在50℃水浴中保溫30 min,取出后,加入3.0 ml DNS試劑終止反應(yīng),再沸水浴5 min后,取出流水冷卻,定容至25 ml,在540 nm波長(zhǎng)處測(cè)定吸光度。以1 ml酶液每30 min催化底物產(chǎn)生出相當(dāng)于1 mg葡萄糖的還原糖量為1個(gè)酶活力單位,以U/ml表示。
1.4.3 蛋白質(zhì)純度鑒定及相對(duì)分子量測(cè)定 采用SDS-PAGE法測(cè)定蛋白質(zhì)純度。聚丙烯酰胺凝膠質(zhì)量分?jǐn)?shù)12%,蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品的相對(duì)分子質(zhì)量范圍14 400~97 400。
蛋白質(zhì)的鑒定和肽段分析采用MALDI-TOFMS方法[12]。將目標(biāo)電泳條帶切下,37℃用胰蛋白酶處理過夜后,將生物大分子電離后檢測(cè)。肽段的信息在NCBInr數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索。
最適反應(yīng)pH值:取純酶液在 pH 3.0~7.5條件下(pH 3.0~6.0為檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液、pH 6.5~7.5為磷酸氫二鈉-磷酸二氫鈉緩沖液),50℃保溫30 min,分別測(cè)定內(nèi)切β-葡聚糖苷酶活力,確定酶的最適反應(yīng)pH值。
最適反應(yīng)溫度:取純酶液在溫度35~70℃條件下,pH4.8保溫30 min,分別測(cè)定內(nèi)切β-葡聚糖苷酶活力,確定酶的最適反應(yīng)溫度。
分別配制濃度為 0.2%、0.3%、0.4%、0.5%、0.7%、1.0%、1.5%、2.0%和2.5%的羧甲基纖維素鈉懸浮液(pH 4.8),與內(nèi)切酶在50℃水浴中保溫30 min,DNS法測(cè)定不同濃度底物產(chǎn)生的還原糖,然后按照Lineweaver-Burk雙倒數(shù)作圖法作圖,得出該酶作用于羧甲基纖維素鈉時(shí)的 Km值。
取不同的金屬離子0.3 mmol/L與纖維素酶在pH 4.8的檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液,在30℃水浴保溫30 min后,50℃下反應(yīng)30 min,測(cè)量有金屬離子作用下的酶活性,以不加金屬離子的酶活性為100%。
將20%~85%硫酸銨沉淀和透析后獲得的粗蛋白質(zhì)經(jīng)DEAE Sepharose FF離子交換層析后,出現(xiàn)5個(gè)峰(圖1)。經(jīng)測(cè)定,峰2和峰3均有內(nèi)切β-葡聚糖苷酶活力,其中峰3內(nèi)切β-葡聚糖苷酶比活力較高,這說明康氏木霉的發(fā)酵液中至少含有2種內(nèi)切β-葡聚糖苷酶。
將離子交換層析得到的蛋白質(zhì)峰3經(jīng)過Sephadex G-75凝膠過濾層析,得到5個(gè)峰(圖2)。經(jīng)測(cè)定,峰3-4為主要的內(nèi)切酶組分。
圖1 總蛋白質(zhì)DEAE sepharose FF離子交換層析洗脫曲線Fig.1 Elution profile of the total protein on DEAE sepharose FF
圖2 Sephadex-G75凝膠過濾層析曲線Fig.2 Filtration profile of peak 3 of the protein on sephadex-G75
內(nèi)切β-葡聚糖苷酶的整個(gè)分離純化過程結(jié)果如表1。最終得到的這種內(nèi)切酶組分比活力達(dá)到19.65 U/mg,與粗酶液相比,提高了3.65倍,回收率為2.83%。
純化的內(nèi)切β-葡聚糖苷酶組分經(jīng)SDS-PAGE電泳,發(fā)現(xiàn)只有1條帶(圖3),表明該組分已達(dá)電泳純。經(jīng)凝膠成像系統(tǒng)分析,該酶的相對(duì)分子量約為44 600。
表1 內(nèi)切β-葡聚糖苷酶的純化結(jié)果Table 1 Purification of endo-β-glucanase
圖3 內(nèi)切β-葡聚糖苷酶SDS-PAGE電泳圖譜Fig.3 Identification of endo-β-glucanase by SDS-PAGE
將該酶進(jìn)行質(zhì)譜分析和數(shù)據(jù)庫(kù)檢索,只有當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)得分大于65和得分可信度大于95%時(shí),才能說明2種蛋白質(zhì)可能匹配。但從質(zhì)譜結(jié)果發(fā)現(xiàn)Mascot得分最高的前5個(gè)蛋白質(zhì)得分也分別只有 62、59、55、55、55 分,得分可信度都為 0。兩項(xiàng)數(shù)值與我們分離得到的酶匹配度都很低。另外,從數(shù)據(jù)庫(kù)搜索出的結(jié)果中并沒有關(guān)于纖維素酶的信息,表明此酶是一種在數(shù)據(jù)庫(kù)中沒有登記的未知蛋白質(zhì),也說明本試驗(yàn)中分離到的內(nèi)切酶是一種新的內(nèi)切β-葡聚糖苷酶組分。
