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        一個(gè)遺傳性非綜合征型耳聾家系的GJB2基因突變分析*

        2015-03-04 07:55:54王義旺胡祥上全慶麗姜海鷗
        重慶醫(yī)學(xué) 2015年33期
        關(guān)鍵詞:基因突變

        王義旺,胡祥上,全慶麗,姜海鷗△

        (1.湖南醫(yī)藥學(xué)院附屬醫(yī)院/懷化市第一人民醫(yī)院耳鼻喉科,湖南懷化418000;2.湖南醫(yī)藥學(xué)院醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室,湖南懷化418000)

        耳聾是最常見的感覺障礙性疾病之一,在新生兒中發(fā)病率約為1/1 000。按表型特征不同,遺傳性耳聾可分為綜合征型耳聾(syndromic hearing loss,SHL)和非綜合征型耳聾(nonsyndromic hearing loss,NSHL)[1]。NSHL可表現(xiàn)為多種遺傳方式,包括常染色體顯性遺傳,常染色體隱性遺傳,X 連鎖遺傳,Y 連鎖遺傳和線粒體遺傳等。遺傳性耳聾具有高度的遺傳異質(zhì)性。迄今為止,共定位NSHL 基因位點(diǎn)136個(gè),已克隆的致病基因有60余個(gè),其中導(dǎo)致遺傳性NSHL的基因中,GJB2、SLC26A4、MYO15A、OTOF、CDH23和TMC1等基因突變較為常見,其中又以GJB2 基因突變最為常見[2],在我國(guó)約18.31%的耳聾患者是由GJB2 基因突變導(dǎo)致的[3]。鑒此,作者對(duì)1個(gè)遺傳性NSHL 家系成員的GJB2基因編碼序列進(jìn)行分析,旨在尋找耳聾患者的致病基因突變。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 該家系4代共14人,其中耳聾患者4例(圖1)。先證者(Ⅲ2),男,42歲,12歲起雙側(cè)耳鳴并進(jìn)行性聽力減退,36歲發(fā)展為全聾。純音測(cè)聽顯示左耳聽力為85分貝,右耳聽力為80分貝,屬于重度耳聾。除耳聾之外,不伴其他器官系統(tǒng)的異常。該家系耳聾患者的起病年齡為12~25 歲,其他患者與先證者臨床癥狀相似。臨床表現(xiàn)為雙側(cè)耳鳴,聽力減退為雙耳對(duì)稱性、以高頻聽力下降為主的感覺神經(jīng)性耳聾。耳部CT 掃描、前庭功能及全身體格檢查,均未發(fā)現(xiàn)異常。

        圖1 患者家系圖

        表1 PCR 擴(kuò)增GJB2基因的引物

        1.2 方法

        1.2.1 DNA 制備 在獲得知情同意之后,采集該家系9個(gè)成員的外周血樣本,包括3例患者(Ⅱ2、Ⅱ5、Ⅲ2)和6名健康人(Ⅱ1、Ⅱ3、Ⅱ6、Ⅲ1、Ⅲ5、Ⅳ1)。血液基因組DNA 提取試劑盒購(gòu)自北京天根生化公司(批號(hào)DP318),按產(chǎn)品說(shuō)明書介紹的方法提取基因組DNA。DNA 濃度測(cè)定后稀釋成為25ng/μL 工作液。

        1.2.2 PCR 擴(kuò)增應(yīng)用Primer5軟件設(shè)計(jì)并合成3對(duì)引物(表1),擴(kuò)增區(qū)域覆蓋GJB2基因的兩個(gè)外顯子及外顯子與內(nèi)含子交界區(qū)域。PCR 反應(yīng)體系:總體積為15μL,2×GC buffer 7.50μL(含MgCl210 mmol/L),dNTP 混合液(10 mmol/L)0.75μL,正反向引物(10μmol/L)各0.75μL,模板基因 組DNA 0.03μg,rTaq DNA 聚合酶(5U/μL)0.80μL,雙蒸水補(bǔ)至15.00μL。反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性10min、95 ℃變性30s、55~60℃退火30s、72℃延伸45s,35個(gè)循環(huán),72℃再延伸10 min。PCR 產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠,恒壓140V 電泳25min,溴化乙錠/紫外線觀察,以證實(shí)PCR 擴(kuò)增的片段。

        1.2.3 產(chǎn)物純化、序列測(cè)定及分析 PCR 產(chǎn)物純化(生工SK1141)后送至上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司,在ABI3730自動(dòng)測(cè)序儀上應(yīng)用相應(yīng)的PCR 引物進(jìn)行雙向直接序列測(cè)定,測(cè)序結(jié)果使用DNAStar軟件進(jìn)行分析。發(fā)現(xiàn)的序列變異在NCBI和Hapmap的多態(tài)數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行查詢,確定是否為單核苷酸多態(tài)(single nucleotide polymorphism,SNP)。通過(guò)同時(shí)檢測(cè)家系內(nèi)所有患者及其健康同胞的相應(yīng)序列,鑒定變異序列是否與疾病表型共分離。

        2 結(jié) 果

        該家系共有存活耳聾患者3例,從家系圖分析,符合常染色體顯性遺傳;所有患者均為語(yǔ)后聾,為雙耳對(duì)稱性、進(jìn)行性、高頻聽力下降為主的感覺神經(jīng)性聾,隨年齡增加耳聾程度逐步加重,最終進(jìn)展為全頻受累的重度感音神經(jīng)性聾?;颊叱霈F(xiàn)聽力下降的年齡,從12~25歲。Ⅱ2,女,65歲,16歲出現(xiàn)聽力下降,48歲發(fā)展為全聾,目前左耳聽力為75分貝,右耳聽力為80分貝。Ⅱ5,男,55歲,25 歲出現(xiàn)聽力下降,42 歲發(fā)展為全聾,目前左耳聽力為85分貝,右耳聽力為84分貝。

