史庭燕 賀靜 王夢筠
(1. 復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院婦產(chǎn)科,上?!?00032; 2. 復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院,上?!?00032;
3. 廣東省廣州市婦女兒童醫(yī)療中心,廣東廣州 510623)
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TNFAIP8家族基因單核苷酸多態(tài)性位點在宮頸癌預(yù)后評估中的作用
史庭燕1,2賀靜3王夢筠2
(1. 復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院婦產(chǎn)科,上海200032; 2. 復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院,上海200032;
3. 廣東省廣州市婦女兒童醫(yī)療中心,廣東廣州510623)
摘要目的:探討腫瘤壞死因子α誘導(dǎo)蛋白8(tumor necrosis factor-α-induced protein 8, TNFAIP8)家族基因的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)位點在宮頸癌預(yù)后評估中的作用。方法:選擇2008—2009年行根治性子宮切除術(shù)并獲得至少2年隨訪的144例宮頸癌患者。采用Taqman探針檢測患者TNFAIP8家族基因中3個多態(tài)性位點(TNFAIP8-rs11064、TNFAIP8-rs3813308和TNFAIP8L1-rs1060555)的基因分型。分析TNFAIP8家族基因SNP位點與宮頸癌預(yù)后的關(guān)系。結(jié)果:攜帶TNFAIP8L1-rs1060555 GG的宮頸癌患者相較于攜帶CG/CC基因型者,腫瘤復(fù)發(fā)的危險度顯著增加(校正HR=3.25,95%CI: 1.06~9.95)。聯(lián)合效應(yīng)分析發(fā)現(xiàn),攜帶TNFAIP8基因家族2~3個危險基因型的患者相較于攜帶0~1個危險基因型者,腫瘤復(fù)發(fā)的危險度顯著增加(校正HR=2.55,95%CI:1.02~6.36)。結(jié)論:TNFAIP8家族基因的SNP位點有望為宮頸癌的預(yù)后評估提供參考。
關(guān)鍵詞宮頸癌;TNFAIP8基因家族;多態(tài)性;預(yù)后
在世界范圍內(nèi),宮頸癌的發(fā)病率居女性惡性腫瘤的第3位,致死率居女性腫瘤的第4位[1]。在發(fā)展中國家,宮頸癌是發(fā)病率最高的女性生殖道惡性腫瘤。近年來,我國每年新增約10萬例宮頸癌患者,占全球發(fā)病例數(shù)的1/5,且呈年輕化趨勢,每年病死病例超過3萬[2]。宮頸癌的發(fā)生、發(fā)展是多因素相互作用的結(jié)果,其中遺傳被認(rèn)為是宮頸癌個體化治療及預(yù)后差異的重要因素。
腫瘤壞死因子α誘導(dǎo)蛋白8(tumor necrosis factor-α-induced protein 8, TNFAIP8)基因家族是一組新發(fā)現(xiàn)的、尚未深入研究的基因,目前認(rèn)為它們具有維持自身免疫和抑制細(xì)胞凋亡的作用[3]。該家族包括TNFAIP8、TNFAIP8L1、TNFAIP8L2和TNFAIP8L3。它們在細(xì)胞增殖、炎性反應(yīng)和細(xì)胞凋亡過程中起重要作用[4]。既往研究[5-6]發(fā)現(xiàn),TNFAIP8和TNFAIP8L1在抑制細(xì)胞凋亡以及腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程中具有重要調(diào)控作用;而TNFAIP8L2被認(rèn)為是重要的免疫相關(guān)負(fù)調(diào)控因子,參與炎性反應(yīng)的發(fā)生發(fā)展。最新研究[7]表明,TNFAIP8L3是一種脂類第二信使轉(zhuǎn)運蛋白,在腫瘤發(fā)生中起促進作用。我們的前期研究[8]發(fā)現(xiàn),TNFAIP8家族基因的功能性單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)位點與宮頸癌的發(fā)生相關(guān)。然而,SNP位點與宮頸癌預(yù)后的關(guān)系尚不明確。因此,本研究探討了TNFAIP8家族基因的SNP位點與宮頸癌預(yù)后的關(guān)系,以期為宮頸癌個體化治療、預(yù)后評估提供分子流行病學(xué)與遺傳學(xué)證據(jù)。
1資料與方法
1.1 一般資料選擇2008—2009年在復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院進行根治性子宮切除加盆腔淋巴結(jié)清掃術(shù)的144例宮頸癌患者,均獲得標(biāo)準(zhǔn)治療和隨訪。術(shù)后3周,當(dāng)患者存在至少兩個高危因素(≥1個盆腔淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、腫瘤直徑>4 cm、脈管浸潤陽性、切緣陽性或者宮頸肌層浸潤深度>1/2中任意兩項)時,行盆腔放射治療加順鉑化療方案治療(30 mg/m2順鉑 + 45 mg/m2紫杉醇)的同步放化療方案。若患者有髂淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,則改用延伸野放射治療。所有患者在術(shù)后兩年內(nèi)每3個月隨訪1次,第2個兩年每6個月隨訪1次,之后每年隨訪1次。腫瘤復(fù)發(fā)定義為:初次治療后,經(jīng)過至少3個月的無瘤期,再次發(fā)現(xiàn)腫瘤灶。無進展生存率(progression-free survival,PFS)為從初次手術(shù)到復(fù)發(fā)。144例患者均自愿參與研究,簽署知情同意書,并提供5 mL外周靜脈血。