2.3.1 最適pH值和溫度 pH值和溫度對(duì)內(nèi)切酶活力影響結(jié)果見圖4、圖5。結(jié)果(圖4)顯示,該酶催化反應(yīng)的最適pH值為4.5(檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液),pH值在4.0到5.0之間酶活力較好,當(dāng)pH值上升到6.0后,酶活力下降比較快。
圖5顯示,該酶的最適反應(yīng)溫度為55℃,在50℃時(shí),酶活力達(dá)到99%,在60℃時(shí),酶活力仍有98%,說明該酶在50℃到60℃之間的穩(wěn)定性好。超過60℃之后,酶活力下降很快,說明該酶對(duì)熱比較敏感。
4 pH值-酶活力曲線圖ig.4 The relationship between p H value and enzymatic activities
圖5 溫度-酶活力曲線圖Fig.5 The relationship between temperature and enzymatic activities
2.3.2 金屬離子和試劑對(duì)酶活力的影響及動(dòng)力學(xué)參數(shù) 金屬離子和其他試劑對(duì)酶活力的影響如表2所示,從加入不同離子后的酶活力可以看出,乙二胺四乙酸(EDTA)、鎂離子(Mg2+)、銅離子(Cu2+)和鋅離子(Zn2+)基本對(duì)酶活力沒有影響,而鈣離子(Ca2+)對(duì)酶的抑制作用較強(qiáng),抑制了近35%的酶活力。二價(jià)鐵離子(Fe2+)、錳離子(Mn2+)、鉛離子(Pb2+)、銨離子(NH+4)則都有不同程度的抑制作用。
表2 金屬離子和試劑對(duì)酶活力的影響Table 2 Effect of chemical reagent and ions on activities of endo-βglucanase
以羧甲基纖維素鈉作為底物,在pH 4.8、50℃條件下測(cè)定酶活力,根據(jù)Lineweaver-Burk雙倒數(shù)作圖法作圖,根據(jù)回歸曲線得出反應(yīng)速率v與底物濃度[S]的標(biāo)準(zhǔn)方程為:1/v=8.633 9(1/[S])+1.195 8。進(jìn)而求得以羧甲基纖維素鈉為底物時(shí),內(nèi)切β-葡聚糖苷酶的米氏常數(shù)Km值為7.22 mg/ml。最大反應(yīng)速率Vmax為3.72 mg/(min·ml)。
由于微生物來源的纖維素酶是多組分酶系,且各組分酶之間的分子量和等電點(diǎn)等相差不大,要將內(nèi)切β-葡聚糖苷酶組分從纖維素酶系中分離純化出來較為困難。本試驗(yàn)從康氏木霉GIMP3.444菌種的發(fā)酵產(chǎn)物中,通過(NH4)2SO4分級(jí)沉淀、DEAE Sepharose FF陰離子交換層析、Sephadex G-75凝膠過濾層析等方法分離純化出一種內(nèi)切β-葡聚糖苷酶組分,電泳檢測(cè)僅顯示1條蛋白質(zhì)條帶,說明該方法比較適宜該菌株內(nèi)切β-葡聚糖苷酶的分離純化。
本試驗(yàn)分離得到的新內(nèi)切β-葡聚糖苷酶的相對(duì)分子質(zhì)量為44 600,比活力為19.65 U/mg,最適反應(yīng)pH值和最適反應(yīng)溫度分別為4.5和55℃,Ca2+對(duì)酶有較強(qiáng)抑制作用,抑制了近35%的酶活力。以羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)為底物時(shí),酶的米氏常數(shù)(Km)為7.22 mg/ml。該酶的質(zhì)譜分析和數(shù)據(jù)庫(kù)檢索結(jié)果表明,分離到的內(nèi)切酶蛋白質(zhì)是一種在數(shù)據(jù)庫(kù)中沒有登記的未知蛋白質(zhì),即一種新的內(nèi)切酶組分。與文獻(xiàn)報(bào)道的內(nèi)切β-葡聚糖苷酶相比,該酶在分子量及一些酶學(xué)性質(zhì)上存在著差異,且這些差異不僅存在于不同來源微生物的酶中,還存在于相同來源微生物的酶中。由于這些差異的存在,就要求我們?cè)谘芯亢屠眠@些酶的過程中必須明確其酶學(xué)性質(zhì),才能更好地發(fā)揮酶活性。正是由于纖維素酶系的復(fù)雜性,導(dǎo)致到目前為止對(duì)纖維素酶水解作用的機(jī)理尚未完全研究清楚,而這種新的纖維素酶組分的發(fā)現(xiàn)也能夠加深我們對(duì)纖維素酶系的組成及其在水解過程中的作用的了解。
從目前的研究看,真菌產(chǎn)生的纖維素酶普遍具有多樣性,如 Wood 等[13]、朱年青等[14]和陳冠軍等[15]分別從康氏木霉 Trichodermakoningii、里氏木霉Trichodermareesei和棘孢曲霉Asgergillusaculeatus中純化出了3種、2種和5種內(nèi)切β-葡聚糖酶,分子量和酶學(xué)性質(zhì)也各不相同。同樣從本試驗(yàn)的分離純化過程中也發(fā)現(xiàn),康氏木霉GIMP3.444除了分泌本試驗(yàn)得到的新內(nèi)切β-葡聚糖酶外,至少還分泌另外1種內(nèi)切β-葡聚糖酶組分。因此,在研究纖維素酶系各成分酶的協(xié)同作用機(jī)理或研究纖維素酶系與其他非酶蛋白質(zhì)的協(xié)同增效作用時(shí),需考慮這種同工酶存在的影響。
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