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        α-淀粉酶在不同地衣芽孢桿菌宿主菌中分泌表達(dá)的對比分析

        2015-01-03 01:15:01陳敬幫周銀華趙新宇陳守文魏雪團(tuán)
        食品科學(xué) 2015年17期
        關(guān)鍵詞:淀粉酶宿主芽孢

        陳敬幫,周銀華,趙新宇,2,陳守文,魏雪團(tuán),2,*

        α-淀粉酶在不同地衣芽孢桿菌宿主菌中分泌表達(dá)的對比分析

        陳敬幫1,周銀華1,趙新宇1,2,陳守文1,魏雪團(tuán)1,2,*

        (1.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湖北 武漢 430070;2.華中農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖北 武漢 430070)

        研究不同地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)宿主菌對α-淀粉酶分泌表 達(dá)的影響。以Bacillus subtilis的P43啟動子,B. licheniformisWX-02α-淀粉酶基因的信號肽、編碼區(qū)和終止子序列為表達(dá)原件,構(gòu)建了α-淀粉酶分泌表達(dá)載體pP43SAT。將pP43SAT分別轉(zhuǎn)入3株B. licheniformis宿主菌:WX-02(ΔamyL)、BL9和BL10,獲得3株α-淀粉酶基因工程菌WX-02(ΔamyL,pP43SAT)、BL9(pP43SAT)和BL10(pP43SAT),并將構(gòu)建的3株工程菌進(jìn)行發(fā)酵對比分析。BL9(pP43SAT)和BL10(pP43SAT)的淀粉酶發(fā)酵活力分別達(dá)到94.01 U/mL和101.94 U/mL,比原始宿主菌WX-02(ΔamyL,pP43SAT)分別提高了21%和31%,這說明BL9和BL10新型宿主菌有利于淀粉酶的分泌表達(dá)。本研究證明多蛋白酶基因缺失可顯著提高α-淀粉酶的表達(dá),為α-淀粉酶的高效表達(dá)提供了新型宿主菌和新策略。

        α-淀粉酶;地衣芽孢桿菌;宿主菌;分泌表達(dá)

        α-淀粉酶可水解淀粉,產(chǎn)生糊精、低聚糖和單糖,在食品、醫(yī)藥和紡織品領(lǐng)域應(yīng)用廣泛[1-2]?;蚬こ碳夹g(shù)常用來提高目標(biāo)蛋白的產(chǎn)量,李金霞等[3]通過大腸桿菌宿主菌實(shí)現(xiàn)了α-淀粉酶的表達(dá),但大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)易形成包涵體,且外膜含有對人和動物有毒性的內(nèi)毒素脂多糖,產(chǎn)物分離純化比較困難[4]。相比之下,地衣芽孢桿菌為食品級微生物,具有較高的安全性,且最適生長溫度高,生長速度快,細(xì)胞壁組成簡單,蛋白分泌能力強(qiáng)[5]。王鳳寰等[6]通過同源整合技術(shù),構(gòu)建了含透明顫菌血紅蛋白基因的地衣芽孢桿菌宿主菌,顯著提高了α-淀粉酶的發(fā)酵活性。牛丹丹等[7]采用同源介導(dǎo)α-淀粉酶基因擴(kuò)增技術(shù),提高了基因拷貝數(shù),顯著提高了α-淀粉酶的發(fā)酵活性。楊艷華等[8]通過過量表達(dá)調(diào)控基因degQ,顯著提高了α-淀粉酶的表達(dá)水平。Ghang等[9]選擇不同釀酒酵母表達(dá)α-淀粉酶基因,最大淀粉酶活性提高了10倍,而Galdino等[10]發(fā)現(xiàn)α-淀粉酶在釀酒酵母中的表達(dá)活力僅為3.93 U/mL。由此可見,宿主菌對外源蛋白的表達(dá)影響很大,宿主菌的改造對α-淀粉酶的發(fā)酵生產(chǎn)至關(guān)重要。