1.2SNP位點選擇根據(jù)HapMap和NCBI 的dbSNP數(shù)據(jù)庫,查詢中國漢族人群TNFAIP8基因的SNP位點。篩選標(biāo)準(zhǔn):(1) 中國漢族人群最小等位基因頻率≥0.05;(2) 各位點間連鎖不平衡(r2<0.8);(3) 位于基因功能區(qū),且SNPinfo在線軟件預(yù)測具有潛在功能性。根據(jù)上述標(biāo)準(zhǔn),我們篩選出3個候選SNP位點:TNFAIP8-rs11064、TNFAIP8-rs3813308、TNFAIP8L1-rs1060555。
1.3血基因組DNA的提取和基因分型檢測采用血液基因組DNA提取試劑盒(購自廣州東盛生物科技有限公司)提取全血基因組DNA,并用超微量紫外可見分光光度計(ND-2000,美國Thermo Scientific公司)檢測DNA的濃度和純度。采用TaqMan探針熒光定量PCR方法檢測SNP位點的基因分型,TaqMan探針和SNP分型試劑(TaqMan Genotyping Master Mix)均購自美國ABI公司。PCR反應(yīng)后的熒光信號通過SDS 2.3軟件(ABI公司)分析。每塊PCR反應(yīng)的384孔板在指定位置設(shè)有陽性和陰性對照各4個。另外,隨機抽取5% 樣本進行測序,測序結(jié)果與TaqMan基因分型結(jié)果的一致率為100%。
1.4統(tǒng)計學(xué)處理采用SAS 9.1軟件進行統(tǒng)計學(xué)處理。采用Kaplan-Meier生存分析曲線、Log-rank檢驗和Cox多元回歸分析評估模型進行TNFAIP8基因家族SNP和宮頸癌患者預(yù)后的相關(guān)性分析。
2結(jié)果
2.1一般情況144例患者的平均年齡(46.5±8.6)歲;按國際婦產(chǎn)科協(xié)會(FIGO)分期標(biāo)準(zhǔn),Ⅰ、ⅡA和IIB期者分別為70、64和8例;腫瘤直徑≥4 cm者85例 (59.0%);盆腔淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陽性和血管浸潤陽性者分別為51例 (35.4%)、53例 (37.1%) ;宮頸肌層浸潤深度>1/2層者110 例 (76.4%) ;術(shù)后采用同步放化療方案者115例 (79.9%)。所有患者治療后均隨訪24~40個月,中位隨訪時間為35個月,其中21例在隨訪期內(nèi)腫瘤復(fù)發(fā),11例患者因?qū)m頸癌病死。見表1。
表1 144例患者的一般情況
2.2TNFAIP8家族基因SNP位點與宮頸癌預(yù)后的相關(guān)性多因素分析顯示,攜帶TNFAIP8L1-rs1060555 GG基因型的宮頸癌患者相較于攜帶CG/CC基因型者,腫瘤復(fù)發(fā)的危險度顯著增加(校正HR=3.25,95%CI:1.06~9.95)。我們將3個SNP位點進行聯(lián)合分析,攜帶TNFAIP8-rs11064 AA、TNFAIP8-rs3813308 CC和TNFAIP8L1-rs1060555 GG中2~3個基因型的患者相對于攜帶0~1個基因型的患者,腫瘤復(fù)發(fā)的危險度顯著增加(校正HR=2.55,95%CI:1.02~6.36)。見表2。Kaplan-Meier生存曲線(圖1)分析也提示,當(dāng)宮頸癌患者攜帶TNFAIP8L1-rs1060555 GG或TNFAIP8-rs11064 AA、TNFAIP8-rs3813308 CC和TNFAIP8L1-rs1060555 GG中的2~3個基因型時,PFS顯著下降(Log-rank檢驗,P分別為0.024、0.014)。
表2 TNFAIP8家族基因SNP位點與宮頸癌預(yù)后的關(guān)系
注:*危險基因型為:TNFAIP8-rs11064AA、TNFAIP8-rs3813308CC、TNFAIP8L1-rs1060555GG
圖1 Kaplan-Meier生存曲線
當(dāng)宮頸癌患者攜帶TNFAIP8L1-rs1060555 GG基因型或攜帶2~3個危險基因型(TNFAIP8-rs11064 AA、TNFAIP8-rs3813308 CC、TNFAIP8L1-rs1060555 GG)時,PFS顯著下降(Log-rank檢驗,P分別為0.024、0.014)。
3討論
TNFAIP8基因家族包括TNFAIP8、TNFAIP8L1、TNFAIP8L2和TNFAIP8L3。本研究未在TNFAIP8L2和TNFAIP8L3基因中篩選到符合要求的SNP,因此最終納入研究的僅為2個基因的3個SNP位點。我們的前期研究[8]已發(fā)現(xiàn),TNFAIP8基因家族的功能性SNP位點與宮頸癌的發(fā)生密切相關(guān),并且TNFAIP8蛋白表達水平與宮頸癌預(yù)后相關(guān),但未對這些SNP位點與宮頸癌的預(yù)后做深入的多個位點聯(lián)合分析。
