馬東方+方正武+邱先進(jìn)+等
摘要:中梁16具有適應(yīng)性廣、抗條銹性強(qiáng)等許多優(yōu)良的生物學(xué)特性。為了給抗病育種和小麥條銹病的區(qū)域治理提供參考, 利用中國(guó)當(dāng)前流行的條銹菌小種CYR29對(duì)中梁16、銘賢169及其雜交群體進(jìn)行抗條銹性遺傳分析, 并對(duì)其抗條銹基因進(jìn)行SSR分子標(biāo)記。結(jié)果表明, 中梁16對(duì)CYR29小種具有良好的抗性, 由1對(duì)顯性基因控制, 暫命名為YrZh16。該基因與位于小麥2AS染色體上的5個(gè)SSR位點(diǎn)Xbarc124、Xbarc212、Xwmc177、Xwmc602和Xwmc827連鎖, 遺傳距離跨度從5.4 cM到16.9 cM。系譜分析該基因可能來(lái)自水源11。與已定位于2A染色體上暫命名抗條銹病基因的比較表明,YrZh16可能是一個(gè)抗條銹病的新基因。
關(guān)鍵詞:中梁16;小麥條銹病;遺傳分析
中圖分類(lèi)號(hào):S512.1 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):0439-8114(2014)22-5351-04
小麥(Triticum aestivum)是一種在世界范圍內(nèi)廣泛種植的禾本科植物,種植面積多于水稻。小麥條銹病是影響小麥生產(chǎn)最重要的病害之一,該病害是由條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型(Puccinia striiformis f.sp. tritici)引起的世界性病害,在低溫和潮濕環(huán)境下易發(fā)生,從小麥一葉期到成熟只要植物仍然是綠色都可以發(fā)生感染[1]。該病菌可隨氣流高空遠(yuǎn)距離傳播,具有發(fā)病范圍廣、流行頻率高等特點(diǎn)。雖然農(nóng)藥的大面積及時(shí)使用可以控制該病害,但要投入大量的人力、物力和財(cái)力,而且污染環(huán)境。國(guó)內(nèi)外大量的研究表明,培育和推廣抗病小麥品種是控制這一病害最有效、經(jīng)濟(jì)且環(huán)保的方法[2]。然而,小麥條銹菌群體毒性結(jié)構(gòu)復(fù)雜,新毒性小種不斷形成,由于利用小麥抗病類(lèi)型單一,促進(jìn)了新生理小種的形成并發(fā)展成為優(yōu)勢(shì)小種,致使小麥條銹病周期性流行。因此,不斷地尋找、鑒定、引進(jìn)新的抗條銹病基因,并對(duì)去抗條銹的遺傳特點(diǎn)進(jìn)行研究,增加抗病基因的多樣性,是控制小麥條銹病發(fā)生流行的迫切任務(wù)[3]。
至今已有51個(gè)位點(diǎn)上的54個(gè)抗條銹基因(Yr1~Yr54)被正式命名[4],另外還有數(shù)十個(gè)被臨時(shí)命名的基因[5],這些基因大部分表現(xiàn)小種專(zhuān)化性。分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展,為抗病基因的檢測(cè)、標(biāo)記與定位提供了更為快捷的手段,其中SSR(Simple sequence repeat)標(biāo)記在小麥抗條銹病基因定位和分子作圖中被廣泛應(yīng)用,大部分已正式命名小麥抗條銹病基因均已獲得與其緊密連鎖的SSR標(biāo)記。
中梁16(水源11/山前麥)是甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所選育的具有相對(duì)持久抗條銹病的冬小麥品種,綜合農(nóng)藝性狀好。本研究旨在明確中梁16抗條銹遺傳規(guī)律,挖掘其抗病基因,并獲得與其緊密連鎖的SSR標(biāo)記,獲得的分子標(biāo)記將為小麥抗條銹病分子輔助育種提供有效的工具。
1 材料和方法
1.1 植物材料和條銹菌小種
用于條銹菌接菌測(cè)試的小麥品種包括:中梁16及其與銘賢169雜交后代F1、F2、F2∶3、BC1代群體。中梁16品種由甘肅省天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所提供。
供試小麥條銹菌生理小種為:CYR29。菌種通過(guò)單孢分離法獲得,并在中國(guó)鑒別寄主上重新鑒定確認(rèn)。
1.2 苗期抗條銹病遺傳分析