        宿主菌的胞外蛋白酶可降解目標(biāo)蛋白,從而降低目標(biāo)蛋白的表達(dá)量。因此,缺失其胞外蛋白酶可能抑制目標(biāo)蛋白的降解,從而提高目標(biāo)蛋白的表達(dá)量。Ignatova等[11]采用不同的大腸桿菌宿主菌表達(dá)青霉素?;?,發(fā)現(xiàn)多蛋白酶基因缺失可顯著提高青霉素?;傅谋磉_(dá)量。Nguyen等[12]利用8蛋白酶基因缺失的枯草芽孢桿菌WB800為宿主菌,顯著提高了納豆激酶的表達(dá)量。WX-02為本課題組前期篩選的一株地衣芽孢桿菌[13],可高產(chǎn)聚谷氨酸[14-15]、2,3-丁二醇[16]和乙偶姻[17],在WX-02的基礎(chǔ)上,通過疊加敲除的手段分別構(gòu)建了多蛋白酶基因缺失的新型宿主菌,前期研究結(jié)果證實(shí)多基因缺失宿主菌可顯著提高納豆激酶的表達(dá)量[18]。多蛋白酶基因缺失的宿主菌還未應(yīng)用于α-淀粉酶的表達(dá),無法理解宿主菌蛋白酶缺失對α-淀粉酶的影響,阻礙該策略在α-淀粉酶表達(dá)中的應(yīng)用。本研究以前期構(gòu)建的多基因缺失宿主菌BL9和BL10為宿主菌進(jìn)行α-淀粉酶的分泌表達(dá),評價(jià)多蛋白酶基因缺失對α-淀粉酶表達(dá)的影響,為α-淀粉酶的高效表達(dá)提供新思路。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        1.1.1菌株

        表1為實(shí)驗(yàn)所用菌株。其中BL9缺失7個(gè)蛋白酶基因(mpr、vpr、aprX、epr、bpr、wprA、aprE、amyL)和1個(gè)鞭毛蛋白基因(hag),同時(shí)為了排除自身基因組中α-淀粉酶基因?qū)Ζ?淀粉酶表達(dá)的影響,還缺失了α-淀粉酶基因(amyL),BL10是在BL9的基礎(chǔ)上進(jìn)一步敲除了蛋白酶基因bprA。

        表1 實(shí)驗(yàn)所用菌株Table1 A list of the strains used in this study

        1.1.2試劑

        DNA聚合酶、dNTPs、各種DNA限制性內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶、RNA酶、蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)Marker、DNA Marker日本TaKaRa公司;DNA回收試劑盒 武漢思特進(jìn)科技發(fā)展有限公司;瓊脂糖 法國Biowest公司;氨芐青霉素(ampicillin,Amp)、四環(huán)素(tetracycline,Tet)、蛋白膠配制所需試劑 美國Sigma公司;其他主要生化試劑購自國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。

        1.1.3培養(yǎng)基

        LB培養(yǎng)基:蛋白胨10 g/L、酵母浸出粉5 g/L、NaCl 10 g/L,pH 7.0~7.2,固體培養(yǎng)基加瓊脂15 g/L。

        芽孢桿菌感受態(tài)制備培養(yǎng)基:生長培養(yǎng)基為含0.5 mol/L山梨醇的LB培養(yǎng)基;洗滌培養(yǎng)基為0.5 mol/L山梨醇,0.5 mol/L甘露醇,10%甘油;恢復(fù)培養(yǎng)基為含0.5 mol/L山梨醇和0.38 mol/L甘露醇的LB培養(yǎng)基。

        淀粉酶發(fā)酵培養(yǎng)基:玉米漿干粉5 g/L、酵母粉5 g/L、蛋白胨10 g/L、檸檬酸鈉12 g/L、K2HPO4·H2O 1 g/L、MgSO4·7H2O 0.5 g/L、CaCl2·2H2O 0.15 g/L,pH 7.0~7.2。

        抗生素質(zhì)量濃度:大腸桿菌克隆篩選和培養(yǎng)使用Amp質(zhì)量濃度為100μg/mL;芽孢桿菌轉(zhuǎn)化子篩選使用Tet質(zhì)量濃度為20μg/mL,重組菌株的培養(yǎng)使用Tet質(zhì)量濃度為25μg/mL。