本研究首次報告了TNFAIP8基因家族SNP在宮頸癌預(yù)后評估中的作用。我們發(fā)現(xiàn),攜帶TNFAIP8L1-rs1060555 GG基因型的宮頸癌患者相對于CC/CG基因型攜帶者,PFS明顯下降,腫瘤復(fù)發(fā)率增加。進一步的位點聯(lián)合分析發(fā)現(xiàn),攜帶TNFAIP8-rs11064 AA、TNFAIP8-rs3813308 CC、TNFAIP8L1-rs1060555 GG中的2~3個的患者比攜帶0~1個的患者,PFS明顯下降,腫瘤復(fù)發(fā)增加。因此,TNFAIP8家族基因的SNP位點在宮頸癌的預(yù)后評估中起重要作用。
TNFAIP8基因定位于染色體5q23.1區(qū)域,主要通過負(fù)性調(diào)節(jié)T細(xì)胞受體和Toll樣受體信號通路來發(fā)揮抗感染和維持免疫穩(wěn)態(tài)的作用[5];其過表達可引起細(xì)胞的增殖,在腫瘤發(fā)生、侵襲過程中扮演癌基因的角色[4,9-10]。TNFAIP8L1基因位于染色體19p13.3區(qū)段,DNA全長16 kb,編碼的蛋白由186個氨基酸組成。目前,對TNFAIP8L1的研究較少,它可能作為抗凋亡的原癌基因,在免疫調(diào)節(jié)和腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起重要作用,但與宮頸癌的關(guān)系尚未見報道。
盡管本研究納入的病例數(shù)較少、隨訪時間較短,但我們的研究首次證實TNFAIP8家族基因SNP位點與宮頸癌預(yù)后相關(guān)。這些位點有望為宮頸癌患者的預(yù)后評估提供參考。我們將在后續(xù)研究中增加病例數(shù)、延長隨訪時間,以更加全面地了解TNFAIP8家族基因SNP在宮頸癌預(yù)后評估中的作用。
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Predictive Value of Polymorphisms in the TNFAIP8 Gene Family for Clinical Outcomes of Cervical Cancer
ShiTingyan1,2HeJing3WangMengyun2
1.DepartmentofObstetricsandGynecology,ZhongshanHospital,F(xiàn)udanUniversity,Shanghai200032,China; 2.FudanUniversityShanghaiCancerCenter,Shanghai200032,China; 3.GuangzhouWomenandChildren’sMedicalCenterinGuangdongProvince,Guangzhou510623,China
AbstractObjective: To investigate the predictive value of polymorphisms in the tumor necrosis factor-α-induced protein 8 (TNFAIP8) gene family in the prognosis of cervical cancer. Methods: A total of 144 cervical cancer patients who had been followed up for at least two years were recruited. Three polymorphism sites TNFAIP8-rs11064, TNFAIP8-rs3813308 and TNFAIP8L1-rs1060555 in the TNFAIP8 gene family were genotyped by the Taqman assay. The associations of polymorphisms in the TNFAIP8 gene family with prognosis of cervical cancer were analyzed. Results: Compared with CG/CC genotypes, tumor recurrence in TNFAIP8L1-rs1060555 GG genotype carriers increased (adjustedHR=3.25, 95%CI: 1.06-9.95). Combined analysis for the three polymorphisms indicated that compared with 0-1 risk genotype carriers, tumor recurrence in 2-3 risk genotype carriers increased (adjustedHR=2.55, 95% CI: 1.02-6.36). Conclusions: Polymorphisms in TNFAIP8 gene family may be predictive biomarkers for prognosis of cervical cancer.
Key WordsCervical cancer;TNFAIP8 gene family;Polymorphism;Prognosis
中圖分類號R71
文獻標(biāo)識碼A
基本項目:國家自然科學(xué)青年基金資助項目(編號:81402142)
·論著·