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        茭白愈傷組織誘導(dǎo)及基因組多態(tài)性分析

        2015-03-15 08:57:32李帥崔海峰金曄康璐瑤葉子弘
        長江蔬菜 2015年22期

        李帥,崔海峰,金曄,康璐瑤,葉子弘

        (中國計量學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院/浙江省生物計量與檢驗檢疫技術(shù)重點實驗室,杭州,310018)

        茭 白 (Zizania latifoliaTurcz) 屬 于 禾 本 科(Gramineae)菰屬多年生水生宿根性草本植物,無性繁殖,古稱菰,主要分布于我國南方區(qū)域,已有千年的栽培歷史[1,2],目前是浙江省的主要水生蔬菜,種植面積達(dá)2.335 余萬hm2,經(jīng)濟(jì)效益十分顯著。人們所食用的茭白實質(zhì)上是茭白植株被其內(nèi)生真菌——菰黑粉菌(Ustilago esculentaP.Henn.)侵染后膨大而成的肥嫩肉質(zhì)莖,屬病態(tài)器官,茭白孕茭是由茭白植株與寄生在其體內(nèi)的菰黑粉菌共同作用的結(jié)果。茭白食用莖富含蛋白質(zhì)、脂肪、糖類、食用粗纖維等,特別是在食用莖未過分老熟時,氨基酸含量多,易吸收,營養(yǎng)價值較高[3]。

        田間茭白的種植方式均為無性栽培,新品種選育主要是通過田間茭墩無性系變異篩選獲得。茭白植株及其內(nèi)生真菌(菰黑粉菌)的基因組變異可能在茭白品種選育及生長特性中具有重要作用[4]。DNA 分子標(biāo)記在植物品種之間親緣關(guān)系和植物資源多樣性的檢測方面得到大量應(yīng)用。利用DNA 分子標(biāo)記可以確定親本之間的親緣關(guān)系和遺傳差異,對親本之間的遺傳距離進(jìn)行客觀的測定,對植物品種進(jìn)行系統(tǒng)劃分[5,6]。因此試驗結(jié)果一般準(zhǔn)確可靠,在實際試驗中有著較廣的應(yīng)用面。

        本試驗通過對雙季茭白龍茭2 號進(jìn)行離體組織培養(yǎng),誘導(dǎo)獲得茭白愈傷組織,并對其進(jìn)行分化培養(yǎng)。此外,采用RAPD 和ISSR 分子標(biāo)記技術(shù)對不同品種茭白及其愈傷組織進(jìn)行基因組多態(tài)性分析,闡明茭白品種間的基因組多樣性及組織培養(yǎng)過程中的無性系變異,探討茭白愈傷組織分化與無性系變異間的關(guān)系,為茭白種質(zhì)資源的研究及栽培品種的品質(zhì)改良提供技術(shù)支持。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        試驗材料取自中國計量學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院溫網(wǎng)室。選取了4 種茭白品種,其中3 個雙季茭白品種:龍茭2 號、梭子茭、浙茭911,1 個野生茭白。以龍茭2 號莖部為材料誘導(dǎo)茭白愈傷組織。

        1.2 試驗方法

        ②茭白愈傷組織獲得及繼代培養(yǎng) 選擇MS 和MB2 兩種培養(yǎng)基進(jìn)行茭白愈傷組織的誘導(dǎo),以N6 培養(yǎng)基為愈傷組織的繼代培養(yǎng)基。培養(yǎng)基配方如下。

        a.MS 誘導(dǎo)培養(yǎng)基。MS 大量元素+MS 微量元素+IAA 1 mg/L+2,4-D 1 mg/L+VB11 mg/L+谷氨酰胺0.01%+瓊脂0.9%+蔗糖40 g/L。

        b.MB2 誘導(dǎo)培養(yǎng)基。MS 大量元素+MS 微量元素+VB51 ml/L+甘氨酸2 ml/L+谷氨酸146 mg/L+水解酪蛋白200 mg/L+蔗糖30 g/L+2,4-D 2 mg/L。

        c.N6 繼代培養(yǎng)基。N6+IAA 1 mg/L+2,4-D 1 mg/L+VB11 mg/L+谷氨酰胺0.01%+瓊脂0.9%+白糖40 g/L。

        ③分化培養(yǎng)基篩選 通過查閱文獻(xiàn)資料[9,10],設(shè)計了不同激素成分及比例的分化培養(yǎng)基,進(jìn)行愈傷組織的誘導(dǎo)分化。培養(yǎng)基配方及激素成分見表1。