        1.2儀器與設(shè)備

        凝膠成像系統(tǒng) 美國Alpha公司;GenePulserTM電脈沖轉(zhuǎn)化儀 美國Bio-Rad公司;HQL300B恒溫大幅振蕩搖床 武漢中科科儀技術(shù)發(fā)展有限責(zé)任公司;高壓滅菌鍋 日本三洋公司;電子分析天平(萬分之一)德國Sartorius Analytic公司。

        1.3方法

        1.3.1α-淀粉酶分泌表達(dá)載體構(gòu)建

        α-淀粉酶分泌表達(dá)載體構(gòu)建參考本課題組先前報(bào)道的方法[19],構(gòu)建步驟如圖1所示。根據(jù)B. licheniformisWX-02基因組序列中的amyL基因序列(MUY_00877),設(shè)計(jì)一對引物PamyLF1(5’-GAGAGGAATGTACA CATGAAATGAAACAACAAAAACGGCTT-3’)和PamyTR(5’-GAAGATCTCGCAATAATGCCGTCGCAC TG-3’),以B. licheniformisWX-02的總DNA為模板,聚合酶鏈 式反應(yīng)(polymerase chain rea ction,PCR)擴(kuò)增得到α-淀粉酶基因的編碼區(qū)(包括信號肽)片段和終止子片段amyL+TamyL,長度約2 040 bp。 根據(jù)B. subtilis168基因組上P43啟動子的序列設(shè)計(jì)一對引物P43F(5’-GG AATTCTGATAGGTGGTATGTTTTCG-3’)和P43R1(5’-AAGCCGTTTTTGTTGTTTCATTTCATGTGTACA TTCCTCTC-3’),PCR擴(kuò)增得到啟動子P43片段,長度約305 bp,將這兩個(gè)片段經(jīng)DNA純化試劑盒純化回收后作為模板,用重疊延伸PCR法(splicing overlap extension PCR,SOE-PCR)連接在一起,得到片段SAT,總長度約2 345 bp,純化回收后,用EcoRⅠ和BglⅡ雙酶切,純化回收片段SAT。然后將pHY300PLK空質(zhì)粒用同樣的酶雙酶切,純化回收后與前面得到的片段連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化E. coliDH5α,轉(zhuǎn)化子經(jīng)菌落PCR驗(yàn)證、質(zhì)粒抽提和雙酶切驗(yàn)證,獲得的重組α-淀粉酶分泌表達(dá)質(zhì)粒命名為pP43SAT,長度約4 870 bp。

        圖 1 1 α-淀粉酶表達(dá)載體pP43SAT的構(gòu)建過程Fig.1 Construction process of α-amylase expression vector (pP43SAT)

        1.3.2α-淀粉酶重組表達(dá)菌株的構(gòu)建

        重組表達(dá)菌株參考本課題組先前報(bào)道的方法構(gòu)建[18]。分別接種B. licheniformisBL9和BL10于LB培養(yǎng)基,37℃、180 r/min過夜培養(yǎng),轉(zhuǎn)接至電轉(zhuǎn)化生長培養(yǎng)基中,250 r/min、37℃培養(yǎng)至OD600nm為0.8~0.9,冰浴10 min,5 500 r/min離心6 m in,收集菌體,用電轉(zhuǎn)化洗滌培養(yǎng)基洗滌菌體3次,重懸于洗滌培養(yǎng)基中,即為感受態(tài)細(xì)胞。取感受態(tài)細(xì)胞加入5μLpP43SAT質(zhì)粒DNA(50 ng/μL),轉(zhuǎn)至預(yù)冷的電轉(zhuǎn)化杯(0.2 cm)中,冰浴1~1.5 min,用電脈沖轉(zhuǎn)化儀2.5 kV電擊1次,迅速加900μL電轉(zhuǎn)化恢復(fù)培養(yǎng)基,37℃水浴1 h,100 r/min恢復(fù)培養(yǎng)2 h,涂含有20μg/mL的四環(huán)素抗性平板,37℃培養(yǎng)20 h,挑取轉(zhuǎn)化子,經(jīng)菌落PCR驗(yàn)證、質(zhì)粒抽提驗(yàn)證,獲得陽性轉(zhuǎn)化子,通過該方法構(gòu)建重組表達(dá)菌株B. licheniformisBL9(pP43SAT)和BL10(pP43SAT),并構(gòu)建含有空質(zhì)粒pHY300PLK的對照表達(dá)菌株。