將親本、F1代、F2代、BC1代以及F2∶3家系小麥種子用1∶100的雙氧水溶液浸泡消毒,蒸餾水中催芽24 h,待萌發(fā)后播種到直徑10 cm的小花盆中,每花盆播種15~20粒,置于溫室按常規(guī)方法培養(yǎng)。在供試小麥幼苗第1葉片充分展開(kāi),第2葉片露尖時(shí)用手指蘸水脫去葉表面的蠟質(zhì)層,同時(shí)用蒸餾水配制條銹菌夏孢子懸浮液,用接種針蘸取懸浮液涂抹于葉片正面。接種完成后,保濕24 h(黑暗、10 ℃)后轉(zhuǎn)入溫室內(nèi)潛育發(fā)病[溫度為15~17 ℃(晝)/10~12℃(夜),光照周期16 h(晝)/8h(夜)],并采用生物鏑燈增加光照強(qiáng)度(光強(qiáng)9 000 lx)。約14 d后待感病對(duì)照銘賢169充分發(fā)病時(shí)開(kāi)始調(diào)查結(jié)果,反應(yīng)型調(diào)查標(biāo)準(zhǔn)分為11級(jí), 即 0、0;、0;+、1、1+、2、2+、3-、3、3+、4。其中0~2+為抗病類(lèi)型, 3-~4為感病類(lèi)型[6]。統(tǒng)計(jì)雙親、雜交后代各株系的抗感分離比例, 用卡方檢驗(yàn)法對(duì)分離后代進(jìn)行分析, 明確供試品種對(duì)特定小種抗條銹性的基因數(shù)目及基因間關(guān)系。
1.3 基因組DNA的提取和抗、感池的構(gòu)建
基因組DNA提取用CTAB法[7]。參考Michelmore等[8]提出的抗、感池建立方法,將F2代群體的10株高抗單株DNA、10株高感單株DNA分別等量混合構(gòu)成抗病基因池(BR)和感病基因池(BS)。構(gòu)建抗感池的單株均經(jīng)過(guò)F2∶3家系驗(yàn)證其純合性。
1.4 SSR標(biāo)記篩選和遺傳作圖
根據(jù)http://wheat.pw.usda.gov公布的小麥SSR引物序列,由上海Invitrogen生命技術(shù)公司合成21條染色體上420對(duì)SSR引物。對(duì)中梁16、銘賢169、抗病基因池、感病基因池和F2代群體的DNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增,篩選多態(tài)性引物。擴(kuò)增產(chǎn)物用8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離,硝酸銀染色后顯影,照相并保存圖像。篩選與抗病親本連鎖的標(biāo)記,進(jìn)而用MAPMAKER 3.0b軟件計(jì)算各標(biāo)記位點(diǎn)與目的基因的遺傳距離,最后用MapDraw V2.0軟件繪制連鎖圖[9]。
2 結(jié)果與分析
2.1 抗條銹性鑒定
苗期接種鑒定表明,中梁16和水源11對(duì)CYR29表現(xiàn)良好的抗銹性,反應(yīng)型為近免疫(IT 0;)。山前麥和感病對(duì)照品種銘賢169對(duì)CYR29均表現(xiàn)高度感病反應(yīng)(IT 4)。推斷中梁16的抗條銹病基因可能來(lái)自于水源11。
2.2 抗條銹性遺傳分析
接種CYR29時(shí),中梁16與銘賢169雜交的F1代15個(gè)植株均表現(xiàn)高抗,BC1代12株抗病,13株感病,經(jīng)卡方檢測(cè)符合1∶1的分離比;反交組合F2代中,抗病植株117株,感病植株44株,符合3∶1的分離比例(χ2=0.35,P=0.49),對(duì)應(yīng)的F2∶3家系中,純抗家系37個(gè),抗感分離家系79個(gè),純感家系43個(gè),分離比例符合1∶2∶1(χ2=0.46,P=0.79)(表1)。上述結(jié)果表明中梁16對(duì)CYR29的抗病性由1對(duì)顯性基因控制,暫命名為YrZh16。以F2群體的161個(gè)單株構(gòu)建作圖群體,對(duì)抗條銹病基因進(jìn)行SSR標(biāo)記。
2.3 YrZh16的SSR標(biāo)記定位
選擇小麥21條染色體上的420對(duì)SSR引物對(duì)中梁16、銘賢169、抗病池及感病池進(jìn)行多態(tài)性引物的篩選。結(jié)果2AS上的5對(duì)引物 (Xbarc124、Xbarc212、Xwmc177、Xwmc602和Xwmc827) 在中梁16、銘賢169及抗感池間能擴(kuò)增出穩(wěn)定的多態(tài)性片段。篩選到的5對(duì)多態(tài)性引物再對(duì)小群體進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果顯示均擴(kuò)增出一致的多態(tài)性,推測(cè)這5個(gè)標(biāo)記與YrZh16連鎖。圖1為SSR引物Xbarc177和Xbarc212在親本、抗感池、部分F2代單株中的擴(kuò)增結(jié)果。