        ④茭白DNA 提取純化 以4 個品種茭白及2種茭白愈傷組織為材料,采用改良的CTAB 法提取DNA[11]。

        表1 分化培養(yǎng)基配方

        表2 2 種標(biāo)記所用引物序列

        ⑤ISSR 和RAPD 擴(kuò)增、檢測 篩選獲得適合茭白基因組多態(tài)性分析的ISSR 引物和RAPD 引物[12,13],引物合成序列見表2。

        反 應(yīng) 體 系 如 下:10×PCR Buffer(Mg2++Plus)3 μL,dNTP Mixture(每個2.5 mmol/L)2 μL,cDNA 1 μL,Primer F(10 μmol/L)1 μL,Primer R(10 μmol/L)1 μL,LA Taq 0.25 μL,ddH2O Up to 25 μL。PCR 反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性3 min;94℃變性30 s,退火30 s,72℃延伸1 min,35 個循環(huán);72℃延伸10 min。所得的PCR 產(chǎn)物均用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳分析。電泳結(jié)束后,使用Gene Genius Bio Imaging System 凝膠成像系統(tǒng)拍照。

        1.3 試驗數(shù)據(jù)及遺傳分析

        用篩選出的12 條ISSR 和7 條RAPD 引物對4 個品種茭白及2 種茭白愈傷組織進(jìn)行擴(kuò)增,按凝膠同一位置上DNA 條帶的有無進(jìn)行統(tǒng)計,有帶的記為“1”,無帶的記為“0”,統(tǒng)計匯總結(jié)果。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 茭白愈傷組織獲得及分化培養(yǎng)

        ①愈傷誘導(dǎo) 誘導(dǎo)獲得了2 種不同類型的茭白愈傷組織(圖1),一種愈傷組織呈綠色,顆粒致密;另一種愈傷組織呈淡黃色,顆粒松散。

        ②分化培養(yǎng) 經(jīng)觀察發(fā)現(xiàn),7 種分化培養(yǎng)基培養(yǎng)表現(xiàn)有較大差異,其中NB、IB2 培養(yǎng)基在培養(yǎng)周期中增殖迅速,體積膨大較快,不分化生根;IZ、MT、IBZ 在培養(yǎng)周期中增殖迅速,一周左右就分化生根;MBA、IB 培養(yǎng)基在培養(yǎng)周期中增殖速度較緩慢,在培養(yǎng)的第二周緩慢分化生根。試驗選用的分化培養(yǎng)基現(xiàn)階段暫時未獲得茭白幼苗(圖2)。

        2.2 擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)性

        利用RAPD 和ISSR 分子標(biāo)記技術(shù)對4 個品種茭白及2 種茭白愈傷組織進(jìn)行了基因組多樣性分析,篩選出的12 條ISSR 和7 條RAPD 引物,共擴(kuò)增出121 條清晰條帶,其中包括20條多態(tài)性條帶。結(jié)果見圖3~5。