        1.3.3重組發(fā)酵菌株的發(fā)酵培養(yǎng)

        將B. licheniformisBL9(pP43SAT),BL10(pP43SAT)和對照菌株接種于5 mL的含四環(huán)素(20μg/mL)的LB培養(yǎng)基中,37℃、180 r/min培養(yǎng)過夜。再以4%的接種量轉(zhuǎn)接到50 mL新鮮的LB培養(yǎng)基中,直到OD600nm為1.0時(shí),以1%的接種量接種到50 mL新鮮的淀粉酶發(fā)酵培養(yǎng)基中,37℃、180 r/min振蕩培養(yǎng)。每隔4 h取樣一次,測定 其OD600nm和淀粉酶活力,取發(fā)酵終點(diǎn)的發(fā)酵液用于十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)分析,鑒定淀粉酶的表達(dá)。

        1.3.4表達(dá)蛋白的鑒 定

        取0.9 mL發(fā)酵上清液,加入0.1 mL 100 g/100 mL的三氯乙酸(trichloroacetic acid,TCA)溶液,顛倒10次混勻,4℃過夜放置,13 000 r/min離心10 min,棄上清,加入0.2 mL無水乙醇洗滌,13 000 r/min離心10 min,棄上清,依此重復(fù)洗滌3次,37℃吹干,加入30μL包含8 mol/L尿素和2 mol/L硫脲的溶液溶解蛋白 樣品,再加入30μL2×SDS-PAGE上樣緩沖液和3μL1 mol/L二硫蘇糖醇(DL-dithiothreitol,DTT),100℃水浴10 min溶解沉淀。SDS-PAGE凝膠參考《分子克隆實(shí)驗(yàn)指南》進(jìn)行配制[20]。將溶解好的蛋白離心后取20μL上樣,用80 V的電壓電泳,當(dāng)溴酚藍(lán)指示劑從濃縮 膠進(jìn)入分離膠后,電壓調(diào)到120 V,繼續(xù)電泳直到溴酚藍(lán)指示劑抵達(dá)分離膠底部,斷開電源停止電泳。電泳結(jié)束后,于考馬斯亮藍(lán)R250染色液 中處理1~2 h,最后于脫色液中處理數(shù)次直至條帶清晰。

        1.3.5α-淀粉酶活力測定

        發(fā)酵液經(jīng)1 000 r/min離心10 min,取上清液,稀釋即為待測樣品。吸取20.0 mL 2 g/mL可溶性淀粉溶液于50 mL離心管中,加入5 mL磷酸鹽緩沖液(pH 6.0)搖勻后置于60℃恒溫水浴鍋中預(yù)熱8 min。加入1 mL待測樣品,搖勻,反應(yīng)10 min。吸取1.00 mL反應(yīng)液至預(yù)先盛有0.5 mL 0.1 mol/L鹽酸溶液和5 mL稀碘液的離心管中,搖勻,并以0.5 mL鹽酸溶液和5 mL稀碘液為空白,在660 nm波長處迅速測定其吸光度(A)。淀粉酶活力單位為U/mL,1 U定義為:在60℃、pH 6.0的條件下1 min水解1 mg淀粉所需的酶量[21]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1α-淀粉酶表達(dá)質(zhì)粒pP43SAT的構(gòu)建

        以設(shè)計(jì)在pHY300PLK載體上PHY-F/PHY-R為引物,通過菌落PCR初步挑選陽性克隆子。挑取候選陽性克隆子過夜培養(yǎng),抽質(zhì)粒,酶切驗(yàn)證結(jié)果如圖2所示,pP43SAT質(zhì)粒經(jīng)過BglⅡ和EcoRⅠ雙酶切后,得到片段大小約為4 870 bp和2 345 bp的兩個(gè)片段,分別與空質(zhì)粒pHY300PLK和片段SAT大小相等,說明pP43SAT質(zhì)粒構(gòu)建成功。