2.4 連鎖遺傳分析
根據(jù)F2分離群體及F2∶3家系反應(yīng)型,確定F2單株的抗感基因型。以2AS上的5對(duì)多態(tài)性引物對(duì)銘賢169×中梁16 F2代分離群體進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示這些位點(diǎn)與YrZh16有明顯的連鎖關(guān)系(表2)。用MAPMAKER 3.0b軟件進(jìn)行連鎖分析, Xbarc124、Xbarc212、Xwmc177、Xwmc602和Xwmc827與抗條銹基因的遺傳距離分別為13.0、5.4、6.6、9.8 和16.9 cM,總跨度為51.7 cM。參照Somers等[10]報(bào)道的小麥染色體上SSR遺傳圖譜, 根據(jù)YrZh16與所獲得5個(gè)連鎖標(biāo)記之間的關(guān)系可知,YrZh16位于小麥染色體2AS上, 且位于Xbarc212和Xwmc177之間。據(jù)此繪制了中梁16中抗條銹病基因YrZh16遺傳連鎖圖 (圖2)。
3 討論
甘肅隴南地區(qū)是中國(guó)小麥條銹病菌越夏異變區(qū),超過(guò)80%的條銹菌新小種首先在甘肅隴南地區(qū)被發(fā)現(xiàn),然后蔓延至其他地區(qū)。中梁16在隴南地區(qū)已種植多年,對(duì)穩(wěn)定小麥條銹菌種群、減輕麥區(qū)菌源壓力等方面有不可忽視的作用。在本試驗(yàn)中,課題組鑒定了中梁16對(duì)條銹菌CYR29具有良好的抗病性,并對(duì)中梁16所含的抗銹基因YrZh16進(jìn)行了分子定位。本研究發(fā)現(xiàn)普通小麥品種中梁16對(duì)中國(guó)優(yōu)勢(shì)條銹菌小種CYR29由1對(duì)顯性基因YrZh16控制, 被定位在染色體2AS上。
目前已報(bào)道的2AS上的抗條銹病基因有Yr17 [11]以及暫命名的QYrtm.pau-2A[12]和QTL 2AS[13]。從系譜上來(lái)說(shuō),Yr17存在于載體品種VPM1、Hyak和Madsen中,QYrtm.pau-2A存在于載體品種T.monococcum PAU14087/Kris,QTL 2AS存在于載體品種Kris/Wasmo,而YrZh16存在于中梁16(水源11/山前麥),與前者并無(wú)交集。從染色體位置來(lái)說(shuō),QYrtm.pau-2A和QTL 2AS靠近染色體端部位置,而YrZh16在染色體短臂中間位置。QYrtm.pau-2A 和QTL 2AS雖然定位在2AS染色體上,但是這兩個(gè)基因均為成株期抗條銹病基因,只在成株期表達(dá),而YrZh16為苗期抗病基因(又稱全生育期抗病基因)不同。用Yr17單基因系苗期接種CYR29 的抗病性表現(xiàn)為中抗(IT 2),而中梁16接種CYR29的抗病性表現(xiàn)為近免疫。此外用CYR29接種山前麥結(jié)果表現(xiàn)高感,而水源11表現(xiàn)高抗,說(shuō)明YrZh16可能來(lái)源于水源11。綜合以上分析,YrZh16可能是一個(gè)與已知基因不同的新基因。
1990年中國(guó)小麥條銹病大流行,給中國(guó)小麥產(chǎn)量造成嚴(yán)重?fù)p失,有些地區(qū)小麥減產(chǎn)高達(dá)50%,有的甚至顆粒無(wú)收。這次條銹病大流行是由于CYR29號(hào)生理小種迅速發(fā)展(1989年其頻率達(dá)40.3%)而導(dǎo)致大面積的種植含有抗條銹基因Yr9的“洛類(lèi)”及其衍生系品種喪失抗條銹性[14]。目前,中國(guó)小麥生產(chǎn)上的主流品種仍然以“洛類(lèi)”衍生系、繁6衍生系和揚(yáng)麥系為主,它們中的大多數(shù)均感條銹病。由于小種專(zhuān)化抗病基因容易被新的條銹菌小種克服,在抗病育種過(guò)程中,中梁16需要與成株抗病基因以及其他全生育期抗病基因等基因聚合,以提高品種的抗病使用年限。在本研究中所明確的抗條銹病基因和獲得的分子標(biāo)記,對(duì)分子標(biāo)記輔助育種和改良抗條銹品種具有重要意義。
參考文獻(xiàn):