        直接雙向測(cè)序后,發(fā)現(xiàn)GJB2基因的6個(gè)變異序列(表2、圖2),這些變異既存在于部分患者中,也在健康親屬中檢測(cè)到,與疾病不存在共分離。本研究中發(fā)現(xiàn)的GJB2基因的核苷酸改變是SNP。

        圖2 GJB2基因中檢測(cè)到的核苷酸變異序列

        表2 GJB2基因中檢測(cè)到的變異序列

        3 討 論

        耳聾是導(dǎo)致交流障礙最常見的疾病,大多數(shù)發(fā)病都與遺傳有關(guān)。遺傳性耳聾患者中70%以上為NSHL。耳聾具有高度的遺傳異質(zhì)性,相關(guān)基因眾多,但在不同人群中GJB2基因突變均是導(dǎo)致NSHL的最主要致病基因[4]。Mignon 等[5]于1996年將人類GJB2定位于13q11-q12,基因全長(zhǎng)5 510bp,含兩個(gè)外顯子,而編碼序列位于exon2,長(zhǎng)為681bp。GJB2含有226個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì),相對(duì)分子質(zhì)量約為26×103,也稱縫隙連接蛋白26(connexin 26,Cx26)。Cx26是一種跨膜蛋白,4次跨膜,共分5個(gè)區(qū):N 端區(qū)、跨膜區(qū)、細(xì)胞外區(qū)、胞漿內(nèi)連接區(qū)和C端區(qū)。Cx26蛋白以六聚體形式結(jié)合形成縫隙連接,形成耳蝸內(nèi)鉀離子運(yùn)輸通道,以維持耳蝸內(nèi)較高水平電位[6]。GJB2基因突變可導(dǎo)致Cx26 蛋白功能缺陷,減少鉀離子再循環(huán)效率,進(jìn)而導(dǎo)致聽力損害[7]。目前發(fā)現(xiàn),GJB2至少有111種突變可以引起NSHI,其中顯性突變9 種,隱性突變92 種,遺傳模式不明突變10種。

        本研究的NSHL家系中,所有患者均為語(yǔ)后聾,為雙耳對(duì)稱性、進(jìn)行性、高頻聽力下降為主的感覺神經(jīng)性聾,不伴其他器官系統(tǒng)的異常。根據(jù)其臨床特征和遺傳方式,作者認(rèn)為該家系屬于常染色體顯性遺傳的非綜合征型耳聾。進(jìn)一步用分子遺傳學(xué)方法嘗試了GJB2 基因的突變篩查,尋找患者特有的突變。檢測(cè)到的6個(gè)變異序列既存在于患者中,也出現(xiàn)在患者的健康親屬中,未發(fā)現(xiàn)與疾病表型共分離的變異。其中c.79G>A(p.Val27Ile)和c.341G>A(p.Glu114Gly)為已報(bào)道的核苷酸多態(tài),而位于3′-UTR 的g.4159T>C、g.5142G/T、g.5227G/A、g.5352T/C突變?yōu)楸狙芯繃?guó)內(nèi)外首次報(bào)道。盡管本研究在GJB2基因的編碼區(qū)發(fā)現(xiàn)了2個(gè)雜合突變79G>A(p.Val27Ile)和341G>A(p.Glu114Gly),但在該家系患者和健康人中均存在這些突變,因此,作者認(rèn)為它們更可能是該基因的SNP,這與大多數(shù)研究者認(rèn)為雜合突變79G>A 和341G>A是GJB2基因的多態(tài)相一致的[8-10]。所以,作者初步排除了GJB2為本研究NSHL家系的致病基因,說(shuō)明遺傳性非綜合征型耳聾存在明顯的遺傳異質(zhì)性。

        [1] Walsh T,Pierce SB,Lenz DR,et al.Genomic duplication and overexpression of TJP2/ZO-2leads to altered expression of apoptosis genes in progressive nonsyndromic hearing loss DFNA51[J].Am J Hum Genet,2010,87(2):101-109.

        [2] Walsh T,Shahin H,Elkan-Miller T,et al.Whole exome sequencing and homozygosity mapping identify mutation in the cell polarity protein GPSM2as the cause of nonsyndromic hearing loss DFNB82 [J].Am J Hum Genet,2010,87(1):90-94.

        [3] Xiao ZA,Xie DH.GJB2(Cx26)gene mutations in Chinese patients with congenital sensorineural deafness and a report of one novel mutation[J].Chin Med J(Engl),2004,117(20):1797-1801.

        [4] Kim HJ,Park CH,Kim HJ,et al.Sequence variations and haplotypes of the GJB2gene revealed by resequencing of 192chromosomes from the general population in Korea[J].Clin Exp Otorhinolaryngol,2010,3(1):65-69.

        [5] Mignon C,F(xiàn)romaget C,Mattei MG,et al.Assignment of connexin 26(GJB2)and 46(GJA3)genes to human chromosome 13q11-q12and mouse chromosome 14D1-E1by in situ hybridization[J].Cytogenet Cell Genet,1996,72(2/3):185-186.

        [6] Su CC,Li SY,Su MC,et al.Mutation R184Qof connexin 26in hearing loss patients has a dominant-negative effect on connexin 26and connexin 30[J].Eur J Hum Genet,2010,18(12):1061-1064.

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        [10] 肖自安,馮永,潘乾.非綜合征性耳聾患者連接蛋白26基因突變的研究[J].中華耳鼻咽喉科學(xué)雜志,2000,35(3):188-191.

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