        圖2 表達(dá)質(zhì)粒pP43SAT的酶切鑒定Fig.2 Identification of expression vector pP43SAT by restriction enzyme digestion

        2.2α-淀粉酶表達(dá)蛋白鑒定

        圖3 不同基因工程菌胞外蛋白的SDS-PAGE圖譜分析結(jié)果Fig.3 SDS-PAGE analysis of extracellular proteins from different genetically engineered strains

        將構(gòu)建好的α-淀粉酶表達(dá)載體pP43SAT分別轉(zhuǎn)入BL9和BL10,得到工程菌株BL9(pP43SAT)和BL10(pP43SAT),并在BL10中轉(zhuǎn)入空質(zhì)粒pHY300P LK得到對照菌BL10(pHY300PLK),抽質(zhì)粒進(jìn)行驗(yàn)證,經(jīng)過液體發(fā)酵,取發(fā)酵24 h時(shí)的發(fā)酵液樣品,在相同條件下進(jìn)行SDS-PAGE分析,結(jié)果如圖3所示。與空白對照相比,BL9(pP43SAT)和BL10(pP43SAT)菌株發(fā)酵液中含有強(qiáng)烈的α-淀粉酶條帶,大小約58 kD,與先前報(bào)道的B. licheniformis α-淀粉酶的分子質(zhì)量相一致[22],說明α-淀粉酶在BL9和BL10中實(shí)現(xiàn)了分泌表達(dá)。從α-淀粉酶條帶強(qiáng)度可以看出,BL10宿主菌具有更高的α-淀粉酶表達(dá)量。BL10是在BL9的基礎(chǔ)上敲除了bprA基因,說明宿主菌缺失蛋白酶BprA可進(jìn)一步提高α-淀粉酶的表達(dá)。

        2.3不同宿主菌對α-淀粉酶發(fā)酵過程的影響

        圖4 不同宿主菌對α-淀粉酶發(fā)酵過程的影響Fig.4 Effects of different host strains on the fermentation process of α-amylase

        為了對比BL9、BL10和野生菌WX-02的α-淀粉酶表達(dá)效果,并排除B. licheniformis自身α-淀粉酶對蛋白表達(dá)的影響,將pP43SAT表達(dá)載體轉(zhuǎn)入缺失α-淀粉酶基因的WX-02(ΔamyL)宿主菌中,構(gòu)建了B. licheniformisWX-02(ΔamyL,pP43SAT)。WX-02(ΔamyL,pP43SAT)、BL9(pP43SAT)和BL10(pP43SAT)的淀粉酶發(fā)酵過程如圖4所示。與WX-02(ΔamyL,pP43SAT)相比,BL9(pP43SAT)和BL10(pP43SAT)菌體生長相對緩慢,最終生物量微弱下降(圖4A),這可能是由于BL9和BL10菌株分別缺失9個(gè)和10個(gè)基因,對菌體的生長具有微弱的損傷作用,這與本課題先前發(fā)現(xiàn)的現(xiàn)象相似[18]。

        微弱降低的菌體量并沒有降低淀粉酶的表達(dá)量,如圖4B所示,BL9(pP43SAT)和BL10(pP43SAT)淀粉酶發(fā)酵活力分別達(dá)到94.01 U/mL和101.94 U/mL,比WX-02(ΔamyL,pP43SAT)的發(fā)酵活力(77.88 U/mL)提高了21%和31%,這說明BL9和BL10新型宿主菌有利于α-淀粉酶的表達(dá),這與先前報(bào)道的納豆激酶變化趨勢相符合[18]。B. licheniformis宿主菌缺失蛋白酶基因后,可降低自身蛋白酶對目標(biāo)蛋白的降解作用,這可能是淀粉酶表達(dá)活性增加的原因。同時(shí),BL10(pP43SAT)的α-淀粉酶表達(dá)活性相對于BL9(pP43SAT)提高了8%,這與SDS-PAGE的蛋白質(zhì)濃度變化趨勢相一致,進(jìn)一步說明BprA蛋白酶的缺失有利于α-淀粉酶的表達(dá)。