[1] LINE R F. Stripe rust of wheat and barley in North America: A retrospective historical review[J]. Annu Rev Phytopathol, 2002(40):75-118.
[2] WAN A, ZHAO Z, Chen X, et al. Wheat stripe rust epidemic and virulence of Puccinia striiformis f. sp. tritici in China in 2002[J]. Plant Disease, 2004, 88 (8):896–904.
[3] 李振岐,曾士邁.中國(guó)小麥銹病[M].北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)出版社, 2002.
[4] BASNET B R, SINGH R P, IBRAHIM A M H, et al. Characterization of Yr54 and other genes associated with adult plant resistance to yellow rust and leaf rust in common wheat Quaiu 3[J]. Molecular Breeding,2013,DOI 10.1007/s11032-013-9957-2.
[5] 馬東方,王海鴿,唐明雙,等.小麥品種中梁21抗條銹病基因遺傳分析與SSR標(biāo)記定位[J].作物學(xué)報(bào),2011,37(12):1-7.
[6] 劉孝坤.小麥抗源對(duì)條銹病的抗性遺傳研究初報(bào)[J].植物保護(hù)學(xué)報(bào),1988,15(1): 33-39.
[7] ROGERS S O, BENDICH A J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues[J]. Plant Molecular Biology, 1985, 5: 69–76
[8] MICHELMORE R W, PARAN I, KESSELI R V. Identification of markers linked to disease-resistance genes by bulked segregant analysis: a rapid method to detect markers in specific genomic regions by using segregating segregating populations[C]. In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, San Diego, USA. 1991, 88: 9828-9832.
[9] 劉仁虎,孟金陵.MapDraw,在Excel中繪制遺傳連鎖圖的宏[J].遺傳,2003,25(3):317–321.
[10] SOMERS D J, ISAAC P, EDWARDS K. A high-density microsatellite consensus map for bread wheat (Triticum aestivum L) [J]. Theoretical and Applied Genetics, 2004, 109: 1105-1114.
[11] BARIANA H S, MCLNTOSH R2 A, Cytogenetic studies in wheat. XV. Location of rust resistance genes in VPM1 and their genetic linkage with other disease resistance genes in
chromosome 2A [J]. Genome, 1993, 36(3): 476-482.
[12] CHHUNEJA P, KAUR S, GARG T, Ghai M, Kaur S, Prashar M, Bains N S, Goel R K, Keller B, Dhaliwal H S, Singh K. Mapping of adult plant stripe rust resistance genes in diploid A genome wheat species and their transfer to bread wheat [J]. Theoretical and Applied Genetics, 2008, 116: 313-324.