        通過對DNA 多態(tài)性進(jìn)行統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn):20 條多態(tài)性條帶中茭白品種材料多態(tài)性條帶有4 條,愈傷組織多態(tài)性條帶有16 條,多態(tài)性百分率分別為3.30%和13.22%。3 個正常茭白品種(梭子茭、龍茭2 號、浙茭911)之間并未檢測到明顯多態(tài)性,但是正常茭白與野生茭白之間存在一定的多態(tài)性,在19 條引物中,共有4 條引物檢測到了多態(tài)性條帶,占總條帶數(shù)的比率為3.31%。通過對愈傷組織和龍茭2 號茭白植株樣本進(jìn)行了PCR 擴(kuò)增,統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn),在19 條引物中共有7 條對引物具有多態(tài)性條帶,占總條帶數(shù)的比率為11.57%,其中愈傷組織中缺失的條帶有5 條,缺失條帶對應(yīng)的引物為ISSR1、ISSR3、UBC857。同時兩種愈傷組織進(jìn)行DNA 多態(tài)性統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)在19 條引物中,共有6 條引物具有多態(tài)性, 占總條帶數(shù)的比率為6.61%(表3,4)。

        圖1 茭白愈傷組織

        圖2 茭白愈傷組織分化培養(yǎng)

        圖3 ISSR1、ISSR3、S2049 擴(kuò)增條帶圖譜

        圖4 ISSR2、ISSR17、A34、K13 擴(kuò)增條帶圖譜

        圖5 S226、S327、S1049、S1060 擴(kuò)增圖譜

        3 討論與結(jié)論

        茭白是由菰黑粉菌侵染野生菰植株后經(jīng)過長期田間馴化篩選獲得的無性系種墩,田間種植方式主要有薹管育苗和茭墩育苗,均為無性栽培方式。目前,茭白新品種選育的方法主要是通過田間茭墩無性系變異,篩選獲得變異茭墩,進(jìn)而通過田間篩選培育具有特色性狀茭白品種[13,14]。無性系變異在茭白品種篩選及特性培育中具有重要作用。本研究誘導(dǎo)獲得雙季茭白龍茭2 號的2 種不同形態(tài)的愈傷組織,并進(jìn)行了分化培養(yǎng),初步篩選出茭白愈傷組織的誘導(dǎo)培養(yǎng)基及分化培養(yǎng)基。

        植物組培無性系變異現(xiàn)象由Heinz 和Mee 首先提出,包括組培后代個體、器官或組織中出現(xiàn)的種種變異現(xiàn)象[15],主要有生理因素、 遺傳因素及生化因素等。植物組織培養(yǎng)中的體細(xì)胞無性系變異是植物組培后代中常見的現(xiàn)象,這種變異現(xiàn)象受植物種類、組織或器官特性、組織培養(yǎng)條件等影響[16]。 本試驗基于ISSR 和RAPD 等DNA 分子標(biāo)記比較分析了茭白栽培品種及愈傷組織的基因組多態(tài)性,發(fā)現(xiàn)組織培養(yǎng)中的無性系變異明顯高于田間栽培的植株變異,正常茭白品種間的多態(tài)性低于正常茭白與野生茭白間的多態(tài)性,野茭無法結(jié)茭,而正常茭白莖部可以膨大成為可食用肉質(zhì)莖[17],野茭與正常茭白的形態(tài)差異可能與基因組多態(tài)性相關(guān)。但愈傷組織與茭白植株間的多態(tài)性很高, 在19條引物中共有7 條引物具有多態(tài)性條帶, 占總條帶數(shù)的11.57%。愈傷組織在分化階段難以長成幼苗,有可能與相關(guān)條帶的增加或缺失有關(guān)。此外誘導(dǎo)獲得的2 種不同愈傷組織間也具有多態(tài)性,占總條帶數(shù)的6.61%,表明組織培養(yǎng)過程中,2 種愈傷組織經(jīng)歷了不同無性系變異,導(dǎo)致形態(tài)差異明顯。

        表3 ISSR 引物擴(kuò)增條帶統(tǒng)計

        表4 RAPD 引物擴(kuò)增條帶統(tǒng)計

        植物組織培養(yǎng)產(chǎn)生的體細(xì)胞無性系變異通常是常規(guī)育種中不可能出現(xiàn)的變異。一個組織培養(yǎng)周期內(nèi)可產(chǎn)生1%~3%的無性系變異幾率[18,19],遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于自然突變頻率,因此,研究無性系變異對茭白品種改良、選育新品種及植物基因型改良具有重要的指導(dǎo)意義。

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