        3 結(jié) 論

        本研究構(gòu)建了α-淀粉酶表達(dá)載體pP43SAT,實(shí)現(xiàn)了α-淀粉酶在地衣芽孢桿菌宿主菌WX-02(ΔamyL)、BL9和BL10中的成功表達(dá)。與宿主菌WX-02(ΔamyL)相比,BL9和BL10可顯著提高α-淀粉酶的表達(dá),分別提高了21%和31%。目前,以枯草芽孢桿菌蛋白酶缺失株為宿主表達(dá)外源蛋白的研究較多,如6蛋白酶缺失株B. subtilisWB600可高效表達(dá)納豆激酶[23]和枯草蛋白酶[24],8蛋白酶缺失株B. subtilisWB800可高效表達(dá)木聚糖酶[25]和磷脂酶C[26],而多蛋白酶缺失的地衣芽孢桿菌宿主菌報(bào)道較少,本課題組前期證明BL10有利于納豆激酶的表達(dá),本研究證明胞外蛋白酶基因缺失可顯著提高α-淀粉酶的表達(dá),進(jìn)一步證實(shí)多蛋白酶缺失宿主菌的應(yīng)用價(jià)值。更重要的是,本研究為α-淀粉酶的增強(qiáng)表達(dá)提供了新的思路,提供了一種高效表達(dá)α-淀粉酶的地衣芽孢桿菌工程菌BL10(pP43SAT),相信經(jīng)過進(jìn)一步的發(fā)酵工藝優(yōu)化和中試放大研究,該菌株有望應(yīng)用于α-淀粉酶的工業(yè)化生產(chǎn)。

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        Comparative Analysis on the Effects of Different Host Strains of Bacillus licheniformis on the Expression and Secretion of α-Amylase

        CHEN Jingbang1, ZHOU Yinhua1, ZHAO Xinyu1,2, CHEN Shouwen1, WEI Xuetuan1,2,*
        (1. State Key Laboratory of Agricultural Microbiology, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China;2. College of Food Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China)

        In the present study, effects of different host strains ofBacillus licheniformison the expression and secretion ofα-amylase were investigated. Firstly, theα-amylase expression vector, named pP43SAT, was constructed based on the promoter P43 fromBacillus subtilisand the signal peptide, coding region and terminator ofα-amylase gene fromB. licheniformisWX-02. The pP43SAT plasmids were then transformed into theB. licheniformishost strains WX-02 (ΔamyL), BL9 and BL10B, respectively, to obtain theα-a mylase genetic engineering strainsWX-02 (ΔamyL;pP43SAT), BL9 (pP43SAT) and BL10 (pP43SAT), respectively. Theα-amylase fermentation processes of these engineered strains were compared.Theα-amylase activities ofstrains BL9 (pP43SAT) and BL10 (pP43SAT) reached 94.01 and 101.94 U/mL, respectively, which were increased by 21% and 31%, respectively, as compared with that of WX-02 (ΔamyL;pP43SAT). These results showed that the novel host strains BL9 and BL10 contributed to the secretion and expression ofα-amylase. It was proved that the deletion of multiple proteases genes could enhanceα-amylase expression obviously, and this st udy provided the novel host strains and novel strategies for efficient expression ofα-amylase.

        α-amylase;Bacillus licheniformis; host strain;secretion and expression

        Q812

        1002-6630(2015)17-0196-05

        10.7506/spkx1002-6630-201517037

        2015-04-10

        湖北省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2014CFB943);華中農(nóng)業(yè)大學(xué)自主科技創(chuàng)新基金項(xiàng)目(2662015QC035)

        陳敬幫(1990—),男,碩士研究生,研究方向?yàn)槭称访笇W(xué)。E-mail:1176154594@qq.com

        *通信作者:魏雪團(tuán)(1984—),男,講師,博士,研究方向?yàn)槭称肺⑸飳W(xué)。E-mail:weixuetuan@mail.hzau.edu.cn

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