[13] CHRISTIANSEN M J, FEENSTRA B, SKOVGAARD I M, et al. Genetic analysis of resistance to yellow rust in hexaploid wheat using a mixture model for multiple crosses [J]. Theoretical and Applied Genetics, 2006, 112: 581-591.
[14] 吳立人,牛永春.我國(guó)小麥條銹病持續(xù)控制的策略[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2000,33(5):46-54.
(責(zé)任編輯 羅亞軍)
[8] MICHELMORE R W, PARAN I, KESSELI R V. Identification of markers linked to disease-resistance genes by bulked segregant analysis: a rapid method to detect markers in specific genomic regions by using segregating segregating populations[C]. In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, San Diego, USA. 1991, 88: 9828-9832.
[9] 劉仁虎,孟金陵.MapDraw,在Excel中繪制遺傳連鎖圖的宏[J].遺傳,2003,25(3):317–321.
[10] SOMERS D J, ISAAC P, EDWARDS K. A high-density microsatellite consensus map for bread wheat (Triticum aestivum L) [J]. Theoretical and Applied Genetics, 2004, 109: 1105-1114.
[11] BARIANA H S, MCLNTOSH R2 A, Cytogenetic studies in wheat. XV. Location of rust resistance genes in VPM1 and their genetic linkage with other disease resistance genes in
chromosome 2A [J]. Genome, 1993, 36(3): 476-482.
[12] CHHUNEJA P, KAUR S, GARG T, Ghai M, Kaur S, Prashar M, Bains N S, Goel R K, Keller B, Dhaliwal H S, Singh K. Mapping of adult plant stripe rust resistance genes in diploid A genome wheat species and their transfer to bread wheat [J]. Theoretical and Applied Genetics, 2008, 116: 313-324.
[13] CHRISTIANSEN M J, FEENSTRA B, SKOVGAARD I M, et al. Genetic analysis of resistance to yellow rust in hexaploid wheat using a mixture model for multiple crosses [J]. Theoretical and Applied Genetics, 2006, 112: 581-591.
[14] 吳立人,牛永春.我國(guó)小麥條銹病持續(xù)控制的策略[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2000,33(5):46-54.
(責(zé)任編輯 羅亞軍)
[8] MICHELMORE R W, PARAN I, KESSELI R V. Identification of markers linked to disease-resistance genes by bulked segregant analysis: a rapid method to detect markers in specific genomic regions by using segregating segregating populations[C]. In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, San Diego, USA. 1991, 88: 9828-9832.
[9] 劉仁虎,孟金陵.MapDraw,在Excel中繪制遺傳連鎖圖的宏[J].遺傳,2003,25(3):317–321.
[10] SOMERS D J, ISAAC P, EDWARDS K. A high-density microsatellite consensus map for bread wheat (Triticum aestivum L) [J]. Theoretical and Applied Genetics, 2004, 109: 1105-1114.
[11] BARIANA H S, MCLNTOSH R2 A, Cytogenetic studies in wheat. XV. Location of rust resistance genes in VPM1 and their genetic linkage with other disease resistance genes in
chromosome 2A [J]. Genome, 1993, 36(3): 476-482.
[12] CHHUNEJA P, KAUR S, GARG T, Ghai M, Kaur S, Prashar M, Bains N S, Goel R K, Keller B, Dhaliwal H S, Singh K. Mapping of adult plant stripe rust resistance genes in diploid A genome wheat species and their transfer to bread wheat [J]. Theoretical and Applied Genetics, 2008, 116: 313-324.
[13] CHRISTIANSEN M J, FEENSTRA B, SKOVGAARD I M, et al. Genetic analysis of resistance to yellow rust in hexaploid wheat using a mixture model for multiple crosses [J]. Theoretical and Applied Genetics, 2006, 112: 581-591.
[14] 吳立人,牛永春.我國(guó)小麥條銹病持續(xù)控制的策略[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2000,33(5):46-54.
(責(zé)任編輯 羅亞軍)